Respiraciones anaeróbicas Bacterias sulfato reductoras. Metabolismo asimilativo y desasimilativo Reducción de compuestos NO3-, SO42-, CO2 Metabolismo Asimilativo -NH2, -SH Integración al metabolismo Metabolismo Desasimilativo Respiración anaerobia Eliminación Bacterias, arqueas, hongos, algas y plantas Procariotes Reducción del nitrato Genes involved in the sequential reduction of nitrate. http://www.geosc.psu.edu/~mbachmann/ Compuesto Estado de oxidación Nitrógeno orgánico (R-NH2) -3 Amonio (NH3) -3 Nitrógeno gas (N2) 0 Oxido nitroso (N2O) +1 Oxido nítrico (NO) +2 Nitrito (NO2-) +3 Dióxido de nitrógeno (NO2) +4 Nitrato (NO3-) +5 Reducción asimilativa y desasimilativa del nitrato Reducción del nitrato •Metabolismo desasimilativo Desnitrificación N03- → NO2- → NO → N2O → N2 •Complejo NADH deshidrogenasa (DH). •Nitrato reductasa (NAR). •Nitrito reductasa (NIR). •NO reductasa (NOR). •N2O reductasa (N2OR). Bacterias desnitrificantes totales o verdaderas •Paracoccus denitrificans Bacteria quimiolitótrofa del hidrógeno que puede emplear también compuestos de azufre. Crece autotróficamente en CO2 y como metilotrofo en compuestos de C1 como metanol y metalamina. •Pseudomonas stutzeri Bacteria Gram negativa quimioheterótrofa no fermentadora , no fluorescente,se encuentra en el suelo y puede vivir de manera saprófita en los humanos, no patógena. Respiración con nitratos Fuera 2 H+ Fp NADH + H+ 2e- N03- + 2e- + 2H+ → NO2- + H2O Fe-S •Nitrato reductasa. •Presente en bacterias aerobias facultativas. Citoplasma Q 2 H+ 2 H+ 2eCyt b556 NO3- + 2 H+ Nitrato reductasa NO2- + H2O ADP + Pi H+ ATPasa H+ ATP Reducción del sulfato Compuesto Estado de oxidación Azufre en compuestos orgánicos (R-SH) -2 Sulfuro (H2S) -2 Azufre elemental (Sº) 0 Tiosulfato (S2O32-) +2 Dióxido de azufre (SO2) +4 Sulfito (SO32-) +4 Sulfato (SO42-) +6 Reducción del sulfato •Reducción desasimilativa Reducción del sulfato. Enzimas. SO42- → APS → SO32- → H2S ATP → PPi. ATP sulfurilasa. 2e-. APS reductasa 6e-. Sulfito reductasa •Reducción asimilativa SO42- → APS → PAPS → SO32- → H2S ATP → PPi. ATP sulfurilasa. ATP → ADP. APS cinasa. 2e-. PAPS reductasa. 6e-. Sulfito reductasa. Respiración con sulfatos. •LDH. Lactato deshidrogenasa •H2asa. Hidrogenasa. •Hmc. Complejo acarreador de electrones. •APS. Adenosin fosfosulfato. Los electrones son donados por el H2 y por compuestos orgánicos como por ejemplo: •Lactato •Acetato •Piruvato •Alcoholes •Ácidos grasos Producción de energía •El principal acarreador de electrones es el cit C3 que acepta los electrones de la H2asa y los transfiere al Hmc, que a su vez proporciona los electrones a la APS red y Sulfito red. •La H2asa oxida al H2 atmosférico y el que procede de la formación de acetato a partir de piruvato y que difunde a través de la membrana. Acetato como donador de eCH3COO- + SO42- + 3H+ → 2CO2 + H2S + H2O El acetato es oxidado a CO2 por la vía del Acetil-CoA empleando reacciones reversibles que emplean algunos anaerobios para la síntesis u oxidación del acetato. Desulfobacter oxida el acetato a través de la vía del ácido cítrico ya que carece de las enzimas de la vía del Acetil-CoA. Autotrofía Crecimiento en medio mínimo en condiciones anaerobias •H2 como donador de electrones. •SO42- como aceptor de electrones. •CO2 como fuente de carbono que se asimila por la vía del Acetil-CoA. Reducción desproporcionada Emplea compuestos de azufre en estados de oxidación intermedios. Implica la descomposición de un compuesto en dos, uno más oxidado y otro más reducido que el compuesto original. S2O32- + H2O → SO42- + H2S En la reacción, la oxidación del tiosulfato por Desulfovibrio sulfodismutans genera la fuerza protón motriz para la producción de ATP. El sulfito y el Sº también son empleados por la bacterias sulfato reductoras que coexisten en el mismo hábitat con las bacterias quimiolitótrofas. Oxidación del fosfito HPO3- + SO42- + H+ → 4HPO42- + HSDesulfotignum phosphitoxidans, anerobio extricto, autótrofo que emplea el fosfito como única fuente de energía. Acopla la oxidación del fosfito a la reducción del sulfato en condiciones anaerobias. Se propone que la fuente de fosfato puede ser orgánica. Bacterias sulfato reductoras •Grupo I. Sulfato reductores, no oxidantes de acetato. •Grupo II. Sulfato reductores, oxidantes de acetato. •Sulfato reductores desasimilativos. Desulfovibrio. Bacteria Gram negativa termofílica. Desulfobacter. Bacteria Gram negativa, emplea acetato como único donador y lo oxida por el ciclo del ácido cítrico. Desulfuromonas. Reduce Sº, anaerobio obligado. Reducción asimilativa de sulfatos El sulfato es transportado dentro de la célula por una permeasa y reducido a sulfito por la vía de sulfato reducción. La síntesis de cisteína a partir de la serina requiere de dos pasos. La serina es combinada con el Acetil-CoA para formar O-acetilserina y seguido reacciona con el sulfuro para formar cisteína. Acetogénesis •Homoacetógenos. 4H2 + H+ + 2HCO3- → CH3COO- + 4H2O Donadores de electrones: compuestos de C1, azúcares, aminoácidos, ácidos orgánicos y ciertas bases nitrogenadas. Algunos homoacetógenos también reducen NO3- y S2O3-. Fuerza protón motriz o fuerza sodio motriz o fosforilación a nivel de sustrato → ATP. Acetobacterium woodii Clostridium aceticum Rutas de la acetogénesis •Vía del Acetil-CoA, ruta principal para los microorganismos homoacetogénicos. •Algunos microorganismos pueden crecer heterotróficamente por la fermentación de azúcares o como quimiolitótrofos a través de la reducción de CO2 a acetato con H2 como donador de electrones . C6H12O6 → 3CH3COO- + 3H+ 2HCO3- + 4H2 + H+ → CH3COO- + 4H2O Vía del Acetil-CoA •Monóxido de carbono deshidrogenasa. Complejo enzimático que tiene como cofactores a los metales Ni, Zn y Fe. Cataliza la reacción de reducción de CO2 a CO que será el carbonil del acetato : CO2 + H2 → CO + H2O •El grupo metil del acetato se origina por la reducción del CO2 por una serie de reacciones en las que participa la coenzima Tetrahidrofolato. Cuando es formado el grupo metilo se transfiere a una proteína que contiene Vitamina B12 como cofactor. Vía del Acetil-CoA •El CH3 es anclado a un átomo de Ni en la COdeshidrogenasa y se combina con el CO que también se encuentra anclado al Fe de la enzima y con la ~SCoA. •La formación del AcetilCoA produce un gradiente de protones para formar ATP y también se forma ATP en la conversión de Acetil-CoA a Acetato. Fijación del CO2 por la vía del Acetil-CoA I Síntesis de acetato como resultado del metabolismo energético Eubacterium limosum Acetonaerobium noterae Acetobacterium woodii Acetobacterium wieringae Acetogenium kivui Acetitomaculum ruminis Clostridium aceticum Clostridium thermoaceticum Clostridium formiaceticum Desulfotomaculum orientis Sporomusa paucivorans Eubacterium limosum (butirato) Treponema primita (intestino de termitas) Fijación del CO2 por la vía del Acetil-CoA Methanosarcina (cocos) y Methanosaeta (filamentos) II Síntesis de acetato en el metabolismo autótrófico Bacterias autotróficas homoacetogénicas Metanógenos autótrofas Bacterias sulfato reductoras autotróficas III Oxidación de acetato en el metabolismo energético Reacción: Acetato + 2H2O → 2CO2 + 8H Bacterias sulfato reductoras del grupo II (diferentes a Desulfobacter) Reacción: Acetato → CO2 + CH4 Metanógenos acetogénicos (Methanosarcina, Methanosaeta) Metanogénesis Material orgánico 1 1 Compuestos de C1, H2 4 Monómeros 1 Acidos grasos, alcoholes 2 3 CH4, CO2 1 I Sustratos del tipo CO2 CO2 (cuando el donador es el H2, ciertos alcoholes o piruvato) Formato, HCOOMonóxido de carbono CO II Metil sustratos Acetato 4 1. Bacterias hidrolíticas y fermentadoras. 2. Bacterias sintróficas 3. Homoacetogénicas 4. Metanogénicas Metanol, CH3OHMetilamina, CH3NH3+ Dimetilamina, (CH3)2NH2+ Trimetilamina, (CH3)3NH+ Metilmercaptano, CH3SH Dimetilsulfuro, (CH3)2S III Sustratos acetotróficos Acetato, CH3COOPiruvato, CH3COCOO- Sustratos en la metanogénesis •I. Sustratos del tipo CO2 CO2 + 4H2 → CH4 + 2H2O •II. Sustancias metiladas CH3OH + H2 → CH4 + H2O 4CH3OH → 3CH4 + CO2 +2H2O •III. Sustratos acetotróficos CH3COO- + H2O → CH4 + HCO3- Coenzimas de arqueas metanogénicas •Acarreadores de C1 Las que transportan la unidad C1 desde el sustrato inicial, el CO2 hasta el sustrato final, CH4. Las marcas en amarillo en las moléculas indican el lugar donde el C1 se une durante la reducción de CO2 a CH4. Coenzimas de arqueas metanogénicas •Acarreadores de C1 Metanofurano (MF), une al CO2 en el primer paso de la metanogénesis. Metanopterina (MP) es la portadora de los C1 durante la reducción. Coenzima M (CoM), interviene en nel paso final de CH3 a CH4. Coenzima F430 (CF430), no es un acarreador pero participa en la parte final de la metanogénesis en el complejo metilreductasa. Coenzimas de arqueas metanogénicas •Coenzimas de OxidoReducción Las que en la reacción redox suministran los electrones necesarios para la reducción de CO2 a CH4. Coenzima F420. Participa en varias reacciones durante la reducción donando los electrones. Coenzima B (CoB) participa en la parte final de la metanogénesis en el complejo metilreductasa. Reducción de CO2 a CH4. 1. CO2 es activado por la E-MF y reducido a formilo. 2. El grupo formilo estransferido por el MF a E-MP, deshidratado y reducido a metileno y después a metilo. 3. El grupo metilo es transferido por la MP a la E-CoM. 4. Metil-CoM es reducido a metano por el sistema metilreductasa. F430 remueve el CH3 formando un complejo Ni2+-CH3 y este es reducido por los electrones de CoB. 5. CoM y CoB son regenerados por la reducción de Com-S-S-CoB con H2. Conversión de Metanol a Metano El metanol es catabolizado transfierendo el grupo metilo a una proteína corrinoide formando CH3-corrinoide que cede el CH3 a CoM para formar CH3-CoM y posteriormente CH4. Si no se cuenta con poder reductor como H2 para el paso final, una parte del CO2 es oxidado para producir electrones. Conversión de Acetato a Metano El acetato es activado y se forma Acetil-CoA que interacciona con la COdeshidrogenasa de la vía del Acetil-CoA. El grupo metilo del acetato se transfiere a la E-corrinoide formando CH3-corrinoide que cede el CH3 a CoM para formar CH3-CoM y posteriormente CH4. Producción de la energía La producción de ATP está ligada al ultimo paso de la Metilreductasa en la metanogénesis. La asociación de CoB con CH3-CoM forma en el paso final forma CH4 y un heterodisulfuro CoM-S-S-CoB. El heterodisulfuro es reducido por la Heterodisulfuro reductasa con los electrones que provienen de la F420 formando CoM-SH y CoB-SH. La tranferencia de electrones provoca la extrusión de protones y se crea una fuerza protón motriz donde participa una proteina transportadora la metanofenazina (MPH). Hábitat de las arqueas metanogénicas. •Sedimentos anóxicos: suelo húmedo, fango y lagos. •Tracto digestivo de animales: rumen en animales rumiantes (ganado vacuno, ovejas, cabras, camellos, etc.); intestino ciego de caballos o conejos; intestino largo de animales monogástricos como humanos, cerdos y perros, intestino de insectos celulolíticos (temitas). •Fuentes geotermales de H2 + CO2: chimeneas hidrotermales. •Lodos activados: tratamiento de aguas residuales. •Como endosimbiontes de protozoarios.