TEMA 1. ADN, GENES Y GENOMAS 1 Definición 1.D fi i ió y conceptos t 2.- Naturaleza química y estructura del DNA 3.- Tipos de DNA eucariótico 4 - Genes: Intrones y exones 4.5.- Genomas: Tamaño y número de genes 1 FLUJO DE LA INFORMACIÓN GENÉTICA Estructura y composición química del ADN PREGUNTA RÁPIDA En el DNA del erizo de mar, por ejemplo, el 17,5% de bases nitrogenadas son citosinas (C) ¿Qué porcentaje de las otras tres bases contiene? 2 REPLICACIÓN DEL DNA Dos palabras que resuman la replicación del DNA -Semi… -Semi… 100 500 pb 100-500 3 Los cromosomas de organismos complejos tienen múltiples orígenes de replicación DNA polimerasa eucariótica- aprox. 50 nucleótido/s. R1, R2 y R3 son replicones (unidades de replicación) Aprox. 25.000 en células de mamífero O1, O2 y O3 son orígenes de replicación La distancia media entre orígenes de replicación adyacentes es de 5 a 300Kb en cromosomas de mamífero TRANSCRIPCIÓN DEL DNA 4 PROMOTOR Combinación de secuencias cortas de DNA en las proximidades del gen PROMOTOR Señales de reconocimiento para la unión de factores de transcripción PROMOTOR FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN Activa la RNA polimerasa para iniciar la transcripción en un sitio concreto TRANSCRIPCIÓN - Se realiza según las necesidades de la célula - Células diferentes transcriben fragmentos de DNA diferentes - Sólo una pequeña porción de DNA se transcribe a RNAm La gran mayoría del DNA de la célula no se transcribe nunca 5 TRADUCCIÓN: CÓDIGO GENÉTICO Señales de terminación Señal de iniciación y metionina Excepciones a la Universalidad UGA CUA AUA AGA AGG UAA UAG terminación leu ile arg arg terminación terminación trp (mitocond. humanas y levadura) thr (mitocondrias levadura) met (mitocondrias humanas) terminación (mitocondrias humanas) terminación (mitocondrias humanas) gln (Paramecium) gln (Paramecium) TRADUCCIÓN 6 - Algunos aminoácidos pueden ser transportados por distintas ARN transferentes que contienen distintos anticodones. - Algunos ARN-t pueden incorporar su aminoácido específico en respuesta a varios codones, de manera que poseen un anticodón que es capaz de emparejarse con varios codones dif diferentes. t Flexibilidad de la tercera base del anticodón (Tambaleo) Emparejamientos codón codón-anticodón anticodón permitidos Extremo 5' del anticodón (ARN-t) Extremo 3' del codón (ARN-m) G UoC C sólo G A sólo U U AoG I U, C o A DNA EUCARIÓTICO Genes de copia única Funcionales Func ona s DNA de secuencia repetida N codificante No difi nt Heterocromatina centromérica Sin función conocida DNA separador Codificante Repeticiones en tándem de número variable Transposones 7 GENES DE HISTONAS DNA TELOMÉRICO O Organismo i S Secuencia i repetida tid Tetrahymena 5' TTGGG 3' Paramecium 5' TTGGGG 3' Tripanosoma 5'TTAGGG 3' Arabidopsis 5' TTTAGGG 3' Homo 5' TTAGGG 3' REPLICACIÓN EXTREMOS DE CROMOSOMAS: DNA TELOMÉRICO 8 GENES EUCARIÓTICOS SON DISCONTINUOS Exón: Parte del gen que da lugar a cualquier RNA maduro. Puede contener DNA codificante o no Intrón: DNA que separa los exones. No codificante . No aparece en el RNA maduro HIBRIDACIÓN DNA- mRNA DEL GEN DE LA OVOALBÚMINA 9 Maduración del RNA en varias etapas PROCESAMIENTOS ALTERNATIVOS EN DIFERENTES CÉLULAS Gen de la α-tropomiosina Corte y empalme mRNA 10 TAMAÑO DE ALGUNOS GENES HUMANOS (Kb) Tamaño gen Tamaño mRNA 1,5 1 5 1,7 11 25 34 45 186 300 > 2000 0,6 0 6 0,4 1,4 2,1 1,6 5,5 9 8,7 17 B-globina Insulina Protein.Kinasa Albumina Catalasa Receptor LDL Factor VIII Tiroglobulina Distrofina Número de intrones 2 2 7 14 12 17 25 36 > 50 TAMAÑO DEL GEN Y NÚMERO PROMEDIO DE EXONES Especies Promedio Promedio de Nº del largo de del gen exones ((Kb)) Promedio de largo mRNA ((kb)) Tamaño del genoma S. cerevisae 1 1.6 1.6 1.3x104 Fungi 3 1.5 1.4 2.7x104 C.elegans 4 4 3 8 x104 Drosophila melanogaster 4 11.3 2.7 1.4x105 Aves 9 13.9 2.4 1.2x106 7 16.6 2.2 3.3x106 Mamíferos 11 DISTRIBUCIÓN DEL NÚMERO DE EXONES EN LOS GENES Tamaño comparado de genomas 12 EL TAMAÑO DEL GENOMA NO ESTÁ RELACIONADO CON LA COMPLEJIDAD DEL ORGANISMO 103 104 105 106 107 108 Tamaño del genoma en KB GENOMAS: TAMAÑO Y NÚMERO DE GENES Genoma Saccharomyces cerevisiae i i C.elegans Grupo Levadura Nemátodo ArabidopsisThalia Planta na Homo sapiens p Humana Tamaño (Kb) Nº de genes 13.500 6.000 100.000 13.500 120.000 25.000 3.000.000 30.000 E.coli Bacteria 4.700 4.000 H. influenzae Bacteria 1.830 1.703 Methanococcus jannaschi Bacteria 1.660 1.738 13 TAMAÑO DEL GENOMA Y NÚMERO DE CROMOSOMAS Nº haploide de cromosomas Levadura Drosophila Gallina Ratón Hombre Maíz Cebolla (16) (4) (39) (20) (23) (10) (8) Tamaño del genoma (Mb) 14 170 1.200 3.000 3.000 5.000 15.000 14