2014-II Microbiología en Salud - Facultad de Ciencias Biológicas

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UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS
FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS
ESCUELA ACADÉMICO-PROFESIONAL DE MICROBIOLOGÍA Y PARASITOLOGÍA
“Carrera acreditada internacionalmente”
SYLLABUS
SEMESTRE ACADÉMICO: 2014 – II
I. DATOS GENERALES
1.1. NOMBRE DEL CURSO
1.2. CÓDIGO DEL CURSO
1.3. CRÉDITOS
1.4. DURACIÓN DEL CURSO
1.5. AÑO DE ESTUDIOS
1.6. NÚMERO DE HORAS
1.7. PRE-REQUISITOS
1.8. HORARIO Y AMBIENTES
1.8.1. TEORÍA
1.8.2. PRÁCTICA
:
:
:
:
:
:
:
MICROBIOLOGÍA EN SALUD
B03147
04
17 semanas
X Ciclo (5º Año)
6 horas (2 hrs. de teoría y 4 hrs. de práctica)
Bacteriología, Virología, Micología.
:
:
Miércoles 12-14 horas (Pab. Docencia, aula 211)
Lunes 14-16 y Miércoles 15-17 horas
(Pab. Investigación, Lab. S-1)
M.Sc. Ruth García de la Guarda
Profesora Principal D.E.
Blga. Mónica Huamán Iturrizaga
Profesora Auxiliar T. P.
Dr. Pablo Ramírez Roca
Profesor Principal D. E.
Blgo. Fernando de la Cruz Calvo
Profesor Auxiliar T. C.
Blgo. Óscar Vásquez Macedo
Clínica Good Hope - Miraflores
Blga. Márllori Vela Pérez
Clínica Good Hope – Miraflores
Blgo. José Alberto Díaz Tello
Magíster en Microbiología - UNMSM
Servicio de Microbiología, Hospital Guillermo Almenara Irigoyen
Blgo. Hugo Marcial Jove-Químper
Biólogo - Microbiólogo
Servicio de Microbiología, Hospital Guillermo Almenara Irigoyen
Blgo. Carlos Patricio Padilla Rojas
Magíster en Bioquímica y Biología Molecular - UPCH
Investigador del Laboratorio de Biología Molecular
Instituto Nacional de Salud
Blgo. Abraham Omar Espinoza Culupú
Magíster en Biología Molecular - UNMSM
Blga. Ruth Iparraguirre
Gerente de la División de Microbiología – GenLab del Perú S.A.C.
Blgo. Alfredo Rebaza Caballero
M.Sc. (c) Biología Molecular - UNMSM
Responsable del Área de Biología Molecular del Laboratorio de Control
Ambiental – DIGESA - MINSA
Ing. Alimentario Januusz Ruíz del Águila
Especialista en ISO17025 – DIGESA - MINSA
Blgo. Mblgo. Oscar Ríos Ríos
Asesor Técnico de Microbiología. Sección de Diagnóstico. Becton Dickinson.
1.9. PROFESORA RESPONSABLE :
PROFESORES COLABORADORES :
PROFESORES INVITADOS:
II. SUMILLA
El curso trata sobre bacterias, hongos y virus de importancia en salud pública. Se examina la función de
la microbiota en la salud integral del hospedero, los mecanismos de patogenicidad y regulación de los
factores de virulencia a nivel celular y molecular, asimismo los aspectos ecológicos de las enfermedades
infecciosas, la influencia del medio ambiente. Se enfatizan los conocimientos sobre los microorganismos
de mayor importancia en nuestro país y las medidas básicas de prevención y control que deben aplicarse.
III. OBJETIVOS DEL CURSO
Al finalizar el curso el estudiante será capaz de:
 Explicar los mecanismos fundamentales de la patogénesis microbiana a nivel celular y molecular.
 Relacionar los cambios medioambientales y factores abióticos con la emergencia de las enfermedades
infecciosas.
 Analizar publicaciones científicas en la especialidad.
 Analizar y discutir estrategias para la prevención y control de las principales enfermedades infecciosas
de nuestro país.
 Preparar propuestas de investigación sobre temas de enfermedades infecciosas.
IV. EVALUACIÓN
 Se tomarán dos exámenes teóricos y prácticos parciales cancelatorios para evaluar la capacidad de
comprensión y de análisis del alumno. La habilidad para interpretar artículos científicos y la actitud
crítica se evaluarán durante las discusiones grupales, seminarios y exposiciones de los trabajos de
revisión.
 Sólo se podrá sustituir un examen teórico. No habrá examen de práctica sustitutorio.
 Primer examen teórico y práctico :
Miércoles 15 de Octubre (12-14 horas, aula 211)
 Segundo examen teórico y práctico:
Miércoles 3 de Diciembre (12-14 horas, aula 211)
 Examen sustitutorio:
Miércoles 10 de Diciembre (12-14 horas, aula 211)
 El promedio final se obtendrá aplicando la siguiente ponderación:
-Promedio de los exámenes teóricos
45%
-Promedio de discusiones grupales, seminarios y trabajos de revisión
5%
-Promedio de los exámenes prácticos
40%
-Promedio de los pasos de práctica y de la actitud durante las prácticas de laboratorio
5%
-Participación y actitud durante las conferencias y prácticas extramurales
5%
 La asistencia es OBLIGATORIA. El alumno con 30% de inasistencias no tendrá derecho a evaluación
final de acuerdo con las disposiciones vigentes de la UNMSM.
V. METODOLOGÍA
Para el desarrollo del curso se emplearán exposiciones teóricas, clases prácticas de laboratorio, conferencias,
análisis y discusión grupal de temas de interés mediante seminarios, trabajos de revisión, así como las
prácticas extramurales en instituciones en las que se haga trabajo profesional con microorganismos de
importancia en salud pública.
VI. PROGRAMACIÓN
CALENDARIZACIÓN POR SEMANAS DE LAS CLASES TEÓRICAS
SEMANA
1
2
3
4
5
6
7
8
9
DESCRIPCIÓN
T1
T2
PROFESOR(A)
Flora microbiana normal en el animal hospedero.
Principios de la patogénesis microbiana. Patogenicidad, virulencia.
Postulados de Koch moleculares. Atributos de los patógenos.
Rol del hierro en la patogénesis microbiana.
Entrada de patógenos al hospedador. Colonización. Adhesinas y
adherencia.
Formación de biopelículas y “Quorum sensing”.
Diseminación a partir del sitio inicial de infección. Principios
generales de invasión. Métodos para medir la invasión.
Estrategias de supervivencia intracelular.
Variación antigénica.
Bases de datos de patógenos. Rutas metabólicas. Interacciones
moleculares con el hospedero.
Mecanismos moleculares de resistencia a antimicrobianos en bacterias.
Determinación fenotípica de la resistencia a antimicrobianos en el
laboratorio clínico.
PRIMER EXAMEN
Avances tecnológicos en el área de microbiología clínica
Fundamentos de los métodos moleculares para el diagnóstico y
tipificación de microorganismos patógenos.
Ruth García
Ruth García
T14
T15
Toxinas microbianas. Mecanismos de acción.
Enfermedades infecciosas emergentes y re-emergentes.
Bioterrorismo. Microorganismos, prevención, control.
Pablo Ramírez, R. García
Ruth García
T16
C3
Infecciones Intrahospitalarias: Prevención, control e investigación.
Mónica Huamán, R. García
Últimos avances en el diagnóstico micológico en el laboratorio clínico José Alberto Díaz Tello, R. García
y micosis oportunistas emergentes.
T3
T4
T5
T6
T7
T8
C1
T9-T10
T11-T12
C2
T13
10
11
Ruth García
Ruth García
Ruth García
Ruth García
Ruth García
Ruth García
Abraham O. Espinoza, R. García
Ruth García
Mónica Huamán, R. García
Ruth García, Mónica Huamán
Ruth Iparraguirre, R. García
Pablo Ramírez, R. García
12
Determinación de la susceptibilidad a agentes antifúngicos.
C4
C5
Hugo Marcial Jove-Químper, R.
García
Resistencia a antimicrobianos por Mycobacterium tuberculosis. Oscar Ríos Ríos, R. García
Farmacocinética y farmacodinámica: conceptos básicos.
13
C6
T17
14
15
16
17
T18
Exposiciones
de los trabajos
de revisión
sobre
epidemiología
de algunas
enfermedades
infecciosas en
el Perú.
Control de calidad en el laboratorio: Alcances de la norma ISO 17025
aplicada a los laboratorios de ensayo.
Microorganismos viables no cultivables en el ambiente. Importancia
en salud pública.
Efecto del cambio climático global y del Fenómeno de El Niño en la
salud pública.
1) Epidemiología de TBC MDR y XDR en el Perú: situación actual,
medidas de prevención y control.
2) Enfermedades metaxénicas en el Perú: situación actual, medidas de
prevención y control.
3) Infecciones de transmisión sexual en el Perú: situación actual,
medidas de prevención y control.
4) IRAs (infecciones respiratorias agudas) en el Perú: situación actual,
medidas de prevención y control.
5) EDAs (enfermedades diarréicas agudas) en el Perú: situación actual,
medidas de prevención y control.
SEGUNDO EXAMEN
EXAMEN SUSTITUTORIO
Januusz Ruíz del Águila, R. García
Ruth García
Ruth García
Ruth García, Mónica Huamán
Ruth García, Mónica Huamán
Ruth García, Mónica Huamán
CALENDARIZACIÓN POR SEMANAS DE LAS CLASES PRÁCTICAS
SEMANA
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
DESCRIPCIÓN
P1
Coordinación de las prácticas del curso. Medidas de bioseguridad.
P2
P3P4
P5
PROFESOR(A) /
ASISTENTE
R. García, M. Huamán
Discusión grupal: Video sobre Diagnóstico microbiológico de la TBC.
Seminarios: Toma de distintos tipos de muestras clínicas, transporte,
rechazo de muestras, informe de laboratorio.
Estudio de la resistencia a antimicrobianos: antibiograma (Kirby-Bauer),
Concentración Mínima Inhibitoria (MIC), Fundamentos. Siembra.
P6 Estudio de la resistencia a antimicrobianos: Lectura e interpretación de
resultados.
P7 Estudio de la resistencia a antimicrobianos: β-Lactamasas de Espectro
Extendido (BLEE), metalo-BLEE, AMPCS. Fundamentos. Siembra.
P8 Estudio de la resistencia a antimicrobianos: Lectura e interpretación de
resultados.
P9- Seminarios: Análisis de artículos científicos sobre resistencia a
P10 antimicrobianos.
P11 Urocultivo: Examen macroscópico, microscópico y siembra.
R. García, M. Huamán
R. García, M. Huamán
P12 Urocultivo: Recuento y selección de colonias. Siembra en cepario.
P13 Urocultivo: Siembra en batería de identificación bioquímica.
Antibiograma.
P14 Urocultivo: Identificación del patógeno y susceptibilidad a drogas.
Lectura e interpretación.
PRIMER EXAMEN
P15 Amplificación de una secuencia génica por PCR en tiempo real (qPCR):
Aplicación a la identificación bacteriana.
M. Huamán, R. García
M. Huamán, R. García
R. García, M. Huamán
R. García, M. Huamán
M. Huamán, R. García
M. Huamán, R. García
R. García, M. Huamán
M. Huamán, R. García
M. Huamán, R. García
R. García, M. Huamán
Alfredo Rebaza, F. De la Cruz,
R. García, M. Huamán
P16 Práctica extramural – Servicio de Microbiología del Instituto Nacional Mónica Huamán, R. García
Materno Perinatal (INMP): Gestión del laboratorio clínico por el
profesional Biólogo-Microbiólogo-Parasitólogo.
P17 Práctica extramural – Servicio de Microbiología del Hospital Guillermo José Alberto Díaz Tello, R.
Almenara: Aislamiento primario de bacterias por el sistema BACTEC y García, M. Huamán
VERSATREK. Identificación y Susceptibilidad Antimicrobiana por el
Sistema MicroScam.
P18 Práctica extramural – Servicio de Microbiología del Hospital Guillermo Hugo Marcial Jove-Químper, R.
Almenara: Susceptibilidad a antifúngicos en el sistema automatizado García, M. Huamán
VITEK 2. Pruebas in vitro para Candida con discos de voriconazol y
fluconazol. Desarrollo de flujogramas de sensibilidad a antifúngicos por
microdilución M27-a3 CLSI y EUCAST.
P19 Coprocultivo: Examen macroscópico, microscópico, siembra directa y R. García, M. Huamán
enriquecimiento selectivo.
P20 Coprocultivo: Selección de colonias. Siembra en cepario.
R. García, M. Huamán
P21 Coprocultivo: Siembra en batería de identificación bioquímica. R. García, M. Huamán
Antibiograma.
P22 Coprocultivo: Identificación del patógeno y susceptibilidad a drogas.
Lectura e interpretación.
P23 Cultivo de secreción de heridas y abscesos, secreción faríngea y líquidos
especiales: Examen microscópico y siembra.
P24 Cultivo de secreción de heridas y abscesos, secreción faríngea y líquidos
especiales: Selección de colonias y siembra en cepario.
P25 Cultivo de secreción de heridas y abscesos, secreción faríngea y líquidos
especiales: Siembra en batería de identificación bioquímica.
Antibiograma.
P26 Cultivo de secreción de heridas y abscesos, secreción faríngea y líquidos
especiales: Identificación del patógeno y susceptibilidad a drogas.
Lectura e interpretación.
R. García, M. Huamán
R. García, M. Huamán
R. García, M. Huamán
R. García, M. Huamán
R. García, M. Huamán
SEMANA
15
16
17
DESCRIPCIÓN
P27 Práctica extramural – Laboratorio de Biología Molecular del Instituto
Nacional de Salud: “Organización de un Laboratorio de Biología
Molecular para el diagnóstico e investigación de enfermedades
infecciosas”.
P28 Práctica extramural – Laboratorio Clínico de la Clínica Good Hope
Miraflores: “Organización y demostración de de las diferentes áreas de
un laboratorio clínico de calidad”.
SEGUNDO EXAMEN
EXAMEN SUSTITUTORIO
PROFESOR(A)
Carlos Padilla, R. García, M.
Huamán
Óscar Vásquez, Márllori Vela, R.
García, M. Huamán
R. García, M. Huamán
R. García, M. Huamán
VII. BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA
TEXTOS:
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AUSINA RUIZ, V., MORENO GUILLÉN S. 2006. Tratado SEIMC de Enfermedades Infecciosas y Microbiología
Clínica. Editorial Médica Panamericana, S. A. Madrid, España, 1595pp.
BAUMAN R. 2007. Microbiology with disesases by taxonomy. 2nd Edition. Pearson Education, Inc. USA. 778pp.
FORBES B. A., SAHM D. F., WEISSFELD A. S. 2007. Bailey & Scott Diagnóstico Microbiológico. 12ª Edición.
Editorial Médica Panamericana. Buenos Aires, Argentina. 1026pp.
GONZÁLES DE BUITRAGO, J.M. 2010. Técnicas y Métodos de Laboratorio Clínico. 3ª Edición. Elsevier Masson,
Barcelona, España. 548pp.
HARVEY R. A., CHAMPE P. C., FISHER B. D. 2008. Microbiología. 2a Edición. Wolters Kluwer Health España S.
A. 438pp.
HOLT, J. G. (Editor Jefe). 1994. Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology. 9ª Edición. Williams and Wilkins,
Baltimore, U.S.A.
LEVINSON W. 2006. Microbiología e Inmunología Médicas. 8ª Edición. McGRAW-HILL - INTERAMERICANA
DE ESPAÑA, S.A.U. 662pp.
MAC FADDIN, J. 2003. Pruebas bioquímicas para la identificación de bacterias de importancia clínica. 3ª Edición,
Editorial Médica Panamericana, S.A. Madrid, España, 850pp.
MADIGAN M.T., MARTINKO J.M., STAHL D.A., CLARK D.P. 2012. Brock Biology of Microorganisms. 13th Ed.
Pearson Education, Inc. USA. 1043pp.
NESTER E.W., ANDERSON D.G., EVANS ROBERTS C. Jr., PEARSALL N.N., NESTER M.T. 2004.
Microbiology. A Human Perspective. 4th Ed. McGraw-Hill Companies, Inc. USA. 817pp.
PRATS G. 2008. Microbiología Clínica. Editorial Médica Panamericana, S. A. Madrid, España, 366pp.
STRASINGER S.K., DI LORENZO M. S. 2010. Análisis de orina y de los líquidos corporals. 5ª Edición. Editorial
Médica Panamericana. Buenos Aires, Argentina. 299pp.
WILSON B. A., SALYERS A. A., WHITT D. D., WINKLER M. E. 2011. Bacterial Pathogenesis. A Molecular
Approach. 3th Ed. ASM Press, Washington DC, USA. 526 pp.
WIN W.C., ALLEN S.D., JANDA W.M., KONEMAN E.W., PROCOP G.W., SCHRECKENBERGER P.C., WOODS
G.L. 2008. Koneman Diagnóstico Microbiológico: Texto y atlas en color. 6ª Edición. Editorial Médica Panamericana.
Buenos Aires, Argentina. 1475pp.
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