Tema 6 Expresión y Regulación de Genes

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Tema 6
Expresión y
Regulación de Genes
Cap. 10, pág. 255-317
¿Qué es un gen?
¿Qué es un gen?
DNA
transcripción
mRNA
no se
traducen
tRNA
rRNA
snRNA
remoción
de intrones
en eucariotas
traducción
construcción de
ribosomas
Proteína
síntesis de proteínas
En
Eucariotas:
En Procariotas:
Estructura de un Gen
promoter
terminator
transcription start point
+1
5’
3’
open reading frame
DNA
5’
3’
ATG
stop
-10 sequence
región promotora: atrae a la RNA polimerasa
-35: punto de contacto inicial de la RNA polimerasa con el DNA
-10: lugar donde la RNA polimerasa comienza a desenrollar el DNA para comenzar
la trascripción
leader
sequence
promoter
terminator
transcription start point
+1
5’
3’
open reading frame
DNA
5’
3’
ATG
secuencia lider (Shine-Dalgarno):
5’-AGGA-3’ orienta correctamente
el mRNA en el ribosoma
stop
Estructura de un Gen
leader
sequence
promoter
terminator
transcription start point
+1
DNA
5’
open reading frame
3’
5’
3’
ATG
transcription
termination site
secuencia terminandora: al ser transcrita forma una
estructura 2º que causa que la RNA polimerasa
se detenga y se retire
leader
sequence
promoter
terminator
transcription start point
+1
5’
3’
open reading frame
DNA
5’
3’
ATG
mRNA
stop
open reading frame
5’
AUG
3’
stop
protein
amino
terminus
carboxy
terminus
DNA→RNA (transcripcion)
síntesis de RNA (3 pasos)
1. iniciación
2. elongación
3. terminación
Síntesis de RNA
Elementos Envueltos en Iniciación
1. RNA polimerasa
•se une a la región promotora
• separa las hebras de DNA
• polimeriza RNA en dirección 5’-3’
DNA
hebra con sentido
síntesis de RNA
RNA
DNA
• uracilo reemplaza a timina
• síntesis de RNA no requiere primer
• RNA polimerasa no tiene mecanismo de corrección
Síntesis de RNA
Elementos Envueltos en Iniciación
1. RNA polimerasa
2. factor sigma: proteína que permite que la RNA polimerasa
reconozca la región promotora y se una específicamente a ella
RNA polimerasa
(centro catalítico)
factor sigma
RNA polimerasa holoenzima
(centro catalítico + factor sigma)
región promotora
Síntesis de RNA (Trascripción)
1. iniciación: acoplamiento de la RNA polimerasa a la región promotora a con la ayuda
del factor sigma
-35 sequence
-10 sequence
Pribnow box
Síntesis de RNA (Trascripción)
Procariotas
• una sola RNA polimerasa para
promotores de diferentes genes:
mRNA
tRNA
rRNA
Eucariotas
tres tipos de RNA polimerasas: I, II y III.
RNA polimerasa I: rRNA
RNA polimerasa II: mRNA, snRNA
RNA polimerasa III: tRNA
• solo requiere el factor sigma
para encontrar el promotor
• varios proteínas accesorias son
necesarias para reconocer el
promotor
Síntesis de RNA (Trascripción)
2. elongación:
• comienza la trascripción
• el factor sigma es liberado,
•la cadena de RNA se extiende hasta alcanzar la región de terminación
Síntesis de RNA (Trascripción)
3. terminación:
• envuelve una secuencia al extremo 3’ del mRNA (región terminadora)
• se forma estructura secundaria en forma de horquilla
• este cambio conformacional desprende la RNA polimerasa
región terminadora
región terminadora
RNA
3’
5’
RNA
RNA
terminador intrínsico
Terminadores Dependientes del Factor Rho
• Rho (hexadímero) se une al mRNA
• Rho usa ATP para moverse a lo largo del mRNA
• la RNA pol. hace una pausa al final de la región terminadora y es alcanzada por el
factor Rho
• Rho desenreda la hebra hibrida de RNA y DNA liberando el mRNA y la RNA
región terminadora
OPERONES
RNA pol
P
gen
mRNA 5’
3’
RNA pol
P
mRNA 5’
RNA pol
gen
P
RNA pol
gen
P
gen
3’
mRNA 5’
3’
mRNA 5’
3’
RNA pol
P
RNA pol
gen
mRNA 5’
P
RNA pol
gen
P
gen
3’
mRNA 5’
3’
mRNA 5’
Operón
RNA pol
gen 1
P
mRNA
5’
proteínas
3’
gen 1
1
gen 2
gen 2
2
gen 3
gen3
3
3’
Operones
unidad reguladora que controla la transcripción de:
• genes funcionalmente vinculados
• físicamente asociados
• genes se transcriben en una molécula de
mRNA policistrónico (codifica varias proteínas
diferentes o distintos tipos de rRNA )
• ejemplos en procariotas:
operón de lactosa
operón de rRNA
Operón de Lactosa
lactosa (disacarido, galactosa + glucosa)
RNA pol
5’
Z
A
3’
mRNA policistrónico
traducción
Lac Z
beta galactosidasa:
descompone la lactosa
en galactosa y glucosa
Lac Y
permeasa
de lactosa
Lac A
acetilasa de
betagalactósidos
(añade -COCH3)
Operón de rRNA
Operón de rRNA
Separación de diferentes tipos de rRNA por centrifugación en un gradiente de sucrosa
Operón de rRNA
+ 21 proteínas
+ 34 proteínas
subunidad 30S
subunidad 50S
ribosoma procariota 70S
Síntesis de Proteínas
Síntesis de Proteínas
Introducción al tRNA
Amino-acil tRNA sintetasa
Phe
Phe
Síntesis de Proteínas
Complejo de Iniciación (mRNA, 30S, tRNA-met, 50S)
Ensamblaje requiere varias proteínas llamadas factores de iniciación y energía de GTP
Síntesis de Proteínas Elongación (llegada de un tRNA + enlace péptido
A=acceptor
P= peptide
E= exit
P-site
A-site
Síntesis de Proteínas
1.Elongación: culmina con enlace péptido 2.Translocación
(requiere el factor de elongación EF-G)
E-site
P-site
A-site
Síntesis de Proteínas
Translocación-Elongación
E-site P-site A-site
Síntesis de Proteínas
Removal of formyl group
formyl
Met
formyl
Peptide deformylase
Met
Methionine aminopeptidase
Met
Functional protein
Trascripción y traducción en procariotas versus eucariotas
Modificaciones del mRNA Eucariota
7-methyl guanosine (5’-cap)
mRNA
intron 1
intron 2
5’
intron 3
AAAAA
3’
poly-A tail
The 5' cap has 4 main functions:
1. Regulation of nuclear export.
2. Prevention of degradation by exonucleases.
3. Promotion of translation
4. Promotion of 5' proximal intron excision.
• transcription
termination signal
• protection against
degradation
Trascripción y traducción en procariotas versus eucariotas
Doblamiento Global de Polipéptidos
doblamiento después de síntesis
espontáneo
con ayuda de proteínas
chaperonas
Efecto de Antibióticos en Síntesis de Proteínas
http://ribosome.bb.iastate.edu/70SnKmode/
Efecto de Antibióticos en Síntesis de Proteínas
aplicación clínica basada en especificidad
por ribosomas procariotas
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