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Presentacin Carmen

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Uso del Escalamiento Multidimensional No-métrico (EMNM) sobre
medidas acústicas cualitativas de espectrogramas
Conference Paper · September 2017
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5 authors, including:
Mariana L Melcón
Ezequiel Andréu
Fundación Cethus
TURMARES, CÁDIZ, SPAIN
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Vocalizations of Commerson's dolphins View project
Echolocation of Franciscana dolphins View project
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SEE PROFILE
USO DEL ESCALAMIENTO
MULTIDIMENSIONAL NO-MÉTRICO
(EMNM) SOBRE MEDIDAS ACÚSTICAS
CUALITATIVAS DE ESPECTROGRAMAS DE
VARIAS ESPECIES DE CETÁCEOS
Carmen Molina, Patricia Pajuelo, Mariana Melcon, Ezequiel Andreu y Daniel Patón
INTRODUCCIÓN
El sonido es fundamental en el reino animal.
EL SONIDO
Velocidad
(λ)
En el mar el sonido se transmite casi 5 veces mas rápido
que por el aire.
Para los cetáceos el sonido es vital para poder realizar todas sus
actividades.
ECOLOCALIZACIÓN (Griffin, 1980)
PRODUCIÓN Y
EMISIÓN DEL
SONIDO EN LOS
ODONTOCETOS
EN LOS
MISTICETOS ES
DISTINTA (A
TRAVÉS DE LA
LARINGE)
(Reidenberg
y Laitman, 2007).
El efecto Doppler es el cambio de frecuencia
aparente de una onda producida por el
movimiento relativo de la fuente respecto a
su observador. Los cetáceos tienen que
acompasar la velocidad de natación y la
frecuencia de emisión para minimizar el
efecto Doppler. Esto les permite evitar a los
depredadores, especialmente a las orcas
(Patón et. al., 2014).
BIOACÚSTICA
Mejora tecnológica con el desarrollo de nuevas herramientas
digitales y de procesamiento de datos. Permiten avanzar en diversos
estudios (diversidad, poblaciones, evaluación de comunidades).
ESPECTROGRAMAS: consiste en la representación gráfica del
espectro de frecuencias de la emisión sonora.
La mayoría de los sistemas de detección de cetáceos se basan en la
utilización del espectrograma, ya que se trata de una transformación
tiempo-frecuencia con una sólida base matemática y resulta
fácilmente interpretable.
DISTANCIAS MATEMÁTICAS
 Distancia o métrica: función matemática que mida la longitud entre dos puntos
cualquiera con las propiedades:
No negatividad/Simetría/Desigualdad triangular/Identidad de los indiscernibles
 Similaridades y disimilaridades más flexibles que las distancias (no desigualdad
triangular)
 Similaridad (S) y disimilaridad (D)medidas recíprocas (S= 1-D) e inversas (S= 1/D)
ESCALAMIENTO MULTIDIMENSIONAL NO MÉTRICO (EMNM)
 Determina la proximidad entre un grupo de elementos reduciendo el número de
dimensiones.
 Realiza iteraciones para explicar las distancias observadas en base a unas
similaridades predichas mediante un número de ejes.
 La diferencia global entre las similaridades/disimilaridades observadas y las
distancias de la ordenación son determinadas mediante una función de estrés
(Stress: suma de cuadrados de los errores normalizados -modelos curvos-).
 Permite análisis de datos sin que sean estrictamente cuantitivos (rangos).
Análisis EMNM basado en distancias matemáticas, en base a
la acústica de cetáceos registradas en espectrogramas.
OBJETIVOS
Proponer una nueva
metodología para el estudio
de los cetáceos.
Comprender mejor su
comportamiento.
MATERIAL Y MÉTODOS
Moby Sound
http://www.mobysound.org/
Voices in the Sea
http://cetus.ucsd.edu/voicesinthesea_org/
Macaulay Library
http://macaulaylibrary.org/
Watkins Marine Mammal Sound http://cis.whoi.edu/science/B/whalesounds/index.cfm
Database
Dolphins Embassy
https://soundcloud.com/dolphinembassy
Tabla 1. URL de las bases de datos acústicas de cetáceos.
Grampus
griseus
Balaena
mysticetus
Delphinus
delphis
Physeter
macrocephalus
Globicephala
macrorynchus
Registro de audio: Especies
MISTICETOS
Familia Balaenidae:
Balaena mysticetus
Eubalaena australis
Eubalaena glacialis
Familia Eschrichtiidae:
Eschrichtius robustus
M. novaeangliae
Familia Balaenopteridae:
Subfamilia Balaenopterinae:
Balaenoptera acutorostrata
Balaenoptera borealis
Balaenoptera edeni
Balaenoptera musculus
Balaenoptera physalus
Subfamilia Megapterinae:
Megaptera novaeangliae
B. musculus
ODONTOCETOS
Familia Monodontidae:
Delphinapterus leucas
Monodon monoceros
Familia Physeteridae:
Kogia breviceps
Kogia sima
Physeter macrocephalus
Familia Platanistidae:
Inia geoffrensis
Lipotes vexillifer
Platanista gangetica
Pontoporia blainvillei
P.gangetica
Familia Ziphiidae:
Berardius arnuxii
Berardius bairdii
Hyperoodon ampulatus
Mesoplodon densirostris
Ziphius cavirostris
P. macrophalus
Familia Delphinidae:
 Subfamilia Cephalorhynchinae
Cephalorhynchus commersoni
Cephalorhynchus eutropia
Cephalorhynchus heavisidii
Cephalorhynchus hectori
Grampus griseus
 Subfamilia Delphininae
Delphinus capensis
Delphinus delphis
Feresa attenuata
Globicephala macrorhynchus
Globicephala melas
Lagenodelphis hosei
Lagenorhynchus acutus
Lagenorhynchus albirostris
Lagenorhynchus obliquidens
Lissodelphis borealis
Neophocaena phocaenoides
Seewave R package
DISTANCIAS
MATEMÁTICAS
MATRIZ
59 especies
16 variables
Espectrograma
Stenella coeruleoalba
EMNM
Vegan R package
Variables
cuantitativas
Variables cuantitativas
DISTANCIA
ZONA
PELÁGICOS
VELOCIDAD
PROFUNDIDAD
LONGITUD
PESO
CONDICION
GRUPO
LONGEVIDAD
BENTOS
ABISALES
OTROS
KRILL
CRUSTÁCEOS
BENTOS
CRUSTÁCEOS
PLANCTON
CEFALÓPODOS
PECES
PELÁGICOS
PECES
ABISALES
PECES BENTOS
PECES RÍOS
MOLUSCOS
CETACEOS
FOCAS
TIBURONES
RAYAS
NUTRIAS
TORTUGAS
HUEVOS
RECURSOS
TALLA PRESA
ESTRELLAS
HOLOTURIAS
Clicks de Physeter macrocephalus
Clicks estrechos de Tursiops australis
Clicks multibanda discontinuos
Ziphius cavirostris
Creaks de Cephalorynchus
commersonii
Silbido de Delphinus capensis
Pulso de Balaenoptera musculus
Pulso multifrecuencia
Balaenoptera acusturostrata
Pulso continuo de
Balaena mysticetus
Zumbido de Lissodelphis borealis
Zumbido multifrecuencia de
Delphinapterus leucas
Infrasonido de Balaenoptera edeni
Ultrasonido de Lagenorhynchus
obliquidens
Simultaneidad de estructuras
sonoras Phocoena phocoena
Espacio acústico uniforme de
Mesoplodon densirostris
Variabilidad intraespecífica
( -25%, 25-50%, 50-75%, +75%)
RESULTADOS
ANÁLISIS CUALITATIVO DE ESPECTROGRAMAS
Destacamos características más COMUNES:
• CLICKS: TODAS LAS ESPECIES.
• SILBIDOS:TODAS LAS SPP MENOS P. macrocephalus.
• INFRASONIDOS:TODAS LAS ESPECIES.
• SIMULTANEIDAD DE ESTRUCTURAS SONORAS
EXCEPTO EN P. macrocephalus.
Variabilidad de la función de estrés en función de la
distancia matemática y el número de ejes del EMDN.
DISTANCIA DE GOWER
Estrés de la distancia elegida respecto a número de ejes.
Distancia de ordenación
Ajuste no métrico R²= 0,967
Ajuste lineal R²= 0,863
Disimilaridad observada
Gráfica de Shepard. Modelo de ajuste más adecuado.
Parámetros más significativos de
EMNM1 y EMNM2:
•
•
•
•
•
LONGITUD
PESO
CONSUMO DE CEFALÓPODOS
CONSUMO DE PECES PELÁGICOS
TALLA DE LA PRESA
Parámetros acústicos y factores del EMNM
Parámetros y especies en el EMNM
Gráfico de estrés de las variables en la ordenación.
Gráfico de estrés de las especies en la ordenación.
DISCUSIÓN
 La variabilidad sonométrica es una característica propia de la especie.
 Separación de clicks (estrechos y multibanda discontinuos) y zumbido multifrecuencia.
 Variables cualitativas podrían ser usadas en futuros estudios a nivel intraespecífico.
 Solo dos ejes explican 96,7% de la variabilidad observada.
 El EMNM es la mejor técnica debido a su flexibilidad.
 La Distancia de Gower es la que mejor se ajusta a nuestros datos por sus propiedades.
 Caracteres para separar especies: pulsos y zumbidos (relacionados con el tamaño de la
especie y con el tipo de presa por estrategias de ecolocalización).
 Pulsos: grandes ballenas y delfines de río.
 Zumbidos: especies de alimentación en aguas profundas o tropicales (B. edeni).
 Ultrasonidos: especies grupales que comen cefalópodos y peces pelágicos
 Análisis multivariantes separan funcionalidades distintas, ideales para explicar enfoques
multiespecíficos (permite asignar variables concretas a especies concretas).
 Metodología sencilla que puede ser usada para estudiar las especies a nivel poblacional o
individual en estudios posteriores.
CONCLUSIONES
El análisis de EMNM usando distancias
matemáticas en base a la acústica de cetáceos
es un método útil para obtener nuevos datos
sobre estas especies. Esta metodología podría
usarse en futuros estudios.
Separamos especies en función de sus
emisiones relacionadas con sus estrategias
alimenticias y aportamos nuevas características
sonométricas, interesante para próximos
estudios.
BIBLIOGRAFÍA
 Griffin D. (1980) The Early History of Research on Echolocation. Animal
Sonar Systems 28:1-8
 Patón D., Reinosa R., Galán M.C., Lozano G. y Manzano M. (2014)
Maintaining of low Doppler shifts in cetaceans as strategy to avoid
predation. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology 455:
50–55
 Reidenberg S.J. y Laitman T.J. (2007) Discovery of a low frequency
sound source in mysticeti (Baleen Whales): anatomical establishment of
a vocal fold homolog. The Anatomical Record 290:745–759
 Oksanen, J. (2011) Multivariate analysis of ecological communities in R:
vegan tutorial. R package version 1.17-7 (http://vegan.r-forge.rproject.org/)
GRACIAS POR SU ATENCIÓN
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