Investigadores del CIC identifican y describen proteínas hasta ahora

Instituto de Biología Molecular y Celular
del Cáncer (IBMCC)
Centro de Investigación del Cáncer
Instituto de Biología Molecular y Celular del Cáncer
Universidad de Salamanca – CSIC
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España
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Investigadores del CIC identifican y describen proteínas
hasta ahora desconocidas
 Del 25 al 30 de septiembre de 2015 será presentado el trabajo en
la reunión anual HUPO2015 que se celebra en Vancouver
(Canadá), donde se reunirán cerca de 3.000 investigadores.
El Centro de Investigación del Cáncer (CIC-IBMCC) es uno de los centros de referencia en
el Human Proteome Project, en esta reunión aporta tres trabajos publicados en la revista de
más impacto en el área de proteómica Journal of Proteome Research. Entre ellos, destaca un
trabajo liderado y coordinado desde el CIC-IBMCC que ha permitido identificar > 9000
proteínas simultáneamente en un único ensayo, de una línea celular de linfoma de célula B
con una extraordinaria correlación con datos transcriptómicos; describiendo por primera
vez varias de esas proteínas que permanecían desconocidas, convirtiéndose en referencia
internacional. Estos resultados serán presentados por el investigador Manuel Fuentes en
una conferencia plenaria en dicho congreso internacional.
En septiembre 2010, durante la conferencia anual de la Organización Mundial del
Proteoma Humano (Sydney, Australia), la comunidad proteómica internacional lanzó el
Proyecto del Proteoma Humano (HPP). Este reto es un ambicioso proyecto para la
caracterización de la expresión, abundancia y localización de al menos una isoforma
representativa de cada uno de los 20.300 genes codificantes de proteínas descritos en el
Genoma Humano.
Uno de los objetivos principales del Human Proteome Project es la caracterización de todas las
proteínas humanas en un contexto biológico, junto con el desarrollo de novedosas
herramientas y reactivos. Estos trabajos posteriormente facilitarán a la comunidad
científica, la comunidad clínica, así como la industria biotecnológica y farmacéutica pueda
utilizar en el descubrimiento de biomarcadores útiles en el diagnóstico, pronóstico y nuevas
dianas terapéuticas; con el objetivo final de mejorar la salud a nivel global.
El proyecto Proteoma Humano ha sido concebido como un esfuerzo coordinado.
Mediante las iniciativas centradas en cromosomas y enfermedades, se garantiza la
finalización de este proyecto dentro de un tiempo definido, asegurando el estudio
sistemático de todas proteínas codificadas en cada uno de los 23 cromosomas y sus
implicaciones patológicas.
Referencias de publicaciones:
1.- Journal Proteome Research, 2015 Volume 14, Issue 9
“Integration of Proteomics and Transcriptomics Data Sets for the Analysis of a Lymphoma B-Cell Line in the Context of
the Chromosome-Centric Human Proteome Project”
Paula Díez, Conrad Droste, Rosa M. Dégano, María González-Muñoz, Nieves Ibarrola, Martín Pérez-Andrés ,
Alba Garin-Muga, Víctor Segura, Gyorgy Marko-Varga, Joshua LaBaer, Alberto Orfao, Fernando J. Corrales, Javier De
Las Rivas, and Manuel Fuentes
pp 3530–3540
Publication Date (Web): July 28, 2015 (Article)
DOI: 10.1021/acs.jproteome.5b00474
2.-Journal Proteome Research, 2015 Volume 14, Issue 9
“Quest for Missing Proteins: Update 2015 on Chromosome-Centric Human Proteome Project”
Péter Horvatovich, Emma K. Lundberg, Yu-Ju Chen, Ting-Yi Sung, Fuchu He, Edouard C. Nice, Robert J. Goode,
Simon Yu, Shoba Ranganathan, Mark S. Baker, Gilberto B. Domont, Erika Velasquez, Dong Li, Siqi Liu, Quanhui Wang,
Qing-Yu He, Rajasree Menon, Yuanfang Guan, Fernando J. Corrales, Victor Segura, J. Ignacio Casal, Alberto PascualMontano, Juan P. Albar, Manuel Fuentes, Maria Gonzalez-Gonzalez, Paula Diez, Nieves Ibarrola, Rosa M.
Degano, Yassene Mohammed, Christoph H. Borchers, Andrea Urbani, Alessio Soggiu, Tadashi Yamamoto, Ghasem
Hosseini Salekdeh, Alexander Archakov, Elena Ponomarenko, Andrey Lisitsa, Cheryl F. Lichti, Ekaterina Mostovenko,
Roger A. Kroes, Melinda Rezeli, Ákos Végvári, Thomas E. Fehniger, Rainer Bischoff, Juan Antonio Vizcaíno, Eric W.
Deutsch, Lydie Lane, Carol L. Nilsson, György Marko-Varga, Gilbert S. Omenn, Seul-Ki Jeong, Jong-Sun Lim, Young-Ki
Paik, and William S. Hancock
pp 3415–3431
Publication Date (Web): June 15, 2015 (Perspective)
DOI: 10.1021/pr5013009
3.-Journal Proteome Research, 2015 Volume 14, Issue 9
In Vitro Transcription/Translation System: A Versatile Tool in the Search for Missing Proteins
Péter Horvatovich, Ákos Végvári, Justin Saul, Jin G. Park, Ji Qiu, Michael Syring, Patrick Pirrotte, Konstantinos Petritis,
Tony J. Tegeler, Meraj Aziz, Manuel Fuentes, Paula Diez, Maria Gonzalez-Gonzalez, Nieves Ibarrola, Conrad
Droste, Javier De Las Rivas, Concha Gil, Felipe Clemente, Maria Luisa Hernaez, Fernando J. Corrales, Carol L.
Nilsson, Frode S. Berven, Rainer Bischoff, Thomas E. Fehniger, Joshua LaBaer, and György Marko-Varga
pp 3441–3451
Publication Date (Web): July 9, 2015 (Perspective)
DOI: 10.1021/acs.jproteome.5b00486