UNIVERSIDAD CATÓLICA VALPARAÍSO. Instituto de Química. TAREA Nº5 QUI 343 Nucleótidos. 1. ¿Qué importancia tienen los grupos funcionales "oxo" y "amino" presentes en la estructura de las bases nitrogenadas que constituyen los ácidos nucleicos? 2. Esquematice las estructuras que ilustran la tautomería ceto-enol de : Guanina y citosina. ¿Por qué la adenina no exhibe tautomería? 3. Defina : nucleótido, nucleósido, enlace fosfodiéster, enlace N-ß-glicosídico y enlace O-glicosídico. 4. ¿Cuál es la masa molecular y el largo de una sección de B-DNA que especifica una proteína de 40 kD? Cada aminoácido está especificado por tres bases contiguas en una banda simple de DNA. 5. Dibuje la fórmula estructural de cada uno de los siguientes compuestos: Guanosín-3'-monofosfato, desoxiadenosín-5'-difosfato, 5'-dADP, 5'TMP, timidina, ....pUpGp...., ácido guanílico. 6. Se descubrió que un preparado de DNA puro contenía 30.4 % de adenina y 19,6 % de citosina. La razón adenina/timina era de 0,98 y la guanina/citosina, de 0,97. Calcule la cantidad de timina presente en este DNA y también la razón de bases púricas con respecto a las pirimídicas. 7. Sólo las cadenas polinucleotídicas que contienen la pentosa ribosa sufren hidrólisis alcalina. Justifique esta aseveración con las reacciones correspondientes. 8. Indique los productos de hidrólisis del polinucleótido indicado al tratarlo con : pGpGpCpUpApCpGpUpApGpApUpCpA a. b. c. NaOH, nucleasa de veneno de serpiente, ribonucleasa pancreática (bovino), 1 d. e. f. 9. exo-ribonucleasa (ss, enlace a). ribonucleasa de hongos, nucleasa de bazo de buey. Dibuje una representación del par de bases complementarias presente en el RNA que corresponde al par A-T del DNA. 10. Escriba secuencia de la banda complementaria a la hebra : (5')ATGCCGTATGCATTC(3'). 11. En muestras de DNA aisladas de dos especies no identificadas de bacterias, la adenina da cuenta del 32 y 17 % respectivamente, del total de las bases. Qué proporción relativa de adenina, guanina, timina y citosina espera Ud. encontrar en las dos muestras de DNA. Qué suposiciones hizó Ud.? Una de las bacterias fue aislada en una terma a 64oC. ¿Cuál DNA proviene de este organismo, una bacteria termofílica? Cuál es la base de su respuesta? 12. Se demostró que un preparado de DNA puro tenía una Tm de 85oC. ¿Cúal es el porcentaje de A+T de este DNA? (Suponga que la medida se tomó sobre una solución del DNA que contenía 0,2M de Na+). 13. ¿Cuál será el efecto de los siguientes factores en la curva de fusión de una solución acuosa de DNA doble? Diminuir la fuerza iónica de la solución. Calentar 25oC sobre el punto de fusión del DNA y después disminuir rápidamente la temperatura a 25oC bajo este punto. Añadir una pequeña cantidad de etanol a la solución de DNA. a. b. c. 14. Calcule el peso en grs. de una molécula de DNA que se extiende de la tierra a la luna (aprox. 200.000 millas). El DNA doble hélice pesa cerca de 1 x 10 -18 g por mil pares de nucleótidos. Hay 1,6 x 10 12 nm por milla y cada par de bases avanza 0,34 nm. Para una comparación interesante, su cuerpo contiene aproximadamente 0,5 g de DNA. 2