Cursos y Tópicos Semestre 2015-2

Cursos y Tópicos
Semestre 2015-2
1. Título del curso o tópico
Genes reporteros para el estudio de los programas de desarrollo de plantas
2. Tutor responsable
Nombre del Tutor:
GUEVARA GARCÍA ANGEL ARTURO
Entidad:
Instituto de Biotecnología
Teléfono:
56 22 77 77 ext 38271
Correo electrónico :
[email protected]
3. Profesores invitados
Jesús Salvador Lopez Bucio (coordinador)
Elizabeth Cordoba Martínez
Luis Cardenas Torres
4. Observaciones del Coordinador del curso o tópico
El coordinador del topico impartirá el 30 % de los temas y se encargará de invitar a los profesores expertos que
elegirán y coordinaran la discusión de artículos para cada clase, finalmente el coordinador aplicará los examenes
correspondientes a cada tema con preguntas redactadas por cada expositor y evaluará el desempeño final de los
participantes del curso.
5. Características para impartir el curso o tópico
Lugar en donde se realizará el tópico:
Instituto de Biotecnología
Horario en que se realizará el tópico:
Martes y Jueves, 9:00-12:00
Número de sesiones:
13
Máximo de alumnos que puede aceptar:
8
6. Métodos de evaluación
Porcentaje Cantidad
Examen
50 %
6
Participación en clase (discusión de artículos) 50 %
7. Introducción / justificación del curso o tópico
En el departamento de biología molecular de plantas se lleva a cabo el estudio de las bases moleculares y
celulares implicadas en el desarrollo de las plantas, así como el comportamiento y sus respuestas ante diversos
estímulos bioticos y abioticos, durante estos procesos se han descrito diversos genes que actúan como reguladores
maestros de desarrollo y cuya expresión espacio temporal se encuentra regulada por los diversos factores a los que
las plantas están expuestas, el uso de genes reporteros como fusiones transcipcionales o postraduccionales es y
seguirá siendo una herramienta muy útil para los estudiantes del departamento de biología molecular de plantas
interesados en elucidar la participación de genes, proteínas o estímulos involucrados en los diferente procesos de
desarrollo de las plantas.
8. Objetivos
Revisar la literatura básica y reciente referente a las diferentes sistemas reporteros usadas para el estudio de los
programas de desarrollo de plantas, haciendo énfasis en sus aplicaciones y limitaciones.
Revisar la literatura referente a las líneas reporteras más utilizadas para el estudio de los programas de desarrollo de
la planta.
9. Temario del curso o tópico
Genes reporteros en el desarrollo de la planta.
1.- Introducción a los genes reporteros. (2 sesiones)
1.1.-El sistema reportero de ß-glucuronidasa
1.1.1.- Análisis cuantitativos
1.1.1.1.- Método espectrofotométrico.
1.1.1.2.- Método fluorométrico.
1.1.2.- Análisis cualitativos
1.1.2.1.- Actividad Histoquimica.
1.1.2.2.- Fijación y clareo de muestras
1.1.4.3.- Análisis por Microcopia de transmisión
1.2.- Sistema reportero con proteínas fluorescentes.
1.2.1.- GFP, YFP, Cherri, Cian.
1.2.2.- Energías de absorción emisión.
1.2.3.- Estrategias de co-localización.
1.2.4.- Microscopia de epiflourescencia y confocal.
1.3.- El sistema reportero de luciferasa.
1.3.1.- Aplicaciones
1.3.2.- Análisis de actividad
1.4.- Sensores de calcio, ROS y fitohormonas.
2.- Generación de líneas reporteras. (2 sesiones)
2.1.- Fusiones transcripcionales.
2.1.1.- Identificación in silico de regiones promotoras.
2.1.2.- Sistemas de clonación y construcción de vectores binarios. para el estudio de promotores.
2.2.- Fusiones traduccionales.
2.2.1.- Localización subcelular de proteínas.
2.2.2.- Identificación de Interacciones.
2.2.2.1.- Complementación Bimolecular de Fluorescencia.
2.3.- Análisis de Expresión.
2.3.1.- Sistemas de Expresión transitoria.
2.3.1.1.- Obtención y Transfección de protoplastos
2.3.1.2.- Infiltración en Nicotiana Benthamiana.
2.3.2.- Sistemas de Expresión Estable.
2.3.2.1.- Generación de plantas transgénicas de Arabidopsis thaliana.
3.- Genes reporteros durante la embriogénesis. (2 sesiones)
3.1.- Lineas marcadoras reporteras para el estudio de la embriogénesis.
3.1.2.- Ejemplos del uso de genes reporteros para el estudio de la embriogénesis.
4.- Genes reporteros durante la germinación y el establecimiento de la plántula. (3 sesiones)
4.1.- Lineas marcadoras reporteras para el estudio de la germinación.
4.1.1.-Ejemplos del uso de genes reporteros para el estudio de la germinación.
4.2.- Lineas marcadoras reporteras para el estudio del desarrollo de la raíz.
4.2.1.-Ejemplos del uso de genes reporteros para el estudio del desarrollo de la raíz.
4.3.- Lineas marcadoras reporteras para el estudio del meristemo apical.
4.3.1.-Ejemplos del uso de genes reporteros para el estudio del meristemo apical.
4.4.- Lineas marcadoras reporteras para el estudio del desarrollo de hojas.
4.4.1.-Ejemplos del uso de genes reporteros para el estudio del desarrollo de hojas.
5.- Genes reporteros durante la floración. (1 sesión)
5.1.- Lineas marcadoras reporteras para el estudio de la floración.
5.1.1.- Ejemplos del uso de genes reporteros para el estudio de la floración.
6.- Genes reporteros durante la senescencia. (1 sesión)
6.1.- Lineas marcadoras reporteras para el estudio de la senescencia.
6.1.1.- Ejemplos del uso de genes reporteros para el estudio de la senescencia.
7.- Genes reporteros y fitohormonas. (2 sesiones)
10. Bibliografía
Breuninger H, Rikirsch E, Hermann M, Ueda M, Laux T. (2008). Differential expression of WOX genes mediates
apical-basal axis formation in the Arabidopsis embryo. Developmental Cell 14:867-876.
Chudakov DM, Matz MV, Lukyanov S, Lukyanov K. (2010). Fluorescent proteins and their applications in imaging
living cells and tissues. Physiol Rev. 90:1103-1163.
Gallagher SR. (1992). GUS Protocols, Using the GUS gene as a reporter of gene expression. Academic press, INC.
Long JA, and Barton MK. (1998). The development of apical embryonic pattern in Arabidopsis. Development 125:30273035.
Okumoto S, Jones A, Frommer WB. (2012). Quantitative imaging with fluorescent biosensors. Annu. Rev. Plant Biol.
63:663-706.
Se incluirán otros artículos novedosos y revisiones referentes a cada tema como punto de partida.
Adicionalmente, cada profesor invitado elegirá artículos para discusión.
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