Moderador: Ferran Sanz (GRIB-IMIM-UPF)

Reutilización de datos en la
investigación biomédica
Ferran Sanz
Programa de Investigación en Informática Biomedica (GRIB)
Instituto hospital del Mar de investigaciones Médicas (IMIM)
Univeridad Pompeu Fabra, Barcelona
“Big Data” biomédico
PRÁCTICA
CLÍNICA
INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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“Big Data” biomédico
PRÁCTICA
CLÍNICA
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
4
“Big Data” biomédico
Millones de HCE pueden ser
reutilizadas para investigación
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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“Big Data” biomédico
Estimación del volumen mundial de
imágenes médicas en 2020: 35 ZB
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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“Big Data” biomédico
INVESTIGACIÓN BIOMÉDICA
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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“Big Data” biomédico
20+ millones de publicaciones
científicas en PubMed®, y
700,000+ se incorporan cada año
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
8
“Big Data” biomédico
En Mayo de 2015, el European GenotypePhenotype Archive (EGA) almacenaba
ya 1.8 PB de datos “omicos” humanos
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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“Big Data” biomédico
ChEMBL: 11K dianas; 1.5M
compuestos; 14M actividades
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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“Big Data” biomédico
No hay que olvidar la información
relacionada con la salud en las
redes sociales (Web 2.0)
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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Integración de información biomedica heterogénea para obtener
una visión más completa de las enfermedades y de sus terapéuticas
Health information
in social media
INTEGRATIVE
STRATEGIES
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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Integración de información biomedica heterogénea para obtener
una visión más completa de las enfermedades y de sus terapéuticas
Health information
in social media
INTEGRATIVE
STRATEGIES
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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• Recurso exhaustivo sobre asociaciones entre genes y
enfermedades (alrededor de medio millón)
• Integra información extraída de bases de datos públicas y de la
literatura científica mediante minería de textos (más del 80%)
• Disponible libremente en: http://ibi.imim.es/DisGeNET
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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Molecular diseasome
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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Análisis de redes para estudiar las
comorbididades
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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Análisis de redes para estudiar las
comorbididades
Clinical diseasome
Molecular diseasome
Ferran Sanz . GRIB (IMIM-UPF)
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¡Muchas gracias por su atención!
http://grib.upf.edu