UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS ESCUELA ACADÉMICO-PROFESIONAL DE MICROBIOLOGÍA Y PARASITOLOGÍA “Carrera acreditada internacionalmente” SYLLABUS SEMESTRE ACADÉMICO: 2014 – II I. DATOS GENERALES 1.1. NOMBRE DEL CURSO 1.2. CÓDIGO DEL CURSO 1.3. CRÉDITOS 1.4. DURACIÓN DEL CURSO 1.5. AÑO DE ESTUDIOS 1.6. NÚMERO DE HORAS 1.7. PRE-REQUISITOS 1.8. HORARIO Y AMBIENTES 1.8.1. TEORÍA 1.8.2. PRÁCTICA : : : : : : : MICROBIOLOGÍA EN SALUD B03147 04 17 semanas X Ciclo (5º Año) 6 horas (2 hrs. de teoría y 4 hrs. de práctica) Bacteriología, Virología, Micología. : : Miércoles 12-14 horas (Pab. Docencia, aula 211) Lunes 14-16 y Miércoles 15-17 horas (Pab. Investigación, Lab. S-1) M.Sc. Ruth García de la Guarda Profesora Principal D.E. Blga. Mónica Huamán Iturrizaga Profesora Auxiliar T. P. Dr. Pablo Ramírez Roca Profesor Principal D. E. Blgo. Fernando de la Cruz Calvo Profesor Auxiliar T. C. Blgo. Óscar Vásquez Macedo Clínica Good Hope - Miraflores Blga. Márllori Vela Pérez Clínica Good Hope – Miraflores Blgo. José Alberto Díaz Tello Magíster en Microbiología - UNMSM Servicio de Microbiología, Hospital Guillermo Almenara Irigoyen Blgo. Hugo Marcial Jove-Químper Biólogo - Microbiólogo Servicio de Microbiología, Hospital Guillermo Almenara Irigoyen Blgo. Carlos Patricio Padilla Rojas Magíster en Bioquímica y Biología Molecular - UPCH Investigador del Laboratorio de Biología Molecular Instituto Nacional de Salud Blgo. Abraham Omar Espinoza Culupú Magíster en Biología Molecular - UNMSM Blga. Ruth Iparraguirre Gerente de la División de Microbiología – GenLab del Perú S.A.C. Blgo. Alfredo Rebaza Caballero M.Sc. (c) Biología Molecular - UNMSM Responsable del Área de Biología Molecular del Laboratorio de Control Ambiental – DIGESA - MINSA Ing. Alimentario Januusz Ruíz del Águila Especialista en ISO17025 – DIGESA - MINSA Blgo. Mblgo. Oscar Ríos Ríos Asesor Técnico de Microbiología. Sección de Diagnóstico. Becton Dickinson. 1.9. PROFESORA RESPONSABLE : PROFESORES COLABORADORES : PROFESORES INVITADOS: II. SUMILLA El curso trata sobre bacterias, hongos y virus de importancia en salud pública. Se examina la función de la microbiota en la salud integral del hospedero, los mecanismos de patogenicidad y regulación de los factores de virulencia a nivel celular y molecular, asimismo los aspectos ecológicos de las enfermedades infecciosas, la influencia del medio ambiente. Se enfatizan los conocimientos sobre los microorganismos de mayor importancia en nuestro país y las medidas básicas de prevención y control que deben aplicarse. III. OBJETIVOS DEL CURSO Al finalizar el curso el estudiante será capaz de: Explicar los mecanismos fundamentales de la patogénesis microbiana a nivel celular y molecular. Relacionar los cambios medioambientales y factores abióticos con la emergencia de las enfermedades infecciosas. Analizar publicaciones científicas en la especialidad. Analizar y discutir estrategias para la prevención y control de las principales enfermedades infecciosas de nuestro país. Preparar propuestas de investigación sobre temas de enfermedades infecciosas. IV. EVALUACIÓN Se tomarán dos exámenes teóricos y prácticos parciales cancelatorios para evaluar la capacidad de comprensión y de análisis del alumno. La habilidad para interpretar artículos científicos y la actitud crítica se evaluarán durante las discusiones grupales, seminarios y exposiciones de los trabajos de revisión. Sólo se podrá sustituir un examen teórico. No habrá examen de práctica sustitutorio. Primer examen teórico y práctico : Miércoles 15 de Octubre (12-14 horas, aula 211) Segundo examen teórico y práctico: Miércoles 3 de Diciembre (12-14 horas, aula 211) Examen sustitutorio: Miércoles 10 de Diciembre (12-14 horas, aula 211) El promedio final se obtendrá aplicando la siguiente ponderación: -Promedio de los exámenes teóricos 45% -Promedio de discusiones grupales, seminarios y trabajos de revisión 5% -Promedio de los exámenes prácticos 40% -Promedio de los pasos de práctica y de la actitud durante las prácticas de laboratorio 5% -Participación y actitud durante las conferencias y prácticas extramurales 5% La asistencia es OBLIGATORIA. El alumno con 30% de inasistencias no tendrá derecho a evaluación final de acuerdo con las disposiciones vigentes de la UNMSM. V. METODOLOGÍA Para el desarrollo del curso se emplearán exposiciones teóricas, clases prácticas de laboratorio, conferencias, análisis y discusión grupal de temas de interés mediante seminarios, trabajos de revisión, así como las prácticas extramurales en instituciones en las que se haga trabajo profesional con microorganismos de importancia en salud pública. VI. PROGRAMACIÓN CALENDARIZACIÓN POR SEMANAS DE LAS CLASES TEÓRICAS SEMANA 1 2 3 4 5 6 7 8 9 DESCRIPCIÓN T1 T2 PROFESOR(A) Flora microbiana normal en el animal hospedero. Principios de la patogénesis microbiana. Patogenicidad, virulencia. Postulados de Koch moleculares. Atributos de los patógenos. Rol del hierro en la patogénesis microbiana. Entrada de patógenos al hospedador. Colonización. Adhesinas y adherencia. Formación de biopelículas y “Quorum sensing”. Diseminación a partir del sitio inicial de infección. Principios generales de invasión. Métodos para medir la invasión. Estrategias de supervivencia intracelular. Variación antigénica. Bases de datos de patógenos. Rutas metabólicas. Interacciones moleculares con el hospedero. Mecanismos moleculares de resistencia a antimicrobianos en bacterias. Determinación fenotípica de la resistencia a antimicrobianos en el laboratorio clínico. PRIMER EXAMEN Avances tecnológicos en el área de microbiología clínica Fundamentos de los métodos moleculares para el diagnóstico y tipificación de microorganismos patógenos. Ruth García Ruth García T14 T15 Toxinas microbianas. Mecanismos de acción. Enfermedades infecciosas emergentes y re-emergentes. Bioterrorismo. Microorganismos, prevención, control. Pablo Ramírez, R. García Ruth García T16 C3 Infecciones Intrahospitalarias: Prevención, control e investigación. Mónica Huamán, R. García Últimos avances en el diagnóstico micológico en el laboratorio clínico José Alberto Díaz Tello, R. García y micosis oportunistas emergentes. T3 T4 T5 T6 T7 T8 C1 T9-T10 T11-T12 C2 T13 10 11 Ruth García Ruth García Ruth García Ruth García Ruth García Ruth García Abraham O. Espinoza, R. García Ruth García Mónica Huamán, R. García Ruth García, Mónica Huamán Ruth Iparraguirre, R. García Pablo Ramírez, R. García 12 Determinación de la susceptibilidad a agentes antifúngicos. C4 C5 Hugo Marcial Jove-Químper, R. García Resistencia a antimicrobianos por Mycobacterium tuberculosis. Oscar Ríos Ríos, R. García Farmacocinética y farmacodinámica: conceptos básicos. 13 C6 T17 14 15 16 17 T18 Exposiciones de los trabajos de revisión sobre epidemiología de algunas enfermedades infecciosas en el Perú. Control de calidad en el laboratorio: Alcances de la norma ISO 17025 aplicada a los laboratorios de ensayo. Microorganismos viables no cultivables en el ambiente. Importancia en salud pública. Efecto del cambio climático global y del Fenómeno de El Niño en la salud pública. 1) Epidemiología de TBC MDR y XDR en el Perú: situación actual, medidas de prevención y control. 2) Enfermedades metaxénicas en el Perú: situación actual, medidas de prevención y control. 3) Infecciones de transmisión sexual en el Perú: situación actual, medidas de prevención y control. 4) IRAs (infecciones respiratorias agudas) en el Perú: situación actual, medidas de prevención y control. 5) EDAs (enfermedades diarréicas agudas) en el Perú: situación actual, medidas de prevención y control. SEGUNDO EXAMEN EXAMEN SUSTITUTORIO Januusz Ruíz del Águila, R. García Ruth García Ruth García Ruth García, Mónica Huamán Ruth García, Mónica Huamán Ruth García, Mónica Huamán CALENDARIZACIÓN POR SEMANAS DE LAS CLASES PRÁCTICAS SEMANA 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 DESCRIPCIÓN P1 Coordinación de las prácticas del curso. Medidas de bioseguridad. P2 P3P4 P5 PROFESOR(A) / ASISTENTE R. García, M. Huamán Discusión grupal: Video sobre Diagnóstico microbiológico de la TBC. Seminarios: Toma de distintos tipos de muestras clínicas, transporte, rechazo de muestras, informe de laboratorio. Estudio de la resistencia a antimicrobianos: antibiograma (Kirby-Bauer), Concentración Mínima Inhibitoria (MIC), Fundamentos. Siembra. P6 Estudio de la resistencia a antimicrobianos: Lectura e interpretación de resultados. P7 Estudio de la resistencia a antimicrobianos: β-Lactamasas de Espectro Extendido (BLEE), metalo-BLEE, AMPCS. Fundamentos. Siembra. P8 Estudio de la resistencia a antimicrobianos: Lectura e interpretación de resultados. P9- Seminarios: Análisis de artículos científicos sobre resistencia a P10 antimicrobianos. P11 Urocultivo: Examen macroscópico, microscópico y siembra. R. García, M. Huamán R. García, M. Huamán P12 Urocultivo: Recuento y selección de colonias. Siembra en cepario. P13 Urocultivo: Siembra en batería de identificación bioquímica. Antibiograma. P14 Urocultivo: Identificación del patógeno y susceptibilidad a drogas. Lectura e interpretación. PRIMER EXAMEN P15 Amplificación de una secuencia génica por PCR en tiempo real (qPCR): Aplicación a la identificación bacteriana. M. Huamán, R. García M. Huamán, R. García R. García, M. Huamán R. García, M. Huamán M. Huamán, R. García M. Huamán, R. García R. García, M. Huamán M. Huamán, R. García M. Huamán, R. García R. García, M. Huamán Alfredo Rebaza, F. De la Cruz, R. García, M. Huamán P16 Práctica extramural – Servicio de Microbiología del Instituto Nacional Mónica Huamán, R. García Materno Perinatal (INMP): Gestión del laboratorio clínico por el profesional Biólogo-Microbiólogo-Parasitólogo. P17 Práctica extramural – Servicio de Microbiología del Hospital Guillermo José Alberto Díaz Tello, R. Almenara: Aislamiento primario de bacterias por el sistema BACTEC y García, M. Huamán VERSATREK. Identificación y Susceptibilidad Antimicrobiana por el Sistema MicroScam. P18 Práctica extramural – Servicio de Microbiología del Hospital Guillermo Hugo Marcial Jove-Químper, R. Almenara: Susceptibilidad a antifúngicos en el sistema automatizado García, M. Huamán VITEK 2. Pruebas in vitro para Candida con discos de voriconazol y fluconazol. Desarrollo de flujogramas de sensibilidad a antifúngicos por microdilución M27-a3 CLSI y EUCAST. P19 Coprocultivo: Examen macroscópico, microscópico, siembra directa y R. García, M. Huamán enriquecimiento selectivo. P20 Coprocultivo: Selección de colonias. Siembra en cepario. R. García, M. Huamán P21 Coprocultivo: Siembra en batería de identificación bioquímica. R. García, M. Huamán Antibiograma. P22 Coprocultivo: Identificación del patógeno y susceptibilidad a drogas. Lectura e interpretación. P23 Cultivo de secreción de heridas y abscesos, secreción faríngea y líquidos especiales: Examen microscópico y siembra. P24 Cultivo de secreción de heridas y abscesos, secreción faríngea y líquidos especiales: Selección de colonias y siembra en cepario. P25 Cultivo de secreción de heridas y abscesos, secreción faríngea y líquidos especiales: Siembra en batería de identificación bioquímica. Antibiograma. P26 Cultivo de secreción de heridas y abscesos, secreción faríngea y líquidos especiales: Identificación del patógeno y susceptibilidad a drogas. Lectura e interpretación. R. García, M. Huamán R. García, M. Huamán R. García, M. Huamán R. García, M. Huamán R. García, M. Huamán SEMANA 15 16 17 DESCRIPCIÓN P27 Práctica extramural – Laboratorio de Biología Molecular del Instituto Nacional de Salud: “Organización de un Laboratorio de Biología Molecular para el diagnóstico e investigación de enfermedades infecciosas”. P28 Práctica extramural – Laboratorio Clínico de la Clínica Good Hope Miraflores: “Organización y demostración de de las diferentes áreas de un laboratorio clínico de calidad”. SEGUNDO EXAMEN EXAMEN SUSTITUTORIO PROFESOR(A) Carlos Padilla, R. García, M. Huamán Óscar Vásquez, Márllori Vela, R. García, M. Huamán R. García, M. Huamán R. García, M. Huamán VII. BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA TEXTOS: AUSINA RUIZ, V., MORENO GUILLÉN S. 2006. Tratado SEIMC de Enfermedades Infecciosas y Microbiología Clínica. Editorial Médica Panamericana, S. A. Madrid, España, 1595pp. BAUMAN R. 2007. Microbiology with disesases by taxonomy. 2nd Edition. Pearson Education, Inc. USA. 778pp. FORBES B. A., SAHM D. F., WEISSFELD A. S. 2007. Bailey & Scott Diagnóstico Microbiológico. 12ª Edición. Editorial Médica Panamericana. Buenos Aires, Argentina. 1026pp. GONZÁLES DE BUITRAGO, J.M. 2010. Técnicas y Métodos de Laboratorio Clínico. 3ª Edición. Elsevier Masson, Barcelona, España. 548pp. HARVEY R. A., CHAMPE P. C., FISHER B. D. 2008. Microbiología. 2a Edición. Wolters Kluwer Health España S. A. 438pp. HOLT, J. G. (Editor Jefe). 1994. Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. 9ª Edición. Williams and Wilkins, Baltimore, U.S.A. LEVINSON W. 2006. Microbiología e Inmunología Médicas. 8ª Edición. McGRAW-HILL - INTERAMERICANA DE ESPAÑA, S.A.U. 662pp. MAC FADDIN, J. 2003. Pruebas bioquímicas para la identificación de bacterias de importancia clínica. 3ª Edición, Editorial Médica Panamericana, S.A. Madrid, España, 850pp. MADIGAN M.T., MARTINKO J.M., STAHL D.A., CLARK D.P. 2012. Brock Biology of Microorganisms. 13th Ed. Pearson Education, Inc. USA. 1043pp. NESTER E.W., ANDERSON D.G., EVANS ROBERTS C. Jr., PEARSALL N.N., NESTER M.T. 2004. Microbiology. A Human Perspective. 4th Ed. McGraw-Hill Companies, Inc. USA. 817pp. PRATS G. 2008. Microbiología Clínica. Editorial Médica Panamericana, S. A. Madrid, España, 366pp. STRASINGER S.K., DI LORENZO M. S. 2010. Análisis de orina y de los líquidos corporals. 5ª Edición. Editorial Médica Panamericana. Buenos Aires, Argentina. 299pp. WILSON B. A., SALYERS A. A., WHITT D. D., WINKLER M. E. 2011. Bacterial Pathogenesis. A Molecular Approach. 3th Ed. ASM Press, Washington DC, USA. 526 pp. WIN W.C., ALLEN S.D., JANDA W.M., KONEMAN E.W., PROCOP G.W., SCHRECKENBERGER P.C., WOODS G.L. 2008. Koneman Diagnóstico Microbiológico: Texto y atlas en color. 6ª Edición. Editorial Médica Panamericana. Buenos Aires, Argentina. 1475pp. ALGUNAS REVISTAS ESPECIALIZADAS Anales de la Facultad de Medicina Revista Peruana de Medicina Experimental Antimicrobial agents and chemotherapy Boletín de la Sociedad Española de Microbiología Clinical Microbiology Review Emerging Infectious Diseases Infection and Immunity Journal of Clinical Microbiology Journal of Infectious Diseases Microbiology and Molecular Biology Reviews Micrbiological Review Revista Latinoamericana de Microbiología Revista Panamericana de Salud Pública ALGUNOS SITIOS WEB DE INTERÉS http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/ www.cdc.gov/ www.who.int/ www.microbelibrary.org/ http://www.asm.org/ http://journal.paho.org/