RECOGIENDO LOS FRUTOS DEL GENOMA

RECOGIENDO LOS FRUTOS DEL GENOMA
Hace ya seis años que disponemos de la secuencia inicial de nuestro genoma, y algunas
voces críticas se preguntan si estaba justificada la explosión mediática que acompañó a
este logro científico. La semana pasada, los días del 6 al 8 de Septiembre, se celebró en
Sitges un congreso Internacional sobre Variación del Genoma Humano. Los mejores
expertos del mundo se han reunido para presentar el estado actual de las investigaciones
que buscan desvelar la base genética de nuestras diferencias individuales, y
especialmente en aquellas variantes genéticas que influyen en la manifestación de las
enfermedades humanas más comunes. Los que hemos tenido el privilegio de asistir a
este congreso estamos deslumbrados por los avances espectaculares que se están
produciendo en el campo de la genómica. Las novedades que se han presentado bastan
para contestar cualquier escepticismo sobre la importancia de disponer del genoma. Con
el genoma humano hemos entrado en una nueva era en el que la genética va a estar
omnipresente en los asuntos humanos.
El genoma de cualquier ser vivo es un mensaje digitalizado en el que están codificados
al menos dos tipos de individualidad. En un primer nivel, el genoma nos asigna a la
especie que pertenecemos. En nuestro genoma está escrito que pertenecemos a Homo
sapiens y no a ninguna otra especie biológica, que somos seres bídepos, con un cerebro
enorme,.. y todas aquellas características que consideramos exclusivas y universalmente
humanas. Pero cada genoma define un nivel aún más básico de individualidad. El
genoma concreto de un individuo difiere de otros genomas individuales en letras,
palabras o párrafos enteros que hacen que cada mensaje genético sea exclusivo del
individuo portador y aquí reside lo que llamamos la parte genética y heredable de los
aspectos físicos y mentales que nos hacen genuinamente únicos en relación al resto de
los individuos de nuestra especie. Un símil de la doble identidad del genoma podríamos
hacerlo con los diferentes estilos arquitectónicos de las catedrales. La catedral de León
es un magnífico templo que pertenece al estilo gótico, pues tiene los elementos
estructurales que definen este estilo: bóveda de crucería, arco ojival, el arbotante que
recoge la presión de la bóveda,… Pero además de estos elementos comunes que
constituyen la arquitectura gótica, hay elementos exclusivos que la hacen única entre
todas las iglesias góticas. Así, la catedral de León, a pesar de que sigue el modelo
clásico francés de tres naves con girola, triforio y amplios ventanales, presenta el coro
en la nave central, rasgo característico del gótico español, lo mismo que las dos torres
adosadas a los pies, además de un color de piedra local, y otros aspectos particulares
que la hacen única y distintas dentro de las iglesias góticas.
Para descubrir la base genética de ambos tipos de individualidad se debe acudir a
fuentes de información biológica distinta. La secuencia del genoma humano que se
presentó por primera vez no pertenece a ningún individuo humano. Era una especie de
genoma consenso ensamblado a partir de partes de genomas de distintos seres humanos.
Por lo tanto, la secuencia del genoma humano no pertenecía a ningún individuo
concreto,
y es algo así como una secuencia consenso, promedio, que de alguna forma no
representa a nadie concreto, pero sí a todos en aquello que tenemos de humano.
En otras palabras, nuestro genoma tiene un mensaje con dos lecturas o niveles: Una que
nos dice a que especie pertenecemos, somo Homo sapiens, es un componente genérico,
que nos dice que somo bípedos, con un cerebro enorme, … y todas aquellas
características que llamamo universalmente humana. Esto estaba captado en el genoma
humano. El genoma humano nos informaba de esto. Podríamos contestar: Cúantos
genes se necesitan para hacer un ser humano, cómo estos de distribuyen en funciones
distintas, y comparando este genoma con el de otras especies, viendo las similitudades y
diferencias podríamos hacer preguntas tan fundamentales cómo que genes o secuencias
de DNA hacen la diferencia entre nuestra especie y cualquier otra especie. Y ha sido
especialmente útil para compararlo con otros organismos para que no. El genoma
humano servía para definir nuestro componente y estamos en ellos para conocerlos
todos. Nuestra unicidad como individuos. Que nos hace distintos. Pero hay una pregunta
que no es posible atacar con la secuencia del genoma humano, y es la relativa a nuestras
diferencias como individuos en el seno de nuestra especie. Para ello necesitamos
comparar las secuencias de genomas de distintos individuos de nuestra especie. El
problema es obtener distintos secuencias de la especie humana y compararlas. Esto es
muy costos, pues si resultó es caro uno, imaginemos muchos genomas. Puesto que al
comparar pequeños partes del genoma que correspondía a la misma región parecía que
la mayoría de las diferencias se debían al cambio de una base (o letra si comparamos el
mensaje químico del genoma con un texto) por otra (90% de las diferencias (diferencias
compartirdas por que desde que surgieron unos la han heredado y han crecido en
frecuencia y otros han mantenido la inicial, o sea polimorfismo) del mensaje se creían
debidos a estas simples diferencia denominadas SNPs (acrónimo de single nucleotide
polymorphism, pronuciado en castellano esnip). letra (metafóricamente hablamos de
letras, pero el genoma es un mensaje químico formado por cuatro bases químicas
química por otra Una alternativa metodológicamente más económica y rápida era
determinar a partir de una muestra representativa es ver como se distribuían los SNP y
por tanto es comparar lo que se creía la parte más diversa, plagternativa Cuando esto se
hizo para pequeñas la población El proyecto HapMap era el siguiente objetivo, consistía
en determinar las diferencia entre cada uno se nosotros. Estas diferencias se creía
explicaban el meollo. Hagamos un catálogo y tendremos todo. Data desideratum.
Tendremos una descripción completa de las diferencias genéticas humanas. El siguiente
paso será relacionar esas diferencias genéticas con las diferencias físicas, morfológicas,
conductuales, fisiológicas. .Hace poco más de dos años que se pensaba SNP 90%
diferencias genéticas humanas. O sea, aquí estaba el meollo de lo genético. El proyecto
HapMap nos ha presentado el mapa de las variantes humana de SNPs, pero la sorpresa
ha surgido cuando se han entrado en detalles el mapa completo 2004 que mostró que
había muchas zonas del genoma que estaban duplicadas, duplicaciones segmentales. No
estaban en chimpancé. Lleva a la sospecha que estas duplicaciones, al ser tan nuevas,
pueden diferir también entre los individuos de la especie humana, siendo fuerte de
diferencias genéticas. Cuando se ha estudiado más detalle se ha confirmado que lejos de
estar explicada gran parte de la variación entre los miembros de nuestra especie por
SNP, parece que los variación en número de copias de regiones repetidas en la principal
fuente de variación en términos de fracción del genoma afectado.
, Gracias a que disponemos de la secuencia del genoma humano. (genéticos, biólogos
moleculares, investigadores médicos, derecho, bioinformática, informáticos)
Nos dirigimos hacia sociedad donde la genética va a tener un papel preponderante. La
omnipresencia de la genética en nuestra vida ha sido hasta la fecha más implícita que
explícita. La genética es nuestra dote biológica al nacer al que se debe gran parte de
nuestro destino sobre el que no podemos hacer nada y que por tanto no hace falta saber
nada más. Pero en dos décadas la genética pasará a ocupar en lugar preponderante en la
conciencia individual y social de nuestra especie.
El protagonismo de la conferencia es los CNV, no somos genética tan parecidos como
creíamos. Dos personas pueden diferir en promedio más de 6MB. Eso quiero decir que
cuando buscamos porque somos diferentes genéticamente o tenemos distintas
susceptibilidades, no sólo estás se deben atribuir al cambio de una letra por otra (SNPs)
como se pensaba, pero si no .. Nos habíamos pasado mucho tiempo desarrollando
técnicas para poder efectuar un mapa de SNPs, Tenemos el cata´logos de SNP, Muchos
autores asociación a gran escala han mostrado los efectos. trabajos han m (primero
SNPs y asociación whole genome). El secreto es porbabr batería todos marcadores.
Simultáneamente se comparan todos los SNP entre enfermos y controles. Culpable por
asociación. Un trabajo reciente muestra la importancia aproximaciones genómicas. Un
solo trabajo había encontrado tanto factores genéticos responsables de la mayoría de las
enfermedades más estudiadas que el resto de trabajos. El factor crítico es repetibilidad,
la importancia del momento es que se está haciendo de forma estándar eso significa
muchas mustras, repeticiones, confirmación, y por tanto la capacidad estadística para
detectar los efectos. Esta en el horizonte conocer el efecto fenotípico de los SNP y
establcer su importancia en las diferencias morfológicas de todo tipo.
para muchas
pero ahora se debe complementar con un mapa de variación de CNV. De esta forma se
han descrito como algunas enfermedades como … están influenciadas por la presencia
de una variante de CNV (). Primero mapa de CNV, el siguiente someterlo también a
efctos asociación.
Dominancia congreso de los datos (generación, técnicas de producción masiva, los
matones de los datos) y bases de datos.
Así todas la variantes genéticas en las que diferimos + asociación -> Base genética
fenotipo. La importancia genética y los factores concretos. Farmacogenómica.
Aplicación desde bench hasta headbed.
Fundamental son las biobancos.. El caso inglés.
Proyecto genomas únicos ->
Poercetnaje étnico de cada genoma. Un individuos que porcentaje tienee amerindio,
europeo o africano. Puerto riqueño vs mejicano. Llamativo eran los cromosomas
individuales y resprentaciones cromosomas en mosacido colores, cada uno
representando un origen. El cromosoma 1, una primera región o bloque pequeña es
amerinidia, la siguiente, mucho mayor es europea, la tercera intermedia es amerindio,
… la sexta es africana, y así. Inmenso. Sobrecogedor, Emocionante.
Problemas éticos Colaboración humanitaria media y largo plazo vs Protección
Genomas únicos -> Watson (hijo esquizofrénico) y Venter. El genoma de Venter se han
identificado los dos juegos de información homóloga que cada individuo tenemos, uno
procedente del padre y otra de la madre. Nos ha revelado el grado importante de
diferencias que existe entre ambos genomas haploides, de modo que en nosotros mismo
albergmaos el 33% de la variación total de la especie.
Genomas de 1000 dolares
Un joven investiadora de la India nos presentó un estudio completo genoma
mitocondroal herramienta perdicta todos los cambios existentes e incluso mutaciones
potencial que efecto tendría, como herramienta diagnóstico. Este genoma, más pequeño
y asequible sirve como paradigma de cómo será para todo el genoma del núcleo
humano.
Dónde estaremos dentro de 15 años? Con la posibilidad de secuenciación de genomas
completos para cada uno de nosotros. Catálogo completo de todas la variantes genéticas,
los SNPs y CNV. Este catálogo se habrá integrado con la batería de efectos de estas
variantes. Lluvia incesante estudios de asociación, todas las poblaciones mundiales.
Muchas, la mayoría, sin efecto. Clave enfermedades, Una medicina y farmacología a la
cata adaptado a nuestro perfil genético consolidándose y que no dejará ya esta senda
porque no hab´ra vuelta at´ras. La vida humana mejorará en calidad, no olvidemos que
las muertes por reaccciones adversar a fármacos ocupan un cuarto puesto en incidencia.
No estoy exagerando, los descubrimientos de la genética están . Ahora bien, quizá
desvelamos que la influencia genética, aunque exista, suele ser difusa, con muchas
variantes disperas con tan poco efecto cada una que no tienen gran valor predictivo ni
terapéutico. Nuestra esperanza de vida se extenderá 10 o más años. Es posible, aunque
lo considero improbable, pero si es así, al menos también lo sabremos. Sabremos para
una ingente cantidad de caracteres que es genético y que es ambiental, y que es la
interacción de muchos de ellos. Nunca antes habíamos tenido posibilidades de
responder seriamente esta pregunta. La oscuridad sobre esta gran cuestión pronto será
resulta. Los que trabajamos en este campo somo unos seres privilegiados, y debemos
también hacer un esfuerzo de comunicación. Somos unos seres priv
Todas las
Retraso mental,
Déficit atención,
suEl genoma humano no era más que idealización promedio de lvarios seres humanos
que se había secuencia
Cuanto de cualquiera de mis aspectos que me definen como persona única e irrepetible,
incluyendo mis enfermedades, distintas de las otras personas de nuestra especie se viene
dado por mi herencia genética, o expresado en término modernos, viene dado por el
contenido de mi genoma. Esta pregunta clásicamente se suele contestar que hay un
componente genético y otro ambiental. Unos caracteres son más genéticos ao nunca ha
sido
La importancia de no perder el tren una vez más. De todas las carreras en las que
podemos entrar, esta es la que no podemos perder. Hay demasiado en juego. De se
consciente de su importancia. Del apoyo decidido, político y social, sin el cual nos
jugamos nuestro futuro bienestar.
Optimismo.
Ataque a la arquitectura genoma
Perfil genético
La investigación en genómica es un ejemplo positivo de cómo la especie humana, ….
Para nuestro país estuvo bien representado, es una gran oportunidad para cogamos el
rumbo definitivo de la modernidad. Si no jugamos en primera en ciencia y biocienca,
entonces no jugaremos en ningún otro aspecto.
Somos partícipes de un momento mágico. Aquello que tenemos el privilegio … no
podemo menos que comunicaroslo con la emoción y el sentido de trascendencia de lo
que estamos descubriendo. La ética del conocimiento de Monod.
Antonio Barbadilla,
Profesor Titular e Investigador del Dpt de Genética de la UAB
Director de la Plataforma de Bioinformática de la UAB
El final apoteósico. El organizador e iniciador de estas reuniones de expertos agradeció
e interés de todos. Puso un ejemplo. La reunión tuvo lugar en un Hotel de lujo con todo
tipo de atractivos, no menor, un juego de piscinas que tentaban con unos días de Sol
atractivo. Pero el organizador dijo que nos veía a todos pálidos, que nadie había usado
el tiempo de ese meeting intenso para ir a la piscina. Habían demostrado el sincero e
inmenso interés por su trabajo. Su entrega y profesionalidad sin límites. Algo casi
imposible de ver en una sociedad del ocio que se entrega a no hacer nada a falta de
proyecto significativos en sus días. Se no contabanen este periódico hace unos la
anécdota que un crucero de lujo en el mediterráno se encontró con una embarcación de
inmigrantes a la deriva a punto de zozobrar. Cuando fueron a su rescate, y uno de los
inmigrantes les preguntó a dónde iban, el capitán les dijo a ninguna parte. Esta es la
metáfora de nuestro tiempo opulento y materialsta que nos ha tocado vivir, donde la
satisfación de nuestras necesidades materiales se limitan a viver en un estrecho mundo
de intrigas, nimiedades y tareas insulsas. Como la religiosidad cósmica de la que
hablaba Esitein, hay admiración, pasmo, por estos secretos profundos de la vida que
radican en el motivo más poderoso y noble de la investigación científica. Como decía
Einstein, en esta época materialista nuestra, los trabajadores científicos serios son la
única gente profundamente religiosa.
La contemplación, la comprensión profunda de la ciencia (frase de artículo museo de las
ciencias principe Felipe). Lo que dice Einstein : la ciencia nos permite
Desde importante decisiones políticas, en el área de la salud y prevención, hasta las
conversaciones de café tendrán como tema la genética.
los avances que se han presentado, hasta el punto que podemos vislumbrar en un
horizonte relativamente cercano respuestas a peguntas tde las preguntas más
importantes que se ha hecho siempre la humanidad desde que tiene conciencia de sí y
curiosidad
Estábamos alojado en un Hotel
, y confirman más allá de toda duda de que el proyecto genoma humano nos ha
conducido a una nueva era en que la genética va a tener un papel preponderante.
Uno edificio modernista tiene un doble componente, el que pertenece a su estilo
arquitectónico, y el que lo hace único distintivo entre los edificios modernistas. La casa
Atmetller de Puig i Cadafall es modernista al igual que el Palau de la Música de
Doménech i Montaner. El genoma humano es un genoma de referencia como si una
iglesia creada con parte del NotreDame, la Catedral de León y la de Chartres formarán
un edifcio gótico. No es ningún edificio concreto, pero recoge el estilo gótico. Podemos
estudiar la forma del portal, los ventanales, el apoyo de la paredes es los arbotantes, las
numerosas torres hacia arriba, etc… Ahora bien, si queremos saber en que es distinto el
NoteDrame de París del la catedral de Barcelona, debemos entrar a comparar
directamente dos iglesias góticas. Lo mismo pasa en el genoma.
Los dos niveles de individualidad (singularidad) incluidos en nuestro genoma: como
especie y como individuo único (junto el componente ambiental) dentro de nuestra
especie.
Que podeomos contestar: Nuestra unicidad como especie. La contesta el genoma
humano.
Nuestra Un genoma nuestro de referecia: que tiene. Ahora tennemos
Entre los numerosos aspectos novedosos que se presentaron, me limitaré a resumir los
que considero más relevantes, pero bastan estos ejemplos para demostrar la tesis que
voy a defender: