Proposta de Tesi a realitzar en el programa de doctorat de “Física Computacional i Aplicada” Tema: Estudi de membranes de fosfolípids en dissolució aquosa mitjançant simulacions de dinàmica molecular Es pretén continuar la recerca que es desenvolupa actualment al Grup de Recerca en Simulació per Ordinador en Matèria Condensada en el departament de Física i Enginyeria Nuclear de la UPC (FEN) en l'àmbit de l'estudi de les mebranes cel·lulars formades per fosfolípids en dissolució aquosa (bàsicament aigua i sistemes iònics). En la imatge al marge veiem una configuració estable del sistema bàsic. Donat que l'estructura d'aquests sistemes és prou coneguda, la part més novedosa de la recerca estarà orientada a l'estudi de la dinàmica dels fosfolípids , com ara el DMPC (di-myristoyl-phosphatidyl-choline) en medis d'aigua pura i en dissolució iònica. Un problema important a analitzar és el de la difusió de les cadenes lipídiques. Es preveu que durant la tesi es col·labori amb un grup experimental de la Universitat Tècnica de Münich i també amb investigadors del departament de FEN a la UPC. Perfil dels candidats: És un treball adreçat a Físics i Químics en general, però molt especialment a Físics de la Matèria Condensada i Químics-Físics. És important el coneixement de mètodes de càlcul numèric i llenguatges de programació (FORTRAN, C++, JAVA, etc.). Més informació: http://simcon.upc.edu/usr/jordi.marti Les persones interessades adreceu-vos a : Dr. Jordi Martí, Departament de Física i Enginyeria Nuclear, Universitat Politècnica de Catalunya, despatx B5-209 Campus Nord UPC, 08034 Barcelona Telèfon: 934017184 O escriviu a l'adreça de correu: [email protected] Versió en anglès: Tema: Study of phospholipid membranes in aqueous solution by molecular dynamics simulations Our aim is to follow the research developped currently at the Computer Simulation in Condensed Matter research group at the department of Physics anf Nuclear Engineering (FEN) at the Technical University of Catalonia, within the topic of the study of cellular membranes formed by phospholipids in aqueous solution (water and ionic systems). At the snapshot we can see a basic stable configuration of such a system. Given that structure of molecular biomembranes is quite well known, the most novel part of the thesis will be oriented towards the analysis of the phospholipid dynamics, such in the case of DMPC (di-myristoylphosphatidyl-choline) in aqueous media and in ionic solution. One of most relevant problems is that of diffusion of lipidic chains. It is expected that throughout the thesis we will have joint work with an experimental group from the Technical University of Munich and with researchers from the department FEN at the UPC as well. Candidates' profile: Physicists and chemists, especially from the areas of Condensed Matter and Chemical Physics, respectively. It is very important the knowledge and ability in numerical calculation procedures as well as programming languages such as FORTRAN, C++, JAVA, etc. Versión en castellano: Tema: Estudio de membranes de fosfolípidos en disolución acuosa mediante simulaciones de dinámica molecular Se pretende continuar con las investigaciones que se desarrollan actualmente en el Grupo de Investigación Simulación por Ordenador en Materia Condensada del departamento de Física e Ingenieria Nuclear de la UPC (FEN) en el ámbito del estudio de las mebranas celulares formadas por fosfolípidos en disolución acuosa (básicamente agua y sistemas iónicos). En la imagen vemos una configuración estable del sistema básico. Dado que la estructura de estos sistemas es ya bastante conocida, la parte más novedosa de la investgación estará orientada al estudio de la dinámica de los fosfolípidos, como por ejemplo el DMPC (dimyristoyl-phosphatidyl-choline) en medios de agua pura y en disolución iónica. Un problema importante para analitar es el de la difusión de las cadenas lipídicas. Se prevé que durante la tesis se colabore con un grupo experimental de la Universidad Técnica de Münich y también con investigadores del departamento de FEN en la UPC. Perfil de los candidatos: Es un trabajo dirigido Físicos y Químicos en general, pero muy especialmente a Físicos de la Materia Condensada y a Químicos-Físicos. Es importante el conocimiento de métodos de cálculo numérico y de lenguajes de programación como FORTRAN, C++, JAVA, etc.