IV Curso de Invierno 2006 “La Función de las algas en el desarrollo de cultivos marinos integrados” Tópico: Función bacteriana en la regeneración de nutrientes Carlos Aranda Borghero [email protected] Objetivos Rol de bacterias en la regeneración de nutrientes • Definir conceptos • Describir actores biológicos • Conocer los procesos que ocurren en ambientes naturales v/s aquellos con enriquecimiento orgánico • Indicar lo que no sabemos “Los desechos de la acuicultura intensiva pueden ser comparados con los efluentes tanto industriales como domésticos, agregando grandes cantidades de carbono, nitrógeno y fósforo al ambiente acuático” Troell M y Berg H (1997) Aquaculture Research, 28: 527-544 ¿Cuál es el destino de los nutrientes contenidos el material orgánico particulado que sedimenta en el fondo marino? C:P en material orgánico disuelto (MOD) y material orgánico particulado (MOP) en ecosistemas con escasa perturbación captación (selectiva) MOD C:P 200-600 advección/ difusión “grazing”, exudación, lisis MOP (vivo) C:P 100-150 hidrólisis, disgregación MOP(muerto) C:P 150-200 agregación (menos selectiva) Es difícil poder aumentar esos valores. lisis/ captación undimiento y levantamiento de partículas (bioenturbiamiento) Primeras consideraciones • El material orgánico que sedimenta: proteínas, lípidos, ácidos nucleicos, carbohidratos, vitaminas y otras moléculas biodegradables. • Biodegradación (CO2, H2O, NH4+, PO4+3, etc). • Nutrientes: especies de N, P (entre otros) – Diagénesis – Regeneración Biodegradación Las bacterias acoplan las reacciones de oxidación y de reducción y canalizan la energía la energía liberada para la producción de ATP. En este acoplamiento, las bacterias transfieren poder reductor a intermediarios que también pueden ser usados en la biosíntesis. Ej.: NAD+ + 2e- + 2H+ Î NADH + H+ Sistemas alternativos para la alimentar la síntesis de ATP (1) Sistemas alternativos para la alimentar la síntesis de ATP (2) Sistemas alternativos para la alimentar la síntesis de ATP (3) En resumen: Fe2+ (FeO) Mn2+ (MnO) Sº H2 S H2 NH4+ CH4 Adaptado de: Nealson KN (1997) Annu Rev Earth Planet Sci. 25: 403-34. Degradación de la materia orgánica en sedimentos marinos (Adaptado de Wimpenny y Peters, 1987; Witzel, 1990) Material orgánico particulado O2, NO3- , NO2-, Fe (III), Mn (IV) Descomposición de Monómeros H2O, N2, Fe (II), Mn (II), CO2 Utilización de Acidos Grasos, amonificación y remineralización de fósforo CO2,, NH4+, PO4-3, H2S SO4= ACIDOGENESIS H2S Reducción de sulfato heterotrófica (Fermentadores, Formatogénicos y Acetogénicos) Hidrogeno CO2 Formato Acetato CO2 H2 Metanogénesis CH4 H2S Reducción de sulfato quimiolitotrófica (mixotrófica) Bacterias reductoras de sulfato Responsables de las mayores tasas de mineralización de la materia orgánica en sedimentos marinos Los más comunes son quimio-organotróficos anaerobios estrictos. (e.g.:Desulfovibrio y Desulfomaculumk) Piruvato, Lactato, Acetato SO4-2 Desulfovibrio H2S CO2 Piruvato, Lactato, Acetato Bacterias reductoras de sulfato Otros son litotróficos anaeróbicos estrictos principalmente mixotróficos (e.g.: Desulfosarcina/Desulfococcus) H2 SO4-2 Desulfosarcina H2S H2O Carbono orgánico Acoplamiento redox organotrófico y quimiolitotrófico en interfase microaerofilia-hipoxia CO2 NO3-, Mn(IV), Fe(III), SO42-, CO2 Respiración anaeróbica O2, NO3-, Mn(IV) Quimiolitotrofía Hidrólisis de R-NH2 CH2O NH4+, Mn(II), Fe(II), S(-II), CH4 H2O, N2, Mn(II), H+ CO2 Algas O2 Material orgánico + + + + + + O2 H2O NO3- N2 MnO2 Mn2+ FeOOH Fe2+ H2 S SO4-2 CO2 CH4 + CO2 + NH4+ Bo.B. JØrgensen 2006, BEME I, Dichato Profundidad de penetración de oxígeno en el fondo marino (mm) 25 µm Mineralizacación de carbono por oxígeno en el fondo marino Glud y Wenzhöfer, 2002 Gradientes de Mn2+, Fe2+ y H2S en el agua intersticial en un sedimento costero con penetración de oxígeno inferior a 5 mm. Canfield y col. 1993. Geochim Cosmochim Acta. 57: 3867-83. (µM) 0 0 50 100 150 200 250 O2 De pth (cm ) 2 4 FeOOH Mn2+ Fe2+ FeS 5 cm 6 H2S 8 10 Tasa de reducción de sulfato SRR (nmol cm-3 d-1) (µM) 0 0 50 100 150 0 200 250 0 O2 4 2 Fe2+ 6 Depth (cm ) De pth (cm ) 2 Mn2+ 4 6 H2S 8 8 10 10 10 20 30 40 % de valor máximo Produndidad (mm) Perfil geoquímico típico de un sedimento marino con 50 mm de penetración de oxígeno Adaptado de: Nealson KN (1997) Annu Rev Earth Planet Sci. 25: 403-34. % de valor máximo Produndidad (mm) Nitrificación/Denitrificación Normalmente en sedimentos aeróbicos, el nitrato es generado por la oxidación del amonio (quimiolototrofía aeróbica), el amonio proviene de los procesos proteolíticos. Obsérvese como las especies oxidadas del N desaparecen hacia la superficie Adaptado de: Nealson KN (1997) Annu Rev Earth Planet Sci. 25: 403-34. Ciclo del Nitrógeno N2 N2O NOP NOD NH4+ NO3-/NO2- L.P.Nielsen 2006, BEME I, Dichato Nitrificación • Oxidación quimiolitotrófica aeróbica de amonio a nitrato vía nitrito. • Las bacterias nitrificantes son un pequeño grupo de bacterias autotróficas (Nitrosomonas, Nitrobacter) • Una nitrificación ineficiente conduce a la acumulación de amonio y/o nitrito. Denitrificación • Reducción anaeróbica de nitrato a N2 (g) • La realizan mayoritariamente aeróbicos facultativos que usan nitrato si oxígeno está asente. • Pueden ser: – heterotróficas (Pseudomonas sp.), – quimilitotróficas obligados (Thiobacillus denitrificans), – facultativos (Paracoccus denitrificans, Halococcus halodenitrificans) • Limita la acumulación de nitrógeno en los ecosistemas y ayuda a mantener el pool atmosférico. ...Sin embargo, N2O es un intermediario que también puede escapar a la atmósfera. ¿ Qué ocurre en sedimentos enriquecidos por acumulación de residuos orgánicos? Detección de sedimentos acumulados por sistemas electroacústicos 25 m La cantidad de sedimentos acumulados depende de múltiples factores que afectan el balance entra la tasa de sedimentación de fecas y alimentos no consumidos v/s la actividad microbiana de descomposición y/o diagénesis (eliminación de CH4 y CO2 y/o mineralización ). Imagen tomada de Wildish DJ y col. (2004) Mar Ecol Prog Ser. 267: 99–105 1. La descomposición del material orgánico produce hipoxia y mayores tasas de reciclaje de nutrientes … … Acoplamiento redox organotrófico – quimiolitotrófico…no tan malo 2. Los sedimentos permanecen oxidados mientras los aceptores de electrones tales como el O2, Mn(IV) y Fe (III) están disponibles, pero cuando estos se agotan, los sedimentos se hacen altamente reducidos y con acumulación de sulfuros. 3. Este ambiente es desfavorable para el crecimiento y sobrevivencia de organismos bentónicos, los cuales tienden a desaparecer reduciendo el bioenturbiamiento. 4. Los procesos bacterianos se convierten en dominantes. 5. Se inhiben las actividades bacterianas aeróbicas como la nitrificación, lo cual también limita la denitrificación, resultando en mayores tasas de liberación de amonio desde los sedimentos. 6. El consumo del pool de especies oxidadas de Fe (normalmente escaso en fondos marinos con altas tasas de sedimentación de MOP) puede contribuir a la liberación de fosfatos desde los sedimentos (v/s diagenésis), debido a la menor captación (retención) por Fe oxidado. ….estimulación de la producción primaria. 7. La reducción de sulfatos se convierte en el proceso de mineralización más importante de la materia orgánica (lixiviados ácidos), incrementando la producción de sulfuros. 8. La acumulación de sulfuros reduce drásticamente la biodiversidad. 9. Si los sulfatos se agotan, la metanogénesis se convierte en el proceso dominante. Se acumulan burbujas de metano en los sedimentos que pueden aflorar y arrastrar H2S(g). …Este es el peor escenario y un claro signo de acumulación de materia orgánica, y por lo tanto, de malas prácticas de cultivo. Wu RS (2002) Marine Pollution Bulletin 45: 35–45. Residuos orgánicos Material orgánico particulado NH4+ Hipoxia H2 S Efectos biológicos, ecológicos ¿Sinergistas? ¿Aditivos? Wu RS (2002) Marine Pollution Bulletin 45: 35–45. Algunos parámetros indicadores Adaptado de : Wildish DJ y col. (2004) Mar Ecol Prog Ser. 267: 99–105 Imágenes de un perfil de sedimento normal y otro con enriquecimiento orgánico Enriquecido Normal a: Agua de mar b: Residuos de alimentos no descompuesto y fecas de los peces en cultivo c: Cuerpos blancos (Beggiatoa sp.) d: Depósitos no orgánicos e: Sedimentos oxidados f: Capas negras ricas en sulfuros metálicos Wildish DJ y col. (2004) Mar Ecol Prog Ser. 267: 99–105 Fondos marinos costeros: ...Sucesión antropogénica, desde ambientes oxigenados hasta fondos anóxicos cubiertos por tapetes bacterianos sulfurooxidantes del género Beggiatoa. 10 µm Fyns Amt (2001) Aquatic Environment of Fyn, Denmark, 1976-2000 Ciclo del Nitrógeno N2 N2O NOP NOD NH4+ NO3-/NO2- L.P.Nielsen 2006, BEME I, Dichato RDNA (DNRA) Redución desasimilatoria de nitrato a amonio • Proceso inverso a la nitrificación • La realizan bacterias anaeróbicas (microaerofílicas) que usan nitrato como aceptor de electrones (cuando está disponible) • Incluye a las bacterias filamentosas del azufre (Beggiatoa) Bacterias sulfuro oxidantes del género Beggiatoa Autotróficos y Mixotróficos: Utilizan CO2 o lixiviados ácidos como fuente de carbono y H2S como fuente de poder reductor, produciendo azufre elemental (depósitos internos) y posteriormente sulfatos Almacenan nitratos solubles en vacuolas que usan en la oxidación de sulfuros y azufre (se ha medido hasta 0,5 M) H2S NO3O2 Beggiatoa SO4-2 CO2 Ácidos orgánicos NH4+ H2O Materia orgánica Amonio Nitrato R d e ed u n i cc tr ió at n o de a s a m as on im io ilat or ia Amonio Agotamiento de O2 Anoxia H2 S Denitrificación v/s RDNA Se observa que en sedimentos cubiertos con Beggiatoa casi no existe denitrificación. ¿Competencia por un nicho o nichos diferentes? ¿Mayor eutrofización? Anamox (anaerobic ammonium oxidation) Anamox en el Mar Negro (Black Sea) Kuypers y col (2003) Nature, 422: 608-611 Amonio Nitrato Materia orgánica Amonio R d e ed u n i cc tr ió at n o de a s a m as on im io ilat or ia N2 Agotamiento de O2 Nitrito Anoxia H2 S Conclusiones • El fósforo contenido en los residuos culmina en la columna de agua principalmente como fosfato inorgánico. • En sedimentos con enriquecimiento orgánico, el nitrógeno se regenera principalmente como amonio en vez de nitratos. • Ciclos nitrificantes-denitrificantes se ven reducidos y desplazados en sedimentos con hipoxia severa. • El sulfuro se libera a altas tasas desde los sedimentos anóxicos, sin embargo, puede ser re-oxidado en la superficie o en la columna de agua. • La magnitud de la oxidación anaeróbica de amonio como proceso para la eliminación del nitrógeno puede ser considerable, pero aun no ha sido estudiada en ecosistemas que sustentan acuicultura intensiva en el sur de Chile.