Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS (EXPRESIÓN GÉNICA) 1.- EL ADN COMO MATERIAL HEREDITARIO 2.- ESTRUCTURA DEL GENOMA Y SU EXPRESIÓN 3.- FLUJO DE INFORMACIÓN GENÉTICA 4.- TRANSCRIPCIÓN: SÍNTESIS DEL ARN 5.- MADURACIÓN DEL ARN 6.- EL CÓDIGO GENÉTICO 7.- EL PROCESO DE TRADUCCIÓN. SÍNTESIS DE PROTEÍNAS 8.- REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA 9.- RESUMEN: Replicación / Transcripción / Traducción Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS (EXPRESIÓN GÉNICA) ANTECEDENTESPAU: 2002–Junio:traducción,etapasyexplicación; códigogené;co; 2004–Junio:transcripciónytraducción,definición; 2004–Sep;embre:transcripciónytraducción,iden;ficaciónenesquemayexplicación; 2005–Sep;embre:códigogené;co,definiciónycaracterís;cas; reparacióndelADN,cómoseproduce; 2006–Junio:transcripciónytraducción,definiciónylocalizaciónintracelular; ARN,;posyfunciónenlasíntesisdeproteínas; formacióndeADNapar;rdeARN; 2008–Sep;embre:códigogené;co,caracterís;cas; 2011–Junio:iden;ficacióndelatraducciónenEucariotas; 1.- EL ADN COMO MATERIAL HEREDITARIO -.1ª Evidencia.Experiencia de Griffith (1928) Las bacterias muertas de Streptococcus pneumoniae tenía un “principio transformante” que era captado por las bacterias vivas no virulentas y transformaban sus caracteres hereditarios convirtiéndolas en virulentas. Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS -.2ª Evidencia.Experiencia de Avery, McLeod y McCarthy (1944) Aislaron a partir de los extractos de neumococos S (virulentos) muertos por calor cinco fracciones distintas: polisacáridos, lípidos, proteínas, ARN y ADN Con cada una de ellas intentaron transformar las células R vivas (no virulentas) ! S (virulentas) Comprobaron que ninguna de las fracciones era capaz de transformarlos excepto la fracción que contenía ADN. Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS -.3ª Evidencia.Experiencia de Hershey y Chase (1952) Experiencia con bacteriófagos en el que se utilizaron marcajes radiactivos con P32 (ADN) y S35 (proteínas) Se tuvo la certeza que el ADN era el portador de la información 2.- ESTRUCTURA DEL GENOMA Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS " GENOMA : Material genético (ADN) de un organismo que se almacena en forma de GENES " GEN : Fragmento de ADN que lleva información para que unos determinados aminoácidos se unan en un orden concreto y formen una proteína. Es una unidad de información hereditaria que se expresa determinando una característica observable o FENOTIPO. G. Beadle y E. Tatum Establecen una relación directa entre la molécula de ADN y la secuencia de aminoácidos de una enzima: “un gen, una enzima” No todas las proteínas son enzimas y hay proteínas formadas por varias cadenas polipeptídicas. La hipótesis se transforma: “un gen, una cadena polipeptídica” Neurospora crassa moho con el que trabajaron produciendo mutaciones con rayos X Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS La información se almacena en forma de GENES a lo largo del GENOMA, pero… ¿Cómo lo hacen PROCARIOTAS y EUCARIOTAS? A) PROCARIOTAS: " 1 solo cromosoma circular " Genes continuos (no existen zonas sin información) " Plásmidos ! moléculas pequeñas de ADN circular que se replican independientemente B) EUCARIOTAS: " ADN se encuentra en el núcleo " Mayor cantidad de ADN que en Procariotas " Hay ADN repetitivo (secuencias ↑ repetidas que no codifican proteínas) " En los genes hay intrones (“sin información”) y exones (“con información”) " ADN se asocia a proteínas (histonas) " Mitocondrias y Cloroplastos tienen ADN circular (≈ Procariotas) 3.- FLUJO DE INFORMACIÓN GENÉTICA Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS ORGANICEMOS LAS IDEAS: 1.- El ADN ha de ser “leído” y “traducida” su información para ver qué aminoácidos se sintetizan. 2.- Un “intermediario” “lee” esa información y se la “copia” 3.- A partir de la información del “intermediario”, se sintetizan los aminoácidos ARNt ADN TRANSCRIPCIÓN REPLICACIÓN PROTEÍNA ARNm NÚCLEO TRADUCCIÓN RIBOSOMAS Este esquema fue considerado durante muchos años el “dogma central de la biología molecular” Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS • Algunos virus poseen ARN replicasa, capaz de obtener copias de su ARN. • Otros poseen transcriptasa inversa que sintetiza ADN a partir de ARN mediante un proceso de retrotranscripción o transcripción inversa. REDEFINICIÓN DEL DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR Transcripción ARN ADN Traducción Transcripción inversa Replicación PROTEÍNAS Replicación Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS RESUMIENDO… • • • • • 1: replicación del ADN 2: transcripción 3: traducción 4: transcripción inversa (en algunos virus, p.e. VIH) 5: replicación de ARN (en algunos virus) 5 Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS PROCARIOTAS EUCARIOTAS 4.- TRANSCRIPCIÓN Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS # La síntesis de ARN o transcripción necesita: CADENA DE ADN QUE ACTÚE COMO MOLDE • ARN polimerasa I ARNr ENZIMAS ! ARN -POLIMERASAS En eucariotas • ARN polimerasa II ARNm • ARN polimerasa III RIBONUCLEÓTIDOS TRIFOSFATO DE A, G, C, U # FASES DE LA TRANSCRIPCIÓN : ARNt y ARNr Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS 5’ 3’ ARN polimerasa 5’ 3’ A U G U G C T A C A C G G C G C U C G A G C C G ARN ADN Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS ARNpolimerasa T A C G A U G C A A C C G T T G C A U U G G C A A C G U C G A T C Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS ARNpolimerasa m-GTP T A A U C G A A G C U U C C G T T G C A G G C A A C G U C G A T C Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS Poli A-polimerasa m-GTP A U G C U C G U G U A ARNm precursor TRANSCRITOPRIMARIO MADURACIÓN G A A A A A Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS ARN -polimerasa Punto de inicio Región a transcribir ADN Centro promotor La ARN-polimerasa se une al centro promotor y comienza la transcripción. Continúa la transcripción del gen Final de la transcripción Señal de corte (AAUAA) Caperuza Procesos pos-transcripcionales ARNm inmaduro Punto de corte La polimerasa sigue transcribiendo un tiempo y después se para. Degradación del ARN sobrante Caperuza Poli-A Poli-A polimerasa ARN mensajero para traducir Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS 5.- MADURACIÓN DEL ARN # ORGANISMOSPROCARIONTES Transcrito primario Los ARNm no sufren proceso de maduración Los ARNt y ARNr se forman a partir de un transcrito primario que contiene muchas copias del ARNt y ARNr. ARNasa ARNt # ORGANISMOSEUCARIONTES Intrón Exón Exón RNPpn Bucle Exón Intrón Bucle Punto de unión entre exones ARNr El ARN transcrito primario sufre un proceso de “corte y empalme” por la ribonucleoproteína pequeña nucleolar (RNPpn) llamado splicing mediante el que se eliminan los intrones y se unen los exones. Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS MADURACIÓN en Eucariotas: " En el proceso de maduración un sistema enzimático reconoce, corta y retira los intrones y las ARN‑ligasas unen los exones, formándose el ARNm maduro " En casi todos los ARNm estudiados, aparece GU (en el punto de corte 5’) y AG (en el punto de corte 3’) de los intrones " FUNCIÓN DE LOS INTRONES: no se sabe la función que cumplen • Existen casos en que un mismo Transcrito Primario produce 2 ARNm diferentes siguiendo dos procesos de “corte y empalme” distintos ARNm maduro precursor cola Cabeza AUG AAAAAA UAG Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS Maduración del ARNm (Visión de conjunto). Región codificadora del gen ADN Promotor E1 I1 E2 I2 TAC ATC Cabeza E1 ARNm precursor ARNm maduro E3 I1 E2 I2 E3 cola AAAAAA AUG UAG Cabeza cola AAAAAA AUG UAG Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS 6.- EL CÓDIGO GENÉTICO " Es el “diccionario” que traduce el la secuencia de bases del ARN ! aminoácidos " Incluye 64 tripletes posibles (4 bases organizadas de 3 en 3: 43 = 64) que codifican para 20 aa proteicos, por lo que cada aa puede ser codificado por más de un triplete. UAA UAG UGA AUG Iniciación Terminación Ej. ¿Qué aminoácido está codificado por el codón GAC? ¿y si fuese GAG? Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS CARACTERÍSTICAS DEL CÓDIGO GENÉTICO # UNIVERSAL # DEGENERADO • Compartido por todos los organismos conocidos incluso los virus. • A excepción de la metionina y el triptófano, un aminoácido está codificado por más de un codón. • El código ha tenido un solo origen evolutivo. • Esto es una ventaja ante las mutaciones. • Existen excepciones en las mitocondrias y algunos protozoos. # CARECE DE SOLAPAMIENTO # SIN IMPERFECCIÓN • Los tripletes se disponen de manera lineal y continua, sin espacios entre ellos y sin compartir bases nitrogenadas • Cada codón solo codifica a un aminoácido. Posibilidad de solapamiento Met Gli Tre His Ala Met Codones de iniciación Fen Leu Ala Leu Solapamiento Pro Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS 7.- EL PROCESO DE TRADUCCIÓN. SÍNTESIS DE PROTEÍNAS LA SÍNTESIS DE PROTEÍNAS necesita RIBOSOMAS Formados por AMINOÁCIDOS ARN MENSAJERO Donde se une el Por donde se une al SUBUNIDAD PEQUEÑA Tienen tres lugares SITIO P SITIO E AMINOACIL-ARNt -SINTETASA y los GRUPOS FOSFATO ANTICODÓN Donde se sitúa el SITIO A ARN DE TRANSFERENCIA Como la Donde se unen los SUBUNIDAD GRANDE ENZIMAS Y ENERGÍA ARNt con el aa POLIPÉPTIDO ARNt Donde se une el EXTREMO 3’ Tiene dos zonas Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS UnióndecadaaaconsuARNtcorrespondientemediantelaintervencióndeunaenzima específica,laaminoacilARNt-sintetasa,ylaenergíaaportadaporelATP. + Aminoacil ARNt -sintetasa + Aminoácido Ácido aminoaciladenílico + ARNtx La unión se realiza en el extremo 3’ del ARNt Existenalmenos20aminoacil-ARNt-sintetasas,una paracadaaminoácido.Sonenzimasmuyespecíficas Aminoácil -ARNtx Iniciación: La subunidad pequeña del ribosoma se une a la región líder del ARNm y el ARNm se desplaza hasta llegar al codón AUG, que codifica el principio de la proteína. Se les une entonces el complejo formado por el ARNt-metionina (Met) (Eucariotas) o ARNt-N formil Metionina (f-Met) (Procariotas). La unión se produce entre el codón del ARNm y el anticodón del ARNt que transporta la metionina (Met). Subunidad menor del ribosoma P 5’ A AAAAAAAAAAA 3’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG UAC Anticodón Codón ARNt 1er aminoácido ARNm Elongación I: A continuación se une la subunidad mayor a la menor completándose el ribosoma. El complejo ARNt-aminoácido2 , la glutamima (Gln) [ARNt-Gln] se sitúa enfrente del codón correspondiente (CAA). La región del ribosoma a la que se une el complejo ARNt-Gln se le llama región aminoacil (A). Subunidad menor del ribosoma P A 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG UAC GUU AAAAAAAAAAA 3’ Elongación II: Se forma el enlace peptídico entre el grupo carboxilo de la metionina (Met) y el grupo amino del segundo aminoácido, la glutamina (Gln). P A ARNm 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG UAC GUU AAAAAAAAAAA 3’ Elongación III: El ARNt del primer aminoácido, la metionina (Met) se libera. P A ARNm 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG GUU AAAAAAAAAAA 3’ Elongación IV: El ARNm se traslada, de tal manera que el complejo ARNt-Gln-Met queda en la región P (peptidil) del ribosoma, quedando ahora la región aminoacil (A) libre para la entrada del complejo ARNt-aa3 P A ARNm 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG GUU AAAAAAAAAAA 3’ Elongación V: Entrada en la posición correspondiente a la región aminoacil (A) del complejo ARNt-Cys, correspondiente al tercer aminoácido, la cisteína (Cys). P A ARNm 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG GUU ACG AAAAAAAAAAA 3’ Elongación VI: Unión del péptido Met-Gln (Metionina-Glutamina) a la cisteína (Cys). P A ARNm 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG GUU ACG AAAAAAAAAAA 3’ Elongación VII: Se libera el ARNt correspondiente al segundo aminoácido, la glutamina (Glu). P A ARNm 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG ACG AAAAAAAAAAA 3’ Elongación VIII: El ARNm corre hacia la otra posición, quedando el complejo ARNt3-CysGlu-Met en la región peptidil del ribosoma. P A ARNm 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG ACG AAAAAAAAAAA 3’ Elongación IX: Entrada del complejo ARNt-Leu correspondiente al 4º aminoácido, la leucina. P A ARNm AAAAAAAAAAA 3’ 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG ACG AAU Leu Elongación X: Este se sitúa en la región aminoacil (A). P A ARNm 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG AC G AAU AAAAAAAAAAA 3’ Elongación XI: Unión del péptido Met-Gln-Cys con el 4º aminoácido, la leucina (Leu). Liberación del ARNt de la leucina. El ARNm se desplaza a la 5ª posición ARNm P A 5’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG AAU AAAAAAAAAAA 3’ Elongación XII: Entrada del ARNt de la leucina, el 5º aminoácido, la arginina (ARNt-Arg). ARNm P A 5’ AAAAAAAAAAA 3’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG AAU GCU Elongación XIII: Unión del péptido Met-Gln-Cys-Leu con el 5º aminoácido, la arginina (Arg). Liberación del ARNt de la leucina (Leu). El ARNm se desplaza a la 6ª posición, se trata del un codón de finalización o de stop (UAG, UGA o UAA) ARNm P A 5’ AAAAAAAAAAA 3’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG GCU Arg-Leu-Cys-Gln-Met Finalización I: Liberación del péptido o proteína. Las subunidades del ribosoma se disocian hasta nueva síntesis y se separan del ARNm. ARNm P A 5’ AAAAAAAAAAA 3’ AU G CAA U G C U UA C GA UAG GCU Arg-Leu-Cys-Gln-Met Finalización II: Después de unos minutos los ARNm son digeridos por las enzimas del hialoplasma. ARNm AAAAAAAAAAA 3’ 5’ A U G C A A U G C U U A C G A U A G Polirribosoma o polisoma. Si el ARNm que se tiene que traducir es largo, puede ser leído por más de un ribosoma a la vez. Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS INICIACIÓN E P A Codón iniciador (AUG) Posición E ARNm Posición P La subunidad pequeña del ribosoma se une al ARNm colocando el codón de iniciación AUG en el sitio P. A continuación se coloca el primer aminoacil-ARNt con el aa N-f-Met en procariotas y el aa Met en eucariotas. ARNt - Met Subunidad grande Finalmente se une la subunidad grande del ribosoma. Posición A ELONGACIÓN Se produce el alargamiento del péptido. Entra un nuevo amnoacil-ARNt complementario al codón del sitio A. Se formará un enlace peptídico entre los dos aa presentes gracias a la peptidil-transferasa. A continuación se trasloca el ribosoma en sentido 5’-3’ sobre 3 bases del ARNm, se libera el sitio A y el segundo ARNt se sitúa en el sitio P. Entra un nuevo aminoacil-ARNt en A. Se forma un nuevo enlace peptídico y se repite el proceso. Desplazamiento del ribosoma 5’ 3’ Enlace peptídico El aminoácido se libera del ARNt Aminoacil -ARNt Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS TERMINACIÓN Se produce cuando el ribosoma llega a un codón de terminación (UAA, UGA o UAG), entonces entra en el sitio A un factor de liberación proteico que separa el péptido del último aminoacil-ARNt. Todos los elementos se separan y la proteína adquiere su estructura tridimensional. Codón de terminación (UAA, UGA, UAG) ARNm Separación de las dos subunidades del ribosoma ARNm ARNt Porción final de la cadena proteica Factor de liberación Proteína en formación POLIRRIBOSOMAS Si el ARN a traducir es lo suficientemente largo, puede ser leído por más de un ribosoma a la vez, formando un polirribosoma o polisoma. Ribosoma ARNm Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS 8.- REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA Una célula no sintetiza todas las proteínas que es capaz, sino sólo aquellas que necesita según su función y momento vital. Es necesario un control que es muy complejo pero que en gran medida ocurre en la transcripción. # EN PROCARIOTAS: Modelo del Operón (Jacob & Monod) Promotor: es una secuencia de nucleótidos en los que se une la ARN-pol para iniciar la transcripción. Genes estructurales: conjunto de genes relacionados con una misma función que se transcriben conjuntamente generando un ARN policistrónico. Operador: secuencia de nucleótidos situados entre el promotor y los genes estructurales. Gen regulador: codifica una proteína que actúa como represor uniéndose al operador e impidiendo que la ARN-pol pueda iniciar la transcripción. ARN-pol EL OPERÓN LACTOSA Promotor Operador Genes estructurales Gen regulador Inductor (alolactosa) Complejo inactivo represor-inductor Represor activo Promotor Operador ADN Transcripción bloqueada La ARN-pol no puede unirse al ADN Transcripción desbloqueada Si hay lactosa en el medio, la bacteria necesita metabolizarla y para ellos requiere 3 enzimas. Es un derivado de la lactosa quien se une al represor y lo inactiva de manera que deja libre el ADN y permite el trabajo de la ADN-pol. Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS # REGULACIÓN DE LA EXPRESIÓN GÉNICA en EUCARIOTAS Es un proceso mucho más complejo y menos conocido. Es importante destacar que es esta regulación la que permite que, a partir de un mismo paquete de genes, se origine la gran diversidad de tipos celulares presentes en un organismo pluricelular complejo. Promotor: es una secuencia de nucleótidos que suele estar situado cerca del gen que se va a transcribir. Tiene un punto de unión para proteínas activadoras que permiten la unión de la ARN-pol. Elementos activadores: controlan la transcripción y pueden estar muy distantes del gen. Suelen ser activados para su transcripción por otras proteínas. Proteínas activadoras: actúan uniéndose al promotor y a los elementos activadores, permitiendo que a continuación se una la ARN-pol. Pueden activar múltiples elementos a la vez. LA REGULACIÓN HORMONAL Muchas hormonas actúan como mensajeros químicos que controlan la expresión génica. Es el caso de las hormonas esteroideas que pueden entrar en cualquier tipo de célula pero sólo en aquellas que presentan un receptor específico forman un complejo hormona-receptor que actúan como Unión del complejo activador de la transcripción. Proteína receptora del citoplasma al ADN celular Transcripción Hormonas esteroideas en el sistema circulatorio Complejo hormona-receptor ARNm 9.- RESUMEN y ACTIVIDADES REPLICACIÓN Moléculas que intervienen Moléculas resultantes Lugar de la célula donde se produce Momento del ciclo celular en el cual tiene lugar Función biológica Particularidades en procariotas Tema 15: DEL ADN A LAS PROTEÍNAS TRANSCRIPCIÓN TRADUCCIÓN