Métodos moleculares aplicados al estudio de microorganismos de interés en Salud Animal

Formulario para presentación de Cursos del Programa de Posgrados
NOMBRE DEL CURSO:
Métodos moleculares aplicados al estudio de microorganismos de interés en salud animal
NOMBRE DEL/LOS COORDINADOR/ES:
Pablo Zunino
Nombre de los Docentes invitados:
Nacionales: Claudia Piccini, Pablo Zunino, Karina Antúnez, Martin Fraga, Paola Scavone, Elena Fabiano.
FECHA DE INICIO……3/11/2014…
75 hs. Totales CARGA HORARIA: 46 hs. presenciales
CUPO:
FECHA DE FINALIZACIÓN………18/12/14…
PROPUESTA DE CRÉDITOS:
No
Sí
5
Cantidad …………………
DINÁMICA Y EVALUACIÓN DEL CURSO:
X
Clases prácticas:
X
Laboratorio:
Seminario individual:
Seminario grupal:
X
Otros:
Examen parcial
Examen final
Clases teóricas:
X
X
Talleres:
X
Evaluación continua
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TRANSMISIÓN POR VIDEOCONFERENCIA
(Por el momento limitada a Reg. Norte- Salto, EEMAC-Paysandú, y Montevideo)
Lugar de transmisión ___________________________
Lugar de recepción
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El docente responsable realizará las gestiones necesarias en Facultad (UPEI-UGESA) y en los otros
puntos de transmisión- recepción de la videoconferencia.
1
PROPUESTA DE 3 MIEMBROS PARA INTEGRAR EL TRIBUNAL EXAMINADOR
(2 como Mínimo docentes de Posgrado)
1……Pablo Zunino……
2……Claudia Piccini …
3……Karina Antúnez……
4……Pala Scavone…
5…………………………………
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FORMULARIO MODIFICADO POR RESOLUCIÓN DEL CAMD DEL 31/03/2011
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2
Curso Teórico - Práctico
Noviembre/Diciembre de 2014
Métodos moleculares aplicados al estudio de microorganismos
de interés en salud animal
Número total de horas: 46 (30 horas teóricas y 16 horas prácticas)
Lugar: Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable
Coordinadores: Pablo Zunino (algún co-coordinador a designar)
Docentes: Ver programa
Participantes:
Objetivo
El objetivo principal del curso es brindar a los estudiantes las herramientas básicas para el diseño de
estrategias de identificación y diagnóstico de microorganismos de interés en sanidad animal, así
como para el estudio de comunidades microbianas nativas.
A la vez, se pretende fomentar la interacción entre estudiantes, así como con los docentes
participantes, estimulando la generación de cooperación científica.
PROGRAMA
PROGRAMA TEÓRICO
MODULO UNO: MÉTODOS DE DIAGNÓSTICO E IDENTIFICACIÓN
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PCR, Reactivos para PCR, Equipamiento necesario, Diseño de primers, Extracción,
purificación y cuantificación de ADN, Extracción de ARN, Retrotranscripción a ADNc,
Métodos basados en PCR (RT-PCR, Multiplex PCR). Dra. Karina Antúnez. Duración: 2
hs.
Secuenciación, Análisis de secuencias. Nociones básicas de bioinformática. Mag. Martín
Fraga. Duración: 2 hs.
PCR en tiempo real, Equipamiento necesario, Tipos de colorantes (tipos de sondas, SYBR
Green), Cuantificación absoluta y relativa, Temperatura de melting. Dra. Karina Antúnez.
Duración: 2 hs
Métodos basados en microscopia de fluorescencia: Nociones básicas de microscopia de
fluorescencia y microscopia confocal, Hibridación in situ fluorescente, Inmunofluorescencia.
Dra. Paola Scavone. Duración: 2 hs.
Taller de discusión: Ejemplo de uso de estas técnicas para el diagnóstico y la identificación
de microorganismos de interés en sanidad animal. Dra. Claudia Piccini, Dr. Pablo Zunino,
Dra. Karina Antúnez, Mag. Martin Fraga, Dra. Paola Scavone. Duración: 4 hs.
MODULO DOS: MÉTODOS DE ANÁLISIS DE COMUNIDADES
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Conceptos generales de diversidad. Filogenia. Diversidad metabólica. Índices de diversidad.
Dra. Claudia Piccini. Duración 2 horas
Microbiotas nativas. Importancia en la fisiología animal. Relación con el hospedero.
Estrategias de modulación de la microbiota. Probióticos. Dr. Pablo Zunino. Duración 2
horas.
Métodos de estudio de comunidades microbianas. Fingerprinting. ARDRA. TRFLP. DGGE.
Bibliotecas de clones- secuenciación. Árboles filogenéticos. Dra. Claudia Piccini. Duración
2 horas
Metagenómica. Dra. Elena Fabiano. Duración 2 horas
Secuenciación masiva. Conceptos básicos. Tipos de plataformas. Aplicaciones. Dr. José
Roberto Sotelo. Duración 2 horas.
Aplicaciones de la secuenciación masiva a la Microbiología. Mag. Martín Fraga. Duración
2 horas.
Taller de discusión: Aplicaciones de estas técnicas para el estudio de comunidades
microbianas en animales de importancia productiva. Dra. Claudia Piccini, Dr. Pablo
Zunino, Dra. Karina Antúnez, Mag. Martin Fraga, Dra. Paola Scavone. Duración: 4 hs.
PROGRAMA PRÁCTICO
Los estudiantes se dividirán en tres grupos y cada uno trabajará con un problema (muestra) diferente:
1. Detección e identificación de microorganismos de importancia en apicultura.
2. Análisis de comunidades microbianas ruminales.
3. Biofilms bacterianos
En cada grupo, se realizarán los siguientes procedimientos:
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Preparación del muestreo. Toma y almacenamiento de muestra.
Extracción de ADN, extracción de ARN.
Retrotranscripción, PCR, Multiplex PCR, Microsatélites, PCR en tiempo real, DGGE
Electraoforesis en gel de agarosa y/o acrilamida, Análisis de imágenes
FISH e inmunofluorescencia
Secuenciación masiva (demostración). Análisis de los resultados de secuenciación masiva.
Las fechas y horarios de los prácticos (a realizarse luego de culminado el programa teórico) se
coordinarán luego de comenzado el curso.
Fecha de inicio: 3 de noviembre de 2014.
Días y horarios: Lunes, Miércoles y Viernes de 9 a 11 hs.