Identificación y cuantificación de Quimerismo Hematopoyético mediante PCR cuantitativa en tiempo real analizando polimorfismos de inserción/deleción “Nuevas tecnologías basadas en Biomarcadores para Hematología” Una oportunidad para la colaboración entre sector biotecnológico y Sistema Nacional de Salud 19 de marzo de 2013 Fundación Jiménez Díaz Dr. Antonio Jimenez-Velasco, Hospital Carlos Haya, Málaga Dra. Ana Martínez-Hortigüela, Instituto de Medicina Genómica, Valencia www.imegen.es Servicios de diagnóstico genético de utilidad clínica; desarrollo a medida de protocolos de detección de cualquier enfermedad genética descrita Amplio catálogo con más de 900 enfermedades genéticas Investigación y Desarrollo Transferencia de Tecnología www.imegen.es QUIMERISMO Células linfohematopoyéticas no propias del receptor que aparecen como resultado de un trasplante alogénico. La determinación cuantitativa de la presencia de quimerismos hematopoyéticos en el periodo post-transplante permite la predicción de recaídas y la toma de decisiones terapéuticas. www.imegen.es MÉTODOS DE ESTUDIO DEL QUIMERISMO SENSIBILIDAD www.imegen.es ESTUDIO DEL QUIMERISMO MEDIANTE REAL TIME PCR SEGUIMIENTO POSTRASPLANTE Calibrador: Receptor pre-ALO: 100% www.imegen.es Los estudios convencionales mediante PCR-VNTR-STR no poseen la suficiente sensibilidad en la detección de células residuales del receptor, pudiendo anticipar sólo el 50% de las recaídas de los pacientes con LA y alo-TMO. La decisión de una intervención terapéutica para impedir la recaída debe estar basada en el incremento del quimerismo y no en el establecimiento de un nivel o valor de riesgo derivado de una única determinación aislada. Las nuevas técnicas de cuantificación por PCR en tiempo real son actualmente la metodología de elección en el seguimiento del QH. www.imegen.es www.imegen.es imegen® - Quimera Screening I Identificación de la informatividad de 8 polimorfismos para el análisis de quimeras hematopoyéticas imegen® - Quimera Screening II Identificación de la informatividad de 7 polimorfismos para el análisis de quimeras hematopoyéticas Se considera que un polimorfismo es informativo cuando se detecta en el receptor del trasplante y no en el donante. El análisis molecular de los polimorfismos SRY y RhD no es necesario ya que SRY es informativo cuando el receptor es varón y la donante mujer. RhD es informativo cuando el receptor tiene grupo sanguíneo Rh+ y el donante RhResultados Resultados Polimorfismo Informatividad Receptor Donante 1 MID 2113 + + No informativo 2 GSTM1 + - Informativo 3 MID 1385 - + No informativo 4 MID 1732 - - No informativo 5 rs4399 + - Informativo 6 MID 1039 + + No informativo 7 Xq28 - - No informativo 8 GSTT1 + - Informativo Polimorfismo Informatividad global acumulada 95,5% Informatividad Receptor Donante 1 MID 154 + + No informativo 2 rs4399del + - Informativo 3 MID 1385del - + No informativo 4 MID 1732del - - No informativo 5 THRY + - Informativo 6 MID 1039del + + No informativo 7 R271 - - No informativo www.imegen.es imegen® - Quimera Cuantificación relativa de polimorfismos de inserción/deleción en quimeras hematopoyéticas mediante PCR a tiempo real El set imegen®-Quimera contiene los oligonucleótidos necesarios para cuantificar polimorfismos de inserción/deleción o alelos nulos respecto a la cantidad total de ADN presente en la muestra. SRY Xq28 R271 RhD www.imegen.es CUANTIFICACION RELATIVA Razón Normalizada = (Ediana)∆Cp diana (calibr. – muestra) ÷ (Eref)∆Cp ref (calibr. – muestra) - Gen de referencia: Beta globina - Calibrador de la reacción: muestra RECEPTOR pre Alo-TPH SENSIBILIDAD: 10-4-10-5 (0,01-0.001%) www.imegen.es Código Nombre del set Nº reacciones Código Nombre del set Nº reacciones IMG-116-1 Screening I 48 IMG-116-12 Cuantificación de MID1039 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-22 Screening II 48 IMG-116-13 Cuantificación de MID1385del en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-2 Cuantificación de SRY en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-14 Cuantificación de MID1732del en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-3 Cuantificación de MID154 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-15 Cuantificación de MID2113del en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-4 Cuantificación de MID1385 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-16 Cuantificación de XQ28del en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-5 Cuantificación de MID1732 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-17 Cuantificación de rs4399del en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-6 Cuantificación de MID2113 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-18 Cuantificación de RhD en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-7 Cuantificación de XQ28 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-19 Cuantificación de MID1946 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-8 Cuantificación de GSTT1 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-20 Cuantificación de THRY en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-9 Cuantificación de R271 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-21 Cuantificación de MID1039del en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-10 Cuantificación de rs4399 en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-23 Cuantificación de Factor VII en quimeras hematopoyéticas 50 IMG-116-11 Cuantificación de GSTM1 en quimeras hematopoyéticas 50 www.imegen.es imegen® - Quimera Interpretación de Resultados Para realizar la cuantificación relativa de la quimera hematopoyética se ha desarrollado un software específico, que permite obtener el resultado mediante introducción de los siguientes parámetros: www.imegen.es GRACIAS www.imegen.es