Descargar el cuaderno de ejercicios doc, 194kb

Anuncio
HINARI Programa de acceso a la investigación en salud
Interface de base de datos PubMed
(Curso básico: módulo 4)
Tabla de contenido
 Conexión a PubMed
 Navegando a través de PubMed
 Búsqueda en PubMed
 Opciones de visualización
 Opciones para impresión, guardar y de envío por correo electrónico
Objetivos del módulo:
En este y los módulos subsiguientes se hará énfasis en las habilidades sobre cómo utilizar PubMed
como una herramienta para identificar artículos en texto completo sobre temas relacionados con la
salud. PubMed es la base de datos biomédica más importante, que indexa más de 5,100+ artículos
de revistas biomédicas. Las habilidades en estos módulos incluyen la búsqueda, identificación de
límites en PubMed, utilizando encabezamientos de materia sobre salud (MeSH por sus siglas en
inglés) y otras herramientas (vista previa / índice e historial) para las estrategias de búsqueda y el
uso de 'My NCBI', un mecanismo que permite crear pestañas de filtro de configuración en el área de
visualización, guardar búsquedas y alertas automáticas por correo electrónico de los nuevos artículos
agregados a PubMed.
Al aprender estas habilidades, dominará una opción muy valiosa para la utilización de las revistas
electrónicas que están disponibles a través de HINARI particularmente será capaz de identificar los
artículos disponibles de múltiples revistas y editoriales asociadas en HINARI. Si bien algunas de
estas tareas son complicadas, se aprenderán habilidades que permiten ser un investigador más
preciso e identificar material clave de manera eficiente.
Al igual que en el primer módulo, es necesario tener acceso a Internet y se requerirá completar una
serie de ejercicios. Se debe ingresar a HINARI e ir a la 'Búsqueda de artículos a través de PubMed
(Medline)' o no se tendrá acceso a los artículos de texto completo (ver sección 1. Conexión a
PubMed).
1. Conexión a PubMed
Los usuarios de HINARI pueden buscar y acceder a artículos de texto completo directamente de la
base de datos PubMed. Necesitará tener los detalles su registro de HINARI para hacer esto.
 Primero ir a la página web de HINARI localizada en www.who.int/hinari donde se puede
seleccionar el enlace LOGIN a HINARI que lleva a la página de inicio de la sesión R4L
(Programa para la investigación en apoyo a la calidad de vida, por sus siglas en inglés).
 Cuando se abre la página de inicio de sesión, ingresar el código de
usuario y contraseña institucional de HINARI en los cuadros de inicio de sesión y hacer
clic el botón Sign In (ingresar) para acceder al sitio HINARI .
 Si no se ingresa a HINARI utilizando el código de usuario y contraseña institucional, no se
tendrá acceso a artículos en texto completo de las editoriales asociadas de HINARI al
término de la búsqueda en PubMed.
 Desde la página de contenido de HINARI (Portal), seleccionar el enlace Buscar en
HINARI textos completo utilizando PubMed.
2. Navegando a través de PubMed
Los ejercicios en esta sección sirven de guía en el proceso de búsqueda y en las opciones
disponibles en PubMed.
¡Sugerencia!
Al utilizar el botón de “Back” (regresar) del navegador mientras se navega PubMed se puede
encontrar la necesidad de utilizar la función de "Refresh" (actualizar) para volver a mostrar la página
web.
3. Búsqueda en PubMed
En la página de PubMed, el cuadro de búsqueda se encuentra en la barra gris horizontal a través de
la página de PubMed. Para buscar en la base de datos PubMed, es necesario asegurarse de que
muestre el botón de Search (buscar) PubMed y de ingresar los términos de la búsqueda en el cuadro
de búsqueda más grande. Cuando se haya ingresado la expresión de búsqueda, hacer clic en el
botón de Search (buscar).
Ejercicio 1
 Desde la página de contenidos de HINARI, seleccionar el enlace Buscar en HINARI textos
completos utilizando PubMed.
 Ingresar los términos de búsqueda en el cuadro de búsqueda vacío - ingresar la siguiente
expresión: malaria infections AND africa (infecciones de la malaria en África).
 Si se desea, se puede ingresar una búsqueda por palabra clave, según el interés del usuario
en lugar de malaria infections AND africa (infecciones de la malaria en África).
 Hacer clic en el botón de Search (buscar). Ahora se deben mostrar los resultados
encontrados.
 ¿Cuántas citas de artículos han sido identificadas?
 Tener en cuenta el texto completo gratuito y filtros HINARI mostrados en pantalla / hacia la
derecha del cuadro de búsqueda en PubMed. ¿Cuántas citas de artículos cuentan con el
texto completo gratuito y filtros HINARI?
 Volver a los resultados de la búsqueda (utilizando el botón Back (regresar) del navegador).
Recordar - es posible que se tenga que actualizar la página si utiliza el botón de Back
(regresar) del navegador.
4. Resultados de búsqueda
Primero asegurarse de que se tiene la página de resultados de PubMed mostrando la expresión de
búsqueda : malaria infections AND africa (infecciones de la malaria en África). Si se ha perdido la
búsqueda, repetir los pasos 1 y 2 en el ejercicio 2 de la sección 4.
Al ver la pantalla de resultados puedes ver que aparece el cuadro de la búsqueda actual. Debajo de
este se mostrará un menú para configuración de la visualización de los resultados. Los resultados se
mostrarán en el formato predeterminado como Summary (resumen) y 20 Items per page (20
artículos por página). Hay también una indicación de la cantidad de artículos obtenidos por ejemplo
1-20 de 16000 y resultados de cuántas páginas hay que ver por ejemplo Página 1 de 800 (ver parte
inferior de la página).
Ejercicio 2
La página de resultados de PubMed muestra la expresión de búsqueda
 Con los resultados de búsqueda de: malaria infections AND africa (infecciones de la
malaria en África) que aparecen en la página, seleccionar Display Settings del menú
desplegable haciendo clic en el enlace.
 Se mostrará el menú que con la elección de opciones de configuración para
visualización. Desplazarse por la lista para ver todos los que están disponibles. La opción
predeterminada es la pantalla de Summary (resumen).
 ¿Qué información muestra la opción de resumen? ¿Qué otra información sería de utilidad?
 Continuar con los ejercicios utilizando la página de resultados de búsqueda de PubMed.
Ejercicio 3
 En la página de resultados de búsqueda de PubMed, seleccionar la pantalla de Abstract
(resumen), ir al menú despegable de Display Settings (configuración de visualización) y
hacer clic en Abstract (resumen).
 Se muestran los detalles de este formato. Tener en cuenta que la pantalla de resumen
contiene un resumen del artículo y es muy valioso para decidir si se desean los artículos de
texto completo o no. Además, la pantalla de resumen contiene los enlaces al texto completo
gratuito y/o editoriales asociadas de HINARI que vinculan a los artículos en texto completo
actuales.
 Una vez más, ¿Qué campos adicionales se muestran en este formato?
 Finalmente, seleccionar MEDLINE del menú despegable de Display Settings (configuración
de visualización).
 El formato MEDLINE muestra todos los campos del registro MEDLINE junto con los
identificadores de campo al inicio de cada línea. Este formato se debe utilizar para la
descarga de registros en el software de gestión de referencias.
 ¿Cuál es el formato de preferencia y por qué?
 Continuar con los ejercicios utilizando la página de resultados de búsqueda de PubMed.
5. Organizando los registros en categorías
El orden predeterminado de los registros es el número de identificación de PubMed. Sin embargo
también se pueden organizar los registros en orden alfabético por autor o por título de la
revista. También se puede utilizar esta función para enumerar los registros por fecha de publicación.
Ejercicio 4
 Mostrar los registros en el formato de Summary (resumen).
 Utilizando la página de resultados de búsqueda, hacer clic en el menú desplegable de
Display Settings (configuración de visualización) y seleccionar la opción para 200. Hacer clic
en el botón de Apply (aplicar)- para activar ese formato. Notar cómo el número de artículos
que muestra ahora es 1-200 (en lugar del número predeterminado de 20) con respecto al
número total de registros encontrados.
 ¿Cuál es el número total de páginas que la búsqueda tiene ahora? (señalado en la parte
superior e inferior de la página)
 Ir al campo de Sort by (organizar por) hacer clic en el menú desplegable junto a Sort by
(organizar por) y seleccionar el First Author (primer autor). Hacer clic en el First Author
(primer autor), y tener en cuenta que los registros están listados en organizar alfabético por
autor.
 A continuación utilizar Sort by (organizar por) para seleccionar Pub Date (fecha de
publicación) hacer clic sobre Pub Date (fecha de publicación) y hacer clic en el botón de
Apply (aplicar).
 Los registros se muestran por la fecha más reciente.
 Volver a Sort by (organizar por) y seleccionar Relevance (relevancia) hacer clic en el botón
de Apply (aplicar).
 Observar cómo los artículos ahora están listados en orden.
 ¿Cuál es el formato de preferencia y por qué?
 Continuar con los ejercicios utilizando la página de resultados de búsqueda en PubMed .
Tener en cuenta que en menú despegable de Display Settings (configuración de visualización) se
pueden cambiar tres variables diferentes a la vez Format (formato) Items per page (artículos por
página) y Sort by (organizar por).
6. Guardar resultados
Para descargar los resultados a una unidad de disco seleccionar Send to file (enviar a archivo)
desde el menú desplegable y se abre un cuadro de dialogo que permite seleccionar una ubicación y
asignar un nombre al archivo. En esta etapa cambiar el tipo de archivo del documento fcgi por all
files (todos los archivos), nombrar archivo y asignarle una extensión de archivo .txt. A continuación
se pueden guardar los datos en el disco 'C' o en una unidad flas o un CD-ROM.
Ejercicio 5
 Asegurarse de que se tienen los resultados obtenidos por la expresión de búsqueda malaria
infections AND africa (infecciones de la malaria en África). Si se ha perdido la búsqueda,
repetir los pasos 1 y 2 del ejercicio 2.
 Colocar una memoria USB o CD-ROM en la unidad correspondiente de la
computadora. (Como alternativa, se puede utilizar el disco duro de la computadora si se
prefiere).
 Colocar marcas de verificación en las casillas junto a los primeros seis (6) registros.
 Para este ejercicio se muestran los resultados en el formato
de Abstract (resumen). Seleccionar para guardar los resultados en el disco (u otra opción)
haciendo clic en File (archivo) en el menú despegable de Sent To (enviar a).
 Un cuadro de diálogo se abrirá preguntando qué se desea hacer con el archivo. Hacer clic
en Save (guardar) y también en las opciones de Format (formato) y Sort by (organizar por)
en los menús desplegables. Hacer clic en Create File (crear archivo).
 Hacer clic en pubmed_result.txt en la parte inferior del navegador (para Google Chrome;
para Mozilla Firefox, un nuevo cuadro se mostrará). Cambiar el nombre del archivo a
malariainfections.txt. Hacer clic en Save (guardar)
 Continuar con los ejercicios utilizando la página de resultados de búsqueda de PubMed.
7. Enviando los resultados por correo electrónico
Mediante las opciones de Sent To (enviar a) también se pueden enviar los resultados por correo
electrónico, en el formato de visualización seleccionado, a la dirección de preferencia.
Ejercicio 6
 Para probar este ejercicio, se necesita una dirección de correo electrónico.
 Desde la página HINARI/PubMed, visualizar los resultados de la expresión de
búsqueda malaria infections AND africa (infecciones de la malaria en África). Si se ha
perdido la búsqueda, repetir los pasos 1 y 2 en el ejercicio 2.
 Colocar las marcas de verificación en las casillas junto a los primeros 6 registros.
 Hacer clic en open (abrir) el menú despegable de Sent To (enviar a).
 Un cuadro de diálogo se abrirá preguntando qué se desea hacer con el archivo. Hacer clic
en E-mail (correo electrónico) y también en las opciones del menú desplegable de Format
(formato) y Sort by (organizar por). Ingresar la dirección de correo electrónico y si lo
desea, un mensaje de texto adicional. Ingresar la palabra que aparece en la imagen y
hacer clic en E-mail (correo electrónico).
 A continuación volver a la página de búsqueda. Debe de aparecer un mensaje en una banda
verde, en la parte superior de los resultados, indicando que los resultados han sido enviados
del servidor de PubMed a la dirección de correo electrónico ingresada.
 Continuar con los ejercicios utilizando la página de resultados de la Búsqueda de PubMed.
Nota: Recordar que desde el menú despegable de Sent To (enviar a), también se puede
enviar información a un file (archivo), clipboard (portapapeles), citation manager (gestor de
referencias) o, utilizando la cuenta de My NCBI (módulo 4.5), Collections (colecciones) o My
bibliography (mi bibliografía).
8. Portapapeles
Los resultados seleccionados también pueden guardarse en el área de portapapeles. El Clipboard
(portapapeles) permite guardar o ver citas seleccionadas de la búsqueda de una o varias búsquedas
que se deseen imprimir, guardar u ordenar. El número máximo de artículos que se pueden colocar
en el portapapeles es de 500.
Ejercicio 7
 Asegurarse de que se tienen los resultados obtenidos por la expresión de búsqueda malaria
infections AND africa (infecciones de la malaria en África). Si se ha perdido la búsqueda,
repetir los pasos 1 y 2 del ejercicio 2.
 Seleccionar seis de los resultados mediante la colocación marcas de verificación en la casilla
junto a ellos.
 Ir a la opción Sent To (enviar a) del menú desplegable y hacer clic en Clipboard
(portapapeles).
 Los artículos han sido transferidos al Clipboard (portapapeles).
 Cuando se regresa a la búsqueda, tener en cuenta la casilla verde en cada artículo en el
portapapeles para cada cita seleccionada.
Ejercicio 8
 Utilizar los resultados del ejercicio anterior enviados al Clipboard (portapapeles).
 Hacer clic en el enlace de Clipboard (portapapeles) abajo y a la derecha del cuadro de
búsqueda.
 Abrir la pantalla de Clipboard (portapapeles).
 Seleccionar dos artículos haciendo clic en las casillas de verificación.
 Utilizar la opción de Clip remove (clip de eliminar) en el menú despegable de Sent To
(enviar a).
 Hacer clic en el Clip remove (clip de eliminar) para eliminar los artículos del Clipboard
(portapapeles).
 Ver un mensaje que indica que los artículos han sido eliminados desde el portapapeles.
9. Clínica adicional enfocada a búsquedas en PubMed
Este ejercicio utilizará operadores de búsqueda booleanos adicionales (OR, NOT) (o, no) en
búsquedas específicas además del desarrollo de estrategias de búsqueda a partir de una pregunta.
Ejercicio 9
 Ingresar los siguientes términos de búsqueda en el cuadro de búsqueda vacío: tobacco use
AND (oral cancer OR lung cancer) (uso del tabaco y (cáncer oral o cáncer del
pulmón). Hacer clic en el botón adyacente de Search (búsqueda).
 ¿Cuántas citas de artículos han sido identificadas?
 Tener en cuenta el texto completo libre y los filtros HINARI mostrados abajo hacia la derecha
del cuadro de búsqueda de PubMed. ¿Cuántas citas de artículos de texto completo gratutio
hay en los filtros de HINARI?
 Ingresar los siguientes términos en el cuadro de búsqueda – ingresar la siguiente
expresión: infections AND (HIV NOT tuberculosis) (infecciones y (no VIH
tuberculosis). Hacer clic en el botón adyacente de Search (búsqueda).
 ¿Cuántas citas de artículos han sido identificados? ¿Cuántas citas de artículos hay en los
filtros de texto completo gratuito en HINARI?
 En la lista de preguntas a continuación, completar dos búsquedas HINARI/PubMed. Para
estas búsquedas, tener en cuenta los términos de búsqueda que se han utilizado y listar el
número total de citas de artículos y a través de los filtros, el número de artículos en texto
completo gratuito en HINARI:
 Therapy: In adults with HIV, are oral antibiotics as effective in treating
infection as intravenous antibiotics? (Terapia: En adultos con VIH, ¿son los
antibióticos orales tan eficaces en el tratamiento de la infección como los
antibióticos intravenosos?)
 Prevention: In obese middle-aged women does weight loss prevent
hypertension? (Prevención: En las mujeres de mediana edad con obesidad, ¿la
pérdida de peso previene la hipertensión?)
 Diagnosis: Can low dose CT lung screening diagnose early signs of lung
cancer? (Diagnóstico: ¿Puede una dosis baja de TC diagnosticar los signos
tempranos de cáncer de pulmón?)
 Prognosis: In elderly patients who present with Ebola symptoms, what is the
relative risk of death? (Pronóstico: En pacientes de edad avanzada que
presentan síntomas del ébola, ¿cuál es el riesgo relativo de muerte?)
 Etiology: Are patients diagnosed with HIV at increased risk for cholera?
Etiología: ¿Están los pacientes diagnosticados con VIH en mayor riesgo de cólera?
Prevention: What are effective strategies to prevent the spread of Ebola?
(Prevención: ¿Cuáles son las estrategias eficaces para prevenir la propagación del
ébola?
Asignación:
Ha completado el Curso básico módulo 4 de HINARI y terminado los nueve ejercicios. Con lo que se
han dominado las habilidades necesarias para buscar, visualizar, descargar y enviar por correo
electrónico las citas de artículos de revistas de PubMed. Dentro de las opciones de visualización, se
debe elegir los formatos que más se adapten a las necesidades personales. Estas habilidades son
cruciales para el uso eficiente de PubMed y para identificar los artículos en texto completo que se
desean acceder.
Actualizado 01 de 2015
Descargar