Marcadores moleculares en NSCLC PERSPECTIVAS 115 RAMR 2014;2:115-124 ISSN 1852 - 236X El rol del neumonólogo en el estudio de los marcadores moleculares en el cáncer de pulmón no pequeñas células Correspondencia: Henri Colt E-mail: [email protected] Autores: Henri Colt1, Septimiu Murgu2 University of California Irvine – USA The University of Chicago, USA 1 Recibido: 27.02.2014 Aceptado: 08.04.2014 2 La mayor parte de los paciente con cáncer de pulmón son diagnosticados, estadificados o re-estadificados utilizando muestras pequeñas obtenidas a través de broncoscopía o punción aspiración. En la era actual de tratamiento personalizado del cáncer de pulmón, el tejido no se require solamente para el análisis histológicomorfológico sino también para el análisis molecular que ayuda a predecir los resultados de determinadas terapias sistémicas. Existen variedad de maneras de procesar las muestras de pequeño volumen para el diagnóstico y la tipificación molecular, las estrategias óptimas varían de una institución a la otra, dependiendo de la infraestructura, experiencia, recursos de laboratorio y tecnología disponible. Este nuevo paradigma en el cual la tipificación molecular de rutina se ha transformado en standar de tratamiento requerirá un manejo más standartizado de la adquisición y el procesamiento de los pequeños especímenes1. Especímenes de citología La aspiración por aguja transbronquial (TBNA), la percutánea bajo TC o la guiada por ecografía endobronquial (EBUS) pueden proveer muestras de cantidad y calidad suficientes para el diagnóstico y el análisis molecular. Las muestras deben ser examinadas inmediatamente después de su obtención para determinar la presencia y cantidad de sangre, material granular, pequeños fragmentos de tejido, pus y material necrótico. La presencia o ausencia de estos elementos debería verificarse antes, durante y después de la preparación del extendido. En el caso de los especímenes broncoscópicos, también debería verificarse la cantidad de mucus y la presencia de fragmentos de cartílago. Estos hallazgos macroscópicos pueden ser indicadores tempranos de la potencial utilidad diagnós- tica de la muestra. Por ejemplo, una muestra de citología que contiene material diagnóstico, muy frecuentemente tiene un aspecto espeso, pálido y de consistencia cremosa2, 3. Los extendidos en que los fragmentos de tejido tienen un aspecto brillante y granular, y la presencia de material granular son más evidentes en los casos en que se encuentra un carcinoma3. Los especímenes citológicos de aspiración con aguja fina probablemente son adecuados para tipificación molecular. Por ejemplo, en un estudio de 128 especímenes citológicos enviados para diagnóstico molecular (punción –FNA– transtorácica y transbronquial en 67, FNAs extratorácica en 29, derrame pleural en 29 y lavado bronquial en 3), en 126 casos (98%) la muestra fue adecuada para análisis de EGFR/KRAS y solamente 2 casos no pudieron ser analizados debido a especímenes pobremente preservados. Varios estudios han descripto el uso de muestras tomadas de forma rutinaria, tales como extendidos o bloques celulares, para pruebas moleculares en pacientes con cáncer de pulmón no pequeñas células (NSCLC)4-7. Algunas de las recomendaciones propuestas para maximizar el rendimiento diagnóstico para diagnóstico molecular de las muestras citológicas incluyen las siguientes: 1.Utilización de evaluación in situ (rapid on-site evaluation o ROSE). La evaluación in situ de los especímenes de citología asegura una celularidad óptima, la cual es crítica para la subtificación del NSCLC y ayuda a confirmar que hay suficiente material para tipificación molecular8. El uso de ROSE aumenta significativamente la precisión diagnóstica y la costo-efectividad de la citología torácica1, 9. Después del examen microscópico, el citopatólogo comunica los hallazgos inmediatamente y notifica al operador cuándo se ha obtenido suficiente material. Las muestras que contienen solamente mucus o predominancia de 116 cartílago bronquial, que tienen pocos o ningún linfocito, material necrótico y poco o nada de material diagnóstico pueden ser de esta forma tempranamente identificadas como inadecuadas. En esos casos, de ser posible se deberían tomar más muestras. 2.Los extendidos se preparan utilizando métodos de tinción standard. Las preparaciones de rutina incluyen los extendidos secados al aire, teñidos con Diff-Quik (DQ); los extendidos fijados con alcohol y teñidos con hematoxilina-eosina o Papanicolaou (H & E/Pap); los extendidos Thin Prep, extendidos en monocapa celular, teñidos con Papanicolaou, preparados por transferencia de células en suspensión; y los bloques de células teñidos con H & E (pellets de células embebidos en parafina preparados usando centrifugación de fluido de CytoLyt después del agregado de HistoGel)8. 3.La subtipificación del NSCLC y el diagnóstico de otros tumores debería seguir los criterios citomorfológicos standard1, 8.Un panel típico de inmunohistoquímica (IHQ) incluye thyroid transcription factor-1 (TTF-1), p63/4A4, y citokeratinas de alto peso molecular (HMWCKs): 34bE12/CK903 yCK5/6.132 Los resultados de varios estudios clínicos muestran que los especímenes pequeños obtenidos por EBUS-TBNA y otras modalidades son suficientes para diagnóstico molecular siempre que la adquisición, manejo y procesamiento de las muestras se realice de manera adecuada12-15. Esto requiere un esfuerzo coordinado entre el equipo que obtiene la muestra y el que procesa la citopatología y la examina. Se han comunicado las siguientes recomendaciones para el manejo y procesamiento de muestras de EBUS-TBNA o TBNA convencional destinadas a análisis molecular16, 17. 1.Cada aspirado se coloca sobre una lámina de vidrio, ya sea inyectando aire desde la jeringa a través de la misma aguja o reemplazando la (jeringa) aguja con un estilete. Luego se inyecta solución salina a través de la aguja de EBUS dentro de la solución de Cytolyt para recuperar las células remanentes. De este material colocado sobre los vidrios se pueden seleccionar todas las partículas de tejido blanquecinas separándolas del mucus-sangre y preparando con ellas dos extendidos. Al resto de la muestra, se la deja en su vidrio original para que forme un coágulo. Uno de los extendidos se seca con Revista Americana de Medicina Respiratoria Vol 14 Nº 2 - Junio 2014 aire para ROSE usando tinción de Diff Quick o Giemsa y el segundo se coloca en etanol al 95% para tinción con Pap, (después de chequear la calidad de la muestra microscópicamente) para aumentar el detalle de los núcleos celulares17, 18. Los extendidos preparados en fresco (levantando el cubreobjeto de los extendidos secados al aire) y los archivados son especímenes valiosos para estudios moleculares de EGFR (usando análisis por PCRf) y KRAS (por pruebas de secuenciación directa), particularmente cuando la celularidad de los bloques celulares no es suficiente (puede ser insuficiente)19. Las ventajas del uso de extendidos directos sobre los bloques celulares para el análisis molecular incluyen la posibilidad de evaluar la calidad de la muestra en el momento de la toma y simultáneamente determinar si quedará material suficiente para análisis subsiguientes al mismo tiempo que, con un menor tiempo de procesamiento, resultados más rápidos y a menor costo19. 2. El tejido obtenido (si se obtiene tejido) se coloca sobre un papel filtro para absorber el exceso de sangre17. Los datos preliminaries no indican diferencias significativas en la tasa de detección de mutaciones entre muestras obtenidas por citología o por histología15. Si se obtiene tejido, se fija con formol buffer al 10% y se hace una muestra fijada en formol y embebida en parafina (FFPE) de la que luego se obtienen cortes y se tiñen con H&E para diagnóstico histológico e IHQ17. Esta muestra también se puede usar para FISH y para extracción de DNA/RNA para determinación de mutación. Las muestras fijadas con formol son las preferidas para la histopatología y para algunos test moleculares, pero los tiempos de fijación todavía no están estandarizados. Después de que las muestras se embeben en parafina, deberían ser almacenadas como un bloque para mantener la integridad de los antígenos a ser analizados. Parte del tejido puede ser almacenado a (-80°C) usando soluciones estabilizadoras para extración de ARN17. 3.Del material en la solución de Cytolyt o del coágulo se hacen bloques celulares que también se colocan en formalina, se centrifugan en el laboratorio de patología y se envían para procesamiento histológico20. Los preparados de bloques celulares permiten identificar la arquitectura del adenocarcinoma (por ejemplo, lepídico, papilar o micropapilar)20 lo Marcadores moleculares en NSCLC cual es importante para una clasificación adecuada de las pequeñas biopsias21. Los bloques de células también permiten obtener múltiples extendidos en un formato concentrado para IHQ subsiguiente22 lo cual permitirá la subtificación del NSCLC, especialmente para los carcinomas pobremente diferenciados20. Los bloques celulares se usan rutinariamente para estudios adicionales, pero pueden ser insuficientes para estudio molecular. La aguja puede además ser lavada con solución salina para microbiología (si esto está indicado) o los especímenes pueden ser usados más tarde para extracción de ADN/ARN23. Muestras de biopsia El rendimiento de las muestras de biopsia para lesiones endobronquiales visibles es de aproximadamente 75 a 95% para el diagnóstico de malignidad. Factores que influyen en ese rendimiento diagnóstico son por ejemplo el tamaño de la pinza y el número de biopsias. Se deben obtener al menos 3 muestras de biopsia con un fórceps con al menos 2 mm de diámetro abierto para garantizar el máximo rendimiento diagnóstico y para minimizar los artefactos. Un número mayor de biopsias lleva a una mayor exactitud diagnóstica, pero también a una tasa mayor de complicaciones tales como el sangrado. En pacientes con malignidades comprobadas, entre un tercio y la mitad de los fragmentos de biopsia no contienen tumor, lo cual interfiere con el posterior análisis molecular. Los pacientes con tumores no visibles o nódulos periféricos requieren biopsias transbronquiales usando fluoroscopía, EBUS radial o navegación electromagnética (EMN). Normalmente, se toman 4 a 5 muestras de biopsia para diagnóstico y se colocan en formalina al 10%, pero se requieren más muestras si se va a realizar análisis molecular2. Los estudios que evalúan las mutaciones generalmente prueban más de 10 mutaciones usando secuenciación o FISH24. Debido a que 95% de las mutaciones son mutuamente excluyentes24, es razonable implementar pruebas secuenciales para EGFR, KRAS y ALK, comenzando ya sea con KRAS o EGFR. El análisis de ALK se reserva habitualmente para tumores con KRAS y EGFR negativos. No son consideradas necesarias pruebas concomitantes, excepto si usar este método secuencial retrasa mucho los resultados y el inicio del tratamiento. A continuación hay algunos ejemplos de 117 las recomendaciones publicadas para las pruebas y los algoritmos de tratamiento en pacientes con NSCLC avanzado: 1.Se realiza primero el análisis de la mutación de EGFR; si la mutación es positiva el paciente es un candidato para tratamiento con inhibidores de la tirosinkinasa(EGFR-TKI)25. 2.Si no hay respuesta al tratamiento o si la mutación EGFR fue inicialmente negativa, el tumor se evalúa para mutación EML4-ALK. Si está presente, el paciente es tratado con crizotinib26. 3.Si no hay respuesta al tratamiento o no hay evidencia de traslocación de ALK, el tumor se evalúa para ERCC1 y RRM1. Los pacientes con bajos niveles son tratados con un regimen que contenga platino con gemcitabina27. Si no hay respuesta al tratamiento, el tumor puede ser evaluado para ERCC1 y TS28. Los pacientes con bajos niveles de ERCC1 y TS pueden ser tratados con una combinación de platino y pemetrexed. 4.Para los pacientes en quienes el tratamiento falla o tienen altos niveles de ERCC1, el mejor tratamiento a ofrecer es en base a taxanos y una droga no platino28. La preocupación acerca de los costos justifica estas recomendaciones de pruebas secuenciales29, 30-33 . Esta estrategia es apoyada por los resultados del estudio en Fase II BATTLE (Biomarkerintegrated Approaches of Targeted Therapy for Lung Cancer Elimination)34. Aunque todas las organizaciones nacionales e internacionales recomiendan el diagnóstico molecular del NSCLC35-37, primero debe establecerse el tipo histológico35. Por ejemplo, hasta este momento, la mutación de EGFR solo debe estudiarse en los adenocarcinomas, large-cell carcinoma y NSCLC-NOS35. Las pruebas no son recomendadas para el carcinoma escamoso ya que tiene la mutación sólo en el 3.6%35, 38. La mutación EGFR es generalmente excluyente de ALK 39 por lo cual no se recomienda el análisis de ALK en pacientes que tienen positiva la mutación EGFR. Las mutaciones KRAS están asociadas con resistencia intrínseca a los TKI40, por lo cual el análisis de KRAS puede ser utilizado para determinar la utilidad potencial de TKIs. De acuerdo a las recomendaciones de la National Comprehensive Cancer Network 2012 y de las guidelines del College of American Pathologists/IASLC/Association for Molecular Pathology, el análisis molecular para 118 otros marcadores que no sean EGFR o ALK todavía no está recomendado35, 38. La evidencia sugiere que hay una heterogeneidad significativa en los mecanismos de resistencia40, los cuales pueden requerir intervenciones terapéuticas específicas. Por ejemplo, el análisis genético e histológico del NSCLC con resistencia adquirida a inhibidores de EGFR mostró que además del mecanismo ya conocido de resistencia de la amplificación delMET(5%) y la mutación EGFR secundaria T790M EGFR (49%), 30% de los tumores tienen mecanismo de resistencia a las drogas desconocidas, 5% tienen mutación PIK3CA y, sorprendentemente, 14% han convertido a carcinoma de pequeñas células (SCLC)41. Los investigadores también han observado que la resistencia genética se pierde después de que el tratamiento con TKI ha cesado. Los resultados de biopsias repetidas tienen un efecto directo sobre las decisiones de tratamiento. Conclusión Los marcadores moleculares son crecientemente importantes en el diagnóstico del cáncer de pulmón y en la planificación del tratamiento. El standard de manejo está cambiando rápidamente en la medida en que los programas multidisciplinarios están integrando el análisis de los marcadores moleculares como parte de su armamentario de rutina del manejo del NSCLC. Dado que neumonólogos tienen una responsabilidad esencial en estos programas, es fundamental que estén al tanto de las estrategias de la toma de decisiones basadas en el resultado de estos análisis moleculares. De esta manera, las discusiones basadas en el completo conocimiento del mecanismo de la toma de decisiones y que realmente integren a neumonólogos, oncólogos, cirujanos, biólogos moleculares y radioterapeutas beneficiarán a los pacientes y a los futuros estudios sobre cáncer de pulmón. El análisis de las muestras pequeñas beneficia a los pacientes, lo que impide la necesidad de muestras más grandes e invasivas. Obtener y procesar las muestras de la manera adecuada mejorará la utilidad de los análisis moleculares y ayudará a todas las instituciones en distintas partes del mundo a adaptarse adecuadamente a los cambios en el estándar de cuidado de los pacientes con NSCLC. Revista Americana de Medicina Respiratoria Vol 14 Nº 2 - Junio 2014 Conflictos de interés: Los autores no presentan conflictos de intereses. Este comentario está basado en el artículo original: Murgu S, Colt H. Role of the pulmonologist in ordering post-procedure molecular markers in non-small-cell lung cancer: implications for personalized medicine. Clin Lung Cancer 2013, 14: 609-26. Bibliografía 1. Tanner NT, Pastis NJ, Sherman C, et al. The role of molecular analyses in the era of personalized therapy for advanced NSCLC. Lung Cancer 2012; 76: 131-7. 2. Thunnissen E, Kerr KM, Herth FJ, et al. The challenge of NSCLC diagnosis and predictive analysis on small samples. Practical approach of a working group. 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In today’s era of personalized medicine, not only is tissue required for morphologic/histocytologic diagnosis but also, for molecular analysis to help predict outcome and guide therapy. A variety of approaches are used to process small-volume specimens for diagnosis and molecular testing; optimal strategies varying from one institution to another, depending on infrastructure, expertise, laboratory resources, and available technology. A paradigm in which routine molecular testing becomes standard of care will require the need for a more streamlined and standardized approach to specimen acquisition and processing1. Cytology Specimens Needle bronchoscopic, CT-guided, or ultrasoundguided aspiration must provide samples of sufficient quality and quantity are necessary for diagnosis and molecular analyses. Immediately after specimen retrieval (eg,), samples should be examined for presence and amount of blood, granular material, small tissue fragments, pus, and necrotic material. The presence or absence of these features should be noted before, during, and after smear preparation. In the case of bronchoscopic specimens, the amount of mucus and the presence of cartilage fragments should also be noted. Macroscopic features could be early indicators of a potentially diagnostic specimen. For instance, a cellular sample containing diagnostic material is often thick and pale with a creamy consistency2, 3. Whereas smears in which small tissue fragments are evident demonstrate a glistening granular appearance. Granular material is more evident in cases of carcinoma3. Fine needle aspiration cytology specimens are probably adequate for molecular testing. For example, in 1 study, of 128 cytologic specimens submitted for molecular testing (transthoracic and transbronchial FNAs [n ¼ 67], extrathoracic FNAs [n ¼ 29], pleural effusions [n ¼ 29], and bronchial brush/wash specimens [n ¼ 3]), 126 (98%) were suitable for EGFR/KRAS testing, and only 2 cases could not be analyzed because of PCR failure (attributed to poorly preserved specimens). Several studies describe using routinely collected cytology specimens, such as smears or cell blocks, for molecular testing in patients with NSCLC4-7. Some of proposed recommendations in order to maximize yield of cytology specimens for diagnosis and molecular testing: 1.Utilization of rapid on-site evaluation (ROSE). On-site assessment of cytology specimens ensures optimal cellularity, which is critical for accurate NSCLC subtyping, and helps confirm sufficient material for predictive marker testing.8 ROSE significantly increases the adequacy, diagnostic accuracy, and cost-effectiveness of thoracic cytology9, 10. After microscopic examination, the cytopathologist immediately reports findings and notifies the operator when sufficient material has been obtained. Samples comprising only mucus, a preponderance of bronchial or cartilage cells, scant or no lymphocytes, necrotic material, and no specific diagnostic material are considered inadequate. If possible, additional passes should be performed. 2.Slides are prepared and stained using standard methods. Routine cytologic preparations include Diff-Quik (DQ)- stained air-dried smears; H & E/Pap-stained alcohol-fixed smears; Pap-stained 121 Marcadores moleculares en NSCLC Thin Prep slides monolayer prepared by transfer of cells in suspension; and H & E-stained cell blocks (paraffin-embedded cell pellets prepared using centrifugation of CytoLyt fluid after the addition of HistoGel)8. 3.Subtyping of NSCLC and diagnosis of other tumors should follow standard cytomorphologic criteria8.,11 A typical IHC panel includes thyroid transcription factor-1 (TTF-1), p63/4A4, and high–molecular-weight cytokeratins (HMWCKs)-34bE12/CK903 and CK5/68 Results from clinical studies demonstrate that small specimens acquired using EBUS-TBNA and other modalities are also sufficient for diagnosis and molecular testing if specimen acquisition, handling, and processing are done appropriately12-15. This requires a coordinated effort between the health care team obtaining the specimen and the cytopathology team processing and examining it. The following steps have been proposed for handling and processing of conventional or EBUSTBNA specimens destined for possible molecular analysis16, 17. 1.Each aspirate is discharged onto a glass slide, either by blowing air with a syringe through the needle or by replacing the needle stylet. Saline is then injected with a syringe through the EBUS needle into Cytolyt solution to discharge any remaining cells. From the material dispelled onto the glass slide, any tan-white colored tissue particles can be selected from the blood/ mucus and smeared on 2 slides. The remaining specimen on the original slide is allowed to clot. One slide smear is air-dried for ROSE using DQ stain or Giemsa, and the second is placed in 95% ethanol for Pap staining (after checking the quality of the specimen microscopically) to enhance nuclear cytological detail17, 18. Archived and freshly prepared direct smears (decover slipped air-dried Romanowsky-stained smears [A])are a valuable specimen source for molecular studies for EGFR (using PCR-based ragment analysis) and KRAS (direct sequencing-based tests), particularly when cell block cellularity is insufficient19. Advantages of using direct smears over cell block for molecular analysis include the ability to assess specimen adequacy at time of retrieval, ability to determine whether sufficient material will be available for subsequent analysis, and less processing and therefore more rapid results at lower cost19. 2.The tissue core (if obtained) is placed on filter paper to absorb excess blood17. Preliminary data indicate no significant difference in mutation rate detection between samples obtained using cytology vs. histology15. If core tissue is obtained, it is fixed with 10% neutral buffered formalin and an FFPE sample is made, which is later stained with H&E stain for histologic diagnosis and IHC17. This specimen can also be used for FISH and for DNA/RNA extraction for mutation assays. Formalin-fixed samples are preferred for histologic classification and some molecular assays, but fixation times are not yet standardized. After paraffin embedding, samples should be stored as a block to maintain the integrity of the antigens being analyzed. Part of the core can be stored(–80C) using stabilizing solutions for RNA extraction 17. 3.Cell blocks are made from the material in Cytolyt solution and/or the clot, which is placed in formalin, centrifuged in the pathology laboratory, and submitted for histological processing20. Cell block slides can aid in identification of adenocarcinoma architectural patterns (ie, lepidic, papillary, and micropapillary) 20 that are important for the proposed classification of small biopsies and aspirates 21. Cell blocks also yield multiple slides in a concentrated format for subsequent IHC22 that will permit accurate histologic subtyping of NSCLC, especially for poorly differentiated carcinomas20. Cell blocks are routinely used for ancillary studies, but might be insufficient for molecular testing. The needle can also be rinsed into saline solution for microbiology if indicated, or specimens might be later used for DNA/RNA extraction23. Biopsy Specimens Yield from biopsy specimens of endobronchialvisible tumors is approximately 75% to 95% for histologic diagnosis of malignancy. Factors influencing yield are forceps size and the number of biopsy specimens. At least 3 forceps biopsy samples should be obtained and a forceps with at least a 2-mm open diameter are warranted to maximize diagnostic yield and diminish chance for artifacts. A greater number of biopsy samples leads to greater diagnostic accuracy, but also a greater risk of complications, such as bleeding. In patients with proven malignancies, between one-third 122 and one-half of the biopsy fragments contain no tumor, which interferes with further downstream molecular analysis. Patients with nonvisible tumor or peripheral nodules usually require transbronchial lung biopsy using fluoroscopy, radial EBUS, or electromagnetic navigation (EMN). Normally, 4 to 5 biopsy specimens are taken for diagnostic purposes and placed in 10% formalin, but more biopsy specimens might be necessary when molecular testing is requested2. Studies evaluating driver mutations often test for more than 10 mutations using sequencing or FISH24. Because 95% of mutations are mutually exclusive24 sequential testing for EGFR, KRAS, andALK is reasonable, beginning with either KRAS or EGFR analysis. ALK analysis is usually reserved for KRAS- and EGFR-negative specimens. Concomitant testing is not considered necessary unlesss equential testing causes delay in treatment. Following are examples of published recommendations for testing and treatment algorithms in new patients with advanced, inoperable NSCLC. 1.EGFR mutation analysis is performed first; if there is a mutation, the patient is a candidate for treatment with EGFR-TKI therapy25. 2.If there is no response to treatment, or if the EGFR mutation is not present, then the tumor is assessed for EML4-ALK rearrangement. If present, the patient is treated with crizotinib26. 3.If there is no response to treatment, or no evidence of ALK translocation, the tumor is assessed for ERCC1 and RRM1. Patients with low levels are treated using a platinum with gemcitabine combination27. If there is no response to treatment, the tumor could be assessed for ERCC1 and TS28. Patients with low levels of ERCC1 and TS could be treated with a platinum with pemetrexed combination. 4.For patients in whom treatment fails or who have high levels of ERCC1, treatment using a taxane with a nonplatinum drug is offered28. Cost concerns29, 30-33 justify current recommendations for sequential analysis. This strategy is further supported by results from the phase II BATTLE (Biomarker-integrated Approaches of Targeted Therapy for Lung Cancer Elimination) trial 34. Though national and international organizations presently recommend that molecular diagnostic studies be included in the evaluation of NSCLC35-37 histologic type should be established before analysis because tumor histology helps Revista Americana de Medicina Respiratoria Vol 14 Nº 2 - Junio 2014 guide molecular analysis testing pathways35. For example, as of this writing, EGFR mutation testing should be performed only on adenocarcinoma, large-cell carcinoma, and NSCLC-NOS35. Testing is not recommended for squamous cell carcinoma, which has a mutation rate of only approximately 3.6%35, 38. EGFR mutations are generally exclusive of ALK rearrangements39 so ALK testing should not be performed for patients who test positive for the EGFR mutation. KRAS mutations are associated with intrinsic TKI resistance40 so KRAS testing can be used for determining candidate patients for TKI therapy. According to the National Comprehensive Cancer Network 2012 recommendations and the College of AmericanPathologists/IASLC/Association for Molecular Pathology draft guidelines, molecular testing for markers other than EGFR and ALK is not yet recommended35, 38. Evidence suggests there is a significant heterogeneity in resistance mechanisms 40 which might require specific therapeutic interventions. For instance, genetic and histologic analyses of NSCLC tumors with acquired resistance to EGFR inhibitors showed that in addition to the known resistance mechanisms of MET amplification (5%) and secondary T790M EGFR mutation(49%), 30% of tumors had unknown drug resistance mechanisms, 5% had PIK3CA mutation, and surprisingly, 14% had converted to SCLC41. The investigators also observed the loss of genetic resistance after TKI treatment had stopped. Results from repeat biopsy had a direct effect on decisions regarding further treatment. Conclusion Molecular markers are increasingly important in lung cancer diagnosis and treatment planning. Standard of care is rapidly changing, as multidisciplinary lung cancer programs are integrating molecular marker analysis and marker-directed therapy into their lung cancer management armamentariums. As pulmonologists take on greater responsibilities in such programs, it is essential they become aware of various decisional management strategies based on results of molecular analysis. In this way, knowledgeable conversations involving the pulmonologist, oncologist, molecular biologist, pathologist, thoracic surgeon and radiation oncologist will benefit patients and the future study of Marcadores moleculares en NSCLC lung cancer pathophysiology. Small sample analysis benefits patients and avoids the need for large specimens. Obtaining appropriate tissue samples, and processing them correctly will enhance the use and value of molecular testing, and help assure that institutions appropriately adapt to changes in standard of care around the world. This text is abstracted from the original article: Murgu S, Colt H. Role of the pulmonologist in ordering postprocedure molecular markers in non-small-cell lung cancer: implications for personalized medicine. 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