GENÉTICA MOLECULAR ADN ARN EL MENSAJE GENÉTICO: Replicación Transcripción Traducción EL CÓDIGO GENÉTICO APLICACIONES ( Ingeniería genética ) EL ADN El estudio de su estructura se puede hacer a varios niveles, apareciendo estructuras: primaria, secundaria, terciaria, cuaternaria y niveles de empaquetamiento superiores Estructura primaria El ADN está compuesto por una secuencia de nucleótidos formados por desoxirribosa. Las bases nitrogenadas que se hallan formando los nucleótidos de ADN son Adenina, Guanina, Citosina y Timina. No aparece Uracilo. Los nucleótidos se unen entre sí mediante el grupo fosfato del segundo nucleótido, que sirve de puente de unión entre el carbono 5' del primer nucleótido y el carbono 3' de siguiente nucleótido. Como el primer nucleótido tiene el carbono 5´ y el siguiente nucleótido tiene el carbono 3´, se dice que la secuencia de nucleótidos se ordena desde 5´a 3´ ( 5´ 3´ ) Estructura seundaria La estructura secundaria del ADN fue propuesta por James Watson y Francis Crick, y la llamaron el modelo de doble hélice de ADN. Este modelo está formado por dos hebras de nucleótidos. Estas dos hebras se sitúan de forma antiparalela, es decir, una orientada en sentido 5' → 3' y la otra de 3' → 5'. Las dos están paralelas, formando puentes de Hidrógeno entre las bases nitrogenadas enfrentadas. Cuando en una hebra encontramos Adenina, en la otra hebra hallamos Timina. Cuando en una hebra encontramos Guanina, en la otra hallamos Citosina. Estas bases enfrentadas son las que constituyen los puentes de Hidrógeno. Adenina forma dos puentes de Hidrógeno con Timina. Guanina forma tres puentes de Hidrógeno con la Citosina. Las dos hebras están enrolladas en torno a un eje imaginario, que gira en contra del sentido de las agujas de un reloj. Las vueltas de estas hélices se estabilizan mediante puentes de Hidrógeno. Esta estructura permite que las hebras que se formen por duplicación del ADN sean copia complementaria de cada una de las hebras existentes. Estructura terciaria El ADN es una molécula muy larga en algunas especies y, sin embargo, en las células eucariotas se encuentra alojado dentro del minúsculo núcleo. Cuando el ADN se une a proteínas básicas, la estructura se compacta mucho. Las proteínas básicas son Histonas La unión con Histonas genera la estructura denominada nucleosoma. Cada nucleosoma está compuesto por una estructura voluminosa, denominada core, seguida por un eslabón o "Linker". El core está compuesto por un octámero de proteínas, Histonas, denominadas H2A, H2B, H3 y H4. Cada tipo de histona se presenta en número par. Esta estructura está rodeada por un tramo de ADN que da una vuelta y 3/4 en torno al octámero. El Linker está formado por un tramo de ADN que une un nucleosoma con otro y una histona H1. El conjunto de la estructura se denomina fibra de cromatina de 100Å. Tiene un aspecto repetitivo en forma de collar de perlas, donde las perlas serían los nucleosomas, unidos por los linker. Estructura cuaternaria La cromatina en el núcleo tiene un grosor de 300Å. La fibra de cromatina de 100Å se empaqueta formando una fibra de cromatina de 300Å. El enrollamiento que sufre el conjunto de nucleosomas recibe el nombre de solenoide. Los solenoides se enrollan formando la cromatina del núcleo interfásico de la célula eucariota. Cuando la célula entra en división, el ADN se compacta más, formando los cromosomas. EL ARN Los ácidos ribonucleicos constan de largas cadenas de ribonucleótidos, y aunque son más cortas que los ADNs, son mucho mas abundantes en la mayoria de las células. Tanto en las células procariotas como en las eucariotas, las tres clases principales de ARN son: ARNm ( ARN mensajero ) ARNr ( ARN ribosómico) ARNt ( ARN transferente ) Cada uno de ellos consta de una sola cadena de ribonucleótidos y una función biológica característica El ARNm actúa como matriz utilizada por los ribosomas para la traducción de información genética en la secuencia aminoacídica de las proteínas. La secuencia del ARNm es complementaria al mensaje genético contenido en un segmento específico de la cadena patrón de ADN. El ARNt consta de una cadena de ribonucleótidos que posee una conformación muy plegada. Cada uno de los 20 aac que se encuentra en las proteínas tiene una o mas ARNt correspondientes a las que se une para ser transportado a los ribosomas, en donde los ARNt actúan como adaptadores para traducir los vocablos del código del ARNm en la secuencia de tres nucleótidos específica denominados anticodon que es complementario con el codón ( secuencia de tres nucleótidos del ARNm que codifica para un aminoácido específico ) El ARNr son los componentes principales de los ribosomas y constituyen el 65% de su peso. Los ARNr desmpeñan un importante papel en la estructura y función de los ribosomas. Según su tamaño se distinguen los siguientes tipos: Ribosomas 70 S ( procariotas ): 30S + 50S Ribosomas 80 S ( eucariotas ): 40S + 60S S = velocidad de sedimentación ( suedberg ) EL MENSAJE GENÉTICO El dogma central de la genética molecular ( Crick 1970 ) ADN transcripción ARN traducción PROTEÍNA Replicación La hipótesis de Watson-crick postulaba que cada hebra del ADN ( duplo-helicoidal ) actuaba como patrón para la replicación de las hebras hijas complementarias. Así se formaban dos moléculas dúplex, idénticas a la del ADN progenitor, de tal modo que cada uno de los cuales contendría una hebra intacta procedente del ADN paterno. Posteriormente se llegó a la conclusión de que cada molécula de ADN dúplex hija contiene una hebra progenitora y una hebra recién sintetizada. Este tipo de replicación se llama semiconservativa. Los modelos replicativos son muy similares en procariotas y en eucariotas. Los cromosomas contienen un origen en donde comienza la replicación. Este punto está constituido por una secuencia de nucleótidos específica sin la cual el ADN no podría duplicarse y que es reconocida por proteínas celulares específicas que inician la replicación en ese punto. La replicación en virus y procariotas se produce de modo bidireccional, donde existen dos horquillas de replicación. Ambas comienzan en el origen, del cual se alejan, a la vez, en direcciones opuestas hasta que los puntos de crecimiento se encuentra de nuevo. En los eucariotas tienen muchos orígenes de replicación y de cada uno de éstos orígenes surgen dos horquillas de replicación que se mueven simultáneamente en direcciones opuestas. Así , en el núcleo de una célula eucariota funcionan simultáneamente varios millares de horquillas de replicación. De la apertura de la doble hélice se encarga una enzima ( helicasa ) en el punto de replicación La ADNpolimerasa III añade nucleótidos a una velocidad de 1000 nucleótidos / minuto en una hebra con dirección 5´- 3´ ( hebra conductora o líder ) de la hebra paterna 5´-3´. Empieza con ARN cebador En la otra hebra de ADN paterna y a partir de ARN ( 3 nucleótidos y sintetizado por una primasa = ARN pol ) que actúa como cebador y con una ADN pol III se añaden nucleótidos para formar fragmentos de ADN( fragmentos de Okazaki ).Estos fragmentos no se sintetizan de forma continua como la otra hebra, debido a que los nucleótidos deben sintetizarse en sentido 5´-3´ y la cadena discontinua está en sentido 3´-5´, luego a medida que la Helicasa va rompiendo la cadena original, debe agregarse un cebador en el extremo 5´ de la cadena discontinua, a continuación sintetiza ADN hasta el ARN cebador anterior. Estos fragmentos de ARN cebador son reemplazados por secuencias de ADN, los degrada una ADN pol I y sustituirlas por los desoxiribonucleótidos correspondientes. Posteriormente la ADN ligasa une los extremos de los fragmentos de Okazaki y da lugar a una cadena continua de ADN Transcripción La transcripción consiste en la síntesis de moléculas de ARN a partir de ADN que se utiliza como molde. Se realiza con ayuda de enzimas denominadas ARN polimerasas ( primasa ). En procariotas existe una sola ARN pol., mientras que en eucariotas existen tres diferentes. También existen ARN pol específicas en mitocondrias y cloroplastos. El proceso comienza en un extremo 5´ terminal del gen, zona conocida como promotora, esta zona es conocida por la ARN pol, hacía el nucleótido 10 existe una zona conocida como caja TATA , en esta zona se sitúa la ARNpol y comienza a añadir nucleótidos en sentido 5´-3´ con una velocidad variable siendo mas lenta en zonas donde aparezcan mayor proporción de G-C ya que tienen tres ptes de hidrógeno. Por detrás la misma polimerasa se encarga de unir las dos hebras de ADN. El final de la transcripción se da cuando aparece una señal de terminación y el ARN se liberará. El proceso en eucariotas es similar al descrito para Escherichia coli pero mas complejo, por ejemplo las zonas de terminación poseen un agrupamiento de moléculas de timina conocidas como filas T. Una vez finalizada la transcripción el ARN va a sufrir un proceso de maduración ( solo en eucariotas ) que consiste en una serie de cortes y empalmes conocidos como splicing. En eucariotas , la síntesis y maduración de ARN se produce en el núcleo, aunque posteriormente el ARN salga al citoplasma para participar en la síntesis de proteínas. Traducción ( el ARNm es leído en dirección 5´-3´) Se lleva a cabo en tres etapas: 1. Iniciación: Se debe formar en primer lugar un complejo de iniciación ( proteínas que ayudan)+ subunidad 30 S + formil-met-ARNt ( lugar P ) que se sitúa en el codón de iniciación ( AUG )+ subunidad 50S 2. Elongación: Se sitúa un aminoacil-ARNt en el lugar correcto ( lugar A ) Se forma un enlace peptídico y el péptido pasa del sitio P pasa al sitio A El ribosoma se desplaza un codón ( tres bases ) hacia 3´ 3. Terminación Después de la formación del último enlace peptídico de la cadena polipeptídica, la proteína está en el sitio A pero cuando ésta se transloca al sitio P, la región del ARNm que queda en el sitio a está formada por uno de los tres codones de terminación. Estos codones no son reconocidos Por ningún aminoacil-ARNt, pero si por los factores de liberación. EL CÓDIGO GENÉTICO Las características de la clave genética fueron establecidas por Crick en 1960: 1. Un aminoácido ( aac ) está codificado por un triplete de nucleótidos denominado codón 2. El código es degenerado, existen mas tripletes que aminoácidos.( un mismo aac está codificado por mas de un triplete ) 3. El código no es ambiguo ( cada codon codifica un solo aac 4. El código es universal ( solo pequeñas excepciones ) 5. Existe un codón de inicio AUG ( metionina ) y tres codones de terminación UAA, UAG, UGA Lys = Lisina Arg = Arginina His = Histamina Asp = Ac. aspartico Glu = Ac. Glutámico Gly = glicina Asn = asparagina Gln = glutamina Cys = cisteína Ser = serina Thr = Treonina Tyr = tirosina Ala = alanina Val = valina Leu = leucina Ileu = isoleucina Pro = prolina Phe = fenilalanina Met = metionina Trp = triftófano APLICACIONES DE INGENIERIA GENÉTICA Libro155-163