UNIVERSIDAD NACIONAL MAYOR DE SAN MARCOS. FACULTAD DE CIENCIAS BIOLÓGICAS ESCUELA ACADÉMICO PROFESIONAL DE MICROBIOLOGÍA Y PARASITOLOGÍA SYLLABUS. SEMESTRE ACADÉMICO I. DATOS GENERALES: 1.1. CURSO 1.2. CÓDIGO 1.3. CRÉDITOS 1.4. DURACIÓN 1.5. AÑO DE ESTUDIOS 1.6. NÚMERO DE HORAS 1.7. PRE-REQUISITO 1.8. HORARIO : 2014 – II : ECOLOGÍA MICROBIANA : B03137 : 4,0 : agosto a diciembre del 2014 : 4° Año : TEORÍA: 02 h; PRÁCTICAS: 04 h : Ecología General, Bacteriología y Micología : Teoría: miércoles, 14:00 a 16:00 h (Aula: 309) Prácticas: Grupo A: miércoles y viernes 16:00 a 18:00h Grupo B: miércoles y viernes 18:00 a 20:00h (Laboratorio 301) 1.9. Prof. RESPONSABLE Prof. Invitados Asistentes de laboratorio : Mg. Jorge León Quispe : Dra. Haydee Montoya T Dr. Pablo Ramírez R Mag. Mario Alcarraz Cuir Mag. Carmen Ruíz Huamán Blga. Mónica Huamán Iturrizaga Blga. Lidia R. Sánchez Pérez Blga. Maribel Baylón Coritoma Bach. Stephanie Montero Trujillo Bach. Nadia Galindo Cabello Bach. Mirko Lino Navarro : Est. Claudia Mateo Tuesta Est. Jéssica Cisneros Moscol Est. Ulrike Tarazona Janampa Est. Junior Caro Castro Est. Abigail Gutierrez Espinosa Est. Carolina Quispe Soto II. SUMILLA: El curso trata sobre el significado de los microorganismos en los ecosistemas naturales. Analiza sus principios en relación a la evolución, biodiversidad, interrelación con su entorno biótico-abiótico, distribución, composición y rol ecofisiológico de las comunidades microbianas en los diversos ecosistemas y ciclos biogeoquímicos. Se pone énfasis en las técnicas de aislamiento y evaluación de microorganismos en ambientes naturales. III. OBJETIVOS: 3.1 OBJETIVO GENERAL: Adquirir una visión global de comunidades microbianas procariotas y eucariotas presentes en diversos ecosistemas, y comprender sus orígenes, funciones, interacciones y principios para su aislamiento y uso práctico. 3.2 OBJETIVOS ESPECÍFICOS: Analizar la diversidad microbiana y comprender sus actividades en los ecosistemas en que proliferan. Analizar los factores que regulan el crecimiento microbiano en la naturaleza, sus interrelaciones con otros organismos y el rol en los ciclos de la materia. Comprender principios básicos de la ecología microbiana y su potencial aplicación en procesos biotecnológicos relacionados a la conservación del medio ambiente. IV. EVALUACIÓN: (Permanente) Exámenes de teoría : 02 Exámenes de práctica : 02 Adicionalmente se calificará la exposición de seminarios, discusión de artículos científicos, presentación de informes y participación del alumno en clases teórico-práctica. Nota promedio: Coeficiente. Exámenes de teoría 3,5 Exámenes de práctica 3,5 Exposición de seminarios 1,0 Presentación de informes 1,0 Participación en clases y asistencia 1,0 V. METODOLOGÍA. El desarrollo del curso comprenderá clases de teoría, práctica y discusión de seminarios. Las clases de teoría serán de tipo expositiva con ayuda de equipo audiovisual promoviéndose en todo momento la participación de estudiantes. Las clases de práctica se realizarán en el laboratorio mediante clases experimentales cortas, promoviéndose trabajos grupales. Se discutirán seminarios previa exposición y análisis de literatura científica actualizada. VI. PROGRAMACIÓN. CONTENIDO: PROFESOR 1° SEMANA (18 - 22 agosto). T1: Generalidades. Desarrollo histórico de Ecología Microbiana. Fuentes de información. Microorganismos en el medio ambiente. J. León T2: Diversidad metabólica microbiana. Organismos fototróficos, litotróficos. Organismos organotróficos. Organismos autotróficos y heterotróficos. J. León 2° SEMANA (25 - 29 agosto). T3: Interacciones entre poblaciones microbianas. Interacciones positivas y negativas. Modelos microbianos de interacciones poblacionales. J. León P1: Salida de campo: Toma de muestras. J. León P2: Técnicas de enumeración de bacterias ambientales. Recuento total de heterótrofos 3° SEMANA (01 – 05 setiembre). T4: Interacciones de microorganismos- plantas. Microorganismos de la rizósfera y filósfera. Micorrizas. Bacterias nodulares y simbiosis. J. León P3: lectura de la P2. Interpretación. J. León P4: Estratificación de microorganismos fotótrofos en Columnas de Winogradsky. J. León 4° SEMANA (08-12 setiembre). T5: Interacciones de microorganismos-animales. Comensalismo, mutualismo y sinergismo de microorganismos-animales. Predación animales-hongos. El ecosistema microbiano del rúmen. J. León P5: 1° lectura e interpretación de la “Columna de Winogradsky” (P4) P6: Antagonismo bacteriano. M. Alcarraz 5° SEMANA (15 - 19 setiembre). Exposición de seminarios (1° parte) P7: lectura de la P6 (Antagonismo bacteriano) P8: 2° lectura e interpretación de la “Columna de Winogradsky” (P4) M. Alcarraz J. León 6° SEMANA (22 - 26 setiembre). T7: Desarrollo de las comunidades microbianas. Dinámica poblacional. Estrategias r y k. Sucesión microbiana. Estructura de las comunidades microbianas. J. León P9: Recuento directo de bacterias ambientales por epifluorescencia N. Galindo P10: 3° lectura e interpretación de la “Columna de Winogradsky” (P4) J. León 7° SEMANA (29 set - 03 octubre). T9: Métodos moleculares en el estudio de comunidades microbianas. P11: Evaluación microbiana de suelos: “técnica de laminilla” P12: Lectura de la P11 (“técnica de laminilla”) P. Ramírez M. Huamán M. Huamán 8° SEMANA. Miércoles 09 de octubre: Primer examen (teoría – práctica). J. León 9° SEMANA (13 - 17 octubre). T10: Ecología fisiológica de microorganismos: adaptación a las condiciones ambientales. Limitaciones abióticas y determinantes ambientales. M. Lino P13: Sucesión microbiana en ambientes acuáticos (formación de biofilms) M. Huamán P14: lectura de la P13 (formación de biofilms). M. Huamán 10º SEMANA (20 - 24 octubre) T11: Los hábitat naturales. Microorganismos en la atmo-ecósfera. J. León T12: Microalgas y cianobacterias, su importancia ecológica y económica. H. Montoya P15: Exposición de seminarios: 2° parte P16: Diversidad de microalgas y cianobacterias en muestras de aguas continentales. M. Baylón 11° SEMANA (27 – 31 octubre). T12: Hidro-ecósfera. Estructura y dinámica de poblaciones microbianas en ambientes marinos y aguas continentales. J. León T13: Microorganismos bentónicos en la mineralización de la materia orgánica en ecosistemas marinos. N. Galindo P17: Observación de protozoarios de vida libre en ambientes acuáticos. L. Sánchez P18: Continuación de la P17 L. Sánchez 12° SEMANA (03 – 07 noviembre). T14: Conferencia: Las floraciones microalgales y sus implicancias en la producción de biotoxinas marinas. C. Ruíz H T15: Lito-ecósfera. El suelo como hábitat microbiano. Patrones de distribución microbiana. Mineralización y descomposición de residuos. M. Alcarraz P19: Aislamiento de bacterias termófilas, psicrófilas y halófilas M. Huamán 13° SEMANA (10 – 14 noviembre). T16: Rol de los virus marinos y sus implicancias en el ecosistema global. S. Montero P20: Lectura de la P19 M. Huamán P21: Aislamiento y evaluación de rizobacterias J. León 14° SEMANA (17 - 21 noviembre). T17: Ciclo del carbono. Transferencia de carbono a través de las cadenas tróficas. Metanogénesis y metilotrofía. Acetogénesis. Degradación de polisacáridos. J. León T18: Ciclo del nitrógeno en la naturaleza. Desnitrificación. Nitrificación. Fijación de nitrógeno. Rol ecológico de bacterias en el ciclo del nitrógeno. J. León P23: Lectura de la P21 J. León 15° SEMANA (24 - 28 noviembre). T19: Ciclo del azufre, con énfasis en ecosistemas marinos. Actividad microbiana sobre el H2S y su significado ecológico. J. León T20: Ciclo de hierro. El papel de los microorganismos en la oxidación del hierro en la naturaleza. Lixiviación microbiana. J. León P23: Exposición de seminarios (3ª parte). 16° SEMANA. Miércoles 03 diciembre: 2° Examen teórico - práctico J. León 17º SEMANA. Miércoles 10 diciembre: Examen Sustitutorio. VII. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS. TEXTOS: 1. ALET, K., and P. NANNIPIERI (eds.). 1995. Methods in Applied Soil Microbiology and Biochemistry Academic Press, London. 2. ATLAS, R and R. BARTHA. 2002. Ecología Microbiana y Microbiología Ambiental. Addison Wesley Publishing Company. USA. 3. BURLAGE R., ATLAS R., STAHL D., GEESEY G. & SAYLER G. 1998. Techniques in Microbial Ecology. Oxford University Press. 4. FENCHEL T. KING G.M & BLACKBURN T.H. 2000. Bacterial Biogeochemistry: The Ecophysiology of Mineral Cycling. Great Britam. 5. Microbiología de PRESCOTT, HARLEY Y KLEIN. 2009. 7° Edición. 6. KIRCHMAN D.L. 2000. Microbial Ecology of the Oceans. USA. 7. MADIGAN M., MARTINKO J. & PARKER J. 2009. Brock, Biología de los Microorganismos. 12 Edición. Pearson – Addison – Wesley. 8. PICKUP R.W; SAUNDERS J.R. 1998. Molecular approaches to environmental microbiology. Cambridge. Great Britam. REVISTAS ESPECIALIZADAS (JOURNAL): 1. Advances in Microbial Ecology. 2. Applied and Environmental Microbiology 3. Aquatic Microbial Ecology 4. Environmental Microbiology 5. Extremophiles. 6. FEMS Microbiology Ecology. 7. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 8. Microbial Ecology and biogeochemistry 9. Microbial Ecology. 10. Microbiological Reviews. 11. Soil Biology and biochemistry. 12. The ISME Journal: Multidisciplinary journal of microbial ecology