prácticas simulacion adn-arn

ESTRUCTURA DE LOS ÁCIDOS NUCLEICOS. VISUALIZACIÓN DE
MACROMOLÉCULAS POR ORDENADOR
El objetivo de esta práctica es facilitar la comprensión de la estructura
tridimensional de las biomoléculas, centrándonos en los ADN y ARN.
ESTRUCTURA DE PROTEÍNAS
1. Nucleósidos y nucleótidos en ADN y ARN
2. Estructura primaria ADN
3. Estructura secundaria ADN
4. Asociaciones entre ADN y proteínas
5. Estructura de los ARN
Material necesario
- Ordenador con acceso a internet. Navegador recomendado: Mozilla Firefox
- A continuación comience la práctica propuesta visitando la página web:
http://biomodel.uah.es/model1j/prot/contents.htm
ESTRUCTURA DE NUCLEÓTIDOS
Identifica los dos nucleósidos
señalados que establecen el
enlace. Colores en CPK
¿Qué tipo de enlace une a estos
nucleósidos?
¿Cuántos enlaces presenta esta
unión?
1.
2.
3.
3. Observa la siguiente figura e identifica los dos nucleósidos presentes:
1 Identifica los dos nucleósidos señalados que establecen el enlace.
2 ¿Qué tipo de enlace une a estos nucleósidos?
3 ¿Cuántos enlaces presenta esta unión?
4) Ve a esta página para estudiar la estructura tridimensional de los ADN forma B
http://biomodel.uah.es/model1j/dna/b-dna.htm
1 Observa el ADN marcando el eje, nucleótidos y con el código CPK.
2 ¿En qué se distingue la forma A de la forma B de los ADN?
3 Cada par de bases que se adiciona a la cadena se desplaza de la anterior unos 36º .
Sigue el ejemplo de la página, avanzando con las flechas y cuenta los pares de bases
representados. Después haz girar la molécula para verla lateralmente.
4 Siguiendo la página, coloca la molécula en forma axial y pulsa sobre “girar”. ¿Es
totalmente simétrica la molécula? Coincide este modelo con el de Watson y Crick
5 Sigue jugando con estas moléculas y de ADN en forma B, A y Z
6) Ve ahora a esta página, deja girar las moléculas y establece una diferencia clara entre
los tres modelos de ADN
http://biomodel.uah.es/model1j/dna/abz-dna.htm
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Sobre el ADN y PROTEÍNAS
1) Observa las figuras siguientes, la primera corresponde a un ADN trenzado cuando
está asociado a las proteínas histónicas. Ve a la página:
http://biomodel.uah.es/model1j/dna-prot/nucleoso.htm y añádele las proteínas,
copia la imagen obtenida y colócala su derecha. ¿Cuantas moléculas de histonas
se han añadido para comprimir esta cadena de ADN?
SOBRE LOS ARN
1) Esta imagen representa un ribonucleótido, mediante flechas o círculos……
3
a) identifica el grupo OH
b) identifica el azúcar
c) Identifica la base nitrogenada y averigua cuál es
d) identifica el H3PO4
En este modelo de ARN se puede comprobar que algunas bases no emparejadas quedan
orientadas hacia el exterior: (modelo de bolas en rojo). Los ARN tienen a formar enlaces
entre bases complementarias de la misma molécula.
2) Ve ahora a esta página http://biomodel.uah.es/model1j/rna/horquilla.htm y resuelve
el ejercicio propuesto. Escribe aquí los resultados
4
3) En el siguiente dibujo, indica el color de : a) el brazo aceptor del aminoácido; b) el
anticodon;
4) Estudia detenidamente este dibujo e indica qué moléculas están implicadas
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