UNIVERSIDAD SANTO TOMÁS Química (Qui-006) Proteínas Córdova, Benjamín Gacitúa, Richard Sanzana, Anastasia Valdebenito, Sebastián Vielma, Támara Cigarroa, Camila Los Ángeles, Chile, 28 de noviembre, 2018 Índice Portada………………………………………………………………………………………………1 Índice………………………………………………………………………………………...………2 Introducción…………………………………………………………………………………………3 Proteínas, estructura, función y clasificación……………………………………………………4 Enlace peptídico…………………………………………………………………………………….8 pH y desnaturalización……………………………………………………………………………..9 Conclusión…………………………………………………………………………………………10 Referencias bibliográficas………………………………………………………………………..11 Introducción En este informe se dará a conocer la estructura, funciones y clasificación de las proteínas; biomoléculas formadas por aminoácidos, como su unidad básica. Las proteínas son macromoléculas fundamentales que están presente en casi todos los procesos biológicos, ya sean reacciones de síntesis o de degradación, púes las enzimas, en su mayoría tienen un origen o naturaleza proteica1. Según lo mencionado, estos polímeros orgánicos naturales1, pueden tener diversas funciones, como transporte, enzimáticas, defensa, estructural, entre otras. Éstas dependen de su estructura (radical libre, sustancias adheridas como oligosacáridos, iones, etc.), lo que determina su especificidad2. Muchas de las reacciones metabólicas requieren condiciones específicas, cuando éstas no se cumplen, no sólo se ve afectado el proceso biológico, sino que también la misma estructura especializada se “desnaturaliza”. El pH óptimo permite un funcionamiento altamente eficaz, rápido y seguro2. También, factores como la temperatura afectan al metabolismo, por ende, la proteína. Proteínas, estructura, función y clasificación Proteínas: Polímeros orgánicos de gran peso molecular, son el producto de uno de los procesos más importantes; la transducción2. Son las moléculas más abundantes en los procesos biológicos y se encuentran en todas las partes de una célula. Una célula puede producir una gran cantidad y diversidad de proteínas, como el producto de la expresión genética, y así llevar a cabo todas las reacciones metabólicas2. Todas las proteínas están constituidas por el ordenamiento o combinación de los veinte aminoácidos esenciales, unidos por enlaces peptídicos para satisfacer las necesidades biológicas1. Las proteínas determinan propiedades físicas en los alimentos que se consumen, percepción de los sabores, aspectos, textura (en función a los sentidos). Además de características como absorción de agua o aceite, formación emulsionante, geles y espumas3. Historia de las proteínas El término proteína deriva del griego "proteos" (lo primero, lo principal) y habla de su gran importancia para los seres vivos4. Con el tiempo se descubrió el material genético, los ácidos nucleicos como las biomoléculas más esenciales, las proteínas fueron desplazadas al segundo lugar en importancia, pero siguen siendo las más abundantes. Para identificar y tener una base de datos más ordenada y sencilla se llegó al consenso de la abreviación en tres letras, ejemplo; Metionina (Met). Rechazando la idea de una sola letra de Margaret Oakley2. La similitud de secuencias de aminoácidos (estructura primaria) de proteínas homólogas, implica parentesco entre las especies (en base a la evolución). La estructura secundaria se descubrió al analizar proteínas fibrosas, que son más simples, usando la técnica de difracción de rayos X (basada en la capacidad de los átomos de difractar los rayos X en función a su tamaño. Tiempo después la microscopía electrónica reveló las estructuras repetitivas de las proteínas fibrosas eran susceptibles de análisis mediante esta técnica. Aun así, se proporcionaron datos referentes a la reiteración de unidades y la periodicidad fija a lo largo de las estructuras, cosa qué no se podía determinar en las cadenas de polipéptidos, por lo que se concluyó que el plegamiento de las cadenas debe ser de manera regular4. El empleo de la difracción de los rayos X en pequeños péptidos en un estado cristalino (más ordenado) pudo dar a conocer la estructura íntima del enlace peptídico, se observó que el enlace C-N es más corto de lo que debiese, así se pudo deducir que el aminoácido posee un carácter parcial de doble enlace (debido al nitrógeno, éste tiene un orbital vacante que le permite compartir en resonancia un par de electrones del doble enlace C-O) el cual impide que el enlace gire sobre sí mismo4. El grupo amino es codiciado en la industria de la alimentación, la hidrólisis es utilizada para obtener una fuente de nitrógeno para la formulación de dietas enterales en niños y adultos enfermos3. Aminoácido Unidad fundamental que determina la estructura de la proteína, por ende, su función. Compuesto por un carbono central, presenta dos grupos funcionales, el grupo amino y el carboxilo. Un átomo de hidrógeno y un radical libre que puede ser un ion, otro grupo funcional, hidratos de carbono, entre otros1. El radical libre proporciona la diferenciación del aminoácido, varía la estructura, carga y solubilidad frente al agua (polaridad). El grupo R´en conjunto con el ordenamiento de los veinte aminoácidos esenciales contribuyen a la especificidad y función2. Existen más aminoácidos que se encuentran en menor cantidad y son menos frecuentes. Las pequeñas secuencias aminoacídicas inactivas dentro de una proteína, pueden ser liberadas tras la hidrólisis proteica y ejercer diversas actividades como; sustancias opioides, opioides antagonistas, inmunomoduladoras y transportadoras de iones3. Estructura: La estructura determina las propiedades y funciones. Todas las proteínas poseen una estructura química central, la cual corresponde a la cadena lineal de aminoácidos, sólo difiere la combinación y orden de éstos2. Organización estructural según su complejidad: Estructura primaria: Cadena lineal de aminoácidos; enlaces covalentes (enlace peptídico y puentes disulfuro)2. Se escribe empezando por el extremo amino terminal y finalizando por el carboxi-terminal, la estructura primaria se basa en los grupos amino y carboxilo, el grupo radical e hidrógeno no forman parte del enlace peptídico4. Estructura secundaria: Disposición estable (espontánea) de la cadena de polipeptídica. Plegamientos repetitivos que siguen una determinada dirección; alfa hélice (debido a los enlaces de hidrógeno intramoleculares; tiene una forma similar a una barra) y lámina plegada beta (su forma casi extendida por sus enlaces de hidrógeno intermoleculares). Los puentes de hidrógeno juegan el papel importante en la disposición bidimensional característica de la estructura secundaria1. Muchos estudios con rayos X, han permitido identificar que ciertas proteínas como la hemoglobina, es en realidad una gran extensión alfa helicoidal1. Estructura terciaria: La cadena polipeptídica completa se pliega en el espacio, formando una estructura tridimensional, donde los aminoácidos apolares se sitúan hacia el interior y los polares hacia el exterior. La estructura primaria está estabilizada mediante la acción de fuerzas de dispersión, enlaces de hidrógeno y otras fuerzas intermoleculares. Pueden ser fibrilares como el colágeno o globulares1. Estructura cuaternaria: Deriva de la interacción de dos o más cadenas para formar una proteína más compleja, posee propiedades distintas a los monómeros que la componen, ejemplo de estructura cuaternaria es la hemoglobina que se compone por cuatro subunidades o estructuras terciarias (cadenas polipeptídicas separadas) unidas por fuerzas de Van der Waals y fuerzas iónicas (fierro)1. Función: Depende de su estructura. Las proteínas son las macromoléculas más versátiles de la materia viva: desempeñan un elevado número de funciones biológicas diferentes. Cada proteína está especializada en llevar a cabo una determinada función. De las cuales cabe destacar las siguientes: catalíticas, estructurales, de transporte y de reserva, contráctiles, de defensa, reguladoras del metabolismo, entre otras4. La función catalítica o degradación, las proteínas como enzimas interaccionan de forma específica con la sustancia a degradar. La función de resistencia o función estructural de las proteínas también es de gran importancia ya que las proteínas forman tejidos de sostén y relleno que confieren elasticidad y resistencia a órganos y tejidos. El transporte es importante, ya que se necesita llevar ciertas sustancias a otros lugares del organismo de manera segura sin que se degraden en el camino. Como reserva de aminoácidos en el desarrollo del embrión. También presente en la contracción muscular a través de la miosina y actina. Otra función como la creación de anticuerpos para regular los factores externos que pueden ser nocivos. Y la función hormonal, hormonas de origen proteico como la insulina2. Clasificación: Holoproteínas Son aquellas que solo están compuestas por aminoácidos, pueden ser globulares como la hemoglobina o fibrosas como el colágeno2. Las globulares están presentes en los lácteos, carbohidratos y en la sangre. Las fibrosas se pueden encontrar en los tendones, ligamentos, membranas sinoviales y cápsulas articulares. Además del cabello, plumas y uñas2. Heteroproteínas Son aquellas que se unen a otra biomolécula o grupo no proteico para desempeñar una función2. Según el grupo no proteico se clasifican: Glucoproteínas, presentes en la composición de cartílagos, huesos, membranas celulares, también como sustancias hormonales; Hormona Luteinizante, y anticuerpos de la sangre2. Lipoproteínas, que se encargan del transporte de triglicéridos, colesterol y otros lípidos 2. Nucleoproteínas, relacionadas con los ácidos nucleicos. Forman complejos estables y permanentes, en cambio las otras proteínas se relacionan con las otras estructuras y pueden separarse según la situación. Un ejemplo por excelencia; las histonas que se entrelazan con la cromatina2. Cromoproteínas, las proteínas relacionadas con un pigmento, como la hemocianina que da el color azulado de los crustáceos2. Enlace peptídico Los aminoácidos se unen entre sí a través de los enlaces peptídicos. Estas uniones se forman por la reacción de síntesis (vía deshidratación; se libera una molécula de agua por cada unión sintetizada) entre el grupo carboxilo del primer aminoácido con el grupo amino del segundo aminoácido. A esta reacción se le denomina reacción de condensación, que resulta característica de los polímeros1. N- terminal se refiere al extremo proteico que posee un grupo amino libre. Hasta C-terminal o carboxilo terminal sin reaccionar2. pH y desnaturalización Los aminoácidos se diferencian en sus propiedades ácido-base y tienen curvas de titulación características. Los aminoácidos con grupos R´ no ionizables, son ácidos dipróticos a pH bajo y existen en diversas formas diferentes al ir aumentando el pH. Los aminoácidos con grupos R´ ionizables poseen especies iónicas adicionales, que dependen del pH del medio y del pKa, del grupo R´2. El pH es un factor determinante, afecta la estructura de la proteína y así su función, por lo que está, cuando se habla de enzimas, no pueden cumplir sus actividades si el pH no es el óptimo1. La “desnaturalización” se define como la pérdida de la estructuras secundarias, terciarias o cuaternarias, cuando el pH no es el indicado, la proteína tiende a desnaturalizarse. Bajo circunstancias leves, ésta puede retornar a su estado biológico normal (fenómeno de desnaturalización reversible)1. Los efectos del pH incluso pueden alcanzar la ruptura de los enlaces peptídicos, como suele ocurrir en procesos de la industria alimenticia; realizando una hidrólisis enzimática, a altas temperaturas (40 a 60 grados Celsius) a valores de 4-8 de pH puede obtenerse los monómeros para la producción de suplementos alimenticios basados en nitrógeno3. Conclusión Las proteínas son biomoléculas sumamente importantes para el desarrollo óptimo de las actividades metabólicas, por eso y otras razones, éstas son las más abundantes en el organismo, constituyen la mayor cantidad del peso molecular dentro de las células. Se encargan de comunicar y transmitir la expresión genética, y así mantener los procesos vitales. Conocer su estructura es esencial para determinar la función que éstas desempeñarán en el organismo, los estudios en el ámbito de la química, biología y ciencias naturales en general permiten la comprensión del funcionamiento proteico de manera integral. Las condiciones óptimas deben mantenerse en equilibrio, los factores que puedan alterar su estructura se les denomina agentes desnaturalizantes. Para comprender estas moléculas es necesario tener disposición, porque hay una gran cantidad de términos y reacciones involucradas, cabe destacar que los procesos biológicos son complejos, porque el ser humano es un organismo complejo. Y las acciones cotidianas son simples según la perspectiva del mundo macro, sin el gran ordenamiento no se podrían realizar las actividades metabólicas. Referencias Bibliográficas 1. Chang. Polímeros orgánicos sintéticos y naturales. En: Toledo, M. Química. 10a Edición. México: Editorial Mc Graw Hill;2010. p.1060-1089. 2. Lehringer. Estructura y catálisis. En: Geller, E. Principios de Bioquímica. 6ª Edición. España: Editorial omega; 2009. p. 41-419. 3. Benitez, R. Hidrolizados de proteína: procesos y aplicaciones. Acta Bioquím Clín Latinoam [Internet] 2008 [27 de dic 2018]; 42 (2): p. 227-236. Disponible en: https://www.researchgate.net/publication/262552066_Hidrolizados_de_proteina_Procesos _y_aplicaciones 4. Segovia, L. Evolución experimental de proteínas. Indd. [Internet] 2007 [27 de dic 2018]; 14 (3): p. 291-302 Disponible en: http://www.ibt.unam.mx/computo/pdfs/libro_25_aniv/capitulo_26.pdf