C.Martínez Riera, "Mapa de tecnologías"

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MEDICAMENTOS INNOVADORES
MAPA DE TECNOLOGÍAS
por
Carlos Martínez Riera
Generalitat Valenciana
4 de julio de 2006
II Conferencia de la Plataforma Tecnológica Española
Medicamentos Innovadores
1
Necesidad de un mapa de tecnologías
ƒ
Catalogar de manera racional las necesidades tecnológicas
que impliquen la gestión del conocimiento en el proceso de
I+D y análisis de medicamentos innovadores
ƒ
Facilitar a las empresas y centros de investigación la
identificación de nichos donde sus productos pueden ser
catalogados y donde pueden suscribir sus áreas de interés.
ƒ
En último término, facilitar la conexión entre la oferta
tecnológica y la demanda en el proceso de I+D de los
medicamentos innovadores.
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Metodología propuesta
ƒ
Establecer una matriz que relacione el proceso de diseño y
desarrollo de Medicamentos innovadores con áreas de
conocimiento relevantes.
ƒ
En cada intersección de la matriz se pueden situar
soluciones tecnológicas para abordar algunas de las fases
del proceso.
ƒ
Estas intersecciones constituyen los nichos de referencia
de la oferta tecnológica
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Antecedentes
ƒ
Esta metodología constituye la base de los sistemas de
gestión del conocimiento para conectar oferta y demanda
ƒ
ƒ
Ejemplos: GECOBIO para la biomedicina. Ayuntamiento de
Velencia, Conselleria de Empresa, Unicersidad y Ciencia.
KNEXT. Universidad Politécnica de Valencia.
http://innci.inco.upv.es:8080/knINGENIO/pages/login.jsp
ƒ
Se basa en establecimiento de un mapa de conocimiento
mediante la definición de dimensiones (2 o más) que
permite una definición matricial del mismo
ƒ
Además, define las categorías de entidades (comunidades
o usuarios).
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Relevancia para la PTE-MI
ƒ
En el contexto de la PTE-MI, el eje de referencia (Eje 1) es
el proceso de diseño, desarrollo y análisis de los
Medicamentos Innovadores.
ƒ
ƒ
La aplicabilidad de las herramientas en el proceso de I+D de
medicamentos es una condición indispensable. Este Eje asegura
que las tecnologías descritas son pertinentes para uno o más
puntos del proceso.
Dos dimensiones adicionales constituyen las disciplinas
científicas (Eje 2) y tecnológicas (Eje 3) que proveen el
conocimiento y las herramientas para abordar las
necesidades del proceso.
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Énfasis en la Gestión del Conocimeinto
ƒ
El ejercicio de cartografía del conocimiento es amplio y
engloba un amplio número de disciplinas con el fin de
abarcar suficientemente el campo posibles oportunidades.
ƒ
No obstante, en el marco de los objetivos de la PTE-MI, se
pondrá el énfasis en la identificación y catalogación de
productos y servicios relacionados con las Tecnologías
de la Información, Computación y Gestión del
Conocimiento.
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Relevancia para la PTE-MI
Ejes propuestos para el mapa del conocimiento
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Eje 1: el proceso de diseño y desarrollo de MI
ƒ
Proceso estándar de diseño, desarrollo y estudios de
Medicamentos (proceso de descubrimiento)
I+D
Prueba de
concepto
Precíinica
Fase I
Fase I
Fase III
Apobación
Fármacovigilancia
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I+D y Prueba de concepto
I+D
Prueba de
concepto
Diagnóstico Identificación
de Dianas
Validación
de Dianas
Priorización
de dianas
Identificación Optimización
de candidatos de candidatos
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Contribución de las tecnologías de Gestión del Conocimiento
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Eje 2: Áreas de conocimiento Biomédicas
ƒ
Áreas de conocimiento biomédicas
S ecuencias
V ariación
E x presión
F unción
R edes génicas
E v olución
S ecuencias
P ro teó m ica
V ariación
E x presión
F unción
R edes de interacción
B io lo g ía d e sistem as F isiom a
M odelado v irtual de órganos
C élula v irtual
Q uim ioinform ática
Q u ím ica
H ighthroughput S creening
Q uím ica com binatoria
Q uím ica G enóm ica
G en ó m ica
F arm aco lo g ía
F árm acocinética
F árm acodinám ica
F árm acogenóm ica
F árm acodinám ica poblacional
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Mapa matricial de aplicaciones
Ejemplo de mapa de aplicaciones basada en dos ejes:
Eje 1 . Proceso de decubrimiento
Eje 2 . Áreas
conocimiento
DIAGNÓSTICO IDENTIFICACIÓN VALIDACIÓN
DE DIANAS
DE DIANAS
Genómica
Proteómica
Biología
de sistemas
Química
Farmacología
Secuencias
Variación
Expresión
Función
Redes génicas
Evolución y Filogenia
Secuencias
Variación
Expresión
Función
Redes de interacción
Fisioma
Modelado de sistemas biol.
Biología computacional
Quimioinformática
Highthroughput Screening
Química combinatoria
Química Genómica
Fármacocinética
Fármacodinámica
Fármacogenética
Fármacodinámica poblacional
Mutaciones génicHomologías de secuencias
Epigenética
Función génica
Análisis de Micro-arrays
Genes diana
Familias de proteínas
PRIORIZACIÓN IDENTIFICACIÓN OPTIMIZACIÓ
PRECLÍNICA FÁRMACODE DIANAS
DE
N DE
CLÍNICA
VIGILANCIA
CANDIDATOS CANDIDATOS
ADMET
Genómica Comparativa
Análisis SNP
Tóxico Genómic Caracterización de expresión génica
Variación genética Var. Genética p4Análisis SNP
Estructura de proteSelectividad de estructuras
Biomarcadores
Función de la proteína
Interacciones proteína-proteína
Modelado de rutas metabólicas
Interacciones proteína-proteína
Biomarcadores
Tóxico Proteómica
Modelos Animales
Modelado de rutas metabólicas
Síntesis automatizada en paralelo
Marcadores de calidad de compuestos
(Genómica Química combinatoria)
Predicción propiedades ADMET
Modelización de ensayos
Selección Pacientes
Diseño de quimiotecas
Diseño de ensayos Eval. riesgos
Modificado de Cambridge Healthtech Institute 2002
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Ejes de tecnologías
ƒ
Además de la clasificación por áreas de conocimiento, los enfoques
bioinformáticos y de informática médica constituyen ejes adicionales
horizontales que intervienen en la mayor parte de las fases del
proceso de descubrimiento.
ƒ
Por ello, constituyen un tercer eje que, a efectos de la presentación,
se segmentan en:
ƒ
ƒ
ƒ
ƒ
ƒ
Tecnologías horizontales
Herramientas para la estratificación y personalización
Otras tecnologías relacionadas
Tecnologías periféricas
Las dos primeras se consideran tecnologías centrales a efectos de la
PTE-MI
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Eje 3a: Tecnologías horizontales
ƒ
Algoritmos y Programación
ƒ
Bases de datos
ƒ
Análisis de Imágenes
ƒ
ƒ
Representación y análisis de
redes
Data/Text Mining
ƒ
Probabilidad y estadística
ƒ
Anotación
ƒ
Ontologías y representación del
conocimiento
ƒ
Computación distribuida (Grid)
ƒ
Análisis de secuencias
ƒ
Modelado molecular
ƒ
Técnicas de simulación
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Eje 3b: Tecnologías de personalización/estratificación
ƒ
Bases de datos genéticas de poblaciones
ƒ
ƒ
Cáncer
Enfermedades congénitas
ƒ
Caracterización de riesgo
ƒ
Integración de información multi-nivel en la historia
clínica
ƒ
ƒ
ƒ
Genómica
Molecular
Genealogía
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Eje 3c: Tecnologías relacionadas
ƒ
Sistemas de información ligados a repositorios de
biomateriales
ƒ
ƒ
ƒ
Seguimiento y monitorización
ƒ
ƒ
ƒ
ƒ
Células, tejidos
Modelos animales y vegetales
Liberación inteligente de fármacos
Biosensores
(Tele-)monitorización de pacientes
Seguridad y Confidencialidad
ƒ
ƒ
ƒ
Protocolos de anonimización
Infraestructura de PKI
Firma de transacciones
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Eje 3d: Tecnologías periféricas
ƒ
Robótica
ƒ
ƒ
Instrumentación
ƒ
ƒ
Robots para cultivos, secuenciación, high trhoughput screening
Implantes avanzados
Otros
ƒ
ƒ
ƒ
ƒ
Workflow de pacientes en ensayos clínicos
Gestión de patentes
Sistemas de información ético-legales
Recursos de información sobre cursos de formación
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Espacio de aplicaciones
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Validación del modelo
Validación y refinamiento del catálogo de
tecnologías
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Validación del modelo
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Validación y refinamiento del catálogo de tecnologías
ƒ
ƒ
ƒ
Posible reordenación de las categorías identificadas
Identificación de tecnologías no consideradas
Reconsideración de tecnologías incluidas. Ejemplo:
ƒ
ƒ
ƒ
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Sistemas ético-legales
Sistemas de información sobre recursos de formación
...
Cada categoría puede así ser refinada si se considera apropiado.
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Criterios para la categorización
ƒ
Cada categoría debe mostrar un equilibrio con respecto a
su ámbito de aplicación: ni demasiado general ni
excesivamente específico
ƒ
El objetivo es permitir que un producto o servicio pueda
ser catalogado dentro de una categoría de manera natural
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Catalogación de la oferta
Catalogación de la oferta
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Catalogación de la oferta
ƒ
Una vez establecido el mapa de conocimiento, podrá
catalogarse la oferta tecnológica
ƒ
Las empresas, centros y otras entidades se inscriben en el
catálogo y definen sus productos o servicios mediante la
caracterización de los mismos en la matriz.
ƒ
Una empresa o centro ‘cataloga’ su producto o servicio
situándolo en uno o más nichos de la matriz
ƒ
El objetivo es que la oferta pueda ser recuperada desde
varios puntos de vista: Tecnología, Aplicación en el
proceso de descubrimiento
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Gestión del conocimiento de la Oferta Tecnológica
ƒ
ƒ
Esta catalogación inicial precisará ser formalizada y
mantenida mediante un sistema de gestión del
conocimiento de la oferta tecnológica.
Un ejemplo de este tipo de sistemas es GECOBIO, que en
la Comunidad Valenciana cataloga la oferta tecnológica en
Biomedicina mediante la identificación de:
ƒ
ƒ
ƒ
ƒ
Entidades: empresas, grupos de interés, comunidades
Definición de sectores biomédicos
Mapa de conocimiento
Gestión de servicios de acuerdo con los perfiles de usuario
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Ejemplo:
Web GECOBIO
Definición de
áreas y
sectores
biomédicos
Herramientas de
Gestión de Servicios
& Información de
acuerdo al perfil del
usuario
Mapa del
conocimiento
biomédico
Definición de
Comunidades,
Entidades,
Grupos de
Usuarios,
Usuarios,
Servicios, …
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Contacto y agradecimientos
ƒ
Esta propuesta ha sido elaborada por
ƒ
ƒ
Carlos Martínez Riera
Conselleria de Empresa, Universidad y Ciencia de la Generalitat
Valenciana
e-mail: [email protected]
Han colaborado decisivamente
ƒ
ƒ
ƒ
Ximo Dopazo
Centro de Investigación Príncipe Felipe de Valencia
Grupo de Bioinformática
Miguel Borrás y Marival Bermejo
Intervalence Biokinetics
Andreu Llambrich
FIVEC Fundación de Innovación Urbana y Economía del
Conocimiento
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