LA GRID

Comunidad GRID y
Supercómputo
Coordinador Luis A. Trejo
[email protected]
Abril 2008
Comunidad GRID y
Supercómputo
Objetivos de la Comunidad
•Objetivos
•Miembros
•Acciones
•Aplicaciones
Objetivos de la Comunidad
El grupo de Grid y Supercómputo tiene como
objetivo fomentar la colaboración, el intercambio
de información y el desarrollo de proyectos
conjuntos entre las instituciones miembros de
CUDI, sustentados en una plataforma nacional
b
basada
d en ttecnología
l í GRID y cómputo
ó
t de
d alto
lt
desempeño, utilizando a su vez la red Internet 2
para el apoyo del desarrollo de la e-ciencia
e ciencia en
México.
Miembros de la Comunidad
Cerca de 500 miembros registrados
g
en el
portal de CUDI
Grupo de trabajo de aproximadamente
30 integrantes de más de 10
instituciones de educación superior del
país.
Acciones:
1. Explorar la ampliación de la participación de
1
universidades, centros de investigación y
grupos
g
p de trabajo
j mexicanos en GRID en
proyectos internacionales como:
EELA (E-Infrastructure
(E Infrastructure Shared Between
Europe and Latin America).
EELA 2 Inicia en Abril 2008
EELA-2
http://www.eu-eela.org/
Acciones:
DEISA 2. (Distributed European
DEISA-2
Infrastructure for Supercomputing
Applications).
pp
) http://www.deisa.org/
p
g
LA-GRID. Latinamerican GRID
http://www.latinamericangrid.org
Open Science GRID
http://www opensciencegrid org/
http://www.opensciencegrid.org/
OSG All hands meeting (Marzo 2008)
Capacitación, migración de aplicaciones
http://www.isgtw.org/
Acciones:
2 C
2.
Capacitación
it ió d
de recursos h
humanos
Promover la p
participación
p
en talleres de
capacitación y migración de aplicaciones,
así como dar a conocer a la comunidad
CUDI eventos sobre cómputo GRID de
relevancia nacional e internacional:
•International ICFA Workshop on Digital Divide
Issues for Global e
e-Science.
Science
Octubre 24-27, 2007.
Universidad Iberoamericana,, Santa Fe
•Semana de e-Ciencia en México. Proyecto EELA.
Octubre 22-26, 2007
UNAM
•Simposio SC (Súper Cómputo) Noroeste 2008
Febrero 19-22,
19 22, 2008.
ACARUS. Universidad de Sonora
•Collaborative and Grid Computing Technologies
ITESM, Campus Monterrey, University of
Reading
g
10 -12 Abril, 2008, Cancún, México
•Talleres de capacitación surgidos del proyecto
LNGSeC, México
Acciones:
2 C
2.
Capacitación
it ió d
de recursos h
humanos
•Taller piloto de Capacitación interna, instalación
de Globus y BOINC y Migración de aplicaciones.
Julio 2007. 20 horas. Tecnológico de Monterrey
•Colaboración con la Comunidad de Educación del
CUDI para el diseño de un programa de
capacitación en tecnologías GRID que permita
capacitar a un mayor número de investigadores,
técnicos y a la comunidad en general
general, de forma
eficiente y con altos estándares de calidad
Acciones:
3. Relación con la Industria
Promoción en la comunidad GRID de
eventos patrocinados
i d por socios
i
estratégicos como son el Seminario de Sun
High Performance Computing y
Visualización, Junio 2007
Promoción de las actividades del consorcio
LA-GRID patrocinado por IBM
(http://www.latinamericangrid.org)
Acciones:
4. Participación en el Proyecto Laboratorios
Nacionales, coordinado p
por Raúl Hazas,
CICESE.
Laboratorio Nacional de Grids de
S
Supercómputo
ó
para ell S
Soporte d
de
Aplicaciones de e-Ciencia (LNGSeC).
Universidades involucradas:
CUDI,, IPICyT,
CU
Cy , IPN,, UDLAP,
U
, UDG,
U G, UNISON,
U SO ,
CICESE, UANL, UCOL, ITESM-CEM
Acciones:
5. Proyecto WINDS
5
WINDS. Promover FP
FP-7
7 entre los
grupos de trabajo de GRID nacionales para la
obtención de financiamiento. Promoverlo
también en otras comunidades del CUDI.
http://www.winds-la.eu
WINDS-LA tiene como objetivo generar el
enlace
l
entre
t grupos d
de iinvestigación
ti
ió d
de lla
Comunidad Europea y América Latina con el
fin de someter propuestas exitosas al
programa FP-7.
Acciones:
Proyecto WINDS
WINDS. http://www.winds-la.eu
http://www winds la eu
Conferencias Regionales:
WINDS@RIO 2007
(Octubre 2007)
WINDS@BUENOS AIRES 2007
WINDS@MEXICO 2007
(Nov 2007)
(Diciembre 2007)
Acciones:
Proyecto WINDS
WINDS. http://www.winds-la.eu
http://www winds la eu
Conferencias Regionales:
Policy Seminar: “Strengthening EU-Latin
America links in ICT research: towards a joint
Roadmap,”
Sao Paulo,
Paulo Brasil – 3,
3 Julio 2008
Acciones:
6. Difusión de las actividades de la comunidad
GRID de CUDI en foros, como:
DIA CUDI. Universidad Autónoma del Estado de
Morelos. 23 Enero 2008
Reunión de Primavera CUDI 2008. Comité de
Aplicaciones. Reunión con Profesores e
Investigadores de la Universidad Autónoma de
Chiapas.Tuxtla Gutiérrez, Chipas
15 Abril, 2008
LA GRID
• LA Grid, is an international multidisciplinary research community and
virtual computing grid, enabling
institutions and industry to extend
beyond their individual reach to facilitate
collaborative IT research
research, education and
workforce development.
LA GRID
• LA Grid is a computing grid to link
faculty students
faculty,
students, and researchers from
institutions across the United States,
Latin America and Spain to collaborate
on complex industry applications for
business and societal needs in the
context of healthcare, life sciences and
disaster mitigation
mitigation.
• Started on December 16, 2005
LA Grid
Education
Research
LA
Grid
Collaboration
Talent
Development
Education
Research
Grid Computing
Distributed Systems
y
Collaboration
Talent Development
Supercomputing
Hands-on Experience
p
Education
Research
LA
Grid
Collaboration
Talent
Development
Education
Research
Collaboration
Talent Development
G id Research
Grid
R
h
• Advanced Applications
– Hurricane Mitigation
– Healthcare
– Bio Tech
• Magnet
g
for Grant Applications
pp
Innovation Directions
•
Healthcare: Delivering secure,
flexible, real-time collaboration
and healthcare information.
•
Life Sciences: Using new pattern
recognition and data mining
technics to make medical
breakthroughs.
•
Hurricane Disaster Mitigation:
Quickly produce mitigation
information based on projected
storm parameters, enable data
sharing, and scale to meet user
demand
Current projects
• Multiview Video Compression on
Supercomputer Hari Kalva and Borko
Supercomputer,
Furht, Department of Computer Science
and Engineering,
g
g, FAU
• Use of Supercomputers for Parallel Linear
Genetic Programming, Thomas
Fernandez, Department of Computer
Science and Engineering, FAU
Current projects
• Security of Grid Systems Ed Fernandez,
M i Petrie,
Maria
P t i Department
D
t
t off Computer
C
t
Science and Engineering, FAU
• Parallel and Distributed Simulation of
Large-Scale
Large
Scale Wireless Sensor Networks on
LA Grid,
Imad Mahgoub, Department of Computer
Science and Engineering, FAU
Current projects
•
Cancer Gene Discovery
Using Bioinformatics
Bioinformatics,
Ram Narayanan, College of
Science FAU
Science,
•
High-level
High
level QoS
management in Grid
environments
environments,
Hector Duran, UdG
Proteins are
components
of cellular
machines
Current projects
• Classical and Quantum Algorithms
for Bioinformatics, Cryptography and
C
Computer
t Networks
N t
k
Salvador Venegas, Tec Monterrey
• Novel Computational Approaches
for Protein Function Prediction
Ed
Edgar
V
Vallejo,
ll j T
Tec M
Monterrey
• Real time simulation and animation
of large crowds.
Isaac Rudomin, Tec Monterrey
Proteins are
components
of cellular
machines
Explosion of genomic data
28
Making sense of genomic data
Inferring
f
protein-protein
interactions
1548 proteins
t i
2358 interactions
Schwikowski B, Uetz P,
Fields S. A network of
protein-protein
interactions in yeast.
Nat Biotechnol. 2000
Dec;18(12):1257-61.
Clustering
Cl
i phylogenetic
h l
i profiles
fil
using
us
ng Fuzzy C-means
means
Fernández, J.C. Vallejo,
E.E. and Morett, E. Fuzzy
C-means for inferring
functional coupling of
proteins from their
phylogenetic profiles.
IEEE Computational
Intelligence in
Bioinformatics and
Computational Biology,
2006.
Anopheles gambiae microarray data analysis
University of California-ITESM
California ITESM
Each box represents
one gene’s
gene s
expression over time
Education
Research
LA
Grid
Collaboration
Talent
Development
Education
Research
Collaboration
Talent Development
Education
Research
LA
Grid
Collaboration
Talent
Development
Education
Research
Collaboration
Talent
Development
Education Courseware
Research Projects
Internships
Mentoring
Job Opportunities
Education
Research
LA
Grid
Collaboration
Talent
Development
LA Grid Today
9 One of the Worlds largest international
academic
acade
cg
grid
d
9 12 Universities under 3 year contracts
9 1500 Processors, across the Universities
are operational
9 52 Faculty members engaged in LA Grid
based research projects
projects.
9 40 Research projects have been launched
pp
9 $ 40M+ in new Research Grant applications
9 30 IBM Internships have been completed
9 30 LA Grid Scholars are being mentored by
IBM Hispanic Executives
LA Grid Today (Cont.)
9 240 Newspaper articles have appeared
f t i LA Grid
featuring
G id and
d IBM's
IBM' leadership
l d hi in
i
the US, Puerto Rico, Mexico and Argentina
9 6 TV Feature stories on CNN en Espanol,
Univision, US Networks and National
Public Radio
9 W3
3 Feature S
Story
9 IBM Innovation that Matters' Campaign
Feature
9 6 Shared University Research Grants
awarded
9 3 IBM equipment donations made
Comunidad GRID y
Supercómputo
Coordinador Luis A. Trejo
[email protected]
Abril 2008