Syllabus Genética Microbiana-2013-2
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UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE MICROBIOLOGÍA Y PARASITOLOGÍA SYLLABUS SEMESTRE ACADÉMICO II. DATOS GENERALES 1.1 NOMBRE DEL CURSO 1.2 CÓDIGO DEL CURSO 1.3 CREDITOS 1.4. AÑO DE ESTUDIOS 1.5 NÚMERO DE HORAS 1.6 DURACIÓN DEL CURSO 1.7 HORARIO Y AMBIENTES: 1.7.1. TEORÍA 1.7.2. PRÁCTICA 1.8 PRE-REQUISITOS 1.9 PROFESOR RESPONSABLE I. : 2013 – II : : : : : : GENÉTICA MICROBIANA B03030 04 Cuarto año 6 horas (2 hrs. de teoría y 4 hrs. de práctica) 17 Semanas : : : : Lunes 15-17 hrs (Pab. docente, Aula 308). (Martes y Jueves 16 – 18 hrs. Lab. 205). Genética Molecular, Microbiología General Dr. PABLO RAMÍREZ ROCA Prof. Principal D.E. Dr. Jaime Sánchez Venegas (4 horas P) Profesor Auxiliar a TC M.Sc. Ruth García de la Guarda (T) Profesora Principal a D.E M.Sc. Débora Alvarado Iparraguirre (T) Profesora Principal a D.E. Blgo. Miguel Angel Talledo Rivera (4T) Prof. Asociado a T.C. Blga. Fernando de la Cruz Calvo (4P) Prof. Auxilar TC M.Sc. Enrique Escobar Guzmán (T) Prof. Principal a D.E. Dr. Juan Jimenez Chunga (P) Profesor Auxiliar a TC Blgo. Yerson Durán Ramírez (UPG-FCB-UNMSM) Bach. Melina Rosas Fretel (FCB-UNMSM) PROFESORES COLABORADORES : PROFESORES INVITADOS ASISTENTES DE LABORATORIO: : Robert Ccorahua Anika Eca Avila Joe Hermosilla Jara Emma Vento Aguirre Santo Gregory Guerra Bieberach Maryanne Melanie Gonzales Carazas Alejandra Ivette Fuentes Quispe Carlos Leonardo Quispe Sosa III. SUMILLA El curso trata sobre la organización, replicación y expresión génica de los microorganismos y de transferencia genética horizontal, incluyendo los procesos de regulación. Se pone énfasis en los mecanismos de recombinación, mutagénesis, reparación, biología molecular microbiana y sus diversas aplicaciones. IV. OBJETIVOS DEL CURSO Al finalizar el curso el estudiante será capaz de: Conocer la organización del genoma microbiano. Comprender los mecanismos de la expresión génica y su regulación, así como de recombinación, mutagénesis y reparación. Comprender la importancia de la microbiología molecular en la ingeniería genética y biotecnología. Manipular microorganismos en el laboratorio y desarrollar trabajos experimentales de genética y biología molecular. Analizar y discutir artículos científicos de genética y biología molecular microbiana. Proponer trabajos de investigación sobre genética y biología molecular microbiana. V. EVALUACIÓN El promedio final se obtendrá aplicando la siguiente ponderación: Promedio de exámenes teóricos : 45 % Promedio de exámenes prácticos : 30 % Pasos de práctica : 10 % Ensayo : 10 % Seminarios : 5% El sistema de evaluación será permanente teniendo en cuenta las siguientes pautas: Los exámenes teóricos parciales se tomarán en las semanas indicadas en el syllabus y no tendrán carácter cancelatorio. Los exámenes prácticos no podrán ser sustituidos. La asistencia a clases prácticas es obligatorio ya que el trabajo realizado en el laboratorio será evaluado permanentemente. El alumno que alcance el 30% de inasistencias en dichas clases estará imposibilitado de ser evaluado. El uso del mandil es obligatorio durante el desarrollo de la práctica ya que está contemplado en las normas de bioseguridad del laboratorio de microbiología. Está terminantemente prohibido abandonar el laboratorio durante el desarrollo de la práctica así como ingerir alimentos durante ésta. Los informes de práctica cuando corresponda deberán ser entregados una semana después de terminada la experiencia. Los seminarios serán evaluados por escrito al inicio y se efectuarán en el horario de práctica. El ingreso a las clases teóricas y prácticas será a la hora señalada en el Syllabus; pasada la hora no se permitirá el ingreso de ningún alumno, registrándose como falta. VI. METODOLOGÍA Para el desarrollo del curso se emplearán exposiciones teóricas, clases prácticas, análisis y debate grupal mediante los seminarios y los ensayos. En los SEMINARIOS se discutirán artículos científicos que muestren los progresos en los métodos para la experimentación en genética y biología molecular microbiana. Todos los alumnos deben de estar en condiciones de presentar los artículos asignados. Todos los docentes del curso discutirán los artículos con los estudiantes. Los ENSAYOS consisten en el análisis y planteamiento de un problema científico en un tema libre escogido por el estudiante en el cual le gustaría investigar, para ello tiene que realizar una revisión bibliográfica. Se debe hacer una proposición original, la cual debe ser presentada en forma de Panel de 90 x 110 cm que incluya: Introducción, Hipótesis, Objetivos, Metodología, Resultados esperados y referencias. Los alumnos harán una defensa oral frente a sus compañeros y profesores del curso. Esta actividad ejercita en la aplicación de los conocimientos adquiridos para plantear problemas científicos y proponer trabajos de investigación en Genética Microbiana. VII. PROGRAMACIÓN: VII.1. CALENDARIZACIÓN POR SEMANAS DE LAS CLASES TEÓRICAS TEMA PROFESOR SEMANA 1 19/08 T1 Conceptos generales P. Ramírez T2 Genoma bacteriano. Cot1/2 P. Ramírez SEMANA 2 26/08 T3 Regulación de la expresión génica III en Bacteria: R. García Iniciación, promotores, terminación. T4 Plasmidios R. García SEMANA 3 02/09 T5 Conjugación R. García T6 Transformación R. García SEMANA 4 09/09 T7 Transposones y secuencias de inserción D. Alvarado T8 Mecanismos de recombinación homóloga P. Ramírez SEMANA 5 16/09 T9 Expresión génica I. Operon lac. Proteína CAP P. Ramírez T10 Expresión génica II. Operon trp. Atenuación Antiterminación. P. Ramírez SEMANA 6 23/09 T11 Expresión génica IV. Fago bacteriófago lambda. P. Ramírez T12 Replicación del DNA y ciclo celular P. Ramírez SEMANA 7 30/09 E1 PRIMER EXAMEN TEÓRICO P. Ramírez/F. de la Cruz SEMANA 8 07/10 FERIADO SEMANA 9 14/10 T13 Mutación y reparación del DNA E. Escobar T14 Transducción. P. Ramírez SEMANA 10 21/10 T15 T16 SEMANA 11 28/10 T17 T18 SEMANA 12 04/11 T19 T20 SEMANA 13 11/11 T21 SEMANA 14 18/11 T22 SEMANA 15 25/11 T23 T24 SEMANA 16 02/12 E2 SEMANA 17 09/12 S1 Mecanismos de recombinación en levaduras Sistemas de exportación de proteínas P. Ramírez P. Ramírez Expresión de genes heterólogos en Escherichia coli.y levaduras Transferencia horizontal de genes y evolución de patógenos P. Ramírez P. Ramírez Sistemas de dos componentes y Quórum sensing Regulación de genes de virulencia en bacterias Fisiología y genética de la fijación de nitrógeno R. García R. García D. Alvarado Genética molecular y Aplicaciones biotecnológicas de Arqueas P. Ramírez Los virus de eucariontes. Conceptos básicos de replicación viral. Genética y biología molecular de virus DNA y RNA M. Talledo M. Talledo SEGUNDO EXAMEN TEÓRICO P. Ramírez EXAMENES SUSTITUTORIO P. Ramírez VII.2. CLASES PRÁCTICAS TEMA PROFESOR RESPONSABLE M. Talledo 1 Extracción de DNA plasmídico 2 Amplificación de una secuencia génica por PCR Electroforesis de DNA F. de la Cruz 4 Transformación bacteriana por shock de temperatura J. Sánchez 5 P. Ramírez/ 6 Transformación bacteriana por electroporación PCR en Tiempo Real 7 Conjugación Fernando de la Cruz/Yerson Durán D. Alvarado 8 Mutantes espontáneas en E. coli M. Talledo 9 Wester Blot Juan Jiménez 3 R. García ASISTENTE DE PRÁCTICA *R. Ccorahua / J. Hermosilla *M. Gonzales / E. Vento *A. Eca / A. Fuentes *J. Hermosilla/ Robert Ccorahua *A. Fuentes/ C. Quispe *G. Guerra/ A. Eca *M. Rosas/ M. Gonzales *G. Guerra/ E. Vento A. Eca *C. Quispe/ R. Ccorahua ASISTENTES EN MESA DE PRÁCTICA** C. Quispe E. Vento G. Guerra A. Eca C. Quispe A. Fuentes G. Guerra; A. Eca E. Vento; C. Quispe A. Fuentes Idem G. Guerra A. Fuentes G. Guerra; A. Eca E. Vento; C. Quispe A. Fuentes G. Guerra; A. Eca E. Vento; C. Quispe A. Fuentes J. Hermosilla *Ayudante Principal, **Todos los ayudantes deben colaborar en las prácticas según su disponibilidad horaria. VII.3. SEMINARIOS TEMA S1. Proteómica S2. Mecanismos de resistencia a metales metales pesados S3. Metagenomas S4. Microarrays VII.4. ENSAYOS PROFESOR P. Ramirez P. Ramírez P. Ramirez F. de la Cruz Semana 15 VIII. BIBLIOGRAFÍA RECOMENDADA TEXTOS: Jiménez, A. y J. Jiménez. 1998. Genética microbiana. Editorial Síntesis S.A. España. Krebs, J.E., Goldstein, E.S., y S.T. Kilpatrick. 2011. Lewin`s Genes X. Pearson Prentice Hall, USA. Madigan, M.T., Martinko, J.M., y J. Parker. 2006. Brock, Biología de los microorganismos. Prentice Hall Iberia, Octava edición. Neidhardt, F.C. 1996. Escherichia coli and Salmonella, Cellular and Molecular Biology. Second edition, ASM Press. Washington D.C. Perera, J., Tormo, A. y García, J. L. 2002. Ingeniería Genética. Expresión de DNA en sistemas heterólogos. Vol. II. Editorial Síntesis, S. A., España. Snyder, L., y W. Champness. 1997. Molecular Genetics of Bacteria. ASM Press, Washington, D.C. Watson, J. D., Gilman, M., Witkowsky, J. and Zoller, M. 1997. Recombinant DNA. Scientific American, Inc., New York. ALGUNAS REVISTAS ESPECIALIZADAS: Annual Review of Microbiology Genome Research Journal Bacteriology Molecular Microbiology Annual Review of Biochemistry Journal of Biotechnology Applied and Environmetal Microbiology Microbiology Microbiology and Molecular Biology Reviews Nucleic Acids Research Cell Science Nature ALGUNOS SITIOS WEB DE INTERÉS: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ http://www.up.univ-mrs.fr/~wabim/english/ http://www.public.iastate.edu/~pedro/ http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/ http://www.genome.jp/kegg/kegg2.html http://www.bact.wisc.edu/Bact330/lecturecholera http://www.sciencedirect.com/