UNIVERSIDAD NACIONAL DE MISIONES Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales “ 2015 - Año del Bicentenario del Congreso de los Pueblos Libres” TRABAJO PRÁCTICO Nº 1/15 SOLUCIONES y BIOSEGURIDAD OBJETIVO: El presente trabajo práctico tiene como objetivo principal ejercitar a los alumnos en la preparación de drogas de uso frecuente en el laboratorio de Genética/Biología Molecular y como objetivo secundario que reconozcan las normas de bioseguridad que deben respetarse en el laboratorio. PARTE I: PREPARACIÓN DE SOLUCIONES Para repasar: Las soluciones pueden representar mezclas _________ o _____________. En una solución líquida, el líquido que representa el _______ volumen se reconoce como__________. Si el solvente es agua, entonces la solución es denominada solución _________. Los componentes ________ son llamados solutos. Dado que todos los organismos vivos están compuestos principalmente de agua, el estudio de la química de la vida, involucra el estudio de la química de soluciones acuosas. De esta manera, la preparación de soluciones acuosas representa una parte esencial de la biología celular y molecular. Concepto de Concentración: Definir ¿Qué es concentración? ¿Cuáles son las diferentes formas posibles en las que puede ser expresada o descripta una concentración? CUIDADO! Un molar (1__) de solución contiene un_____ de _____ por______ de solución Un milimolar (1___) de solución contiene un_____ de _______por _______de solución Un micromolar (1 ____) de solución contiene un _______ de _____ por ____ de solución Un mol (1 mol) de cualquier sustancia es igual a _____________unidades básicas (RECORDAR: la unidad básica de un elemento son los átomos individuales, y la unidad básica de un compuesto son las moléculas individuales). Así, el PM de una sustancia nos indica cuántos gramos pesa un mol de esa sustancia. POR EJEMPLO: Cátedra Genética Molecular – Trabajos Prácticos 2015 1 UNIVERSIDAD NACIONAL DE MISIONES Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales “ 2015 - Año del Bicentenario del Congreso de los Pueblos Libres” El PM del permanganato de potasio (KMnO4) es de 158,04 g/mol. Entonces si tenemos 154,04 g de KMnO4 en un litro de solución la concentración será de _______. IMPORTANTE: “gramo”, “mg”, “litros”, “mol” y “milimol” son todos ejemplos de, unidad de _______. Por otro lado “g/L”, “mg/mL”, “milimoles por litro”, “micromolar” y “molar” son TODOS ejemplos de unidades de _________________. Entonces, siempre que sea necesario indicar la cantidad de una sustancia o la concentración de una solución ASEGURARSE QUE SE UTILIZA LA UNIDAD APROPIADA. PRESTAR ATENCIÓN!: la abreviatura para mol (unidad de __________) es “_____” y la abreviatura para molar (unidad de _____________) es “____”. ¿Por qué necesitamos preparar soluciones con concentraciones específicas de solutos? Cuando preparamos soluciones en el laboratorio, controlar la concentración de los solutos en la solución es un aspecto crítico. Cuando se falla en el control cuidadoso de la concentración de los solutos en la solución puede causar por ejemplo la muerte de células en un cultivo celular o que las mismas crezcan de manera anormal. De igual forma, la concentración inadecuada de los solutos en solución que contienen biomoléculas puede causar que las biomoléculas se desnaturalicen o se agreguen, volviéndolas de esta forma inactivas!!! . Por otro lado, la concentración de los solutos puede asimismo afectar la velocidad y tipos de reacciones químicas que pueden tener lugar en una solución. A. Disolver Solutos en un solvente. Este método se utiliza cuando….. Cloroformo/Alcohol isoamílico 24:1 Calcular la cantidad de cloroformo y alcohol isoamílico que será necesario para preparar una solución final de 350 ml. 1. 0.5 M EDTA PH 8.0 (disódico) Se preparará 1 litro de esta solución. 2. Preparar 160 ml de BrEt (10mg/ml) 3. Un becario desea preparar 80 mL de una solución de 1.0 M de TRIS/HCl PH 7,5 ¿Cúanto TRIS deberá pesar para preparar esta solución? El becario pesó correctamente la cantidad de TRIS, luego lo colocó en un beaker, midió 80 mL de H20 destilada con en un cilindro graduado, adicionó el H2Od al beaker, y luego Cátedra Genética Molecular – Trabajos Prácticos 2015 2 UNIVERSIDAD NACIONAL DE MISIONES Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales “ 2015 - Año del Bicentenario del Congreso de los Pueblos Libres” mezcló bien la solución con la ayuda de un agitador y el “stir bar” o buzo hasta que toda el TRIS se disolvió. ¿Qué fue lo que hizo mal el becario? Si el volumen final de la solución que el preparó fue 95 mL, ¿cuál sería la molaridad real de la solución? 4. SDS 10% p/v (Dodecil Sulfato de Sodio) ¿Qué cantidad de droga deberá pesar para preparar 350 ml? 5. TBE 10X Si para preparar 1 litro de esta solución de Tris, Borato, EDTA necesito disolver 108 g de Tris, 55 g de ácido bórico y 7,44 g de EDTA en 600 ml de agua destilada. Y luego ajustar a volumen y conservar a temperatura ambiente. ¿A qué concentración se deben encontrar cada una de las tres drogas en la solución? 6. SUSTANCIA LIOFILIZADA Se cuenta con 45,2 nm de una sustancia X (liofilizada). Se necesita preparar con ella una solución stock de [100 µM] ¿Qué volumen de agua destilada se deberá agregar al liofilizado? B. Diluir una solución stock existente utilizando la técnica de dilución paralela Cuando se preparan soluciones en normalmente más fácil….. Se desea preparar 50 mL de 0,15 M de Cl2Ca a partir de una solución stock de 2.0 M 7. En ciertas oportunidades puede ser necesario preparar varias soluciones que posean cada una diferentes concentraciones del mismo soluto. Esto es conocido como dilución paralela serial. Calcular la cantidad de KMnO4 de una solución stock al 0,01 M y la cantidad de H2Od necesaria para hacer 10 mL de cada una de las siguientes soluciones. Cátedra Genética Molecular – Trabajos Prácticos 2015 3 UNIVERSIDAD NACIONAL DE MISIONES Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales “ 2015 - Año del Bicentenario del Congreso de los Pueblos Libres” Concentración Diluida Volumen necesario de la solución stock de KMnO4 al 0,01 M Volumen de H2Od requerida 1,0 MKMnO4 0,6 mM KMnO4 0,4 mM KMnO4 0,2 mM KMnO4 100 µM KMnO4 50 µM KMnO4 20 µM KMnO4 C. Diluir una solución stock existente utilizando la técnica de dilución seriada Existen dos situaciones en las que se deben utilizar las diluciones seriadas preferentemente a las diluciones paralelas. 1. Utilizarla cuando se necesitan varias soluciones del mismo soluto y existe un factor de dilución constante. 2. Utilizarla cuando el factor de dilución es tan grande que la cantidad de solución stock necesaria para realizar la dilución en un paso es tan pequeña que es muy difícil medirla adecuadamente. Se tiene una solución stock de 1,6 M de sucrosa y se necesita preparar soluciones con la siguientes concentraciones de sucrosa: 0,4 M, 0,1 M, 25 mM, y 6,25 M ¿Cuál es el factor de dilución para esta serie? Se desea preparar cuatro soluciones mediante una dilución serial. La concentración de la solución stock es de 2,7 M y el factor de dilución es 3. ¿Cuál será la molaridad de las cuatro soluciones? Se tiene una solución stock de 1,0 M de glicina y se necesitan 5 mL de una solución 0,1 m. ¿Cuál será el factor de dilución necesario para diluir la solución stock? ¿Cómo realizar una dilución seriada? Ej. Se tiene una solución stock de ClNa 2 M y se desean preparar 15 mL de cada una de las siguientes concentraciones de ClNa: 0,2 M; 20 mM, 2 mM y 0,2 mM. ¿Cómo prepararían estas diluciones utilizando la técnica de la dilución seriada? Cátedra Genética Molecular – Trabajos Prácticos 2015 4 UNIVERSIDAD NACIONAL DE MISIONES Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales “ 2015 - Año del Bicentenario del Congreso de los Pueblos Libres” 8. PCR Solución Maestra (o Master Mix) Preparar la Master Mix para un volumen final de 25 µl. La solución debe contener 1 mM Cl2Mg, 25 µM de cada dNTP, 1 µM de cada iniciador o primer (dos), 50 mM ClK y 10 mM de Tris/ClH (pH 8). Las concentraciones stock con las que se cuentan son: Cl2Mg 2 M dNTP [200 µM] ClK 1 M Tris/HCl (pH 8) 1 M Primers [10 µM] 9. Es necesario realizar una reacción de amplificación específica. Para ello se requieren preparar 20 µl de primers por cada reacción a una concentración de 10 pmol/µl = 60 ng/µl. ¿Qué volumen de la solución stock del primer “Cbra_F” que posee una concentración de 100 µM necesitará para realizar 8 reacciones de amplificación? ¿Cuál es la concentración de la dilución preparada del primer “Cbra_F”, expresada en µM? 10. ¿Cómo ajustaría UD. el pH a 5.2, de una solución de Acetato de Potasio 2 M? PARTE II: BIOSEGURIDAD 1- Detalle cuáles son los cuidados y normas de bioseguridad (biológica, química y física) que debe reunir un laboratorio con riesgo biológico. 2 - Detalle la bibliografía consultada. Sugerencia: http://www.sigmaaldrich.com/argentina.html Cátedra Genética Molecular – Trabajos Prácticos 2015 5