Primera parte

Asignatura:
Laboratorio Clínico en Microbiología (Curso 2007 – 2008)
Facultad de Biología (Licenciatura en Bioquímica)
TEMA 15
LA INFORMÁTICA EN EL
LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA.
RECURSOS INFORMÁTICOS PARA LA
ORGANIZACIÓN DEL LABORATORIO
Y EMISIÓN DE RESULTADOS
CONCEPTOS
Informática:
Conjunto de conocimientos científicos y técnicas que hacen posible el tratamiento
automático de la información mediante ordenadores. (R.A.E.)
Ordenador:
Máquina electrónica, dotada de memoria de gran capacidad y de métodos de
tratamiento de la información, que puede resolver problemas aritméticos y
lógicos gracias a la utilización de software registrado en ella. (R.A.E.)
Software:
Conjunto de programas, instrucciones y reglas informáticas para ejecutar
ciertas tareas en una computadora. (R.A.E.)
Programa:
Conjunto unitario de instrucciones que permite a un ordenador realizar
funciones diversas, como el tratamiento de textos, el diseño gráfico, la
resolución de problemas matemáticos, el manejo de bancos de datos, etc.
(R.A.E.)
Microbiología e Informática:
RECURSOS
►  Aplicaciones informáticas de uso general
►  Redes de comunicación. Internet y sus
aplicaciones
►  Aplicaciones específicas en microbiología
clínica: Gestión de la información
►  Otros recursos de interés
APLICACIONES INFORMÁTICAS DE
USO GENERAL
► 
► 
► 
► 
► 
► 
Procesadores de texto
Hojas de cálculo
Gestores de bases de datos
Editores de páginas “web”
Programas de presentación
Editores de imágenes
►  Lectores de archivos
►  Reconocimiento óptico de
caracteres (OCR)
►  Reconocimiento de voz
►  Paquetes estadísticos
►  Otras ..........
PROCESADORES DE TEXTO
CARACTERÍSTICAS:
  Crear, editar, componer, almacenar, modificar e imprimir textos
digitales: Cortar, copiar, pegar, vincular, buscar, reemplazar, etc.
  Diferentes formatos: Párrafo, fuentes, bordes y sombreados,
tabulaciones, columnas, tablas, etc.
  Visualización de páginas: Diferentes diseños, marcas, presentaciones preliminares, etc.
  Inserción de elementos: Campos, imágenes, símbolos, objetos,
etc.
  Otras herramientas: Correctores ortográficos y/o gramaticales, diccionarios multilingües y/o de sinónimos etc.
Ejemplos: Word (Microsoft); Wordperfect (Corel); Wordpro (Lotus
Smartsuite); Write (OpenOffice); ….
HOJAS DE CÁLCULO
CARACTERÍSTICAS:
  Manejar, números y textos, en forma de tablas y en campos de
información: Establece relaciones entre ellos.
  Campos de información: Celdas, (intersección de filas y columnas),
que componen la hoja.
  Pueden realizar cálculos con funciones y/o fórmulas: Matemáticas, estadísticas, de búsqueda, lógicas, etc.
  Crear gráficas: Con los datos almacenados o calculados, así como
rectas de regresión y/o ajuste, etc.
  Otras herramientas: Muchas de las de los procesadores de texto.
Ejemplos: Excel (Microsoft); Lotus 1, 2 3 (Lotus Smartsuite); QuatroPro (Corel);
Calc (OpenOffice); …
GESTORES DE BASES DE DATOS
CARACTERÍSTICAS:
  Gestionar datos: Administrar conjuntos de información relacionada
(base de datos), almacenada, actualizada y estructurada, pudiendo
ser manipulada y analizada por el propio programa o por otros.
  Datos: Almacenados en tablas de diferentes tipos y, cada tabla se
compone de registros y cada registro de campos.
  Formato: Gráfico en pantalla; impreso y digital en salida.
  Búsquedas: Existe la posibilidad de filtros.
  Cálculos: Existe la posibilidad de cálculos sencillos.
  Otros herramientas: Muchas de los procesadores de textos y de las
hojas electrónicas.
  Tipos de bases de datos : Según variabilidad, contenido y modelo.
Ejemplos: Oracle (Oracle); Acces (Microsoft); File Maker (File maker);
Progress (Progress software); End Note (Thomson); ….
TIPOS DE BASES DE DATOS
Según variabilidad:
Estáticas: De sólo lectura.
Dinámicas: Permite ser actualizada en el tiempo.
Según contenido:
Bibliográficas: Contiene representación de fuente primaria.
De texto completo: Almacena fuentes primarias.
Directorios: Como las guías telefónicas.
Multimedia: Imágenes, audios, videos, etc.
De información biológica: Información de ciencias biológicas o médicas
Según modelo:
Jerárquicas: Organizadas en forma de árbol (nodos primarios y secundarios)
De red: Un mismo nodo primario puede tener varios primarios.
Relacional: Utiliza relaciones entre campos de datos.
Orientadas a objetos: Almacena los objetos completos.
Documentales: Indexación a texto completo.
Deductivas: Permite hacer deducciones a través de inferencias.
Distribuidas: Almacenan datos en diferentes computadores en red.
PROGRAMAS DE PRESENTACIONES
CARACTERÍSTICAS:
  Organizar, ilustrar y distribuir ideas de forma clara y sencilla: En pantalla o en forma de diapositivas, transparencias,
carteles o pósters.
  Posibilita: Animaciones, autoformatos, autoajustes de texto, diseños de tablas, publicaciones en “web”, combinaciones de
colores etc.
  Otras herramientas: Muchas de las propias de los procesadores de textos, hojas electrónicas y editores de imagen.
Ejemplos: Powerpoint (Microsoft); Freelance Graphics (Lotus); Corel
Presentations (Corel); Harvard Graphics (Harvard Graphics); ….
EDITORES DE PÁGINAS “WEB”
CARACTERÍSTICAS:
  Crear y editar documentos de hipertexto: Utilizan lenguaje
HTML (HyperText Markup Language) visible en internet.
  Lenguaje HTML: Lenguaje que estructura documentos en
forma de etiquetas, compatible y de fácil aprendizaje que crea
docu-mentos atractivos con hiperenlaces, imágenes, etc.
  Tecnología: WYSIWYG (“What You See Is What You Get” ó “Lo
que ves es lo que obtienes”)
  Otras herramientas: Correctores ortográficos, gramaticales, y
otras propias de procesadores de textos.
Ejemplos: Frontpage (Microsoft); Dreamweawer (Macromedia); Hot Metal
(Softquad); ….
EDICIÓN DE IMÁGENES
CARACTERÍSTICAS:
  Visualización y edición de imágenes, cambiar formatos de
éstas, hacer composiciones, retoques, etc.
  Recursos gráficos: Añadir texto a las composiciones, herramientas de dibujo, seleccionar y editar partes de una imagen,
cambiar de posición una imagen, cambiar tamaño de imagen,
cambiar colores, creación de diferentes formatos, etc.
  Otras herramientas: Creación y superposición de capas y
máscaras de capa, .
Ejemplos: Photoshop (Adobe); Gimp (Gimp); ….
LECTORES DE ARCHIVOS
CARACTERÍSTICAS:
  Visualizar, imprimir y navegar por textos e imágenes:
Ficheros en formato PDF (Portable Document Format) que se
presentan en pantalla de manera idéntica que en el documento
impreso.
  Cualquier persona en cualquier lugar puede abrir un archivo PDF. Sólo es
necesario tener el software gratuito Adobe Reader. Pueden firmarse
digitalmente.
  El formato PDF de Adobe permite la redistribución del texto y/o imágenes
para que se muestre correctamente en plataformas portátiles, como los
dispositivos Palm OS, Symbian y Pocket PC.
  Se pueden descargar: Artículos de revistas, impresos, libros
electrónicos y formularios de solicitudes y proyectos..
  Otras herramientas: Algunos programas admiten también la
edición de archivos en PDF , crear formularios, etc.
Ejemplos: Acrobat Reader (Adobe) que es sólo lector; Acrobat (Adobe)
que es también editor.
RECONOCEDORES ÓPTICOS DE
CARACTERES (OCR)
CARACTERÍSTICAS:
  Extraer: De una imagen escaneada los caracteres que
componen un texto para almacenarlos en un formato (ASCII o
Unicode) con el que puedan interactuar procesadores de textos.
Transforma documentos impresos en digitales.
  Los OCR (Optical Character Recognition): En la actualidad,
junto al texto, registran y almacenan el formato en el que se
escribió el texto.
  Otras herramientas: Algunos programas (OCR) admiten
también la edición de archivos en PDF y buen reconocimiento
de tablas y los OMR (Optical Mark Recognition) útiles para el
reconocimiento de marcas.
Ejemplos: OmniPage (Scan Soft); TextBrige (Scan Soft) ABBYY Fine
Reader (Abbyy); ….
RECONOCEDORES DE VOZ
CARACTERÍSTICAS:
  Comunicar, mediante la voz, directamente al usuario con el
ordenador sin necesidad de ningún soporte intermedio de
comunicación.
  Niveles de reconocimiento: Después de entrenamiento llega
a ser superior al 95%, llega a reconocer cerca de 160 palabras
por minuto.
  Otras herramientas: Control de sistemas operativos y diversos
programas de utilidad.
  Son prácticos para: Los que no saben escribir bien a máquina
o los que tienen algún impedimento físico y porque deja libres
las manos para utilizarlas en otra cosa.
Ejemplos: Dragon Naturally Speakimg (Scan Soft); Via Voice (IBM); Free
Speech (Philips); ….
PAQUETES ESTADÍSTICOS
CARACTERÍSTICAS:
  Definición: Son un conjunto de programas informáticos
específicamente diseñados para el análisis estadístico de datos
con el objetivo de resolver problemas de estadística descriptiva,
inferencial o ambos
  Permiten: Aplicar a un mismo fichero de datos un conjunto
ilimitado de procedimientos estadísticos
sincronizada, sin salir del programa.
de
manera
  Otras características: Requieren un cierto nivel de conocimientos de estadística.
Ejemplos: SPSS (SPSS); Gauss (Aptech); Mathematica (Wolfrand
Research); ….
OTRAS
 PROGRAMAS PARA LA CREACIÓN DE
ETIQUETAS. De código de barras, de
código difuso…..
 PROTOCOLOS DE COMUNICACIONES.
Ponen en contacto los autoanalizadores con
el servidor central y vuelcan en este los
datos generados por aquellos.
 ETC. ……..