Citrobacter freundii

ENCUESTA 58
CEPA ENVIADA: Citrobacter freundii
El género Citrobacter,originalmente comprendía dos especies: Citrobacter freundii y Citrobacter
koseri (también llamado Citrobacter diversus durante algún tiempo). Con el avance de la
Biología Molecular quedó integrado por 11 especies. Estas especies no sólo pueden separarse
por diferencias en su material genético sino que también pueden utilizarse algunas pruebas
bioquímicas para identificarlas (Fig 1).
ORNITINA
MALONATO
+
INDOL
+
UREA
DULCITOL
MALONATO
+
MALONATO
C. freundii
C. gillenii
+
INDOL
+
C.werkmannii
+
MELIBIOSA
+
C. sedlakii
C. youngae
+
C. murliniae
+
Citrobacter sp 9
C. koseri
CITRATO
+
C. amalonaticus
C. farmeri
Fig 1. Diagrama dicotómico para llegar a especie en el género Citrobacter.
Para asegurar la identificación es necesario utilizar la tabla completa y, sobre todo, focalizar los
estudios de las siguientes pruebas:
C. freundii: melibiosa +
C.youngae: melibiosa C.murliniae: melibiosa C.werkmannii: melibiosa – , citrato +, acetato +, arginina +
C. braakii
C. gillenii: melibiosa +/-, citrato -/+, acetato –, arginina -/+
C. braakii : malonato –, citrato +, melibiosa +, movilidad +
Citrobacter sp 9 : malonato +, citrato -, melibiosa - , movilidad C. amalonaticus: melibiosa –, citrato +
C. farmeri: melbiosa + , citrato –
C. sedlakii: sacarosa –
C. koseri: sacarosa +/-, arginina +, movilidad +, citrato +
Todas las especies de Citrobacter se han aislado de muestras ambientales (agua, suelo, etc.),
alimentos y del tracto gastrointestinal de hombres y animales. Algunas de ellas son patógenas
oportunistas en el hospital y en menor medida en la comunidad. Producen infecciones
urinarias, infecciones del tracto respiratorio e infecciones de heridas principalmente en adultos
mayores de 65 años. Entre el 50 y el 60% de estas infecciones son polimicrobianas y se
asocian a altas tasas de mortalidad (18 – 50%) o internaciones prolongadas. La meningitis está
casi exclusivamente asociada a Citrobacter koseri y se da en niños menores de dos meses
(media 7 días de edad) con complicaciones graves (abscesos cerebrales) y frecuentes
secuelas neurológicas. La diseminación en estos casos se da por transmisión persona-persona
por parte de personal del hospital y menos frecuentemente por contaminación de madre a hijo.
Los muestreos ambientales son generalmente negativos.
Las especies nuevas C. gillenii (previamente genomoespecie 10) y C. murliniae (previamente
genomoespecie 11) se han encontrado en muestras clínicas, alimentos, animales y muestras
ambientales.
En Citrobacter del grupo C. freundii (Citrobacter freundii, Citrobacter youngae, Citrobacter
murliniae, Citrobacter braakii y Citrobacter werkmannii) la resistencia natural a beta-lactámicos
está dada por la presencia de cefalosporinasas inducibles de clase C. De esta manera, estas
bacterias (como la enviada en el control de calidad) normalmente presentan resistencia a
ampicilina y cefalosporinas de primera generación (corte del halo de cefalosporinas de tecera
generación en la proximidad de un disco de cefoxitina). Desde el punto de vista epidemiológico
es importante llegar a conocer la especie (en este caso C. freundii) aunque a los efectos
clínicos, como puede deducirse de lo anterior, alcanza con conocer el grupo al que pertenece
(en este caso grupo C. freundii). De este modo, aunque las pruebas de sensibilidad a
ampicilina y cefalotina den resultados de sensibilidad por punto de corte, deben ser informadas
como resistentes a estos antibióticos. Respecto de las cefalosporinas de tercera generación, si
no se trata de una mutante desreprimida, se informa la sensibilidad como tal, pero efectuando
una aclaración de que si se emplea en el tratamiento, puede fallar por selección de mutantes,
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que para esta especie rondan en 1 en 10 – 1 en 10 . La utilización de tratamiento combinado
con aminoglucósidos, si bien es recomendable si se decide el uso de estas cefalosporinas,
también puede fallar.
La importancia de llegar a conocer el grupo, reside en que todo esto no es válido para C.koseri,
que tiene una penicilinasa natural sólo activa sobre ampicilina (CKO-1), de expresión
constitutiva (1, 2).
C. amalonaticus y C. sedlakii presentan sendas cefalosporinasas inducible CdiA y SED-1. Esta
última fue encontrada también en C. farmeri y C rodentium. Por ello sus patrones de
sensibilidad se acercan más al de C. freundii que al de C. koseri (3,4,5).
.Para
llegar a grupo C. freundii hay dos pruebas escenciales: ornitina e indol.
Para definir C. koseri, además de estas dos se requiere al menos utilizar las pruebas de
malonato y melibiosa.
De esta manera también quedan agrupados C. sedlakii, por un lado y C. farmeri y C.
amalonaticus por otro, que presentan beta-lactamasas naturales diferentes como ya se dijera
anteriormente.
La prueba de SH2 a partir del TSI es sólo orientadora porque hay cepas dentro del grupo C.
freundii que son negativas (C.freundii 11 %, C. braakii 50%, C. gillenii 22%, C. murliniae 27%,
C. werkmanii 5% y C. youngae 28%) y otras de C. amalonaticus (12%) que son positivas (6).
Referencias bibliográficas
1.
Petrella, S., M. Renard, N. Ziental-Gelus, D. Clermont, V. Jarlier, and W.Sougakoff. 2006.
Characterization of the chromosomal class A beta-lactamase CKO from Citrobacter koseri. FEMS Microbiol.
Lett. 254:285–292.
2.
Underwood, S., and M. B. Avison. 2004. Citrobacter koseri and Citrobacter amalonaticus isolates carry
highly divergent beta-lactamase genes despite having high levels of biochemical similarity and 16S rRNA
sequence homology. J. Antimicrob. Chemother. 53:1076–1080.
3.
Oliva, B., M. C. Marinucci, G. Amicosante, A. Oratore, and P. M. Bennett.1987. Citrobacter diversus
4.
Perilli, M., N. Franceschini, B. Segatore, G. Amicosante, A. Oratore, C. Duez, B. Joris, and J. M. Frere.
ULA27 produces two forms of a chromosomal β-lactamase. J. Antimicrob. Chemother. 20:23–35.
1991. Cloning and nucleotide sequencing of the gene encoding the β-lactamase from Citrobacter diversus.
FEMS Microbiol.Lett. 67:79–84.
5.
Petrella, S., D. Clermont, I. Casin, V. Jarlier, and W. Sougakoff. 2001. Novel class A β-lactamase Sed-1
from Citrobacter sedlakii: genetic diversity of β-lactamases within the Citrobacter genus. Antimicrob. Agents
Chemother. 45:2287–2298.
6.
Brenner DJ, O’Hara CM, Grimont PAD, Janda JM, Falsen E, Aldova E, Ageron E, Schindler J, Abbott
SL, Steigerwalt AG. Biochemical Identification of Citrobacter species defined by DNA hybridization and
description of Citrobacter gillenii sp. nov. (formerly Citrobacter genomospecies 10) and Citrobacter murliniae
sp. nov. (formerly Citrobacter genomospecies 11). J Clin Microbiol. 1999; 37: 2619–2624.
Fig 2. Dendrograma de homología genética entre especies de Citrobacter y otras especies
relacionadas de enterobacterias. Agrupación según las beta-lactamasas naturales.