Comunidad GRID y Supercómputo Coordinador Luis A. Trejo [email protected] Abril 2008 Comunidad GRID y Supercómputo Objetivos de la Comunidad •Objetivos •Miembros •Acciones •Aplicaciones Objetivos de la Comunidad El grupo de Grid y Supercómputo tiene como objetivo fomentar la colaboración, el intercambio de información y el desarrollo de proyectos conjuntos entre las instituciones miembros de CUDI, sustentados en una plataforma nacional b basada d en ttecnología l í GRID y cómputo ó t de d alto lt desempeño, utilizando a su vez la red Internet 2 para el apoyo del desarrollo de la e-ciencia e ciencia en México. Miembros de la Comunidad Cerca de 500 miembros registrados g en el portal de CUDI Grupo de trabajo de aproximadamente 30 integrantes de más de 10 instituciones de educación superior del país. Acciones: 1. Explorar la ampliación de la participación de 1 universidades, centros de investigación y grupos g p de trabajo j mexicanos en GRID en proyectos internacionales como: EELA (E-Infrastructure (E Infrastructure Shared Between Europe and Latin America). EELA 2 Inicia en Abril 2008 EELA-2 http://www.eu-eela.org/ Acciones: DEISA 2. (Distributed European DEISA-2 Infrastructure for Supercomputing Applications). pp ) http://www.deisa.org/ p g LA-GRID. Latinamerican GRID http://www.latinamericangrid.org Open Science GRID http://www opensciencegrid org/ http://www.opensciencegrid.org/ OSG All hands meeting (Marzo 2008) Capacitación, migración de aplicaciones http://www.isgtw.org/ Acciones: 2 C 2. Capacitación it ió d de recursos h humanos Promover la p participación p en talleres de capacitación y migración de aplicaciones, así como dar a conocer a la comunidad CUDI eventos sobre cómputo GRID de relevancia nacional e internacional: •International ICFA Workshop on Digital Divide Issues for Global e e-Science. Science Octubre 24-27, 2007. Universidad Iberoamericana,, Santa Fe •Semana de e-Ciencia en México. Proyecto EELA. Octubre 22-26, 2007 UNAM •Simposio SC (Súper Cómputo) Noroeste 2008 Febrero 19-22, 19 22, 2008. ACARUS. Universidad de Sonora •Collaborative and Grid Computing Technologies ITESM, Campus Monterrey, University of Reading g 10 -12 Abril, 2008, Cancún, México •Talleres de capacitación surgidos del proyecto LNGSeC, México Acciones: 2 C 2. Capacitación it ió d de recursos h humanos •Taller piloto de Capacitación interna, instalación de Globus y BOINC y Migración de aplicaciones. Julio 2007. 20 horas. Tecnológico de Monterrey •Colaboración con la Comunidad de Educación del CUDI para el diseño de un programa de capacitación en tecnologías GRID que permita capacitar a un mayor número de investigadores, técnicos y a la comunidad en general general, de forma eficiente y con altos estándares de calidad Acciones: 3. Relación con la Industria Promoción en la comunidad GRID de eventos patrocinados i d por socios i estratégicos como son el Seminario de Sun High Performance Computing y Visualización, Junio 2007 Promoción de las actividades del consorcio LA-GRID patrocinado por IBM (http://www.latinamericangrid.org) Acciones: 4. Participación en el Proyecto Laboratorios Nacionales, coordinado p por Raúl Hazas, CICESE. Laboratorio Nacional de Grids de S Supercómputo ó para ell S Soporte d de Aplicaciones de e-Ciencia (LNGSeC). Universidades involucradas: CUDI,, IPICyT, CU Cy , IPN,, UDLAP, U , UDG, U G, UNISON, U SO , CICESE, UANL, UCOL, ITESM-CEM Acciones: 5. Proyecto WINDS 5 WINDS. Promover FP FP-7 7 entre los grupos de trabajo de GRID nacionales para la obtención de financiamiento. Promoverlo también en otras comunidades del CUDI. http://www.winds-la.eu WINDS-LA tiene como objetivo generar el enlace l entre t grupos d de iinvestigación ti ió d de lla Comunidad Europea y América Latina con el fin de someter propuestas exitosas al programa FP-7. Acciones: Proyecto WINDS WINDS. http://www.winds-la.eu http://www winds la eu Conferencias Regionales: WINDS@RIO 2007 (Octubre 2007) WINDS@BUENOS AIRES 2007 WINDS@MEXICO 2007 (Nov 2007) (Diciembre 2007) Acciones: Proyecto WINDS WINDS. http://www.winds-la.eu http://www winds la eu Conferencias Regionales: Policy Seminar: “Strengthening EU-Latin America links in ICT research: towards a joint Roadmap,” Sao Paulo, Paulo Brasil – 3, 3 Julio 2008 Acciones: 6. Difusión de las actividades de la comunidad GRID de CUDI en foros, como: DIA CUDI. Universidad Autónoma del Estado de Morelos. 23 Enero 2008 Reunión de Primavera CUDI 2008. Comité de Aplicaciones. Reunión con Profesores e Investigadores de la Universidad Autónoma de Chiapas.Tuxtla Gutiérrez, Chipas 15 Abril, 2008 LA GRID • LA Grid, is an international multidisciplinary research community and virtual computing grid, enabling institutions and industry to extend beyond their individual reach to facilitate collaborative IT research research, education and workforce development. LA GRID • LA Grid is a computing grid to link faculty students faculty, students, and researchers from institutions across the United States, Latin America and Spain to collaborate on complex industry applications for business and societal needs in the context of healthcare, life sciences and disaster mitigation mitigation. • Started on December 16, 2005 LA Grid Education Research LA Grid Collaboration Talent Development Education Research Grid Computing Distributed Systems y Collaboration Talent Development Supercomputing Hands-on Experience p Education Research LA Grid Collaboration Talent Development Education Research Collaboration Talent Development G id Research Grid R h • Advanced Applications – Hurricane Mitigation – Healthcare – Bio Tech • Magnet g for Grant Applications pp Innovation Directions • Healthcare: Delivering secure, flexible, real-time collaboration and healthcare information. • Life Sciences: Using new pattern recognition and data mining technics to make medical breakthroughs. • Hurricane Disaster Mitigation: Quickly produce mitigation information based on projected storm parameters, enable data sharing, and scale to meet user demand Current projects • Multiview Video Compression on Supercomputer Hari Kalva and Borko Supercomputer, Furht, Department of Computer Science and Engineering, g g, FAU • Use of Supercomputers for Parallel Linear Genetic Programming, Thomas Fernandez, Department of Computer Science and Engineering, FAU Current projects • Security of Grid Systems Ed Fernandez, M i Petrie, Maria P t i Department D t t off Computer C t Science and Engineering, FAU • Parallel and Distributed Simulation of Large-Scale Large Scale Wireless Sensor Networks on LA Grid, Imad Mahgoub, Department of Computer Science and Engineering, FAU Current projects • Cancer Gene Discovery Using Bioinformatics Bioinformatics, Ram Narayanan, College of Science FAU Science, • High-level High level QoS management in Grid environments environments, Hector Duran, UdG Proteins are components of cellular machines Current projects • Classical and Quantum Algorithms for Bioinformatics, Cryptography and C Computer t Networks N t k Salvador Venegas, Tec Monterrey • Novel Computational Approaches for Protein Function Prediction Ed Edgar V Vallejo, ll j T Tec M Monterrey • Real time simulation and animation of large crowds. Isaac Rudomin, Tec Monterrey Proteins are components of cellular machines Explosion of genomic data 28 Making sense of genomic data Inferring f protein-protein interactions 1548 proteins t i 2358 interactions Schwikowski B, Uetz P, Fields S. A network of protein-protein interactions in yeast. Nat Biotechnol. 2000 Dec;18(12):1257-61. Clustering Cl i phylogenetic h l i profiles fil using us ng Fuzzy C-means means Fernández, J.C. Vallejo, E.E. and Morett, E. Fuzzy C-means for inferring functional coupling of proteins from their phylogenetic profiles. IEEE Computational Intelligence in Bioinformatics and Computational Biology, 2006. Anopheles gambiae microarray data analysis University of California-ITESM California ITESM Each box represents one gene’s gene s expression over time Education Research LA Grid Collaboration Talent Development Education Research Collaboration Talent Development Education Research LA Grid Collaboration Talent Development Education Research Collaboration Talent Development Education Courseware Research Projects Internships Mentoring Job Opportunities Education Research LA Grid Collaboration Talent Development LA Grid Today 9 One of the Worlds largest international academic acade cg grid d 9 12 Universities under 3 year contracts 9 1500 Processors, across the Universities are operational 9 52 Faculty members engaged in LA Grid based research projects projects. 9 40 Research projects have been launched pp 9 $ 40M+ in new Research Grant applications 9 30 IBM Internships have been completed 9 30 LA Grid Scholars are being mentored by IBM Hispanic Executives LA Grid Today (Cont.) 9 240 Newspaper articles have appeared f t i LA Grid featuring G id and d IBM's IBM' leadership l d hi in i the US, Puerto Rico, Mexico and Argentina 9 6 TV Feature stories on CNN en Espanol, Univision, US Networks and National Public Radio 9 W3 3 Feature S Story 9 IBM Innovation that Matters' Campaign Feature 9 6 Shared University Research Grants awarded 9 3 IBM equipment donations made Comunidad GRID y Supercómputo Coordinador Luis A. Trejo [email protected] Abril 2008