Documento 531495

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Editora
DOLLY MONTOYA C.
Instituto de Biotecnología
Universidad Nacional de Colombia
CONSEJO ASESOR
CONSEJO EDITORIAL
ANDRÉS ILLANES
Escuela de Ingeniería Bioquímica
Universidad Católica de Valparaíso,
Chile
RUBÉN TORRENEGRA
Facultad de Ciencias
Pontificia Universidad Javeriana,
Colombia
ALBA MARINA COTES
Corporación Colombiana de Investigación
Agropecuaria
Corpoica
ALLAN RUSSELL
McGowan Institute
for Regenerative Medicine
Universidad de Pittsburgh, EE.UU.
MYRIAM SÁNCHEZ
Corporación Biotec
Cali, Colombia
GUSTAVO BUITRAGO H.
Instituto de Biotecnología
Universidad Nacional de Colombia
JORGE OSSA
Corporación Biogénesis
Universidad de Antioquia,
Colombia
SERGIO ORDUZ
Corporación de Investigaciones
Biológicas
Medellín, Colombia
ARCADY SINITSYN
Departamento Cinética Enzimática
Universidad Estatal de Moscœ, Rusia
DAVID CALA
Corporación para el Desarrollo
Industrial de la Biotecnología y
Producción Limpia, Colombia
JUAN GENTINA
Escuela de Ingeniería Bioquímica
Universidad Católica de Valparaíso,
Chile
PATRICIA DEL PORTILLO
Biología Molecular e Ingeniería
Genética
Corpogen, Colombia
JOSÉ SÁNCHEZ-SERRANO
Centro Nacional de Biotecnología
Madrid, Espaæa
RODOLFO QUINTERO
Programa de Biotecnología del
Petróleo Instituto
Mexicano del Petróleo,
México
LUIS CAICEDO
Facultad de Ingeniería, Área
de Ingeniería Bioquímica
Universidad Nacional de Colombia,
Colombia
YOAV BASHAN
Departamento de Microbiología
Centro de Investigaciones Biológicas
del Noroeste, MØxico
ÓSCAR CASTELLANOS
Facultad de Ingeniería
Universidad Nacional de Colombia
ÓSCAR ALZATE
Departament of Neurobiology Duke
University Medical Center - USA
ENRIQUE GALINDO
Departamento de Bioingeniería
Universidad Autónoma de México MØxico
RAFAEL RANGEL ALDAO
Departamento de Tecnología y Procesos
Biológicos y Bioquímicos
Universidad Simón Bolívar-Venezuela
MARÍA TERESA REGUERO
Instituto de Biotecnología
Universidad Nacional de Colombia
JORGE MAYER
Goleen Rice Project-Manager
University of Freiburg -Alemania
Directora ejecutiva LUZ
JENNY DUSSAN
Centro de Investigaciones
Microbiológicas
Universidad de los Andes, Colombia
ÁNGELA SASTOQUE RIVERA
Con el apoyo de:
Esta publicación ha sido indexada en:
Chemical Engineering and BiotechnologyAbstracts-Verfahrenstechnische
Berichte-CEABA-VTB (Alemania)
Sistema de información de publicaciones científicas seriadas de América
Latina, el Caribe, Espaæa y Portugal-LATINDEX
índice de publicaciones seriadas científicas y tenoiogicas colombianas de
Colciencias-PUBLINDEX
Incluida en los catÆlogos de
THE BRITISH LIBRARY Con el
respaldo institucional de:
ASOCIACIÓN COLOMBIANA PARA EL AVANCE DE LA CIENCIA - ACAC
FUNDACIÓN ANDINA PARA EL DESARROLLO TECNOLÓGICO Y SOCIAL - TECNOS
La Revista Colombiana de Biotecnología es una
publicación interinstitucional, especializada en
la divulgación de desarrollos científicos y técnicos,
así como otros temas relacionados con las diversas
áreas de la biotecnología.
CONTENIDO
EDITORIAL
ES RESPONSABILIDAD DE TODOS RESOLVER EL PROBLEMA DE ACCESO ......................... 3
ESTABLECIMIENTO DE UN MEDIO DE CULTIVO SUMERGIDO PARA UNA CEPA NATIVA
DE UN HONGO POLIPORAL
Carolina Peæa Serna, Andrea Sierra Cadavid, Alex Armando SÆez Vega,
Benjamín Alberto Rojano ................................................................................................................ 5
Traducciones y revisión de textos en inglés
JASON GARRY
ESTABLECIMIENTO DE UN SISTEMA DIAGNÓSTICO PARA LA DETECCIÓN DE Ralstonía
solanacearum Y DIFERENCIACIÓN GENÉTICA UTILIZANDO MARCADORES MOLECULARES RAPD
Edisson Chavarro Mesa, Jorge Evelio Ángel Díaz ..................................................................... 14
Diagramación
Impresión
Fundación Cultural Javeriana de
Artes GrÆficas - JAVEGRAF
ESTUDIOS PRELIMINARES EN LA ESTANDARIZACIÓN DE UN PROTOCOLÓ PARA LA
OBTENCIÓN DE CALLOS EMBRIÓGÉNICÓS EN DOS CLONES DE CAUCHÓ (Hevea
brasiliensis MÜLL. ARG.) DE DIFERENTES ORÍGENES GEOGRÁFICOS Santiago
Cadavid Ruiz, César Augusto Hernández Rendón, Rodrigo Hoyos S.,
Marisol Medina S, Luis Fernando Restrepo.................................................................................. 32
TGF-B Y UN INHIBIDOR ESPECÍFICO DE TGF-P REGULAN PERICENTRINA B Y MYH9 EN
CÉLULAS DE GLIÓMA
Óscar Álzate, Cristina Osorio, Michael H. Herbstreith, Mark Hjelmeland, Robert Buechler,
Dong Ning He, Shideng Bao, Jeremy N. Rich ............................................................................ 48
Coordinación académica
UNIVERSIDAD
NACIONAL
DE COLOMBIA
Sede Bogotá, D.C.
ANÁLISIS BIÓINFÓRMÁTICÓ Y PREDICCIÓN DE GENES EN SECUENCIAS GENÓMICAS DE
Clostridium SP. IBUN22A
José David Montoya Solano, Zulma Rocío Suárez Moreno, Dolly Montoya Castaño,
Fabio Ancízar Arístizábal Gutiérrez ............................................................................................. 57
Créditos fotos carátula Foto derecha: Callos
friables obtenidos a partir de hojas jóvenes del
clon PB 254 a los 50 días. PolitØcnico
Colombiano Jaime Isaza Cadavid, Universidad
Nacional, Sede Medellín, Universidad de
Antioquia. Medellín. Foto izquierda: Mapa
completo de las proteínas que son aumentadas y
disminuidas por ambos tratamientos. La
explicación e identificación se muestran en la
tabla 1 del artículo TGF-p and a specific TGF-p
inhibitor regulate pericentrin B
and MYH9 in glioma cell lines.
Foto inferior: Interfase de usuario del sistema
ENKI-DB. Grupo de bioinformÆtica del Instituto
de Biotecnología de la Universidad Nacional de
Colombia
ENKI-DB: SISTEMA DE INFORMACIÓN TAXONÓMICA Y MOLECULAR DE ESPECIES
PROPIAS DE LA BIODIVERSIDAD COLOMBIANA
Andrés M. Pinzón, María Teresa Reguero, Emiliano Barreto........................................................ 65
INSTRUCCIONES PARA LOS AUTORES ................................................................................. 75
CONTENTS
EDITORIAL
ES RESPONSABILIDAD DE TODOS RESOLVER EL PROBLEMA DE ACCESO ......................... 3
ESTABLISHMENT ÓF A SUBMERGED CULTURE MÉDIUM FÓR A NATIVE STRAIN ÓF
A PÓLIPÓRAL MUSHRÓÓM
Carolina Peæa Serna, Andrea Sierra Cadavid, Alex Armando SÆez Vega,
Benjamín Alberto Rojano ................................................................................................................ 5
Pœblico objetivo
Investigadores, estudiantes y profesionales de
las disciplinas que se desarrollan en torno a la
biotecnología.
ESTABLISHING A DIAGNÓSTIC SYSTEM FÓR DETECTING Ralstonía solanacearum
AND GENETIC DIFFERENTIATIÓN USING RAPD MOLECULAR MARKERS
Edisson Chavarro Mesa, Jorge Evelio Ángel Díaz ..................................................................... 14
Periodicidad: semestral
PRELIMINARY STUDIES FÓR ÓPTIMIZING A PRÓTÓCÓL FÓR ÓBTAINING EMBRYÓGENIC
CALLUSES IN TWÓ RUBBER (Hevea brasiliensis MÜLL. ARG.j CLONES FRÓM DIFFERENT
GEÓGRAPHICAL ÓRIGINS Santiago Cadavid Ruiz, César Augusto Hernández Rendón,
Rodrigo Hoyos S,
Marisol Medina S, Luis Fernando Restrepo.................................................................................. 32
TGF-B AND A SPECIFIC TGF-P INHIBITOR REGÚLATE PERICENTRIN B AND MYH9 IN
GLIÓMA CELL LINES
Óscar Álzate, Cristina Osorio, Michael H. Herbstreith, Mark Hjelmeland, Robert Buechler,
Dong Ning He, Shideng Bao, Jeremy N. Rich ............................................................................ 48
Suscripciones, envío de trabajos, canjes o
comentarios: Instituto de Biotecnología /
Universidad Nacional de Colombia. Ciudad
Universitaria. Edificio Manuel Ancízar. A.A.
14490 de BogotÆ.
Tels. [5-71] 316 54 50 / 316 50 00
(exts. 16966 / 16975) Fax:
[5-71] 316 54 15
Correo electrónico:
[email protected]
BIÓINFÓRMATIC ANALYSIS AND GENE PREDICTIÓN IN GENÓMIC SEÓUENCES FRÓM
Clostridium SP. IBUN22A
José David Montoya Solano, Zulma Rocío Suárez Moreno, Dolly Montoya Castaño,
Fabio Ancízar Arístizábal Gutiérrez ............................................................................................. 57
La Revista Colombiana de Biotecnología no se
responsabiliza por las ideas emitidas por los
autores.
ENKI-DB: MOLECULAR AND TAXÓNÓMIC DATA INTEGRATIÓN SYSTEM FÓR CÓLÓMBIAN
SPECIES
Andrés M. Pinzón, María Teresa Reguero, Emiliano Barreto........................................................ 65
AUTHÓR INSTRUCTIÓNS FÓR THE REVISTA COLOMBIANA DE BIOTECNOLOGÍA ............ 75
Los artículos que aparecen en esta revista
pueden ser reproducidos citando la fuente.
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Rev. Colomb. Biotecnol. Vol. VIII N° 1 Julio 2006
3-4
EDITORIAL
Es responsabilidad de todos resolver el
problema de acceso
La exigencia al Ministerio de Ambiente, Vivienda y Desarrollo Territorial (MAVDT) de resolver el
problema de acceso a los recursos genØticos no debe entenderse como una responsabilidad
exclusiva de dicha institución. Siendo necesaria una política y acción gubernamental, en el
contexto en que se desarrolla el asunto tiene variables técnicas, jurídicas y políticas regionales e internacionales.
La gestión técnica de la investigación científica en recursos genéticos es también responsabilidad de los investigadores y de las instituciones de investigación. No son pocos los
investigadores que ignoran la legislación de acceso, o que no se han preocupado por conocerla. Este desconocimiento no excusa su incumplimiento pero sí incide en la inexactitud de las
peticiones y en la falta de idoneidad de los anexos que acompaæan las solicitudes. No obstante,
se debe reconocer que el investigador, ademÆs de superar la nada fÆcil tarea de conseguir
recursos financieros para investigación, en las condiciones actuales debe asumir los trámites
administrativos tendientes a obtener las autorizaciones ambientales. Esta tarea es aœn mÆs
compleja cuando la investigación abarca recursos ubicados en territorios de pueblos indígenas, comunidades afrodescendientes y locales.
Por su parte, las universidades no pueden continuar ignorando el problema (a veces el
drama) que viven sus investigadores; en œltimas son las instituciones las que acreditan la
realización de investigación científica como parte de sus logros. Algunas universidades han
dado pasos en este camino aunque se encuentran diferencias significativas. Se conoce que
en universidades privadas como la Universidad de los Andes se dedica un profesional para
trÆmites administrativos de permisos y autorizaciones ambientales vinculados con investigación en diferentes proyectos. En contraposición, una institución como la Universidad Nacional
de Colombia, que registra el mayor número de grupos de investigación en categoría A, B y C
en genética y biología molecular no ofrece apoyo alguno a sus investigadores en esta materia.
La solución no se puede plantear como la eliminación del régimen de acceso previsto en
la Decisión 391 de 1996. Vista como una cuestión regional, la legislación sobre acceso expresa una decisión política de los países andinos inspirada en el propósito de fortalecer sus
capacidades de negociación y de desarrollar la ciencia y tecnología a nivel local, nacional y
regional. Frente a una situación en la que los beneficios económicos fluyen sólo hacía los
países usuarios de los recursos genéticos, la Decisión 391 de 1996 desarrollando el Convenio
de Diversidad Biológica (CDB), busca que los países proveedores participen en la distribución
de beneficios derivados de la utilización de recursos genéticos.
¿Por quØ el rØgimen de acceso andino no ha conseguido estos objetivos? es una pregunta
que no se resuelve con su eliminación, ni con la modificación de sus elementos estructurales. La
abolición del régimen de acceso nos llevaría al paradigma anterior al CDB; una situación
paradisíaca para los biopiratas que continuarían colectando recursos genéticos como "patrimonio común de la humanidad" para luego constituir derechos de propiedad intelectual sobre
componente de la biodiversidad.
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Rev. Colomb. Biotecnol. Vol. VIII N° 1 Julio 2006
3-4
Quienes no tienen esta diversidad biológica saben lo que está en juego y sacan ventajas de
todas las oportunidades. Los negociadores por Colombia y Perœ en el TLC apostaron ingenuamente a que Estados Unidos reconociera la legislación de acceso de la región andina. Este
país, que no ha firmado el CDB frente a 189 países, no tuvo pudor en ignorar las pretensiones
colomboperuanas. Al contrario, aprovechó la ligereza de incluir la biodiversidad en las negociaciones para sacar beneficios adicionales: no sólo desconoció el carácter obligatorio del régimen
de acceso andino sino que impuso los contratos bilaterales como el mecanismo idóneo para
acceder a los recursos genéticos1.
Adicionalmente como resultado de las negociaciones, Colombia se compromete a "suministrar las bases de datos públicamente accesibles" sobre conocimientos tradicionales2. Las
bases de datos pueden ser un instrumento para evitar patentes que no cumplan el requisito de
novedad, pero al mismo tiempo pueden simplemente permitirle al bioprospector reducir los costos asociados con la búsqueda de información sobre biodiversidad y conocimientos tradicionales.
Cumpliendo el propósito de reforzar el régimen de propiedad intelectual, el TLC le permite
a Estados Unidos garantizar las herramientas para que sus instituciones e investigadores aprovechen sus ventajas científico-técnicas y patenten elementos de la biodiversidad: Colombia no
sólo quedó obligada a ratificar el Convenio UPOV 1991 y el tratado de Budapest sobre
microorganismos sino que se compromete a realizar "todos los esfuerzos razonables" para
establecer patentes sobre plantas3.
El acceso legal a recursos genéticos reconociendo a Colombia como país de origen, es
más que un asunto jurídico administrativo. En la medida en que las modernas biotecnologías le
otorgan valor potencial a todo material genético, el acceso a la diversidad biológica y a la información genética adquiere una importancia estratégica. Lo cierto es que el investigador que
busque aportar con su trabajo al fortalecimiento de las capacidades nacionales tiene tambiØn
abierto el camino para trabajar en la solución del problema. Por ejemplo, puede forjar alianzas
estratégicas con investigadores de otros países respetando los derechos establecidos sobre la
biodiversidad y el conocimiento tradicional asociado a su uso y manejo. Es claro que su labor
tiene implicaciones políticas y económicas: la información que colecta de pueblos indígenas
sobre manejo y uso de recursos biológicos puede ser la base de nuevos compuestos bioquímicos o de productos de importancia comercial.
En todo caso el investigador, nacional o extranjero, necesita certeza jurídica para emprender inversiones de tiempo o de recursos significativas. Sin un rØgimen que garantice procedimientos
de acceso oportunos y seguros el país pierde la opción de atraer mayor desarrollo científico y
técnico. Portante, la reglamentación que se construya en materia de acceso a recursos genéticos
debe establecer un equilibrio entre facilitar la investigación, afirmar la soberanía de Colombia
como país de origen y reconocer los derechos de los pueblos indígenas y comunidades locales
sobre su conocimiento tradicional. Es claro que sin investigación no se puede agregar valor a la
diversidad biológica, no se reconocen los conocimientos tradicionales, no se dispone de la
información técnica y científica que haga viable su utilización sostenible, y finalmente, se elimina
toda posibilidad de distribuir beneficios derivados de su utilización.
1
Carta de entendimiento anexa al Tratado de Libre Comercio entre Estados Unidos de AmØrica y Colombia sobre Biodiversidad
y Conocimiento Tradicional.
2
Ibídem.
3
Véase capítulo XVI, Derechos de propiedad intelectual, Tratado de Libre Comercio entre Estados Unidos de Am érica y
Colombia.
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