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1 Estructura y funcion celular bfm

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Bioquímica y fisiología
microbiana
Tema 1. Introducción
¿Qué es BFM?
☁
Fisiología
☁
☁
El estudio de las funciones de los organismos
entendiendo que los procesos de la vida están
mediados por sus estructuras, relación
estructura-función.
Bioquímica
☁
☁
El estudio de las reacciones químicas que
soportan la vida.
También están relacionadas la estructura con
la posibilidad de llevar al cabo reacciones
bioquímicas.
Objetivos
☁
Introducir la bioquímica y fisiología microbiana
como tema de estudio científico.
☁
Describir la importancia de los microorganismos y
su diversidad en la naturaleza.
☁
Describir a Escherichia coli como modelo de estudio
de la composición estructural y molecular de las
células bacterianas.
☁
Describir las diferencias entre células Grampositivas y Gram-negativas.
Objetivos
☁
Entender las estructuras celulares, factores de
crecimiento, metabolismo y composición
genética de los microorganismos
☁
Presenta las inter-relaciones entre la
microbiología, bioquímica y genética en el
contexto del funcionamiento de las células
bacterianas.
☁
Tomar a los organismos unicelulares como un
modelo para tratara de entender organismos
más complejos.
Metas
☁
Entender:
☁ Cómo una célula funciona en su ambiente
☁ Cómo puede alterarse para contender con
cambios en el ambiente
☁ Cómo puede reproducirse a partir de
sustratos simples del ambiente
Palabras clave
Prokaryotic
Eubacteria (Bacteria)
Archaebacteria (Archaea)
Eukaryotic
Plasmid
Chromosome
Ribosome
Peptidoglycan (murein, mucopeptide)
Gram stain
Gram negative
Gram positive
Cell envelope
Cell membrane
Cell wall
Outer membrane
Periplasmic space
Oxidative phosphorylation
Spheroplast/protoplast
Flagella
Chemotaxis
Axial filament
Periplasmic binding protein
Permeases
Storage Granules
Pili (fimbriae)
Capsule (slime layer, glycocalyx)
Endospore (spore)
Importancia de los
microorganismos
☁
Ubicuos, se encuentran en todos los nichos del ambiente
☁ Ambientes extremos, temperatura, presión salinidad, etc.
☁
En procesos del ambiente
☁ Flora bacteriana natural en intestinos de rumiantes
☁
En procesos industriales, bioremediación, fermentaciones
(alcohol, ac. Acético, etc. ) producción de antibióticos
☁
Estructura comunitaria de los microorganismos. Los
individuos participan en procesos particulares pero la
comunidad se requiere para procesos completos.
Clasificación de los
microorganismos
☁
Habían 5 reinos. Pero ahora hay tres Dominios
☁ Eukarya, organismos con núcleo y
compartamentalizados, todos los
multicelulares y algunos unicelulares.
☁ Bacteria, no compartamentalizados,
unicelulares.
☁ Archaea, unicelulares con membranas
características y genoma muy alejado del
bacteriano.
☁
Nota:
☁ Bacteria (con mayúscula) se refiere al
dominio,
☁ bacteria, (con minúscula) se refiere a los
procariontes, los miembros de los dos
dominios, Bacteria y Archaea son procariontes.
Los microorganismos se definen por su fenotipos o características físicas.
Temperatura óptima de crecimiento
☁ Psicrófilos:
-12 a 20 ºC
☁ Mesófilos: 14 a 45 ºC
☁ Termófilos moderados 42 a 69ºC
☁ Termófilos extremos 66 a 105 ºC
pH
☁
Acidófilos: pH bajo ~ 3
☁
Neutrófilos: pH ~7
☁
Alcalinófilos: pH alto ~10
Salinidad
☁
Halófilos. Alta salinidad
Oxígeno
☁
Aerobios obligados: requieren O2
☁
Aerobios facultativos: no requieren O2 pero
crecen mejor si está presente
☁
Microaerofílicos: requieren muy pequeñas
cantidades de O2
☁
Aerotolerantes: no se requiere el O2 y su
adición no mejora el crecimiento.
☁
Anaerobios obligados: el O2 inhibe el
crecimiento.
Nutrición
☁ Fuente
de
energía: luz vs química
☁ carbono: orgánica vs inorgánica
☁
☁ Aceptor
de electrones terminal
Fuente de
Carbono
Orgánico
quimioheterótrofos
CO2
quimioautótrofos
Orgánico
CO2
Fotoheterótrofos
fotoautótrofas
Verdes no sulfurosas
Púrpuras no sulfurosas
Aceptor final de
electrones
O2
Animales,
protozoarios, hongos,
bacterias
No O2
Orgánico
Streptococcus
Inorgánico
Clostridium
H2O
Fotosíntesis
Oxigenativa
No H2O
Fotosíntesis
Anoxigenica
verdes y púrpuras
sulfurosas
Energía
Redox
quimiótrofos
Luz
fotótrofos
Ejemplo
☁
Coloramator indicus
☁ Bastón Gram positivo inmóvil no
esporulante.
☁ Quimiorganotrófico y anaerobio obligado
☁ Alcalinotrófico, termófilo que puede
fermentar una gran cantidad de carbohidratos
Los microorganismos como
modelo de estudio
☁
Tiempo corto de generación
☁
☁
☁
☁
Pueden reproducirse hasta cada 20 minutos
Buenos para estudiar mutaciones
Se pueden estudiar un gran número de células idénticas
Tamaño pequeño
☁
Permite estudiar grandes poblaciones
☁
Tamaño pequeño de su genoma
☁
Diversidad nutricional
Escherichia coli como modelo de
estudio en BFM
☁
Escherichia coli es usada como paradigma.
☁
Paradigma: es —desde fines de la década de
1960— un modelo o patrón en cualquier
disciplina científica u otro contexto
epistemológico.
☁
Pero no es representativo de todos los
microorganismos.
☁
Cada microorganismo tiene sus carácterísticas
particulares.
Pregunta
☁
¿Cómo es el cromosoma bacteriano?
☁ Circular
☁ Lineal
☁ Varios circulares
☁ Varios lineales
☁ Circular a veces lineal a veces
☁ Ninguna de las anteriores
El paradigma de E. coli
Características morfológicas de
los microorganismos
☁
Forma, bacilos, cocos, espirilos
☁
Tamaño
☁
Coloración de Gram, positivo o negativo
☁
Formación de esporas, endosporas
Forma
Bacilos: con forma
alargada
☁
Cocos: con forma
redondeada
☁
Espirilos: con forma
helicoidal
☁
Vibrión: con forma de
coma ortográfica
Tamaño
☁
http://www.camfilfarr.c
om/cou_pol/industries/
care/microbial_size.cfm
Movilidad
☁
Cilios, pequeños
☁
Flagelos, grandes
☁
Fimbriae o pili, estructura tubular rígida
Diferencias entre
eucariontes y
procariontes
The Cell Envelope
Gram Positive
Gram Negative
Oxidative phosphorylation occurs at cell membrane
(since there are no mitochondria).
Cell Wall
Cytoplasm
Cell membrane
The cell wall is outside of cell membrane
– rigid, protecting cell from osmotic lysis.
Outer Membrane
☁
Gram negative bacteria
☁
major permeability barrier
☁
space between inner and outer membrane
☁ periplasmic space
☁
store degradative enzymes
☁
Gram positive bacteria
☁
no periplasmic space
GRAM NEGATIVE
CELL ENVELOPE
Outer Membrane
(Major permeability barrier)
Porin
Lipopolysaccharide
Braun lipoprotein
Degradative enzyme
Inner (cytoplasmic) membrane
Periplasmic binding protein
Cytoplasm
Permease
GRAM POSITIVE CELL
ENVELOPE
Degradative enzyme
Lipoteichoic acid
Peptidoglycan-teichoic acid
Cytoplasmic membrane
Cytoplasm
Peptidoglicano y ácido teicóico
Schematic representation of the cell wall of Gram-negative bacteria showing several
layers of polysaccharides and glycoconjugates
Essentials of Glycobiology
Second Edition
Chapter 20, Figure 1
Synthesis of peptidoglycan occurs in three phases
Essentials of Glycobiology
Second Edition
Chapter 20, Figure 4
Structure of Streptococcus pyogenes peptidoglycan with teichoic acid
Essentials of Glycobiology
Second Edition
Chapter 20, Figure 5
Structure of the cell wall of mycobacteria
Essentials of Glycobiology
Second Edition
Chapter 20, Figure 8
FLAGELLA
☁
Some bacteria are motile
☁
Locomotory organelles- flagella
☁
Taste environment
☁
Respond to food/poison
☁ chemotaxis
flagelos
• Flagella
– embedded in cell membrane
– project as strand
– Flagellin (protein) subunits
– move cell by propeller like action
Axial filaments
☁
☁
☁
☁
spirochetes
similar function to flagella
run lengthwise along cell
snake-like movement
Making Wall-less forms
☁
Result from action of:
☁ enzymes lytic for cell wall
☁ antibiotics inhibiting peptidoglycan biosynthesis
☁
Usually non-viable
☁
Wall-less bacteria that don’t replicate:
☁ spheroplasts (with outer membrane)
☁ protoplasts (no outer membrane).
☁
Wall-less bacteria that replicate
☁ L forms
Naturally Wall-less Genus
☁
Mycloplasma
☁
Membrana celular mas gruesa pueden tener
esteroles y lipoglicanos.
☁
Pleiomórficos
Pili (fimbriae)
☁
hair-like projections of the cell
☁
sexual conjugation
☁
adhesion to host epithelium
Capsules and slime layers
☁
outside cell envelope
☁
well defined: capsule
☁
not defined: slime layer or glycocalyx
☁
usually polysaccharide
☁
often lost on in vitro culture
☁
protective in vivo
Colonies of Bacillus anthracis.
CDC.
☁
The slimy or mucoid appearance
of a bacterial colony is usually
evidence of capsule production.
☁
In the case of B. anthracis, the
capsule is composed of poly-Dglutamate.
☁
The capsule is an essential
determinant of virulence to the
bacterium.
☁
In the early stages of
colonization and infection the
capsule protects the bacteria
from assaults by the immune
and phagocytic systems.
http://bioinfo.bact.wisc.edu/themicrobialworld/structure.html
Endospores (spores)
☁
Dormant cell
☁
Produced when starved
☁
Resistant to adverse
conditions
☁
☁
high temperatures
organic solvents
☁
contain calcium
dipicolinate
☁
Bacillus and Clostridium
Pared celular de Archaea
☁
No contiene peptidoglicano
☁
Puede ser de
☁
☁
☁
☁
pseudopeptidoglicano (pseudomureina) tiñe G+
pseudomureina cubierta de proteína, tiñe G+
monocapa superficial de proteina o glicoproteina, sin
pseudomureina (algunos halófilos,
alg.metanogénicos y termoacidófilos) tiñe G-
Existen Archaea sin pared
Pseudopeptidoglicano de Archaea
Funciones de la pared
☁
Rigidez y resistencia osmótica (mantener la
forma, evitar la lisis).
☁
Comunicación con el medio exterior.
☁
Puede estar involucrada en patogenicidad (LPS)
☁
Barrera para algunas moléculas (porinas en
gram negativos).
☁
Espacio periplásmico (enzimas de transporte,
hidrolíticas, etc.)
La membrana celular
☁
Estructura:
☁
Bicapa fosfolipídica con proteínas embebidas;
puede contener también hopanoides de
estructura similar al colesterol
☁
En Archaea, éteres de alcohol isoprenoide,
algunas forman monocapas.
Estructura de la Membrana
Citoplasmática
Los lípidos en Bacteria y Archaea
tienen diferentes enlaces químicos
Eter - Archea
Ester - Bacteria
Isopreno
Funciones de Membrana
Citoplasmática
☁
Barrera de Permeabilidad
☁ sólo moléculas pequeñas, sin carga, hidrofóbicas,
pueden atravesar la membrana por difusión.
☁
Ancla de Proteínas
☁ transporte, generación de energía, quimiotaxis
☁
Generación de fuerza proton motriz

En fotótrofas: Estructuras intracitoplasmáticas,
soportan el aparato fotosintético
(Vesículas, túbulos, tipo tilacoides)
☁
Síntesis de pared, y estructuras extracelulares.
Membrana citoplasmática
de E. coli
Nutrición
☁ Fuente
de
energía: luz vs química
☁ carbono: orgánica vs inorgánica
☁
☁ Aceptor
de electrones terminal
Diferencia entre la estructura celular
de Bacteria, Archaea y Eucarya
Propiedad
Bacteria
Eucarya
Membrana
NO
SI
nuclear
Organelos
NO
SI
Tamaño
70S
80S
ribosoma
Peptidoglicano
SI
NO
en la pared
Esteroles en
NO
SI
membrana
(hopanoides)
Lípidos de
Ester unidos Ester unido a
membrana
a glicerol
glicerol
Archaea
NO
NO
70S
NO
SI
Eter,
ramificados
Ejemplo
☁
Coloramator indicus
☁ Bastón Gram positivo inmóvil no
esporulante.
☁ Quimiorganotrófico y anaerobio obligado
☁ Alcalinotrófico, termófilo que puede
fermentar una gran cantidad de carbohidratos
Los microorganismos como modelo de estudio
☁
Tiempo corto de generación
☁
☁
☁
☁
Pueden reproducirse hasta cada 20 minutos
Buenos para estudiar mutaciones
Se pueden estudiar un gran número de células idénticas
Tamaño pequeño
☁
Permite estudiar grandes poblaciones
☁
Tamaño pequeño de su genoma
☁
Diversidad nutricional
Energía la nutrición y
Clasificación por
Redox
Luz
la quimiótrofos
fuente
de energía
fotótrofos
Carbono
Orgánico
CO2
quimioheterótrofos quimioautótrofos
O2
Animales,
protozoarios, hongos,
bacterias
Orgánico
CO2
Fotoheterótrofos
fotoautótrofas
Verdes no sulfurosas
Púrpuras no sulfurosas
Aceptor final de
electrones
No O2
Orgánico
Inorgánico
Streptococcus Clostridium
H2O
Fotosíntesis
Oxigenativa
No H2O
Fotosíntesis
Anoxigenica
verdes y púrpuras
sulfurosas
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