UNIVERSIDAD INTERAMERICANA DE PUERTO RICO RECINTO DE BAYAMON Departamento de Ciencias Naturales y Matemáticas Bioquímica: QUIM 4220 Preguntas de práctica: Introducción a la Bioquímica 1. Dibuje las estructuras de los siguientes compuestos: a) C2H5NO2 (un aminoácido) b) C2H4O2 (un ácido) c) C3H2N2 (anillo aromático de 5 átomos) e) C2H4O3 (un ácido) g) H3PO4 (ácido fosfórico) d) C3H7NO2S (un aminoácido) f) H2O2 h) CH4N2O (una amida) b) Mencione 5 elementos químicos presentes en biomoléculas. c) Mencione las cuatro clases mayores de biomoléculas. d) Mencione al menos una función biológica de las siguientes biomoléculas: a) ADN b) ARN c) aminoácidos d) lípidos e) carbohidratos f) vitaminas g) proteínas h) agua b) Cuál de los siguientes son biopolímeros: a) Glucosa b) celulosa c) ADN d) urea e) aminoácidos f) Hemolglobina g) nucleótidos h) proteínas i) agua j) O2 b) Paree el polímero con el monómero el cual lo forma: Polímero Monómero __ 1. Ácidos nucleicos a. Glucosa __ 2. Polisacáridos b. Aminoácidos __ 3. Proteínas c. Nucleótidos __ 4. Celulosa d. Monosacáridos __ 5. Almidón c) Identifique el tipo de enlace (o enlaces) entre los siguientes pares de átomos o moléculas: a) NaCl b) H2O c) H2O y H2O d) NH3 y H2O b) Determine cuál de las siguientes aseveraciones son falsas y reescríbala de forma que sea cierta: a) Enlaces no-covalentes se rompen más fácil que los covalentes. b) La fortaleza de un enlace no-covalente es casi siempre 300 kJ/mol. c) Interacciones no-covalentes ocurren a menudo entre algunas moléculas solamente. d) Enlaces no-covalentes se rompen reversiblemente a temperatura ambiente. c) Describa la diferencia entre puentes de hidrógeno y enlaces iónicos. d) Qué propiedad del agua es la que más contribuye a que ésta pueda disolver gran cantidad de biomoléculas en la célula. e) Prediga cuál de los siguientes compuestos es soluble en agua: a) CH3CH2OH b) CH3(CH2)10CH2OH c)CH3CH2COOH d) e) f) CH2OH O OH O OH +H3N CH C O- H2C OH HC OH H2C OH OH H OH g) CH3 CH3 HO b) Para preparar un amortiguador de pH 4, cuál de los siguientes ácidos sería el más efectivo: a) Láctico (pKa = 3.85) b) acético (pKa = 4.75) c) fosfórico (pKa1, 2,3 = 2.14, 7.20, 12.4) c) El pH de los fluidos corporales se estabiliza por medio de amortiguadores. Cuál de los siguientes compuestos sería el amortiguador, con sus pKa, más efectivo a pH fisiológico: a) Na2HPO4, 12.32 b) NH4OH, 9.24 c)*NaH2PO4, 7.21 d) CH3COOH, 4.74 e) Ácido cítrico, 3.09 b) Ácido acetilsalicílico (aspirina) tiene un pKa de 3.5 y la siguiente estructura: COOH OCOCH3 a) Dibuje la estructura de esta molécula en la forma en que encontraría en el plasma sanguíneo. b) Dibuje la estructura de esta molécula en la forma en que encontraría en jugo gástrico. c) De sus conocimientos de la química, cuál de los siguientes podría ser un ingrediente en anti-ácidos: a) NaHCO3 b) vitamina C (ácido ascórbico) c) Mg(OH)2 d) CH3COOH e) NaAl(OH)2CO3 g) jugo de limón h) CaCO3 f) aspirina b) Una marca comercial de aspirina contiene MgCO3. ¿Cuál es el propósito de este ingrediente? c) Escriba la reacción de disociación para cada uno de los siguientes compuestos importantes en la bioquímica. Muestre la disociación de todos los protones acídicos. a) HCl b) CH3COOHc) NH4+ c) CH3(CH2)13CH2COOH d) H3PO4 e) H2O f) H2CO3 g) +H3N CHCOOH R b) Muestre un posible puente de hidrógeno entre agua y aquellas de las siguientes moléculas que pueden formar puentes de hidrógeno: a) CH3CH2OH b) CH3CH2CH3 c) d) O +H3N CH C O- O CH2 H2N C NH2 SH b) Identifique los siguientes aminoácidos como dipróticos o tripróticos y escriba la reacción de disociación de todos los hidrógenos acídicos: O O +H3N a) CH CH3 C C O OH +H3N CH2 O +H3N CH C OH b) +H3N CH C c) OH C d) NH3+ C OH CH2 OH (CH2)4 O CH O NH2 a) Para el siguiente dipéptido, identifique los hidrógenos que pueden formar puentes de hidrógeno con H2O. Diferencie además los átomos que son donantes o receptores de puentes de hidrógeno. O H2N CH C O H N CH CH2 CH2 OH SH C OH b) Ordene las siguientes soluciones en términos de mayor a menor acidez: a) Jugo gástrico b) sangre c) lluvia ácida d) cola e) café c) as bases nitrogenadas a continuación forman se enlazan por puentes de hidrógeno desde diferentes hebras de la hélice del ADN. Identifique aquellos átomos que pueden participar en la formación de puentes de hidrógeno y cuáles son donantes o receptores de puentes de hidrógeno. NH2 O N N N N H NH N H O d) Determine cuáles de las siguientes aseveraciones sobre interacciones nocovalentes son falsas y re-escríbalas de manera que sean ciertas: a) Enlaces iónicos resultan de la atracción electroestática entre grupos funcionales ionizados con cargas opuestas. b) Puentes de hidrógeno resultan de la interacción de entre un anión y un átomo de hidrógeno. c) Interacciones hidrofóbicas son atracciones electroestáticas entre grupos funcionales no-polares y agua. d) H+ y OH- se unen por un enlace iónico para formar agua. e) Interacciones hidrofóbicas son importantes en la formación de micelas cuando el detergente dodecanoato de sodio, CH3(CH2)10COONa, se añade a agua. e) Identifique la interacción que mantiene los siguientes átomos o moléculas juntos: a) NaCl b) Na+(H2O)n c) CH3COONa d)R-OH, R-OH e) RNH3Cl b) Para cada par de moléculas a continuación, determine cuál es la más polar: a) H2O, CH3OH b) H2O, CH3CH2OH c)CH3(CH2)3CH3, CH3CH2OH d) e) H 2C , CH3CH2OH g) NH2CH2CH3, CH3CH3 H 2C f) O O OH OH CH3CNH2 CH3CH O O CH3CNH2 NH2CNH2 b) Para cada par de moléculas a continuación, determine cuál es la menos polar: a) CH3CH3, HOCH2CH3 b) HOCH2CH3, H2O c) d) H3C CH3 H3NCHCOO- CH3 OH CH H3NCHCOO- CH3CH2COOH CH3CHCOOH e) HOOCCH2COOH, CH3CH2CH2COOH b) Cuál es la concentración molar de agua pura. c) Escriba la estructura del ácido conjugado de las siguientes bases: a) OH- b) HCO3c) H3NCH2COOd) CH3COO- e) H2PO4b) Escriba la estructura de la base conjugada de los siguioentes ácidos: a) H2O b) H3NCH2COOH c) CH3(CH2)10COOH d) HCO3e)NH3CH2(CH2)10CH2NH3 30. Si la constante del producto iónico de agua, Kw, a 25 °C es 10-14 M-2, ¿cuáles son las concentraciones de H3O+ y OH- a esta temperatura? 31. Siendo HCl un ácido fuerte, calcule el pH de una solución de 4×10 -4 M de HCl. 32. Calcule [OH-] en una solución acuosa donde [H3O+] = 0.1 M. ¿Cuál es el pH de la solución? 33. Escriba la reacción de disociación de ácido acético y su expresión de equilibrio. Identifique en la reacción el ácido, la base, el ácido conjugado y la base conjugada. 34. Cuál de los siguientes es el ácido más fuerte: ácido bórico (pKa = 9.0) o ácido acético (pKa = 4.7) 35. Una solución de 0.1 M de un ácido débil está 0.05% ionizada. ¿Cuál es el pK de este ácido? 36. a) Calcule el pH de una solución de 1.0 L que contiene 0.1 M de ácido acético y 0.1 M de acetato de sodio dado que, para ácido acético, pKa = 4.7. b) Cuál será el pH de la solución después de añadirle 0.05 mol de NaOH a un litro de la solución. c) Calcule el pH de una solución que se prepara añadiendo 0.05 mol de NaOH a un litro de agua pura. d) Compare el cambio que ocasionó el NaOH a la solución del amortiguador y a la del agua pura. 37. ¿Cuántos moles de acetato de sodio y ácido acético habría que mezclar para preparar un amortiguador de 0.4 M acetato/ácido acético con un pH de 5.5? (La molaridad de un amortiguador es igual a la suma de la molaridad del ácido más la de su base conjugada.) ¿Cuál sería el pH final luego de añadirle 0.1 mol de HCl al este amortiguador? 38. ¿Cuántos gramos de succinato de sodio y succinato de disodio hay que añadir a 1.0 L de agua para preparar un amortiguador con pH 6 y una concentración de 50 mM? 39. Usted necesita preparar una solución de acetato de potasio, KOAc, a pH 5 y 3 M de K+ para aislar ADN plasmídico de una bacteria. ¿Cuántos moles de KOAc y de ácido acético, HOAc, necesita para preparar 500 mL de esta solución? 40. Describa: isomería óptica, isomería estructural, moléculas quirales, isómeros conformacionales, enantiómeros, configuración L/D, diaestereoisómeros, enlaces, cis/trans. 41. Describa lo que sucede en reacciones de sustitución, eliminación, adición, rearreglos, oxido-reducción, ácido/base. 42. Describa las tendencias de radio atómico, energía de ionización y electronegatividad en la Tabla Periódica. Relacione las tendencias de energía de ionización y electronegatividad con radio atómico. 43. Describa las posibles fuerzas interatómicas y explique su fortaleza relativa.