Bacterias y Archaea - Uprm - Recinto Universitario de Mayagüez

Anuncio
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Primeros organismos
Capítulos 27:
Bacterias y Archaea
Dr. Fernando J. Bird-Picó
Departamento de Biología
Recinto Universitario de Mayagüez
• Dos dominios: Archaea y Bacteria
• No poseen organelos celulares con membrana tales
como el núcleo, cloroplastos, mitocondrios, plastidios,
etc.
• Los más numerosos (5,000 especies conocidas (se
estiman 4 millones especies)
• Diversidad genética entre éstos es inmensa
• Microscópicos
• En un puñado de tierra puede haber 10,000 especies
[diferentes] de procariotas
• Ubicuos: Se encuentran en todos lados
• Microbiología: la mayoría entre 0.5 – 5 µm (células
eucariotas entre 10 -100 µm)
Figure 27.2
Formas morfológicas
bacterianas comunes:
• Cocos (sencillos, racimos, rosarios)
• Bacilos (alargados, bastones)
• Espirales
(a) Cocos
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
(b) Bacilos
3 µm
1 µm
• Vibrios (en forma de coma)
1 µm
– Espirilo (hélice rígida)
– Espiroqueta (hélice flexible)
(c) Espirales
1
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Micrococcus
bacteria tipo
coco
Spiroplasma
bacteria tipo
espiral
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
Salmonella
bacteria tipo
bacilo
Microscopía
de barrido
electrónico
mostrando
bacterias en
la cabeza de
un alfiler
2
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Pared celular
•
Paredes celulares en eubacteria:
– Gram-positiva
• Función: mantener forma de la
célula, protección, y evitar que
exploten en ambientes hipotónicos
• Bacteria – pared de peptidoglicano
• Archaea – pared de polisacáridos y
proteínas pero no peptidoglicano
• Peptidoglicano muy grueso
– Gram-negativa
• Peptidoglicano muy delgado
• Poseen membrana externa
• Incluye las bacterias más patogénicas- membrana externa tóxica y
protege contra defensas del huésped
• Más resistentes a antibióticos: membrana externa no permite
entrada de éstos
• Muchos antibióticos atacan peptidoglicano y dañan paredes
celulares de bacterias
•
Cápsula
• De polisacárido o proteína; es “pegajosa” - adhesión
• Rodeando y envolviendo la pared celular
• Hace la bacteria más resistente a defensas del cuerpo
Figure 27.3
Figure 27.4
(a) Gram-positive bacteria
(b) Gram-negative
bacteria
Carbohydrate portion
of lipopolysaccharide
Bacterial
cell wall
Bacterial
capsule
Cell
wall
Peptidoglycan
layer
Plasma
membrane
Tonsil
cell
Outer
Cell membrane
wall Peptidoglycan layer
Plasma membrane
Peptidoglycan traps crystal violet,
which masks the safranin dye.
Crystal violet is easily rinsed away, revealing
the red safranin dye.
Gram-negative
bacteria
Gram-positive
bacteria
200 nm
10 µm
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
3
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Figure 27.5 Gram-positive and gram-negative bacteria
• Fimbrias:
– Estructuras proteicas que se extienden desde la célula
– Ayudan a las bacterias a adherirse a las superficies (“fimbrias” o
“attachment pili”)
• Pilos
– Hay pilos sexuales (más largos de que fimbrias): permiten
intercambio de DNA entre procariotas)
• Flagelo
– Produce movimiento rotativo
– Compuesto de cuerpo basal, gancho, y filamento
Fimbrias y Pilos en bacteria tipo
bacilo
Figure 27.7
Flagellum
Filament
Hook
Motor
Cell wall
Plasma
membrane
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
20 nm
Rod
Peptidoglycan
layer
4
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Figure 27.8
Organización Interna (subcelular)
1 µm
0.2 µm
• Células procariotas carecen de una
compartimentalización compleja
• Algunos procariotas poseen membranas
especializadas que llevan a cabo funciones
metabólicas (mesosomas)
Respiratory
membrane
Thylakoid
membranes
(a) Aerobic prokaryote
• Material genético bacteriano
– Molécula de DNA Circular en región
nucleoide
– Plásmidos
• Reproducción asexual
– Fisión binaria
– Gemación (“budding” o yemas)
– Fragmentación
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
(b) Photosynthetic prokaryote
Plásmidos R y Resistencia
Antibiótica
• plásmidos R tienen genes para resistencia a antibióticos
• Tomar antibióticos hace que se seleccionen las bacterias
con genes que son resistentes a antibióticos
• Cada vez es mas común las cepas de bacterias
resistentes a una gama amplia de antibióticos
5
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Figure 27.8
Chromosome
Plasmids
• Transformación
– Ingesta de fragmentos de DNA
• Transducción
– Bacteriófago acarrea DNA bacteriano entre células
• Conjugación
– Células de diferentes tipos (“mating”) que se aparean
e intercambian material genético
1 µm
Fig. 27-11-4
Transformación
Phage DNA
A + B+
Transducción
A+
B+
Donor
cell
A+
Recombination
A+
A – B–
Recipient
cell
A + B–
Recombinant cell
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
6
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
Figure 27.13
08/02/2016
Conjugación y recombinación en E. coli
F plasmid
Endosporas
Bacterial
chromosome
F+ cell
(donor)
F+ cell
Mating
bridge
F− cell
F+ cell
(recipient)
Bacterial
chromosome
(a) Conjugation and transfer of an F plasmid
Hfr cell
(donor)
A+
F factor
F− cell
(recipient)
A+
A+
A−
A+
A−
A−
A+
A−
A+
Recombinand
F− bacterium
(b) Conjugation and transfer of part of an Hfr bacterial chromosome,
resulting in recombination
• Células aletargadas,
de alta resistencia al
calor, frío y
desecación,
producidas por
algunas eubacterias
• Bajo condiciones
adversas de estrés
en el medioambiente
• Perduran por siglos
• Clostridium tetani,
Bacillus anthracis
Endospora
Table 27.1
Procariotas se pueden clasificar sobre
la base de sus requisitos nutricionales:
• Heterótrofos
– Fotoheterótrofos
– Quimioheterótrofos
• Se alimentan de materia orgánica muerta y/o en
descomposición
• Autótrofos
– Fotoautótrofos
– Quimioautótrofos
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
7
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
Cianobacterias o algas verdeazules
08/02/2016
Procariotas también se pueden clasificar por
sus requisitos atmosféricos (metabolismo)
• La mayor parte de las bacterias son
aeróbicas
• Las bacterias anaerobias facultativas
utilizan oxígeno si está disponible (llevan a
cabo respiración celular y fermentación)
• Las bacterias anaerobias obligadas
solamente pueden llevar a cabo metabolismo
de forma anaeróbica (fermentación)
• Algunos procariotas convierten nitrógeno
atmosférico(N2) en ammonia (NH3)
Fig. 27-14
Cooperación Metabólica
• Cooperación entre procariotas les permite utilizar
recursos ambientales que de otra forma no
podrían utilizar como células individuales
• Anabaena (cianobacteria): las células
fotosintéticas y células fijadoras de nitrógeno
(heterocitos) intercambian productos metabólicos
• En otras especies, la cooperación se lleva a cabo
en colonias que tapizan superficies (“biofilms” y
tapetes)
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
Anabaena
Photosynthetic
cells
Heterocyte
20 µm
8
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Fig. 27-15
Clasificación de Procariotas:
Uso de técnicas de PCR para obtener de forma
más rápida secuencias de diferentes genomas y
comparar los mismos (sistemática molecular) han
sido de gran ayuda.
1 µm
“biofilms”
Figure 27.15
• Dominio Bacteria
– Reino Bacteria
• Gram + y Gram • Dominio Archaea
– Reino Archae
Eukarya
Archaea
Bacteria
• Paredes celulares carecen
de peptidoglicanos
• Mecanismo de traducción
es similar al de los
eucariotas
Table 27.2
Euryarchaeotes
Crenarchaeotes
UNIVERSAL
ANCESTOR
Nanoarchaeotes
Domain Archaea
Korarchaeotes
Domain
Eukarya
Eukaryotes
Proteobacteria
Spirochetes
Cyanobacteria
Domain Bacteria
Chlamydias
Gram-positive
bacteria
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
9
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Medioambiente típico de bacterias
termófilas
• Metanógenas
– Producen gas metano (CH4)
– Ambientes anaeróbicos
• Halófilas extremas
– Habitan soluciones de sales saturadas (salinas)
• Termófilas extremas
– Habitan ambientes cuyas temperaturas pueden
sobrepasar los 100°C
Bacteria
• Incluye la mayoría de los procariotas que
los humanos están conscientes
• De diferentes requerimientos nutricionales
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
• Lleva a cabo funciones ecológicas vitales:
– Descomponedoras de materia orgánica
– Fijación de nitrógeno para las plantas
• Patógenas
– Postulados de Koch:
• Presencia del patógeno en individuos afectados
• Muestra del patógeno puede ser cultivada
(pura)
• Muestra del cultivo es inoculada en individuo no
afectado causando la misma enfermedad
• Se recupera el microorganismo del individuo
inoculado experimentalmente
– Exotoxinas: producidas por bacterias y
secretadas al exterior de las mismas (o liberadas
al morir la bacteria): difteria y botulismo
– Endotoxinas: toxinas forman parte de la pared
celular de las bacterias gram-negativas
10
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Figure 27.17-a
Bacterias Gram (-)
Subgroup: Alpha Proteobacteria
Subgroup: Beta Proteobacteria
Alpha
• Grupo grande y diverso de bacterias
• Sobre la base de secuencias de rRNA, se agrupan en
cinco (5) subgrupos:
2.5 µ m
Gamma Proteobacteria
Delta
Epsilon
– Alpha
• Simbiontes de plantas, animales y algunas patógenas
Subgroup: Gamma Proteobacteria
1 µm
Beta
Rhizobium (arrows) inside a root
cell of a legume (TEM)
Nitrosomonas (colorized TEM)
Subgroup: Delta Proteobacteria
Subgroup: Epsilon Proteobacteria
– Beta
• Nitrosomonas (oxida NH3) y Neisseria gonorrhoeae
– Gamma
• Myxobacterias (bacterias lamosas)
Thiomargarita namibiensis
containing sulfur wastes (LM)
– Epsilon
Fruiting bodies of Chondromyces
crocatus, a myxobacterium (SEM)
2 µm
300 µ m
200 µ m
• Enterobacterias y Vibrio cholerae
– Delta
Helicobacter pylori (colorized TEM)
• Tracto digestivo de animales (Helicobacter pylori)
Figure 27.17-b
• Gram- + incluye
5 µm
Cyanobacteria
Gram-Positive Bacteria
40 µ m
Streptomyces, the source of many
antibiotics (SEM)
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
Actinomycetes, descomponedores en suelo
Bacillus anthracis, causante del anthrax
Clostridium botulinum, causante del botulismo
Algunos Staphylococcus y Streptococcus, que pueden ser
patogénicos
– Micoplasmas, células más pequeñas que se conocen
–
–
–
–
2 µm
Leptospira, a spirochete
(colorized TEM)
5 µm
Chlamydia (arrows) inside an
animal cell (colorized TEM)
Oscillatoria, a filamentous
cyanobacterium
Bacterias Gram +
Spirochetes
2.5 µ m
Chlamydias
Hundreds of mycoplasmas covering
a human fibroblast cell (colorized SEM)
11
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Importancia de Procariotas
• Si procariotas desaparecieran hay pocas
probabilidades de que otras formas de vida
sobrevivan
• Indispensable en el reciclaje de elementos
químicos
– (fijación de nitrógeno: bacterias -únicas capaces
de convertir nitrógeno atmosférico en forma útil
para plantas)
– Descomponedores (saprobios) obtienen sus
nutrientes de organismos muertos-regresan
elementos al ambiente en forma inorgánica para
que las plantas lo utilicen
– Bacterias autótrofas
• Toda la vida depende de procariotas
Pueden vivir en relación
simbiótica
• Tres tipos de relaciones
1. mutualismo - ambos se benefician
2. comensalismo - uno se beneficia, el otro no se afecta
3. parasitismo (una se beneficia la otra se perjudicaabsorben sus nutrientes de fluídos de húespedes vivos)
Ejemplos:
– Bacteria en intestino nos proveen vitaminas-mutual
– Bacterias en raíces de leguminosas- plantas
habichuelas, etc. (mutual)-bacteria le brinda nitrógeno,
planta le da azúcar para respiración celular
– Bacterias patógenas - parasitismo
• Bacterias (parasíticas)- patógenos de
plantas y animales– causan enfermedades-patógeno se
adhiere a célula -se multiplica y produce
toxinas- venenos
• Exotoxinas: secretadas
• Endotoxinas: al romperse célula bacteriana
• tuberculosis, cólera, enfermedades sexuales
(chlamydia, gonorrea), botulismo,
envenenamiento por comida, salmonella,
úlcera digestiva, ántrax, tétano, etc.
Nitrosomonas (colorized TEM)
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
12
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Uso de procariotas en
investigación y tecnología
Importancia de Procariotas
–
–
•
•
•
•
Microbiología industrial
Microbiología médica (clínica)
Ecología microbiana (ej. Bioremediación)
Microbiología de alimentos
–
–
Bioremediación en derrames de
petróleo
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
Producción de antibióticos-eritromicina,
estreptomicina
Bioremediación- usar procariotas y hongos para
remover (degradar) contaminantes (agentes químicos
peligrosos como pesticidas, yerbicidad, petróleo,
gasolina, metales pesados, etc.) del suelo, agua y aire
a compuestos no tóxicos
Tecnología- crecer bacterias en el laboratorio,
manipuladas genéticamente, para que produzcan
medicinas-, insulina, interferón, antibióticos, hormona
de crecimiento, alcohol, acetona, vacunas, vitaminas
Microbiología de alimentos- usa ácido láctico
bacteriano para convertir leche a Yogurt, queso,
salami, vinagre, chocolate
Plantas de tratamiento de aguas
usadas
13
BIOL 3052 - Bacteria y Archaea
08/02/2016
Table 27.2
Fig. 27-21
Lyme disease
5 µm
Dr. Fernando J. Bird-Picó - 2016
14
Descargar