Aminoácidos I y II

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Aminoácidos I
Br. Cecilia López
Área Bioquímica
Departamento de Biología Molecular y Celular
Marzo 2012
Neurotransmisores (GABA,
dopamina)
Aminoácidos
Mediadores de la inflamación
(Histamina)
Intermediarios del ciclo de la
urea (ornitina, citrulina)
Proteínas
Hemoglobina (sangre)
Inmunoglobulinas
(Leche)
Receptor de insulina
(células)
Lisozima (saliva)
Albúmina (sangre,
leche, huevos)
Estructura general de los aminoácidos:
aminoácidos:
Grupo
carboxilo
Grupo
amino
α
Hidrógeno
Cadena lateral
o grupo R o
radical
pH=7
Clasificación de los aminoácidos
aminoácidos::
Si forman o no parte de las proteínas
proteínas::
Aminoácidos que forman parte de las
proteínas (20 aminoácidos)
aminoácidos)..
Aminoácidos que no forman parte de las
proteínas..
proteínas
Los 20 aminoácidos que forman parte
de las proteínas a su vez se pueden
clasificar::
clasificar
a) Según la naturaleza química y polaridad
de su grupo R.
b) De acuerdo al número de grupos
carboxilo y amino presentes en la molécula
molécula..
c) En aminoácidos esenciales
esenciales en animales superiores.
superiores.
y
no
a) Según la naturaleza química y polaridad de
su grupo R en
en::
Aminoácidos con grupos R apolares alifáticos
alifáticos..
Aminoácidos con grupos R aromáticos
aromáticos..
Aminoácidos con grupos R polares sin carga
carga..
Aminoácidos con grupos R cargados positivamente (Básicos)
(Básicos)..
Aminoácidos con grupos R cargados negativamente (Ácidos).
(Ácidos).
Aminoácidos con grupos R apolares alifáticos
alifáticos::
Glicina
(Gly)
Leucina
(Leu)
Alanina
(Ala)
Valina
(Val)
Metionina (Met) Isoleucina (Ile)
Figura 3-5, pág. 79. Lehninger 4º ed, Omega, 2005
Aminoácidos con grupos R aromáticos:
aromáticos:
Fenilalanina
(Phe)
Tirosina (Tyr)
Triptófano (Trp)
Figura 3-5, pág. 79. Lehninger 4º ed, Omega, 2005
Aminoácidos con grupos R polares sin carga
carga::
Serina
(Ser)
Prolina
(Pro)
Treonina
(Thr)
Asparagina
(Asn)
Cisteína
(Cys)
Glutamina (Glu)
Figura 3-5, pág. 79. Lehninger 4º ed, Omega, 2005
Cisteína
Cistina
Grupo sulfhidrilo
Puente
disulfuro
Cisteína
Figura 3-7, pág. 80. Lehninger 4º ed, Omega, 2005
Aminoácidos
con
grupos
positivamente (básicos):
(básicos):
R
cargados
H+
Lisina
(Lys)
Arginina (Arg)
Histidina (His)
Figura 3-5, pág. 79. Lehninger 4º ed, Omega, 2005
Aminoácidos con grupos
negativamente (ácidos)
(ácidos)::
Aspartato (Asp)
R
cargados
Glutamato (Glu)
Figura 3-5, pág. 80. Lehninger 4º ed, Omega, 2005
a)
Según la naturaleza química
polaridad de su grupo R:
y
• Grupos R apolares alifáticos
alifáticos:: 6 aminoácidos
aminoácidos.. Glicina, Alanina,
Valina, Leucina, Metionina, Isoleucina
Isoleucina..
• Grupos R aromáticos:
aromáticos: 3 aminoácidos.
aminoácidos. Fenilalanina, Tirosina,
Triptófano..
Triptófano
• Grupos R polares sin carga
carga:: 6 aminoácidos
aminoácidos.. Serina, Treonina,
Cisteína, Prolina, Asparagina, Glutamina
Glutamina..
• Grupos R cargados positivamente (Básicos):
(Básicos): 3 aminoácidos
aminoácidos..
Lisina, Arginina, Histidina
Histidina..
• Grupos R cargados negativamente (Ácidos)
(Ácidos):: 2 aminoácidos
aminoácidos..
Aspartato, Glutamato
Glutamato..
b) De acuerdo al número de grupos carboxilo
y amino presentes en la molécula
molécula::
Monoamino
Mono
amino--mono
monocarboxilo
carboxilo
Monoamino
Mono
amino--dicarboxilo
dicarboxilo
Diamino--monocarboxilo
Diamino
monocarboxilo
Ejemplos::
Ejemplos
Glicina (Gly)
Glutamato (Glu)
Lysina (Lys)
c) Aminoácidos esenciales
esenciales::
1) Metionina (Met)
2) Lisina (Lys)
3) Fenilalanina (Phe)
4) Treonina (Thr)
5) Leucina (Leu)
6) Valina (Val)
7) Triptófano (Trp)
8) Isoleucina (Ile)
9) Histidina (His)
10)Arginina (Arg)
Propiedades de los aminoácidos:
aminoácidos:
Comportamiento anfótero:
anfótero: Los grupos carboxilo y amino
de los aminoácidos actúan como ácidos o bases débiles
según el pH del medio
medio..
Como base aceptando protones:
protones:
COOH 3N + C
H
Gly
H + HCl
COOH
H 3N + C
H
H
Propiedades de los aminoácidos:
aminoácidos:
Como ácido donando protones:
protones:
COOH3N+
C
H
Gly
H + NaOH
COOH2N
C
H
H + H2O
Ión dipolar o zwitterion
H
Gly
pKa
Es un valor de pH en el que el grupo
disociable se encuentran 50 % disociado y 50
% sin disociar
disociar..
Nomenclatura de los pKa:
pKa:
pK1: es el pKa del grupo carboxilo del carbono α.
pK2: es el pKa del grupo amino del carbono α.
pKR: es el pKa del grupo disociable de la cadena
lateral (carboxilo o amino)
amino)..
Tabla 3-1, pág 78. Lehninger 5º ed, Ed Omega, 2005
Comportamiento del aminoácido glicina frente
al agregado de NaOH:
NaOH:
NaOH
COOH
H3N+
C
H
100%
50%
H
NaOH
H2O
COO-
COOH3N+
C
H
H2O
H2N
C
pK2=9.6
pk1=2.34
H
50%
100%
H
50%
100%
H
Comportamiento del aminoácido glicina frente
al agregado de HCl:
HCl:
HCl
COOH
H3N+
C
H
100%
50%
H
H+
H3N+
HCl
COOC
H
H+
H2N
COOC
pK2=9.6
pk1=2.34
H
100%
50%
H
100%
50%
H
pI (punto isoeléctrico)
Es un valor de pH donde el aminoácido tiene
carga neta 0.
Se calcula como el promedio de los valores de
pKa que rodean al aminoácido en su forma con
carga neta 0.
Cálculo de pI del aminoácido glicina:
COOH
H3N+
C
H
+1
H
COOH3N+
pK1= 2.34
C
H
COOH2N
H
pK2= 9.6
±
pI=
pI
=
C
H
-1
Pk1 + pK2
2
= 5.97
H
Curva de titulación del aminoácido glicina:
glicina:
Figura 3-10, pág 83. Lehninger 4º ed, Ed Omega, 2005
Curva de titulación del aminoácido glicina:
glicina:
Figura 3-10, pág 83. Lehninger 4º ed, Ed Omega, 2005
Curva de titulación del aminoácido glicina:
glicina:
+1
±
-1
Figura 3-10, pág 83. Lehninger 4º ed, Ed Omega, 2005
Curva de titulación del ácido glutámico:
glutámico:
+1
±
-1
-2
pI= 2.19+4.25 = 3.22
2
Figura 3-12, pág 84.Lehninger 4º ed, Ed Omega, 2005
Curva de titulación de la Lisina:
Lisina:
pK1
pK2
pKR
R
pI= 8.55+10.53 =9.74
2
Curva de titulación de la Histidina:
Histidina:
+2
+1
-1
±
pI= 6.00+9.17 =7.59
2
Figura 3-10, pág 84.Lehninger 4º ed, Ed Omega, 2005
Aminoácidos II
Br. Cecilia López
Área Bioquímica
Departamento de Biología Molecular y Celular
Marzo 2012
Propiedades de los aminoácidos:
aminoácidos:
Propiedades ópticas:
ópticas:
Grupo
carboxilo
Grupo
amino
α
Hidrógeno
Grupo R
Carbono quiral
o asimétrico
Actividad óptica:
óptica:
Estereoisomería::
Estereoisomería
L-Alanina
CH3
Ala
D-Alanina
Enantiómeros (imágenes especulares):
especulares):
Amino
H
CH3
CH3
Ala
Carboxilo
Diasterómeros (imágenes no especulares):
Amino
H
Gly
H
H
Carboxilo
Configuración absoluta
Convención de Fisher
L-Gliceraldehido
L-Alanina
D-Gliceraldehido
D-Alanina
Propiedad de los aminoácidos con
grupos aromáticos
Grupo
indol
Grupo benceno
Fenilalanina
Tirosina
Triptofano
Espectro de absorción en el rango ultravioleta
de los aminoácidos con grupos aromáticos:
aromáticos:
Espectro de absorción en el rango ultravioleta
de los aminoácidos con grupos aromáticos:
aromáticos:
Longitud de onda (nm)
Aminoácidos que no forman parte de las
proteínas:
Intermediarios del ciclo de la urea en hígado:
hígado:
Aminoácidos que no forman parte de las
proteínas:
Neurotransmisores::
Neurotransmisores
Aminoácidos que no forman parte de las
proteínas:
Neurotransmisores::
Neurotransmisores
Aminoácidos que no forman parte de las
proteínas:
Mediadores de la inflamación:
inflamación:
Enlace peptídico:
peptídico:
Enlace peptídico:
peptídico:
Extremo
Amino
terminal
Extremo
Carboxilo
terminal
Serilgliciltirosilalanil--leucina
Serilgliciltirosilalanil
Ser--Gly
Ser
Gly--Tyr
Tyr--Ala
Ala--Leu
Aminoácidos
Neurotransmisores (GABA,
dopamina)
Mediadores de la inflamación
(Histamina)
Proteínas
Intermediarios del ciclo de la
urea (ornitina, citrulina)
Hemoglobina (sangre)
Inmunoglobulinas
(Leche)
Receptor de insulina
(células)
Colágeno
Albúmina (sangre,
leche, huevos)
Lisozima (saliva)
Queratina
(Piel y
anexos)
Miosina
(músculo
esquelético)
Resumen::
Resumen
Los aminoácidos son los sillares estructurales de las proteínas
proteínas..
Se encuentran formados por un grupo amino (NH3+, un grupo carboxilo
(COOH), un hidrógeno (H) y una un grupo R unidos al carbono α.
Los aminoácidos que forman parte de las proteínas se clasifican según
la naturaleza química y polaridad de su grupo R, según la cantidad de
grupos carboxilo y amino presentes en la molécula y en esenciales y
no esenciales
esenciales..
Tienen comportamiento anfótero
anfótero..
Los grupos titulables pueden estar total o parcialmente disociados
disociados..
Los aminoácidos pueden tener carga (+) o (-) según el pH del medio
medio..
El carbono α se encuentra unido a cuatro sustituyentes diferentes
siendo un centro quiral (excepción Glicina)
Glicina)..
Los aminoácidos que forman
configuración absoluta L.
parte
de
las
proteínas
tienen
La fenilalanina, tirosina y triptofano absorben luz en el rango
ultravioleta (280 nm)
nm)..
Resumen::
Resumen
El carbono α se encuentra unido a cuatro sustituyentes diferentes siendo
un centro quiral (excepción Glicina)
Glicina)..
Los aminoácidos que forman parte de las proteínas tienen configuración
absoluta L.
La fenilalanina, tirosina y triptofano absorben luz en el rango ultravioleta
(280 nm)
nm)..
Bibliografía::
Bibliografía
Principios de Bioquímica.
Bioquímica. Lehninger, Nelson &
Cox, 4º Edición, Omega, 2005
2005..
Biochemistry. Voet & Voet.
Biochemistry.
Voet. Wiley & Sons 3º Ed.
Ed.
Panamericana, 2006
2006..
Bioquímica. Mathews & van Holde.
Bioquímica.
Holde. 2º Edición,
McGraw--Hill, Interamericana, 1998
McGraw
1998..
Fisiología animal.
animal. Hill
Hill-- Wise
Wise-- Anderson.
Anderson. Ed
Panamericana, 2006
2006..
Muchas Gracias!!!!!!!!!!!!!!!
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