IA-MBA-PT-010 Escherichia coli O157:H7 en carne molida

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1. Objetivo
Disponer de un método para detectar la presencia de Escherichia coli O157:H7 en carne bovina.
2. Alcance
Para aplicar en muestras de carne molida, cortes de carne bovina usados en la preparación de carne
molida y carne molida mezclada con otras carnes o productos de pollo.
3. Responsabilidad y Autoridad
Jefe de Sección: velar por el cumplimiento de las normas establecidas en este procedimiento.
Coordinador Técnico de Sección: velar por el cumplimiento de las normas establecidas en este
procedimiento.
Analistas de laboratorio: realizar el ensayo según lo descrito en este procedimiento.
4. Definiciones
No aplica
5. Abreviaturas y/o Siglas
CTS m+n: Caldo Tripticasa de soya modificado + Novobiocina y Casáminoacidos
6. Referencias y/o Bibliografía
IA-MBA-PE-009 Manejo de la muestra
IA-MBA-PE- 015 Control de calidad de reactivos
IA-MBA-PE-009-RE-012 Hoja de trabajo: Análisis de Escherichia coli O157:H7
SEG-PE- 005 Control de medios de cultivo
USDA/FSIS Microbiology Laboratory Guidebook Online, capítulos 5A.02 y 5.05 (01/10/10)
Instrucciones para la identificación de enteropatógenos con el sistema api 20E
Instrucciones de Reveal Microbial Screening Test para E.coli O157:H7 NEOGEN
®
Instrucciones de Dynal Anti-E.coli O157
®
Instructivo Kit prueba de látex RIM E. coli O157:H7 REMEL
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Instructivo Kit Shiga Toxina Premier EHEC Cat. # 608096 Meridian
®
Instructivo Guía DuPont Qualicon BAX System
7. Descripción del procedimiento
7.1 Fundamento Teórico
La muestra a analizar se le agrega un caldo de enriquecimiento selectivo que contiene los
nutrientes necesarios para la supervivencia y multiplicación para E. coli O157:H7 así como un
antibiótico para su selectividad. Después se realiza una prueba tamiz de PCR, por medio del BAX
System y el kit BAX
®
®
E. coli O157:H7 MP según instrucciones del fabricante. Opcionalmente se
puede usar una prueba con dispositivo de flujo lateral, donde la muestra atraviesa una zona que
contiene anticuerpos específicos conjugados con partículas coloidales. Si los antígenos de E.coli
O157: H7 están presentes en la muestra se unirán estos por medio de una reacción antígenoanticuerpo y este inmunocomplejo se unirá a los anticuerpos anti E.coli O157: H7 que se encuentran
en la zona de reacción y se formará un precipitado visual. A las muestras con reacción positiva se
les realiza una prueba de separación inmunomagnética y luego se cultiva en medios selectivos y
diferenciales para el aislamiento y posterior confirmación bioquímica, serológica y confirmación de
Toxina/Gen.
7.2. Equipo, materiales, reactivos, kit y antisueros, medios de cultivo
7.2.1 Equipo
Balanza electrónica sensibilidad 0.1 g
Incubadora 35 ºC  2 ºC
Incubadora 42 ºC  1 ºC
Stomacher
Micropipeteador 20 µl - 200 µl
Mezclador de muestras Dynal MX4
Concentrador de partículas magnéticas Dynal ( MPC)S
Pipeteador eléctrico
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®
Equipo BAX System
Microcentrífuga
7.2.3 Materiales y reactivos
Bolsas plásticas para stomacher 7 ½ x 11 ¾ pulg (ancho x largo) con cierre de alambre
Pipetas de 5 ml
Puntas para micropipeta 20 µl -200 µl
Asas de Drigalski
Asas bacteriológicas
api 20 E
®
Kit de prueba de flujo lateral Reveal E. coli O157 NEOGEN
®
Kit prueba de látex RIM E. coli O157:H7 REMEL
Kit Shiga Toxina Premier EHEC Cat. # 608096 Meridian
®
Kit BAX System PCR E. coli O157:H7 MP (Qualicon # 17720673)
Microesferas paramagnéticas recubiertas con anticuerpos anti E. coli O157 (Dynal # 710.04 )
PBS con Tween 20
Tubos eppendorff 1,5 ml estériles
7.2.4 Medios de cultivo
Caldo Tripticasa de soya modificado con novobiocina + casáminoacidos (CTS m+n)
Agar Rainbow O157 + Telurito de Potasio y Novobiocina de Sodio
Agar Tripticasa de soya con sangre de oveja al 5 %
7.2.5 Cepas de referencia
E. coli génerica ATCC 25922
E. coli O157: H7 ATCC 700728 no toxigénica
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7.3 Procedimiento
7.3.1
Realizar el manejo de la muestra según lo establecido en el procedimiento IA-MBA-PE-009.
7.3.2
Pesar 325 g  32. 5 g de muestra y agregarle 975  19.5 ml de CTS m+n para una dilución 1:4.
Agitar en stomacher por 2 minutos y seguir paso 7.3.3. Alternativamente pesar 5 muestras de 65
g  2 g cada una en bolsa plástica estéril. Agregar 585 ml de caldo CTS m+n a cada bolsa
para una dilución 1:10. Agitar en stomacher por 2 minutos. Seguir paso 7.3.3
7.3.3
Incubar de 15 a 22 horas a 42ºC  1ºC. Incluir un control positivo (E. coli O157: H7 ATCC
700728), uno negativo (E. coli ATCC 25922) y un medio sin inocular.
7.3.4
®
A partir de la muestra diluida 1:4 hacer la prueba de PCR BAX E.coli O157:H7 MP siguiendo
instrucciones del fabricante. Si se usa el dispositivo de flujo lateral seguir instrucciones del
fabricante Reveal E. coli O157 NEOGEN.
Si usa la muestra diluida 1:10 se debe tomar 5 ml de CTS m+n de cada bolsa de stomacher
®
colocarlos en un recipiente estéril hacer la prueba de PCR BAX E.coli O157:H7 MP siguiendo
instrucciones del fabricante. Si se usa el dispositivo de flujo lateral seguir instrucciones del
fabricante Reveal E. coli O157 NEOGEN.
7.3.5
Hacer la prueba anterior de tamizaje a los controles.
7.3.6
Las muestras que den negativo la prueba de PCR BAX o con el dispositivo de flujo lateral se
®
reportan como E. coli O157:H7 Ausencia en 325 g.
7.3.7
®
Las muestras que dan un resultado inválido o indeterminado en la prueba de PCR BAX se
puede:
-repetir la prueba con la opción de reanalizar del sistema BAX®
-preparar nuevos tubos de BAX® y repetir el análisis de PCR
-realizar la prueba de flujo lateral Reveal E. coli O157 NEOGEN
7.3.8
Si el resultado es negativo reportar como lo descrito en el punto 7.3.6, si es positivo pasar al
punto 7.3.10 y reportar según apartado 7.4.1 a)
7.3.9
Si el control positivo da un resultado negativo, indeterminado o una señal de error en la prueba
de PCR BAX , esto afecta el set de muestras que se analizó por lo que se puede:
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- repetir la prueba con la opción de reanalizar del sistema BAX
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®
®
- preparar nuevos tubos de BAX y repetir el análisis de PCR
- realizar la prueba con el dispositivo de flujo lateral Reveal E. coli O157 NEOGEN
7.3.10 Los caldos CTS m+n que dieron positivo a la prueba de tamizaje se les realiza la prueba de
separación inmunomagnética de acuerdo a las instrucciones (anexo1) y se siembra en agar
Rainbow O157.
7.3.11 Incubar las placas a 35 ° C  2° C por 24-26 horas
7.3.12 Lectura de las placas:
-
Colonias típicas E. coli O157:H7 : crecimiento de colonias negras o grises
-
Las colonias de E. coli O157: H7 pueden presentar una tonalidad azulada si están rodeadas de
colonias color rosado o magenta.
Nota: Si no hay colonias típicas reincubar las placas por 6- 24 horas a 20 ºC– 24ºC y reexaminar
la placa.
7.3.13 A las colonias sospechosas aisladas, si es posible una por submuestra (5 por muestra) hacer
®
prueba de látex RIM E. coli O157 REMEL de acuerdo a instrucciones del fabricante.(anexo 2)
®
7.3.14 Si la prueba látex RIM E. coli O157 REMEL es positiva rayar las colonias sospechosas en
agar sangre de oveja al 5%. Incubar a 35 ºC  2 ºC por 16 -24 horas.
7.3.15 De acuerdo al resultado , reportar de la siguiente manera:
a) Si el resultado de la prueba es negativo se reporta como ausencia en 325 g
b) Si el resultado es positivo se reporta según el apartado 7.4.1 b).
7.3.16 A partir de las colonias en agar sangre realizar las siguientes pruebas:
1) Bioquímica api 20 E
®
®
2) Prueba de látex RIM E. coli H7 REMEL siguiendo las instrucciones del fabricante.
3) Determinación de Shiga toxinas I y II por la prueba Premier EHEC Cat. # 608096 Meridian
de acuerdo a instrucciones del fabricante.( anexo 3)
4) Determinación por PCR de los genes para Shiga Toxina; el cual se llevará a cabo en
laboratorio de Referencia INCIENSA del Ministerio de Salud.
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7.4 Reporte de resultados
7.4.1
Reportar de la siguiente forma:
a) Positivo potencial: Si presenta reacción positiva en la prueba de tamizaje.
b) Positivo presuntivo: Si se aíslan colonias típicas en el agar Rainbow O157 y da prueba
positiva con antisuero O157.
c) Presencia en 325 g: Si la cepa es identificada bioquímicamente
como E. coli,
es
confirmada como O157 y presenta al menos uno de los siguientes criterios.
a) Producción de Shiga toxina
b) Positivo para genes Shiga toxina
c) Se determina que genéticamente es H7
7.5 Control de Calidad
7.5.1
El control de calidad de los medios de cultivo utilizados se debe llevar a cabo de acuerdo al
procedimiento SEG-PE-005.
7.5.2
Realizar control de calidad a cada lote de reactivos críticos utilizados, según el procedimiento
IA-MBA-PE-015 de control de calidad de reactivos.
7.5.3
Toda la información generada por el análisis de la muestra se registra en el formulario IA-MBAPE-009-RE- 012 Hoja de trabajo: Análisis de Escherichia coli O157:H7
8. Anexos
Anexo1. Diagrama de prueba Dynal® Anti-E.coli O157.
Anexo 2. Instructivo de prueba de serología E.coli O157:H7 Remel.
Anexo 3. Shiga Toxina Premier EHEC
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Anexo 1
Uso de Dynabeads Anti- E.coli O157
Remover el plato magnético del concentrador de partículas magnético Dynal ( MPC-S) y colocar en la gradilla
tubos eppendorf de 1,5 ml. estériles.
Agregar 20 ul de Dynalbeads Anti-E.coli O157 (que previamente han sido resuspendidas por vortex) a cada tubo
eppendorf que se vaya a usar.
Agregar a cada tubo eppendorf 1 ml de muestra. Hacer lo mismo con el
control positivo y negativo
Agitar por 10- 15 minutos a temperatura ambiente en el
mezclador Dynal MX4
Colocar el plato magnético en la gradilla del MPC-S. Invertir los tubos
eppendorf varias veces. Dejarlos reposar por 3 minutos
Sin quitar el plato magnético de la gradilla del MPC-S elimine el
sobrenadante de los tubos eppendorf.
Quitar el plato magnético de la gradilla del MPC-S agregar a los tubos
eppendorf 1 ml de PBS con Tween 20. Invertir varias veces para resuspender
Poner el plato magnético a la gradilla del MPC-S. Dejar los tubos eppendorf
reposar por 3 minutos.
Sin quitar el plato magnético de la gradilla del MPC-S elimine el sobrenadante
de los tubos eppendorf.
Quitar el plato magnético de la gradilla del MPC-S y agregar a los tubos
eppendorf 1 ml de PBS con Tween 20. Invertir varias
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Poner el plato magnético a la gradilla del MPC-S. Dejar los tubos eppendorf reposar
por 3 minutos
Sin quitar el plato magnético de la gradilla del MPC-S elimine el sobrenadante de los
tubos eppendorf
Quitar el plato magnético de la gradilla del MPC-S y agregar a los tubos eppendorf 500
ul de PBS con Tween 20. Agitar en vortex. Seguir los pasos 1, 2, 3 en su orden.
2
Hacer dilución 1:10 con (01 del
complejo Beads-bacteria ) y 0.9 de
PBS Tween 20. (Si se requiere se
puede hacer dilución 1:100)
3
1
Centrifugar por 2 minutos el remanente y
descartar el sobrenadante.
Agregar 0.1ml PBS Tween 20, resuspender
Colocar 0.1 ml de complejo Beads-bacteria. Con asa de Drigaski estéril rayar las placas de MACS –CT.
Seguir instrucciones del procedimiento MBA-PT-010. E. coli O157
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Anexo 2
Diagrama Serología E. coli O157:H7 remel
Para la muestra y los controles positivo y negativo, depositar una gota de E. coli O157 Test Latex en círculos
separados de la lámina desechable que provee el fabricante.
A su vez en un círculo aparte se deposita una gota del Control de Látex (sólo para la muestra)
Usando un palito desechable o una asa remover una porción de las colonias sospechosas y emulsionar en el círculo que
contiene la gota de E. coli O157 Test Latex.
Hacer el mismo procedimiento con el círculo que contiene el Control de Latex.
Depositar una gota del control positivo y una del negativo en los círculos correspondientes que contengan una gota de E.
coli O157 Test Latex
Mezcle bien por rotación por un minuto.
La prueba es positiva si hay aglutinación
Si la cepa aglutina tanto con el E.coli O157 Test
Latex y el Control Latex se hace una suspensión
de la cepa en solución Salina al 1 de McFarland y
se hierve por 10 minutos. Se toma 30-50 ul de la
suspensión y se vuelve a realizar la prueba para
O157
Si la cepa aglutina tanto con
el E.coli O157 Test Latex y el
Control Latex y es
bioquímicamente E. coli se
envía a un laboratorio de
referencia.
Si aglutina solo con
el E. coli O157 Test
Latex.
Si hay aglutinación con el E.coli O157
Test Latex y no con el Control Latex se
reporta como positivo para E. coli O157.
Se procede a rayar las colonias en agar
sangre.
Incubar 18 a 24 h a 35 °C.
Repita el test pero esta vez usando
E. coli H 7 Test Latex en lugar del E.coli
O157 Test Latex.
El Control Latex es omitido en este paso
Una aglutinación indica presencia de E. coli H7.
La prueba se reporta positivo para E. coli O157:H7.
Si no aglutina con H7 hacer pasajes de la cepa en medio motilidad y
repetir la prueba.
Si la cepa no aglutina con H7 se reporta E. coli O157/NM
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Anexo 3
Prueba Premier EHEC Shiga Toxina I y II E.coli O157
Separar el # de micropocillos requeridos para la
muestras y 1 para el control positivo y uno para el control
negativo. Colocarlos en la tira de micropocillos y
registrar su posición
Colocar varias colonias sospechosas del agar
sangre en 200 ul de diluente Premier EHEC.
Agitar vortex 15 segundos
.
Tomar 100 ul de la dilución de las colonias y agregarlo al micropocillo que corresponda.
Para los controles positivo y negativo colocar 2 gotas de cada uno en los micropocillos rotulados para tal fin.
Mezclar bien durante 30 segundos agitando en forma circular
Sellar los micropocillos e incubar durante una hora a
temperatura ambiente ( TA ).
Desechar el contenido de los micropocillos y lavar 5 veces con buffer
de lavado 1X
Añadir a cada micropocillo 2 gotas de anticuerpo de detección mezclar
agitando circularmente por 30 segundos.
Sellar los micropocillos e incubar a TA por 30 minutos
Desechar el contenido de los micropocillos y lavar 5 veces con bufer
de lavado 1X
Sellar los micropocillos e incubar a TA por 30 minutos
Desechar el contenido de los micropocillos y lavar 5 veces con buffer de
lavado 1X
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Añadir 2 gotas de la solución sustrato. Mezclar por agitación circular por 30
segundos
Añadir 2 gotas de conjugado enzimático a cada micropocillo. Mezclar por
agitación circular por 30 segundos
Incubar por 10 minutos a TA. Añadir 2 gotas de solución de parada y leer la reacción dentro de
los 15 minutos después de añadir la solución de parada
Negativo: Incoloro
Positivo: Amarillo definido
Si se presenta un color amarillo poco visible se evalúa por espectrofotometría a 450 nm contra blanco de
reactivos:
Negativo: OD < 0,180
Positivo : OD > 0,180
Preparación de la solución de lavado 1X
Hacer dilución 1:20 del tampón de lavado 20X
II. Preparar el volumen necesario de acuerdo
al Nº de muestras. La solución de lavado 1X
es estable por 3 meses a temperatura
ambiente.
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