F. Sanz, "Planes estratégicos de la Plataforma Medicamentos Innovadores"

Planes de la PTE-MI para la colaboración y la promoción de la investigación
• Diseñar y ejecutar estudios sobre la situación de las prioridades
estratégicas:
• Proyecto BEST sobre investigación clínica.
• Estudio de la oferta por parte de proveedores tecnológicos y
de demanda por parte de la industria farmacéutica en gestión
del conocimiento en el I+D farmacéutico.
• Estudio de la oferta de actividades de formación y
necesidades de perfiles profesionales por parte de la
industria.
• Favorecer la génesis de proyectos de investigación cooperativos que
resulten sinérgicos con los objetivos de la plataforma:
• CENITs liderados por la industria farmacéutica
• Redes del ISCIII (RETICS): COMBIOMED
• Facilitar la participación de los actores españoles en las actividades
de IMI.
Medicina traslacional “ómica”
Phenotype of each individual = f (genotype ; environment)
Health events = f (clinical history ; biomolecular knowledge)
Informática biomédica
Integration of genomic and clinical information with
preventive, diagnostic and therapeutic purposes
Adapted from BIOINFOMED white paper
Relaciones traslacionales entre informática médica y bioinformática
Clinical record data:
Patient history
Symptoms and signs
Drug prescriptions and observed side-effects
Clinical
data
“omic”
Research
Genomic &
proteomic
information
SNP data
Gene-disease associations
Microarray technology
Biological pathways
Adapted from BIOINFOMED white paper
Red de excelencia europea INFOBIOMED
INFOBIOMED: Structuring European Biomedical
Informatics to Support Individualised Healthcare
• Main objective: "Set a durable structure for BMI at the European
level that supports its consolidation as an integrative scientific
discipline that exploits the synergies between BI and MI“ (BI and MI
have been separate disciplines up to now).
• Specific objectives can be broadly divided in 2 groups:
• “Community”: education, training, mobility, spreading
knowledge, creating a self-sustainable structure.
• “Scientific”: data integration; methods, technologies & tools;
pilot applications.
• 42 months starting on Jan 1st, 2004.
• 16 institutions from 10 countries: IT, BMI, MI & pilot field experts.
• www.infobiomed.org & www.infobiomed.net
Joint Programme
of Activities
Plan de trabajo
de INFOBIOMED
Data
analysis &
modelling
Data
characteristics &
ontologies
DB
integration
Ethics&
confidentiality
Pilots are the ‘proof of concept’
concept’ of the pursued integrative vision of BMI
Piloto en Farmainformática de INFOBIOMED
Integración de información biomédica para obtener una visión más completa
de una enfermedad, su tratamiento farmacológico y las reacciones adversas
Enfermedad
Información
clínica
Sistemas
Dianas
Fármacos
Información
“ómica”
Información
química
Piloto en Farmainformática de INFOBIOMED
Case study: Complex Regional Pain Syndrome (CRPS)
Pathology
Pathway
Target
Drugs
•
Pathology to Pathway: EMC identifies all known pathways related to CRPS
through literature mining, and share the information with AZ.
•
Pathway to Target: The known pathways are merged or expanded by EMC
and AZ. Both obvious and non-obvious interactions are investigated. EMC uses
the knowledge retrieval tool Collexis and AZ the pathway analysis tool
PathwayAssist for this purpose.
•
Target to Ligands/Approved Drugs: AZ and IMIM identify approved drugs or
ligands that are active against members of the pathways, using biologically
annotated ligand/drug databases.
•
Approved Drugs to Clinical Outcome: EMC verifies in its clinical database if
the approved drugs identified are being used, what are their indications,
whether it is possible to use them in CRPS or whether patients on these drugs
have an altered incidence of CRPS.
Piloto en Farmainformática de INFOBIOMED
Simplified Picture of Possible CRPS 1 Pathophysiology
Inflammation
Substance P
Map kinase
IL-1β
Glutamate
Protein kinase C
Nerve Growth Factor
NF-κB
Calcium accumulation
IκB degradation
Spinal prodynorphin
iNOS
Calpain
Hyperexcitability of
nociceptive neurons
TNFα
IL-1β
IL-6
COX-2
Dynorphin
NMDA
Receptor complex
Prostaglandin E2
Neurofilament light chain
protein (NFL) degradation
Increased nociceptive
Stimuli processing
Hyperalgesia Allodynia
Degeneration and death
of motorneurons
Inflammation
Pain
COMBIOMED
Propuesta de Red Temática de
Investigación Cooperativa en
Computación Biomédica
Visión
La comprensión de los fenómenos biológicos requiere la integración de
información desde el nivel molecular y genético hasta el nivel de
población, incluyendo los niveles intermedios de célula, tejido, órgano e
individuo. Para cada uno de estos niveles, la cantidad de datos que se
generan hoy en investigación crece a un ritmo exponencial.
La Biomedicina es cada vez más una disciplina intensiva en el uso y
elaboración de información. La aplicación de métodos computacionales no
solamente es indispensable para la recolección, gestión y análisis de los
datos biomédicos de todo tipo, sino que forma parte de la propia esencia
de dicha ciencia.
Estructura de COMBIOMED
Algunas colaboraciones previstas en COMBIOMED
Industria
farmacéutica
PTE-MI
(GC)
CEGEN
INFOBIOMED
COMBIOMED
BSC
INB
Distribución geográfica de los participantes en COMBIOMED