Bioquímica y Fisiología Microbiana. Cuestionario 1 Bioquímica General

Bioquímica y Fisiología Microbiana.
Cuestionario 1
Bioquímica General
«Nombre» «Apellidos»:
Responde las preguntas según se indique. Si incluye alguna figura, póngala al
final de todas las respuestas, numérelas y cítela en su respuesta (Ej. Ver Figura
1). No copien de Internet, aunque no lo crean, es más fácil saber eso que saber si
se copian entre ustedes.
Indicaciones. El archivo que les mando se llama “cuestionarioX”. El que ustedes
me regresen se debe llamar “«Nombre» cuestionarioX” u otro nombre que los
identifique (ej. su apellido o sobrenombre). Por favor renómbrenlo antes de
enviármelo. Además, pongan su nombre antes de contestar las preguntas y no
olviden poner en el Asunto del mail que me manden BFM.
Saludos y échenle ganas.
Responde: Verdadero (V) o Falso (F) y explica tu respuesta en máximo 5
renglones.
1. Las células utilizan energía para mantenerse en un estado estacionario
lejos del equilibrio termodinámico.
2. La estructura tridimensional de las macromoléculas biológicas depende del
concurso de múltiples interacciones débiles.
3. Las proteínas son rígidas debido a que presentan abundantes enlaces
débiles
4. Los enlaces peptídicos son enlaces amida
5. Los enlaces carbono-carbono siempre tienen libertad de giro
6. Un carbono quiral o asimétrico es aquel que es diferente a todos los demás
7. La síntesis de moléculas biológicas no requiere energía porque es
espontánea
8. Los pKa de las cadenas laterales de aminoácidos siempre tienen valores
intermedios entre el pKa1 y el pKa2.
9. El punto isoeléctrico de un aminoácido es el pH para el cual presenta una
carga eléctrica nula.
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10. La homología de secuencias proteicas puede servir para establecer
relaciones evolutivas entre distintos organismos.
11. El efecto Bohr impide la oxidación del ion Fe2+ de la hemoglobina.
12. La Hemoglobina actúa como transportador de CO2 y H+ desde los tejidos
periféricos a los pulmones.
13. La constante de disociación es igual a la mitad de la concentración de
ligando cuando la función de saturación es ½ de su valor máximo.
14. El plegamiento de las proteínas es un proceso cooperativo.
15. En el proceso de plegamiento proteínico la entropía de la proteína aumenta
y la del disolvente disminuye.
16. El punto isoeléctrico de la histidina es igual a (pKaR+pKa2) / 2.
17. El ADN es un polímero de desoxiribonucleósidos o de residuos de
desoxiribonucleósidos.
Las siguientes preguntas respóndelas en máximo media hoja escrita y si necesitas
imágenes puedes extenderte.
18. ¿Cuáles son los aminoácidos cuya cadena lateral tiene carga a pH neutro?
Escribe su nombre completo, su denominación abreviada con tres letras y
con una sola letra y su estructura a pH neutro Respuesta.
19. ¿Cuál es la proporción de cadenas laterales protonadas y no protonadas en
la histidina a pH 7.0 (pKaR=6.0).
20. ¿Cuáles son los aminoácidos cuyas cadenas laterales son polares?
21. ¿Cuáles son los aminoácidos cuyas cadenas laterales pueden formar
puentes de hidrógeno? Escribe su estructura e indica los grupos
potencialmente dadores y/o aceptores de enlaces por puente de hidrógeno.
22. A qué pH crees que será mas soluble la Phe: a pH=2.0, a pH=7.0 o a
pH=12 ¿Porqué?
Responde: Verdadero (V) o Falso (F) y explica tu respuesta en máximo 5
renglones.
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23. Las enzimas aumentan la velocidad de reacción disminuyendo la energía
de activación
24. Las enzimas son siempre proteínas y nunca requieren componentes
adicionales no proteicos
25. Durante la reacción enzimática nunca se producen cambios estructurales
en la enzima
26. Moléculas con estructura similar a la del estado de transición son buenos
inhibidores no competitivos
27. Las enzimas sólo son específicas frente a moléculas quirales. Esta
propiedad se conoce como estereoespecificidad
28. Un enzima puede cambiar la constante de equilibrio de una reacción,
puesto que varía las constantes cinéticas K1 y K-1
29. Las enzimas permiten la realización de reacciones químicas de forma
rápida y en condiciones no extremas
30. La velocidad de una reacción enzimática es independiente de la
concentración de enzima
31. La ecuación de Michaelis-Menten no es válida cuando la concentración de
producto es elevada
32. En el estado estacionario las concentraciones de S, E y ES pueden
considerarse constantes
33. La constante de Michaelis (KM) es siempre igual a la constante de
disociación del comoplejo Enzima-Suatrato (Ks)
34. KM es igual a la velocidad de reacción enzimática para la cual [s]=Vmax/2
35. Tanto KM como Kcat pueden depender del pH
36. La velocidad de las reacciones enzimáticas siempre aumenta con la
temperatura
37. KM y Vmax pueden medirse experimentalmente y son características de
cada enzima, pero no de cada sustrato
38. KM y Vmax son características de cada enzima y de cada sustrato
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39. La inhibición y la activación enzimáticas pueden constituir mecanismos de
regulación
40. Las modificaciones covalentes son siempre reversibles y consisten en la
adición de grupos químicos
41. Los zimógenos o proenzimas son activados a través de modificaciones
irreversibles que son siempre catalizadas por otras enzimas
42. El paso limitante de un conjunto de reacciones sucesivas es siempre el mas
rápido
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Las siguientes preguntas respóndelas en máximo media hoja escrita y si necesitas
imágenes puedes extenderte.
43. La mayoría de las reacciones que ocurren en los sistemas vivos son
favorables desde el punto de vista termodinámico.
a) ¿Porqué entonces son necesarias las enzimas?
b) Algunas reacciones no son favorables termodinámicamente y sin
embargo ocurren ¿Es suficiente la implicación de una enzima para
que esto sea posible?
44. Una enzima puede utilizar dos sustratos A y B. La KM para el sustrato A es
5 mM mientras que para el sustrato B es 10 mM. Sin embrago el número de
recambio es idéntico para los dos sustratos
c) ¿Por cuál de los dos sustratos mostrará mayor especificidad?
d) Si ambos sustratos se encuentran a la misma concentración ¿Cuál
es la relación entre las velocidades de catálisis de los sustratos A y
B?
45. Nombre los 20 -aminoácidos estándares. Dé sus abreviaturas de 3 letras y
de una letra. ¿Cuál es el único aminoácido que no tiene actividad óptica?
¿Cuáles dos aminoácidos son isómeros? Identifique los dos aminoácidos,
que aunque no son isómeros, tienen casi la misma masa molecular para la
molécula neutra. ¿Cuál es la masa molecular promedio de un aminoácidos?
46. Dibuje la forma iónica predominante de los siguientes péptidos a los
distintos valores de pH: 1,5; 7,0 y 13,6. a) Phe-Met-Arg, b) Gln-Ile-His-Thr,
c) WKD
47. Dibuje la estructura de los siguientes oligopéptidos: a) LILIANA b) DAVID
c) MATIAS
48. Dibuje la estructura resultante de la formación de un enlace cistina entre los
siguientes oligopéptidos: Val-Cys; Ser-Cys-Pro
49. ¿Por qué algunos libros consideran la Arg como un aminoácido esencial y
otros libros no?
50. Defina anfolito.
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51. Explique la función biológica de los siguientes aminoácidos no proteicos: alanina, homocisteína, citrulina, ácido -aminobutírico,
D-alanina,
4-
hidroxiprolina.
52. Defina las estrucutras primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria de las
proteínas.
53. Las siguientes preguntas respóndelas en máximo una hoja escrita y si
necesitas imágenes puedes adicionarlas al final.
54. Flujo de los átomos de carbono.
¿Cuál es el destino del carbono
marcado con radioactividad de cada
uno de los siguientes compuestos si
es adicionado a un extracto celular
que
contiene
las
enzimas
y
cofactores de la glucólisis, del ciclo del ácido cítrico y el complejo de la
piruvato deshidrogenasa? (El 14C marcado esta marcado en rojo).
55. Organice en sentido negativo positivo los siguientes pares redox y
prediga la formación o no de ATP.
Oxidante
Reductor
E´0 (V)
A
AH
0,22
B
BH
-0,80
C
CH
-0,20
D
DH
-0,19
E
EH
0,14
F
FH
0,28
G
GH
0,84
K
KH
-0,43
L
LH
0,10
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56. Indique la importancia de la quiralidad del penúltimo C de un monosacárido.
57. Mencione las aldohexosas y cetosas más comunes en la naturaleza.¿Por
qué hay mayor número de d-aldohexosas que d-cetohexosas?
58. ¿Cómo se pueden identificar azúcares reductores? Dé ejemplos de ellos y
a partir de que compuestos se producen.
59. La inulina es un polisacárido cuya función es almacenar energía y se
encuentra en muchos tubérculos. La mayor parte de inulina consiste en
fructosa enlazada (2,1). Dibuje la estructura de la inulina. ¿Puede usted
digerir la inulina?
60. Defina glucanos y resalte su importancia biológica.
61. ¿En qué se diferencian la maltosa, celobiosa, lactosa y sacarosa?¿Qué
tienen en común?
62. ¿Cuáles son los polisacáridos de almacenamiento?
63. La amilopectina, a diferencia de la amilosa, no tiene una estrucutra
secundaria tipo hélice ¿Por qué?
64. ¿Qué pasaría si a usted le da un ataque de hambre en el salón y decide
comerse el pupitre de madera? ¿Lo podría digerir? Explique.
65. Defina glucoproteínas y cómo se clasifican.
66. ¿Qué función cumple el glucocáliz?
67. ¿Qué son lectinas y para qué sirven?
Las siguientes preguntas respóndelas en máximo media hoja escrita y si necesitas
imágenes puedes extenderte.
68. Defina gen y genoma.
69. Escriba las estructuras químicas de las bases nitrogenadas. Señale sus
diferencias.
70. ¿En qué se diferencian nucleótidos de nucleósidos?
71. ¿Qué funciones cumplen los ácidos nucleicos?
72. ¿Cuál es la estructura primaria, secundaria y terciaria de un ácido nucleico?
73. ¿Qué tipos de nomenclatura existen para escribir la secuencia de un ácido
nucleico?
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74. ¿Cómo se demostró que el DNA es el portador del mateiral genético?
75. ¿Cómo se demostró que el DNA es una doble hélice?
76. ¿En qué consiste el mecanismo de autoreplicación?
77. ¿En qué consistió el experimento de Messelson y Stahl?
78. ¿Cuál es la diferencia entre las hélices A, B y Z? ¿Existe alguna preferencia
de estas hélices para el DNA y RNA?
79. ¿Qué significado tiene el hecho de que una molécula de DNA esté
“relajada” o “superenrollada”?
80. Defina topoisomerasas y mencione sus funciones.
81. ¿Cómo se clasifican los RNA?
82. Defina tRNA y mencione sus características y funciones biológicas
83. ¿Cómo se puede desnaturalizar el DNA?
84. Defina y explique brevemente transcripción y traducción.
85. ¿Qué actividad tienen los ácidos biliares, los jabones y los detergentes
sobre las grasas?
86. Escriba la fórmula de un triglicérido
87. Escriba la fórmula del colesterol
88. ¿Por qué es importante el colesterol?
89. ¿Qué es la saponificación de un glicérido? Dar ecuación y condiciones?
90. ¿Qué es una emulsión y en que difiere de una solución micelar?
91. ¿Qué propiedad de los lípidos permite la formación de estas soluciones?
Hacer esquemas.
92. ¿Cómo se clasifican los lípidos?
93. ¿Cuáles son los ácidos grasos esenciales? Definir el termino esencial.
94. ¿Qué compuestos se obtendrán por tratamiento de la 1-paimitil, 2-oleil,
fosfatidilcolina con las siguientes agentes de hidrólisis?
(a) Fosfolipasa A, (b) Fosfolipasa B, (c) Fosfolipasa C, (d) NAOH
95. Una mezcla de I -paimitil, 2-estearil, 3-laurilglicerol y acido fosfatidico en
benceno, se agita con igual volumen de agua. Después de separar las
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fases, que lípido se encontrara en mayor concentración en la capa acuosa?
Fundamentar la respuesta y dar formulas.
96. Porque los ácidos grasos son relativamente insolubles, mientras que el
acido de 2 C (acético) es muy soluble?
97. Que compuesto de los siguientes será mas soluble en agua:
a) Monoglicérido o triglicérido, b) Diglicerido o ac. Fosfatidico, c) Esteroide o
esterol
98. En que difieren los aceites vegetales de las grasas?