Presentación de PowerPoint

Análisis filogenético de microalgas del genero Dunaliella
(Chlorophyceae, Dunaliellales)
Dunaliella (Chlorophyceae) … desde 1836 …
1836 - Turpin (Francia) “Globularia kermesina”
1837 - Dunal (Salinas de Montepellier, Francia)
“Haematococcus salinus”,
“Protococcus salinus”
1905 - Teodoresco (Bucarest, Rumanía)
Diferentes hábitats
Importancia de Dunaliella
Dunaliella salina - carotenos (β-caroteno)
Alimentos y suplementos dietéticos, piensos, cosmética
- glicerol (farmacéutica, cosmética)
Dunaliella tertiolecta – acuicultura
Dunaliella acidophilla (pH 0-3) – estudios de transporte iónicos, homeostasis (pH)
carotenos
glicerol
Taxonomia tradicional: caracteres morfológicos y fisiológicos
(Género Dunaliella: 28 especies reconocidas)
Dibujos y clave adaptados de Massyuk (1973) y Borowitzka y Siva (2007)
Metodología
Extracción ADN
PCR
Secuenciación
FUENTE
PROCESADO
ANÁLISIS (n=157)
Metodología
ITS (Internal Transcribed Spacer)
For
18s rDNA
ITS1
5.8s
ITS2
26s rDNA
Rev
Goff et al. (1994) J. Phycol. 30: 521-37
ITS2 Database
http://its2.bioapps.biozentrum.uni-wuerzburg.de/
Softwares: 4SALE, ProfDistS, CBCAnalyzer
Section
Peirceinae
Taxonomía Tradicional
Assunção et al. J. of Applied Phycol. (2012): 24(4), 635-639
Section
Dunaliella
Subgenus
Dunaliella
Section
Viridiae
Section
Tertiolecta
Género Dunaliella
Subgenus
Pasheria
Subgénero Pacheria
Subgénero Dunaliella
3 Clados de D. salina
+ D. salina ITC5.105 “Janubio”
4 Clados de D. viridis
+ D. viridis var. palmelloides
+ D. viridis var. euchlora
1 Clado tertiolecta
D. pseudosalina
Assunção et al. Aquatic Systems. 2012: 8-2
Assunção et al. Phycol. Res. Accepted
Section
Peirceinae
Section Viridiae
Subgenus
Dunaliella
Section
Dunaliella
Section
Tertiolecta
Subgenus
Pasheria
Taxonomía tradicional
Taxonomía molecular
Assunção et al. Phycol. Res. Accepted
Distribución geográfica (D. salina)
ITS (Internal Transcriber Spacer)
CC
CC: Islas Canarias
Lanzarote
Fuerteventura
Gran Canaria
Mainland of Spain
France
Tunisia
Israel
Mongolia
China
Australia
Mexico
Chile
subclade2
Dunaliella salina ITC5105 “Janubio”
Dunaliella salina AC144
Dunaliella salina 9802
Dunaliella salina UTEX1644
0.99
Dunaliella salina CCAP19/25
Dunaliella salina CONC007
1.00
Dunaliella salina CONC001
0.97
Dunaliella salina ITC5118 “Île de Ré 01”
Dunaliella salina ITC5122 “Île de Ré 05”
Dunaliella salina ITC5119 Île de Ré 02”
0.83
Dunaliella salina CONC006
Dunaliella salina DCCBC1
1.00
Dunaliella salina CCAP19/18
0.97 Dunaliella bardawil nomen nudum [salina] CCAP19/30
1.00
Dunaliella salina ITC5114¨”La Tapa”
Dunaliella salina CCAP19/12
Dunaliella bardawil nomen nudum [salina] ATCC30861
0.92
Dunaliella bardawil nomen nudum [salina] ITC5000
0.98 Dunaliella bardawil nomen nudum [salina] UTEX2538
Dunaliella salina Taggu
1.00
Dunaliella salina OUC66 “hd4”
Dunaliella salina OUC38 “hd3”
Dunaliella salina OUC36 “hd2”
Dunaliella salina OUC21 “hd1”
Dunaliella salina hd6
1.00
Dunaliella salina hd5
Dunaliella salina Yucatan
Dunaliella salina ITC5107 “Añana”
Dunaliella salina ITC5106 “Majo”
Dunaliella salina ITC5104 “Guatiza”
Dunaliella salina ITC5103 “Rio”
Dunaliella salina ITC5102 “Tenefé”
Dunaliella salina ITC5101 “Punta”
Dunaliella salina ITC5100 “Vargas”
0.1
Dunaliella salina ITC5003 “BCA421”
0.80
subclade1
Otras Dunaliella species
35 cepas D. salina, 12 nuevos aislamientos, 8 aislamientos CC
Assunção et al. Aquatic Systems. 2012: 8-2
CBC (Compensatory Base Changes): Discriminar species
ESPECIE (unidad biológica): grupo de organismos capaces de entrecruzarse y de producir descendencia fértil
ITS2 Database: http://its2.bioapps.biozentrum.uniwuerzburg.de/
CBC (Compensatory Base Change): estructura 2aria del ARN
4SALE, CBCAnalyzer
*Prever la compatibilidad sexual entre 2 individuos
(>1CBC entre 2 individuos = diferentes especies)
(0CBC
“
= ????)
*Müller et al. 2007. RNA, 13:1469-1472; Coleman, 2009. Mol.Phyl. & Evolution 50:197-203
CBC (Compensatory Base Changes): Discriminar species
Müller et al. 2007. RNA, 13:1469-1472; Coleman, 2009. Mol.Phyl. & Evolution 50:197-203
CBC (Compensatory Base Changes): Discriminar species
D. viridis var. palmelloides CCAP11/34
D. lateralis
(>3CBC)
Diferentes grupos de D. viridis
Diferentes grupos de D. salina
(>cepas con >1CBC)
D. salina ITC5105 (Janubio)
(0CBC-2 cepas)
D. acidophila
D. pseudosalina
…
(>cepas con >1CBC)
Assunção et al. J. of Applied Phycol. (2012): 24(4), 635-639
Assunção et al. Aquatic Systems. 2012: 8-2
Assunção et al. Phycol. Res. Accepted
Conclusiones
1- Desacuerdo entre taxonomía tradicional y molecular
2- Subgénero Pascheria: Se propone que quede obsoleto.
3- Dunaliella salina: 3 grupos biológicos distintos.
Cepa Canaria (ITC5105) originaria de las salinas “Janubio” de Lanzarote
4- Dunaliella viridis: 4 entidades biológicas distintas
“D. euchlora” y “D. palmelloides”
5- Dunaliella pseudosalina: No pertenece a la sección Dunaliella
6- Sección Tertiolecta: Diferentes especies = misma secuencia
7- CBC: Útil y practico cuando funciona
8- No existe información geográfica
9- especies mal identificadas.
GRACIAS