PROTEÍNAS Concepto y estructura Las proteínas son moléculas compuestas por C,H,O y Nitrógeno, elemento distintivo de las proteínas, que no forma parte de manera general de lípidos y glúcidos, además las proteínas tienen Azufre en pequeña proporción. Estructuralmente las proteínas son polímeros de aminoácidos, están formadas por la combinación de 20 aminoácidos distintos, Los polímeros de los aminoácidos se pueden clasificar, como los polímeros de los monosacáridos, según su tamaño en oligopéptidos y polipéptidos, la palabra proteína es prácticamente sinónima de polipéptido, generalmente son polímeros de más de 100 unidades de aminoácidos. Existen en la naturaleza oligopéptidos como la insulina de 30 aminoácidos que no son considerados proteínas, otros ejemplos son algunas hormonas. Las proteínas son todas unas diferentes de otras y tienen funciones específicas de cada una,catalizadores, transportadoras, receptores de señales químicas en las membranas celulares, estructurales, defensivas, etc; generalmente nunca cumplen funciones energéticas; esta diversidad es debida no a su composición, como ya hemos visto, pues son combinaciones de 20 aminoácidos siempre iguales, sino a su estructura que está determinada por la proporción de cada aminoácido y la secuencia que ocupan cada uno de ellos en la molécula. Esta secuencia está determinada por los genes como ya veremos. Como ejemplo basta decir, que las variaciones con repetición de 20 elementos tomados de 100 en 100 (20100) es el número de posibles proteínas distintas de 100 aminoácidos. Los aminoácidos Los aminoácidos son moléculas orgánicas que presentan un grupo carboxílico (ácido) -COOH y un grupo amino –NH2. los aminoácidos formadores de las proteínas son aminoácidos ya que presentan el grupo amino y el grupo ácido unidos al mismo carbono, el carbono , Dentro de los aminoácidos, son de la serie L; siempre el grupo amino se encuentra a la izquierda de la cadena de carbono. los 20 aminoácidos formadores de proteínas se diferencian en el radical que está unido al carbono , además de estos aminoácidos se encuentran otros que no son aminoácidos como el GABA ( aminobutírico) que es un neurotransmisor pero que nunca forma parte de las proteínas. Tipos de aminoácidos Los aminoácidos se clasifican según su radical en: apolares (Alanina, prolina, fenilalanina), polares sin carga (Glicina, Cisteína, Serina) polares con carga negativa (ácido glutámico y ácido aspártico) y polares con carga positiva (Lisina, arginina e Histidina) cada uno de estos tipos de radicales diferentes se comportan de manera diferente cuando los aminoácidos se encuentran unidos formando proteínas y determinan así la estructura de las proteínas como ya veremos. Características de los aminoácidos Como ya hemos dicho los aminoácidos son universales, se encuentran en todos los seres vivos. Algunos aminoácidos son esenciales, no pueden ser sintetizados en un organismo determinado y los tiene que ingerir en la dieta, cada grupo de seres vivos tiene unos determinados aa. esenciales, menos las plantas que los forman todos. (Recordad que también son esenciales para el hombre algunos ácidos grasos y las vitaminas) Los aminoácidos en disolución son moléculas anfóteras; se comportan como ácidos o como bases según el pH del medio utilizándose como tampones naturales, ello es debido a que su grupo amino es capaz de aceptar protones en medio ácido y el grupo carboxílico los desprende en medio básico, cuando se polimerizan pierden esta capacidad ya que el grupo ácido de un aminoácido reacciona con el grupo amino del siguiente, aunque las proteínas siguen siendo anfóteras debido a los radicales polares con carga. Enlace peptídico los aminoácidos se polimerizán al reaccionar el grupo carboxílico de uno con el grupo amino del siguiente desprendiéndose una molécula de agua. el enlace que se forma entre el carbono y el nitrógeno tiene una especial rigidez, semejante a los dobles enlaces, que le impide rotar libremente esta característica determina en parte la estructura de las proteínas. Estructura de las proteínas En las proteínas se pueden reconocer cuatro niveles de estructura diferentes. Estructura primaria: La estructura primaria es la secuencia de aminoácidos que forman la proteína, esta secuencia es específica para cada proteína y está determinada por la secuencia de nucleótidos del ADN, cada gen tiene la información para la secuencia de una proteína, esta secuencia queda estabilizada por enlaces peptídicos y solo se rompe mediante hidrólisis. La secuencia de aminoácidos determina las demás estructuras por fenómenos fisicoquímicos. Estructura secundaria. Existen dos tipos de estructuras secundarias, la estructura en -hélice es característica de las proteínas globulares y está formada por el arrollamiento en hélice de los aminoácidos, cada vuelta de hélice tiene unos 3,6 aa. y crece en sentido dextrogiro (Cada aminoácido está más alto que el de su izquierda) de forma que el oxígeno del carbono carboxílico de un aminoácido forma un enlace de hidrógeno con el hidrógeno del grupo amino del aminoácido que está encima. Estos enlaces de hidrógeno forman una estructura muy estable. Los radicales de los aminoácidos se disponen en sentido radial al eje de la hélice. El otro tipo de estructura secundaria es la estructura -lámina plegada en esta estructura los aminoácidos se colocan formando una cadena lineal en la que se alternan los radicales, uno por encima y el siguiente por debajo de la línea formada por los enlaces peptídicos y los enlaces de los carbonos carboxílicos y los grupos aminos con el carbono . Se colocan varias cadenas paralelas o antiparalelas que se estabilizan por puentes de hidrógeno entre los oxígenos y los hidrógenos de distintas cadenas, también se pueden formar láminas plegadas con diferentes trozos de un mismo polipéptido. También se considera un tipo particular de estructura secundaria a la triple hélice que forman las fibras de colágeno al retorcerse unas con otras. Estructura terciaria. La -hélice y la -lámina plegada pueden deformarse en diferentes lugares de la estructura debido a la presencia de aminoácidos demasiado grandes, o demasiado rígidos como la prolina, o al la presencia de dos radicales cargados de la misma o diferente carga muy próximos, etc. de forma que la estructura secundaria se altera adoptando una disposición espacial, generalmente de forma globular que se llama estructura terciaria, este tipo de fuerzas se estabiliza por las fuerzas electrostáticas que la originan pero además se pueden formar enlaces de hidrógeno entre grupos que queden próximos al producirse esta estructura o a la presencia de puentes disulfuros que se forman entre dos radicales próximos de cisteina: -CH3-S-S-CH3- estos enlaces covalentes son mucho más fuertes como estabilizantes de la estructura terciaria que el resto de los enlaces aunque un son los causantes de su origen. Otro tipo de fuerzas que estabilizan esta estructura son las interacciones hidrofóbicas entre grupos apolares que se asocian. Estructura cuaternaria. No todas las proteínas la poseen, esta estructura se consigue por la asociación de varios polipéptidos diferentes y, generalmente, de origen también diferente que se asocian y se estabilizan gracias a fuerzas débiles del tipo de Van der Waals, en este caso las cadenas separadas llamadas protómeros no tienen actividad biológica por lo que se llama proteínas a la estructura cuaternaria que forman, el ejemplo más utilizado de estructura cuaternaria es la hemoglobina, está formada por dos cadenas y dos originadas por dos genes diferentes pero que no funcionan si no están asociadas. Hay muchas enzimas de estructura cuaternaria. Desnaturalización. Las proteínas a medida que se van formando en los ribosomas van adquiriendo de forma espontanea su estructura por que es la termodinámicamente más estable en la s condiciones de formación y es con esa estructura nativa con la que ejercen su función, si se alteran las condiciones fisicoquímicas del medio la proteína pasará espontáneamente a la conformación más estable termodinámicamente para las nuevas condiciones esta transformación puede suponer la perdida de efectividad parcial o total de la proteína, a este fenómeno se le llama desnaturalización. Los factores fisicoquímicos que influyen principalmente son el pH y la temperatura, también la concentración de sales. La temperatura es una medida de la energía cinética de las moléculas al aumentar la temperatura aumenta la vibración de las moléculas y se debilitan los enlaces débiles principalmente los en laces de hidrógeno, las fuerzas de Van der Waals y las interacciones hidrofóbicas de forma que la proteína cambia de estructura, hay que destacar que los aumentos pequeños de temperatura pueden ser reversibles si se vuelve a las condiciones iniciales, pero grandes aumentos de temperatura pueden llegar a romper enlaces covalentes con lo que se alteraría la estructura primaria y la desnaturalización sería irreversible. La variación del pH supone una redistribución de cargas eléctricas de la molécula, un radical positivo puede desprender un protón si aumenta el pH y pasar a ser neutro y los radicales negativos pueden aceptar protones si desciende el pH con lo que la distribución de cargas se altera en cualquier caso produciendo distintas a las anteriores. Cambios bruscos de pH en ambos sentidos pueden también hacer irreversible el proceso de desnaturalización. Las sales al disolverse se disocian y pueden actuar como ácidos o como bases por lo que la desnaturalización por aumento de la concentración salina tiene el mismo fundamento físico que el pH. (Pensad en lo que ocurre al huevo batido cuando se añade sal o limón, o se calienta) Importancia biológica de las proteínas Las proteínas no son moléculas utilizadas como reserva energética, son las últimas en metabolizarse en caso de desnutrición. La importancia de las proteínas radica en su estructura primaria que condiciona el resto de sus estructura, la secuencia de aminoácidos de una proteína es consecuencia directa de la secuencia de nucleótidos del ADN, de forma que los individuos que poseen genes diferentes poseerán proteínas diferentes. Son como ya hemos visto una diferente de la otra y cada una tiene una función específica, se podría resumir sus funciones en: estructurales (queratina de pelos y uñas, colágeno, elastina, etc), Reserva de materia (albúmina de huevo, es una proteína que el embrión irá hidrolizando para obtener los aminoácidos necesarios para formar sus propias proteínas) El resto de las proteínas se podrían llamar reguladoras ya que de alguna u otra manera ayudan a mantener estable al organismo, en la bibliografía se diferencian en transportadoras (hemoglobina), defensivas (Anticuerpos), mecánicas con función contráctil (Actina y miosina) , osmoreguladoras (albúmina de la sangre) y biocatalizadoras (Enzimas).