Grupo: Grp Clases Teóricas Estructura y Bios¡ntesis.(955805

PROYECTO DOCENTE
ASIGNATURA:
"Estructura y Biosíntesis de Macromoléculas"
Grupo: Grp Clases Teóricas Estructura y Bios¡ntesis.(955805)
Titulacion: Grado en Biología
Curso: 2015 - 2016
DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA/GRUPO
Titulación:
Grado en Biología
Año del plan de estudio:
2009
Centro:
Facultad de Biología
Asignatura:
Estructura y Biosíntesis de Macromoléculas
Código:
1530029
Tipo:
Optativa
Curso:
4º
Período de impartición:
Segundo Cuatrimestre
Ciclo:
0º
Grupo:
Grp Clases Teóricas Estructura y Bios¡ntesis. (1)
Créditos:
6
Horas:
150
Área:
Bioquímica y Biología Molecular (Área principal)
Departamento:
Bioquímica Vegetal y Biología Molecular (Departamento responsable)
Dirección postal:
FACULTAD DE BIOLOGÍA, C/ PROFESOR GARCÍA GONZÁLEZ, S/N 41012 - SEVILLA
Dirección electrónica:
http://www.departamento.us.es/dbiovege
COORDINADOR DE LA ASIGNATURA
RONCEL GIL, MERCEDES
PROFESORADO
1
2
RONCEL GIL, MERCEDES
RUIZ PEREZ, JOSE FRANCISCO
Curso académico: 2015/2016
Última modificación: 2015-09-30
1 de 8
OBJETIVOS Y COMPETENCIAS
Objetivos docentes específicos
1. OBJETIVOS DE CARÁCTER TEÓRICO
1.1. Conocer los fundamentos de la estructura de macromoléculas
1.2. Conocer los procesos de biosíntesis de macromoléculas.
1.3. Conocer la estructura de ácidos nucleicos y proteínas, así como las relaciones estructura/función.
1.4. Comprender los sistemas de procesamiento, maduración y modificación de las macromoléculas.
2. OBJETIVOS DE CARÁCTER METODOLÓGICO
2.1. Aprender técnicas básicas para el análisis de macromoléculas biológicas.
2.2. Aprender técnicas básicas de aislamiento y caracterización de macromoléculas biológicas.
2.3. Aprender técnicas de básicas de bioquímica y biología molecular.
2.4. Comprender el acercamiento experimental para abordar el estudio de procesos regulados.
2.5. Familiarizarse con la infraestructura general y específica de un laboratorio de bioquímica.
Competencias
Competencias transversales/genéricas
Competencias transversales/genéricas
1.Capacidad de análisis y síntesis
2.Capacidad de organizar y planificar
3.Capacidad de generar nuevas ideas
4.Solidez en los conocimientos básicos de la profesión
5.Comunicación oral y escrita en la lengua nativa
6.Conocimiento de una segunda lengua
7.Habilidades para recuperar y analizar información desde diferentes fuentes
8.Capacidad de crítica y autocrítica
9.Habilidades para trabajar en equipo
10.Iniciativa y espíritu emprendedor
11.Capacidad para aplicar la teoría a la práctica
12.Habilidades de investigación
13.Capacidad de aprender
14.Habilidad para trabajar de forma autónoma
Competencias específicas
Competencias específicas
Cognitivas (saber):
1. Conocimientos bioquímicos básicos de los procesos biológicos.
2. Conocimientos básicos de la estructura de macromoléculas
3. Conocimientos de las técnicas específicas para el análisis estructural de las macromoléculas
4. Conocimientos de los procesos de síntesis de las macromoléculas más importantes.
Procedimientos/Instrumentales (saber hacer):
1. Utilizar los métodos y técnicas específicos para el análisis funcional y estructural de las macromoléculas.
2. Analizar información a partir de diferentes fuentes.
3. Manejar la bibliografía, tanto tradicional como a través de las nuevas tecnologías de acceso a la información científica.
4. Preparar, exponer públicamente y defender un trabajo.
5. Utilizar la informática como herramienta de análisis e investigación.
Actitudinales:
1. Solidez en los conocimientos bioquímicos básicos de los procesos biológicos.
2. Conocer los procesos de síntesis de las macromoléculas más importantes.
3. Capacidad de análisis y síntesis.
4. Capacidad crítica y autocrítica.
5. Capacidad para aplicar la teoría a la práctica.
6. Capacidad de generar nuevas ideas.
7. Interpretación de datos de observaciones experimentales en términos de sus significados y las bases que lo sustentan.
CONTENIDOS DE LA ASIGNATURA
Relación sucinta de los contenidos (bloques temáticos en su caso)
Los contenidos de la asignatura se pueden agrupar en CINCO grandes bloques temáticos:
1. ESTRUCTURA DE ÁCIDOS NUCLÉICOS.
2. ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS.
3. BIOSÍNTESIS DE DNA.
4. BIOSÍNTESIS Y PROCESAMIENTO DE RNA.
5. BIOSÍNTESIS DE PROTEÍNAS.
Curso académico: 2015/2016
Última modificación: 2015-09-30
2 de 8
Relación detallada y ordenación temporal de los contenidos
Unidad 1. Estructura y estabilidad del DNA (4 horas)
Nucleótidos y ácidos nucleicos: Modelo de Watson y Crick de la doble hélice. Interacciones que estabilizan la estructura secundaria.
Parámetros estructurales del DNA. Familias de DNA: DNA B, DNA A, DNA Z. Curvamiento del DNA. Superenrollamiento del DNA y formas
topológicas.
Unidad 2. Estructura y estabilidad del RNA (2 horas)
Forma RNA A. Interacciones entre bases. Predicción y determinación de la estructura secundaria. Estructuras terciarias. Estabilización de la
estructura. Patrones estructurales. Ejemplos de estructuras tridimensionales de RNAs.
Unidad 3. Estructura y estabilidad de proteínas (5 horas)
Aminoácidos. Enlace peptídico. Conformación: proteínas fibrosas y globulares. Niveles de estructura. Estructura secundaria. Diagramas
topológicos. Caracterización preliminar de la conformación proteica. Patrones estructurales. Dominios estructurales. Clasificación de las
proteínas según su estructura tridimensional. Proteínas alfa. Proteínas beta. Proteínas alfa-beta. Proteínas de membrana. Estabilidad de
proteínas: Termodinámica del plegamiento. Interacciones no covalentes en proteínas. Contribuciones mayoritarias y minoritarias a la
estabilidad. Cinética y mecanismo del plegamiento in vitro.
Unidad 4. Complejos macromoléculares (2 horas)
Interacciones intermoleculares y equilibrio de unión. Complejos permanentes y transitorios. Propiedades de las interfases proteína-proteína.
Naturaleza de las interacciones y reconocimiento proteína-DNA. Motivos estructurales. Proteínas asociadas al DNA. Empaquetamiento del
DNA. Estructura de la cromatina. Tipos de interacciones proteína-RNA. Motivos de unión a RNA. Ejemplos de complejos proteína-RNA.
Estructura del ribosoma.
Unidad 5. Biosíntesis de DNA (6 horas)
Mecanismos de la replicación del DNA y el mantenimiento de su estructura. Estructura y mecanismo catalítico de DNA polimerasas.
Topoisomerasas y superenrollamiento del DNA. Otras proteínas implicadas en la replicación. Dinámica de la horquilla de replicación.
Estructura y función de la telomerasa. Estructura y mecanismo catalítico de enzimas implicados en la modificación y reparación del DNA.
Unidad 6. Biosíntesis de RNA (3 horas)
Mecanismo de la transcripción. Estructura y mecanismo catalítico de RNA polimerasas. Bases estructurales del reconocimiento del promotor
por las diferentes RNA polimerasas y mecanismo de iniciación de la transcripción. Elongación y terminación de la transcripción.
Unidad 7. Regulación de la transcripción (3 horas)
Diversidad de mecanismos regulatorios de la transcripción. Interacciones proteína-DNA y proteína-proteína implicadas en la regulación de la
transcripción en bacterias y eucariotas. Estructura de la cromatina y transcripción. Papel de la estructura del RNA en regulación: atenuación,
ribointerruptores, RNAs no codificantes.
Unidad 8. Procesamiento, modificación y degradación del RNA (4 horas)
Estructura del espliceosoma y mecanismo de la eliminación de intrones. Interacciones moleculares que regulan el procesamiento alternativo
de intrones. Estructura y mecanismo catalítico de los intrones de grupo I y II. Estructura y mecanismo catalítico de enzimas implicados en el
procesamiento de RNAs estables. Modificaciones post-transcripcionales en el RNA y edición. Enzimas y complejos moleculares implicados
en la degradación de RNA y su regulación. miRNAs e interferencia génica.
Unidad 9. Biosíntesis de proteínas (4 horas)
Mecanismo de la traducción. Estructura y función de las aminoacil-tRNA sintetasas. Interacciones moleculares durante las diferentes etapas
de la traducción.
Mecanismos estructurales y cinéticos para la fidelidad de la traducción. Mecanismo catalítico
de la formación del enlace peptídico. Interacción entre inhibidores y el ribosoma.
Unidad 10. Regulación de la traducción, plegamiento, localización y degradación de proteínas (2 horas)
Interacciones implicadas en la regulación de la iniciación de la traducción. Papel de la estructura del RNA en regulación: ribointerruptores,
RNAs no codificantes. Regulación por miRNAs. NMD. Plegamiento in vivo. Estructura y función de chaperonas. Localización intracelular de
proteínas y secreción. Estructura y función de los complejos implicados. Degradación de proteínas y su regulación: ubiquitinación y
sumoilación, el proteasoma.
ACTIVIDADES FORMATIVAS
Relación de actividades formativas del cuatrimestre
Curso académico: 2015/2016
Última modificación: 2015-09-30
3 de 8
Clases teóricas
Horas presenciales:
35.0
Horas no presenciales:
70.0
Metodología de enseñanza-aprendizaje:
Asistencia voluntaria. Cada clase teórica consistirá en una lección magistral en la que se presentarán los contenidos del tema, se
plantearán cuestiones para el debate y se propondrán diferentes actividades de aprendizaje. Tendrán una duración de 90 minutos y se
impartirán dos días a la semana en un aula del edificio rojo de la Facultad de Biología, según el calendario aprobado por la Junta de
Centro.
Se le suministrará a los alumnos copia del material audiovisual que se vaya a emplear durante el curso a través de la plataforma
WebCT. Se fomentará la interacción profesor-alumno. Se resolverán dudas a través de la plataforma WebCT tanto de foma
individualizad como colectiva, además de tutorías a petición de los alumnos.
Se fomentará el uso de la plataformas WebCT para el establecimiento de discusiones on-line (chat) sobre temas de la asignatura según
determinen los alumnos y moderado por los profesores.
Competencias que desarrolla:
1. Solidez en los conocimientos básicos de la estructura de macromoléculas y en las técnicas usadas para determinarla.
2. Solidez en los conocimientos bioquímicos básicos de los procesos biológicos.
3. Conocer la regulación del metabolismo intermediario.
4. Capacidad de análisis y síntesis.
5. Capacidad crítica y autocrítica.
Prácticas de Laboratorio
Horas presenciales:
8.0
Horas no presenciales:
6.0
Metodología de enseñanza-aprendizaje:
Las asistencia a las prácticas de laboratorio es obligatoria y requisito indispensable para aprobar la asignatura. Se realizarán en
sesiones de 4 horas en los laboratorios del edificio verde de la Facultad de Biología, según el calendario aprobado por la Junta de
Centro.
Las prácticas se evaluarán mediante la presentación por parte de los alumnos de un dossier con los resultados obtenidos que incluya
discusión crítica y conclusiones y por la contestación a cuestionarios relacionados con las mismas al final de cada sesión.
Competencias que desarrolla:
1. Solidez en los conocimientos bioquímicos básicos de los procesos biológicos.
2. Capacidad de análisis y síntesis.
3. Habilidades de investigación.
4. Capacidad crítica y autocrítica.
5. Capacidad para aplicar la teoría a la práctica.
6. Capacidad de trabajo en grupo
Prácticas informáticas
Horas presenciales:
3.0
Horas no presenciales:
5.0
Metodología de enseñanza-aprendizaje:
La asistencia a las prácticas informáticas es obligatoria y requisito indispensable para aprobar la asignatura. Se realizarán en una sesión
de 2 horas en las aulas de informática del edifico rojo de la Facultad de Biología, según el calendario aprobado por la Junta de Centro.
Consistirán en el aprendizaje del manejo, bajo tutela y a un nivel básico, tanto de servidores y bases de datos de estructura de
macromoléculas como de programas gráficos para el análisis estructural de macromoléculas.
Se evaluarán mediante la presentación por parte de los alumnos de un informe tras dichas prácticas.
Competencias que desarrolla:
1. Solidez en los conocimientos bioquímicos básicos de los procesos biológicos.
2. Capacidad de análisis y síntesis.
3. Capacidad crítica y autocrítica.
4. Capacidad de preparación de un trabajo.
Curso académico: 2015/2016
Última modificación: 2015-09-30
4 de 8
Exposiciones y seminarios
Horas presenciales:
9.0
Horas no presenciales:
9.0
Metodología de enseñanza-aprendizaje:
De realización voluntaria. De acuerdo con el profesor, cada alumno elegirá un artículo científico de actualidad que trate sobre aspectos
relacionados con el temario.
La exposición oral tendrá una duración de aproximadamente 20 minutos, tras lo cual se establecerá una discusión sobre los resultados,
técnicas, conclusiones, etc.
Competencias que desarrolla:
1. Solidez en los conocimientos bioquímicos básicos de los procesos biológicos.
2. Capacidad de análisis y síntesis.
3. Capacidad crítica y autocrítica.
4. Capacidad de preparación, exposición pública y defensa de un trabajo.
Exámenes
Horas presenciales:
2.0
Horas no presenciales:
0.0
Tutorías individuales de contenido programado
Horas presenciales:
2.0
Horas no presenciales:
0.0
Metodología de enseñanza-aprendizaje:
Resolución de dudas y otras cuestiones planteadas por el alumno en sesiones presenciales.
Tutorías colectivas de contenido programado
Horas presenciales:
1.0
Horas no presenciales:
0.0
Metodología de enseñanza-aprendizaje:
Se convocará una primera tutoría colectiva de inicio de curso para discutir los objetivos, métodos, evaluación y posibilidades de éxito en
la asignatura
BIBLIOGRAFÍA E INFORMACIÓN ADICIONAL
Bibliografía general
Bioquímica
Autores:
JM Berg, JL Tymoczko y L Stryer
Edición:
6ª
Publicación:
Reverté, 2008
ISBN:
9788429176001
Lehninger, Principios de Bioquímica
Autores:
DL Nelson y MM Cox
Edición:
5ª
Publicación:
Omega, 2009
ISBN:
9788428214865
Curso académico: 2015/2016
Última modificación: 2015-09-30
5 de 8
Biochemistry
Autores:
D Voet y JG Voet
Edición:
4ª
Publicación:
Wiley, 2011
ISBN:
9780470570951
Biochemistry
Autores:
CK Mathews, KE Van Holde, DR Appling
Edición:
and SJ Anthony-Cahill
Publicación:
Prentice Hall, 2012
ISBN:
9780138004644
Autores:
J.D. Watson
Edición:
5ª
Publicación:
Editorial Médica Panamericana, 2006
ISBN:
9788479035051
4ª
Biología Molecular del Gen
Bibliografía específica
Proteins. Structures and Molecular Properties
Autores:
TE Creighton
Edición:
2ª
Publicación:
Freeman, 1997
ISBN:
9780716770305
Introduction to protein structure
Autores:
C Branden and J Tooze
Edición:
2ª
Publicación:
Garland, 1999
ISBN:
9780815323051
Introduction to Protein Architecture
Autores:
AM Lesk
Edición:
1ª
Publicación:
Oxford University Press, 2001
ISBN:
9780198504740
Autores:
C Gómez-Moreno y J Sancho
Edición:
1ª
Publicación:
Ariel Ciencia, 2003
ISBN:
9788434480612
Estructura de proteínas
Understanding DNA. The molecule and how it works
Autores:
CR Calladine, HR Drew, BF Luisi and AA
Edición:
Travers
Publicación:
Elselvier Academic Press, 2004
ISBN:
9780121550899
Autores:
D Elliot and M. Ladomery
Edición:
1ª
Publicación:
Oxford University Press, 2011
ISBN:
9780199288373
3ª
Molecular Biology of RNA
SISTEMAS Y CRITERIOS DE EVALUACIÓN Y CALIFICACIÓN
Sistema de evaluación
Curso académico: 2015/2016
Última modificación: 2015-09-30
6 de 8
Evaluación de las Clases Teóricas
Examen Escrito (75%).
Por tratarse de una asignatura cuatrimestral, durante el mes de junio se realizará una única prueba escrita, aplicándose el mismo criterio
durante las convocatorias de septiembre y diciembre.
El aprendizaje del alumno en contenidos teóricos se evaluará mediante examen escrito sobre los contenidos de las clases teóricas con una
duración de 2 horas.
Evaluación de las Clases Prácticas
Prácticas de Laboratorio e Informáticas (15%)
Se evaluará la entrega de un Informe de las Prácticas. Se valorará la participación en la prácticas y la capacidad que muestre el estudiante
para el análisis de los datos obtenidos durante la misma.
Evaluación de los Seminarios
Exposiciones y Seminarios (10%)
Los trabajos escritos que se expondrán en forma de seminario se evaluarán en base a la capacidad de síntesis, la claridad en la exposición
de los datos presentados, a la actualidad de los mismos, la adecuación de la bibliografía utilizada en la preparación de los trabajos y la
dificultad del tema elegido. Asimismo, se valorarán las respuestas y explicaciones sobre cuestiones o dudas que se planteen al final del
seminario por parte del resto de los alumnos y por el profesor.
Evaluación Global
Las puntuaciones obtenidas en los apartados de TEORÍA, PRÁCTICAS y SEMINARIOS se sumarán para constituir la calificación final
según la ecuación Nota final= 75% Nota Teoría+ 15% Nota Prácticas+ 10% Nota Seminario. La asistencia y realización de las prácticas son
obligatorias. La puntuaciones obtenidas en PRÁCTICAS y SEMINARIOS serán válidas hasta la convocatoria de Diciembre.
Criterios de calificación
Los criterios de evaluación se definen en el apartado anterior
CALENDARIO DE EXÁMENES
La información que aparece a continuación es susceptible de cambios por lo que le recomendamos que la confirme con el Centro cuando se
aproxime la fecha de los exámenes.
1 ª Convocatoria
CENTRO: Facultad de Biología
Fecha:
7/6/2016
Aula:
Por definir
Hora:
Por definir
2 ª Convocatoria
CENTRO: Facultad de Biología
Fecha:
1/9/2016
Aula:
Por definir
Hora:
Por definir
CENTRO: Facultad de Biología
Diciembre
Fecha:
2/12/2015
Aula:
Por definir
Hora:
Por definir
TRIBUNALES ESPECÍFICOS DE EVALUACIÓN Y APELACIÓN
Curso académico: 2015/2016
Última modificación: 2015-09-30
7 de 8
Presidente:
FRANCISCO JAVIER FLORENCIO BELLIDO
Vocal:
AGUSTIN VIOQUE PEÑA
Secretario:
FRANCISCO FERNANDO DE LA ROSA ACOSTA
Primer suplente:
MIGUEL ANGEL DE LA ROSA ACOSTA
Segundo suplente:
MANUEL HERVAS MORON
Tercer suplente:
MERCEDES GARCIA GONZALEZ
ANEXO 1:
HORARIOS DEL GRUPO DEL PROYECTO DOCENTE
Los horarios de las actividades no principales se facilitarán durante el curso.
GRUPO: Grp Clases Teóricas Estructura y Bios¡ntesis. (955805)
Calendario del grupo
CLASES DEL PROFESOR: RONCEL GIL, MERCEDES
HORARIO SIN ESPECIFICAR
CLASES DEL PROFESOR: RUIZ PEREZ, JOSE FRANCISCO
HORARIO SIN ESPECIFICAR
Curso académico: 2015/2016
Última modificación: 2015-09-30
8 de 8