Microbiología General 2006 - 2007

Microbiología General
2006 - 2007
Grupos de microorganismos
importantes en agronomía
Formación de la tierra
Aparición de
los animales
Origen de los
procariontes
Eucariontes
multicelulares
Eucariontes
Origen de los
eucariontes
Procariontes
Origen de la
fotosíntesis oxigénica
http://www.bacterialphylogeny.com/
Taxonomía y filogenia
Historia evolutiva de los
microorganismos
Identificación
Clasificación
Nomenclatura
Clasificación
filogenética
Clasificación que refleja la historia
evolutiva de los microorganismos
basada en comparación de
secuencias de
RNA 16S
Genomas
Grupos de
genes
Universal tree of life
Árbol filogenético universal
Universal tree of life
Árbol filogenético universal
Filogenia basada en la comparación de
secuencias representativas del ARN
16S de organismos seleccionados en los
tres reinos
El Reino Archaebacteria pasó a
denominarse Archaea con posterioridad
a la publicación de este trabajo
Woese, C. 1987.Bacterial evolution. Microbiological Reviews 51: 221-271
Gram positivas
Gram negativas
• Las bacterias representan la mayor
parte (90%) de los procariontes
conocidos.
• Actualmente se clasifican en 25
grupos taxonómicos o phyla sobre la
base de la secuencia del 16s-RNA
Gram negativas
Proteobacterias
Alpha
Caulobacterales - ej. Caulobacter
Acidithiobacillales
Parvularculales
Aeromonadales - ej. Aeromonas
Rhizobiales - ej. Rhizobium
Alteromonadales - ej. Pseudoalteromonas
Rhodobacterales
Cardiobacteriales
Rhodospirillales - ej. Acetobacter
Chromatiales – bacterias púrpura del S
Enterobacteriales - ej. Escherichia
Rickettsiales - ej. Rickettsia
Sphingomonadales ej. Sphingomonas
Gamma
Burkholderiales - ej. Bordetella
Pasteurellales - ej. Haemophilus
Methylophilales
Pseudomonadales - ej. Pseudomonas
Neisseriales - ej. Neisseria
Nitrosomonadales – ej. Nitrosomonas
Rhodocyclales
Desulfarcales
Syntrophobacterales
Desulfuromonadales
Thiotrichales - ej. Thiomargarita
Vibrionales - ej. Vibrio
Xanthomonadales - ej. Stenotrophomonas
Procabacteriales
Myxococcales - Myxobacteria
Methylococcales
Oceanospirillales
Hydrogenophilales
Beta
Legionellales - ej. Legionella
Bdellovibrionales
Delta
Desulfobacterales
Desulfovibrionales
Desulfurellales
Epsilon
Nautiliales
Campylobacterales - ej.g. Helicobacter
Clase Bacteroidetes
Bacteroidetes
Bacteroides
Bacteroidales
Clase Flavobacteria
Clase Sphingobacteria
Bacillus
Bajo contenido en G+C
Firmicutes
Bacillales
Lactobacillales
Clostridum
Mollicutes
Mycobacterium
Alto contenido en G+C
Actinobacteria
Streptomyces
Firmicutes
B. cereus
Bacterias Gram-positivas
con bajo contenido en G+C
Bacillus
B. anthracis
B. thuringiensis
Bacillales
Staphylococcus
Staph. aureus
Enterococcus
Bacilos
Lactobacillus
Lactobacillales
Lactococcus
Streptococcus
Pediococcus
Oenococcus
C. botulinum
Clostridios
Clostridium
C. tetani
C. perfringens
Mollicutes
Mycoplasma
Phytoplasma
Actinobacteria
Bacterias Gram-positivas
con alto contenido en G+C
Mycobacterium
Streptomyces
Corynebacterium
Frankia
Propionibacterium
Grupos de microorganismos más importantes en agronomía
procarióticos
eucarióticos
protozoos
Gram
negativos
aerobios
anaerobios
acelulares
algas
positivos
esporulantes
no esporulantes
líquenes
hongos
Clasificación
estructural
Otros microorganismos
bacterias
viroides
vegetales
priones
animales
Hongos
filamentosos
Levaduras
obligados
facultativos
virus
Clasificación
funcional filogenética
Ascomicetos
Deuteromicetos
Basidiomicetos
“perfectos”
“imperfectos”
Microorganismos Gram negativos aerobios
Grupo de los rizobios
Agrobacterium
Fijación de nitrógeno en simbiosis
Patógeno vegetal
Ingeniería genética vegetal
Brucella
Patógeno de animales y humanos
Acetobacter y Gluconobacter
Producción industrial de vinagre
Azotobacter
Fijación de nitrógeno en vida libre
Patógeno de animales y humanos (oportunista)
Pseudomonas
Patógeno vegetal
Agente de deterioro de alimentos
Agente de biorremediación
Pseudomonas
Pseudomonas
Azotobacter
Ferredoxina
(oxidada)
Ferredoxina
(reducida)
Fe
(reducido)
MoFe
(oxidado)
Nitrogenasa I
Nitrogenasa
II
Fe
(oxidado)
MoFe
(reducido)
Brucella
B. mellitensis
B. abortus
Microorganismos Gram negativos
anaerobios facultativos
Enterobacteriaceae
Fermentación ácido-mixta
Fermentación butanodiólica
Escherichia
Serratia
Shigella
Enterobacter
Salmonella
Klebsiella
Yersinia
Erwinia
Vibrionaceae
Aeromonas
Vibrio
Enterobacteriaceae
Enterobacteriaceae
Erwinia carotovora
Erwinia amylovora
Erwinia amylovora
Erwinia amylovora
Vibrio
Microorganismos Gram-negativos
anaerobios obligados
Ecología de la producción de metano
Organismos
metanógenos
Microorganismos Gram positivos
esporulantes
Formación de la endospora
Bacillus thuringiensis
Bacillus thuringiensis
Bacillus
thuringiensis
El gen Bt se
inserta en un
cultivo
El insecto plaga muere al comer cualquier
parte de la planta transfromada
Bacillus thuringiensis
Clostridium botulinum
Clostridium botulinum
Clostridium tetani
Clostridium tetani
Microorganismos Gram positivos no esporulantes
Streptococcus
bacterias lácticas
Leuconostoc
Pediococcus
Lactobacillus
Staphylococcus
Otras bacterias
Listeria
Corynebacterium
grupo corineforme
Propionibacterium.
Frankia
Actinomicetos
Streptomyces
Mycobacterium
Microorganismos Gram positivos
no esporulantes
Bacterias lácticas.
Streptococcus
Leuconostoc
Pediococcus
Lactobacillus
Staphylococcus aureus
Staphylococcus aureus
Listeria
Frankia
Streptomyces