ESTUDIO DE LOS SERES VIVOS A NIVEL MOLECULAR. NOCIONES DE BIOQUÍMICA. Los seres vivos están formados por moléculas químicas, llamadas principios inmediatos. Reciben este nombre porque pueden ser separados de la materia por procedimientos puramente físicos. Los principios inmediatos inorgánicos son: el agua y las sales minerales. Los principios inmediatos orgánicos son: los glúcidos, los lípidos, las proteínas y los ácidos nucleicos. EL AGUA Es un disolvente universal, que permite que se lleven a cabo en ella todas las reacciones que se dan en los seres vivos y por lo tanto todos los procesos vitales. Por esta razón tanto los líquidos intracelulares (que se encuentran en el interior de las células), como los extracelulares (que rodean a las células), son disoluciones acuosas. Una elevada proporción de los seres vivos es agua. En los primates, entre los que nos incluimos, la proporción es de un 70 %. En organismos acuáticos, como las medusas puede llegar a ser un 90 % y en semillas en estado de latencia es solo del 10 %. Además de ser un disolvente universal, el agua cumple otras muchas funciones, entre otras destaca que es también un buen regulador térmico. Es menos densa en estado sólido y ello preserva los ecosistemas acuáticos al flotar el hielo y permitir que la vida se desarrolle por debajo. El agua tiene su máxima densidad a 4º C. LAS SALES MINERALES Son sustancias inorgánicas como cloruros, fosfatos, carbonatos y sulfatos de Na, K, Ca y Mg. En los seres vivos pueden hallarse como sales precipitadas o más frecuentemente se encuentran en disolución disociadas en aniones y cationes. Aniones: Cl-, HPO4=, H2PO4-, HCO3-, SO4= Cationes: Na+, K+, Ca2+, Mg2+ Las sales minerales cumplen varias funciones en los seres vivos: 1. Algunos cationes como el Na+, K+, Ca2+ son imprescindibles para el correcto funcionamiento de los sistemas nervioso y muscular. 2. Son reguladoras del pH, puesto que los aniones tienden a captar protones y disminuyen por lo tanto en pH. Recordad que un ácido es toda sustancia capaz de ceder protones (H+) al medio. La acidez de un medio se cuantifica con el pH o presión de hidrógeno, que nos indica en una escala logarítmica la cantidad de protones (H+) que hay en el medio. El pH se define como: pH= -log [H+] Se mide en una escala que va de 1 a 14. Un medio es ácido si el pH está comprendido entre 1 y 6,9. Tiene exceso de protones. Un medio es neutro si tiene un el pH de 7. Un medio es básico o alcalino si el pH está comprendido entre 7,1 y 14. Tiene déficit de protones. 5 3. Las sales son también componentes estructurales de los seres vivos. Por ejemplo, los fosfatos de calcio forman parte de los huesos de los vertebrados. Se encuentran en alimentos ricos en calcio como los productos lácteos (leche, yoghurt, queso etc.). El carbonato cálcico CaCO3, forma el exoesqueleto de muchos invertebrados como corales y foraminíferos. LOS GLÚCIDOS (Glycos=dulce) Son principios inmediatos orgánicos formados por C, H y O. Reciben también el nombre de hidratos de carbono, porque tienen el H y el O en la misma proporción que el agua. Desde el punto de vista químico, los glúcidos poseen varios grupos OH (alcohol) y un grupo –C=O (carbonilo), que puede ser aldehido o cetona. Existen tres tipos principales de glúcidos: 1. Monosacáridos. Son los glúcidos más sencillos, de menor Mr. Sus moléculas no son hidrolizables. La hidrólisis (hidros=agua, lisis=ruptura) es una reacción que produce la ruptura de las moléculas incorporando una molécula de agua. Se dan reacciones de hidrólisis en el aparato digestivo para descomponer las moléculas de gran tamaño en moléculas de pequeño masa molecular relativa. Los monosacáridos pueden tener de 3 a 6 carbonos, los más frecuentes tienen 5 ó 6 carbonos y reciben el nombre de pentosas y hexosas. Monosacáridos más importantes: Ribosa, forma parte del RNA o ácido ribonucleico. C5H10O5 Glucosa C6H12O6 Desoxirribosa, forma parte del DNA o ácido desoxirribonucleico. C5H10O4 Galactosa C6H12O6 6 Fructosa C6H12O6 Los monosacáridos son de color blanco, de sabor dulce, facilmente cristalizables y solubles en agua. 2. Disacáridos (di=dos). Están formados por dos monosacáridos. Por hidrólisis, por lo tanto, originan dos monosacáridos. Los más importantes son: Maltosa (glu + glu): formada por dos moléculas de glucosa. Es el azúcar de malta y se obtiene también por hidrólisis del glucógeno y del almidón. Lactosa (gal + glu): formada por una molécula de galactosa y una de glucosa. Es el azúcar de la leche y no existe en ninguna otra fuente natural. Sacarosa (glu + fruc): está formada por una molécula de glucosa y otra de fructosa. Es el azúcar de caña o de remolacha que consumimos habitualmente (azúcar de mesa). Los disacáridos son también de color blanco, de sabor dulce, fácilmente cristalizables y solubles en agua. Los que hemos vista tienen por formula bruta (no desarrollada) C12H22O11, es decir dos hexosas sumadas menos una molécula de agua. 3. Polisacáridos (poli=muchos). Están formados por muchos monosacáridos. Por hidrólisis, por lo tanto, originan muchos monosacáridos. Los más importantes son: Almidón (glu +glu + glu +glu +glu...): formado por muchas moléculas de glucosa. Es la reserva de glucosa en los vegetales. Como sabemos, durante a fotosíntesis las plantas sintetizan glucosa, que después se polimeriza a almidón. Es decir, el almidón es el producto final de la fotosíntesis: 6 CO2 + 6 H2O + energía solar → C6H12O6 + 6 O2 dióxido de carbono agua glucosa oxígeno ↓ almidón Reacción global de la fotosíntesis o función clorofílica. (cloroplastos) Los polisacáridos de origen vegetal abundan en las harinas y féculas de cereales (trigo, cebada, centeno, maíz...), legumbres (garbanzos, alubias, lentejas...), frutos secos (nueces, avellanas, almendras, castañas...) etc. Son también de color blanco, pero no son solubles en agua (forman únicamente disoluciones coloidales) y no cristalizan con facilidad. Glucógeno (glu +glu + glu +glu +glu...): formado también por muchas moléculas de glucosa. Es la reserva de glucosa en los animales. Se encuentra sobre todo en el hígado y en los músculos. Celulosa (glu +glu + glu +glu +glu...): está formada también por muchas moléculas de glucosa. Es un polisacárido estructural que constituye la pared de las células vegetales, que rodea a la membrana plasmática. El hombre no puede digerir la celulosa y constituye juntos con otros componentes la fibra dietética. Como no se puede digerir estimula los movimientos intestinales a la vez que retiene agua. Por ello tienen una función laxante, es decir, favorece la evacuación de las heces y evita el estreñimiento. Los rumiantes (herbívoros) si pueden digerir la celulosa gracias a las celulasas que fabrican bacterias que viven en simbiosis en su aparato digestivo (rumen). Astringente: que estriñe. Laxante: que favorece la evacuación de las heces. Herbívoro: se escribe la primera con “b” porque viene de “hierba” y la segunda con “v” del verbo “devorar”. 7 Función de los glúcidos: - Función energética: los monosacáridos producen energía cuando se oxidan hasta H2O y dióxido de carbono CO2. C6H12O6 + 6 O2 Glucosa → 6 CO2 + 6 H2O + energía (32 moléculas de ATP). oxígeno dióxido agua de carbono Reacción de la respiración. (mitocondrias) - Función estructural: la ribosa (que forma parte del RNA), la desoxirribosa (que forma parte del DNA) y la celulosa (que forma la pared de las células vegetales), poseen esta función. - Función de reserva de energía: cumplen esta función los disacáridos y sobre todo los polisacáridos como por ejemplo el almidón y el glucógeno, que son reserva de glucosa. El almidón es la reserva de glucosa en los vegetales y el glucógeno es la reserva de glucosa en los animales. LOS LÍPIDOS Son principios inmediatos orgánicos de composición química heterogénea que tienen en común el ser insolubles en agua y solubles en sustancias orgánicas como cloroformo, éter, alcohol etc. Los grupos más importantes son: Grasas: pueden ser de origen animal o de origen vegetal. En los animales constituyen el tejido adiposo, formado por adipocitos, que contienen en el citoplasma una gran gota de grasa. Las grasas de origen animal contienen ácidos grasos saturados, sin dobles enlaces carbono-carbono y son sólidas a temperatura ambiente. Reciben el nombre de sebos, manteca, tocinos, mantequilla. Ejemplo de ácido graso saturado: CH3-(CH2)14-COOH ácido palmítico. P. fusión: 63,1 º C Las grasas de origen vegetal son líquidas a temperatura ambiente porque contienen ácidos grasos insaturados, con dobles enlaces carbono-carbono. Reciben el nombre de aceites. Ejemplo de ácido graso insaturado: CH3-(CH2)7-CH=CH-(CH2)7-COOH ácido oleico. P. fusión: 13,1 º C La función de las grasas es la de reserva de energía. También cumplen funciones de aislamiento térmico y protección. Fosfolípidos: son lípidos que tienen en su molécula una molécula incorporada de H3PO4 o ácido fosfórico. También tienen ácidos grasos*. Son muy importantes, porque junto con las proteínas forman las membranas celulares, tanto la membrana plasmática de la célula como las membranas de los distintos orgánulos (de células animales y vegetales). Es decir, las membranas celulares son de naturaleza lipoproteica. 8 Esteroides: son un grupo de lípidos de composición muy diferente a los anteriores, químicamente son derivados del anillo esteroideo. Pertenecen a este grupo algunos lípidos de la membrana plasmática de las células como el colesterol. También pertenecen a este grupo la Vitamina D(1) (antirraquítica) y algunas hormonas, como las hormonas(2) sexuales segregadas por las gónadas (ovarios y testículos) y las hormonas de la corteza de las glándulas suprarrenales (glándulas que se encuentran encima de los riñones). (1) Buscad la función, las características y las fuentes de las Vitaminas A, B1, C, D, K, E. Escribir tres o cuatro líneas de cada una de ellas y estudiadlas. (2) Una hormona es una sustancia segregada por glándulas del organismo, llamadas glándulas de secreción interna o endocrinas, que vierten sus productos al líquido extracelular y de ahí son recogidas por la sangre y repartidas por todo el organismo. Ejercen su función sobre determinadas células del organismo, que modifican su metabolismo por acción de la hormona. Terpenos: son un grupo de lípidos muy diferente de los anteriores, con distinta estructura química. Pertenecen a este grupo algunos pigmentos vegetales, como los carotenos (pigmentos anaranjados de las plantas) y las xantofilas (pigmentos amarillos de las plantas). También pertenecen a este las vitaminas A, K y E. LAS PROTEÍNAS Son principios inmediatos orgánicos formados por C, O, H y N. Casi todas contienen también S. Químicamente todas las proteínas están formadas por unas moléculas de pequeño masa molecular relativa que reciben el nombre de aminoácidos (a.a.). La formula general de un aminoácido es: R es H para la glicina NH2 | R-C-COOH | R es CH3 para la alanina H Existen un total de 20 a.a. que forman todas las proteínas de todos los seres vivos. Cada proteína se diferencia de las otras por el número, el tipo y el orden de los a.a. que la forman. Las proteínas suelen tener un gran masa molecular relativa, son macromoléculas. Se consideran proteínas si tienen un Mr mayor que 10000 o un número de a.a. mayor que 100. Si una cadena de a.a tiene un Mr<10000 o un nº de a.a.<100 recibe el nombre de péptido. Las propiedades de las proteínas dependen de su forma espacial, es decir de cómo se pliegue en el espacio la cadena de a.a. La forma más estable posible recibe el nombre de conformación nativa. La pérdida de esta conformación se llama desnaturalización y ocasiona la pérdida de las propiedades de la proteína. - En general, por su forma, existen dos grandes grupos de proteínas: Proteínas fibrosas, de forma alargada. Por ejemplo, es una proteína fibrosa la queratina, proteína animal que forma el pelo, las uñas, la epidermis de la piel, las pezuñas, las cornamentas etc.). Proteínas globulares, de forma redondeada. Por ejemplo: la hemoglobina, las inmunoglobulinas. 9 Funciones de las proteínas Las proteínas cumplen una gran cantidad de funciones, entre las que destacan las siguientes: - Enzimas. En los seres vivos se dan una gran cantidad de reacciones bioquímicas, cuyo resultado es la formación, el desarrollo y el crecimiento de cada individuo. El conjunto de estas reacciones recibe el nombre de metabolismo. Todas las reacciones que se dan en los seres vivos son posibles a que cada una de ellas está catalizada por una proteína enzimática (enzima). Un catalizador es una molécula que aumenta la velocidad de reacción, pero en el caso de los seres vivos se puede decir que el enzima hace posible la reacción, ya que sin las proteínas enzimáticas la velocidad de reacción sería tan pequeña que la vida no sería posible. De modo que todo lo que es un ser vivo (todos los caracteres que presenta) es el resultado de la actuación de las proteínas enzimáticas que posea. A su vez esas proteínas enzimáticas se sintetizan siguiendo las instrucciones contenidas en el DNA, es decir, el DNA dicta el tipo, el orden y el número de a.a. que debe tener una determinada proteína. Por ello, los genes determinan los caracteres de un ser vivo. - Elementos estructurales. Muchas proteínas forman parte de la célula o de los líquidos extracelulares. Son proteínas estructurales las proteínas de la membrana (recordad que las membranas celulares son de naturaleza lipoproteica). Son también proteínas estructurales la queratina, el colágeno y la elastina. - Elementos de transporte. Muchas proteínas transportan átomos o determinados grupos químicos a través del organismo. Por ejemplo, la hemoglobina es una proteína que transporta O2 y CO2. - Anticuerpos (Ac). Los vertebrados saben reconocer como extrañas distintas sustancias ajenas al organismo. Estas sustancias pueden ser inorgánicas o bien pertenecer a otro ser vivo, es decir, pueden ser cualquier tipo de molécula. Reciben el nombre de Antígenos (Ag). Se define un antígeno como una sustancia que introducida en un organismo da lugar a la síntesis de Anticuerpos. Es decir, cuando un antígeno penetra en el interior de un ser vivo, éste reacciona formando anticuerpos, sustancias de naturaleza proteica capaces de reaccionar con el antígeno y neutralizarlo. Todos los anticuerpos son proteínas y reciben también el nombre de Inmunoglobulinas. Las Inmunoglobulinas son fabricadas por las células plasmáticas, que se forman por maduración de linfocitos. - Hormonas. Ya sabemos que las hormonas son segregadas por glándulas de secreción interna o endocrinas, son vertidas al líquido extracelular y son recogidas por la sangre que las reparte por todo el organismo. Muchas hormonas son de naturaleza proteica, como por ejemplo la insulina que disminuye el nivel de glucosa en sangre (es hipoglucemiante). 10 LOS ÁCIDOS NUCLEICOS Reciben este nombre porque se descubrieron en el núcleo de las células eucariotas (células con verdadero núcleo). Desde el punto de vista químico los ácidos nucleicos son moléculas de gran masa molecular relativa (macromoléculas), que están formadas por una sucesión de nucleótidos. Cada nucleótido está formado a su vez por: - Un azúcar monosacárido que puede ser ribosa para el RNA o desoxirribosa para el DNA. RIBOSA DESOXIRRIBOSA - Una molécula de ácido fosfórico H3PO4. - Una base orgánica nitrogenada que puede ser Adenina (A), Timina (T), Guanina (G), citosina (C) y Uracilo (U). La timina solo se encuentra en el DNA y el uracilo solo se encuentra en el RNA. Los nucleótidos se unen para formar los ácidos nucleicos de la siguiente manera: DNA RNA H3PO4 H3PO4 Desoxirribosa-A= T-Desoxirribosa H3PO4 H3PO4 Desoxirribosa-T= A-Desoxirribosa H3PO4 H3PO4 H3PO4 Ribosa-A H3PO4 Ribosa-U H3PO4 Desoxirribosa-G= C-Desoxirribosa H3PO4 H3PO4 Desoxirribosa-C= G-Desoxirribosa Ribosa-G H3PO4 Ribosa-C Existen dos tipos de ácidos nucleicos: el DNA ó ácido desoxirribonucleico y el RNA o ácido ribonucleico. El DNA se encuentra siempre en el núcleo y no sale de él. Químicamente tiene desoxirribosa y sus bases son, como acabamos de ver A, T, G y C. Además el DNA es una molécula doble, constituida por dos hebras o cadenas de polidesoxirribonucleótidos que se unen por medio de sus bases, que se enfrentan en el interior de la molécula, la A con la T y la 11 G con la C. Esas dos hebras o cadenas se enrollan hacia la derecha y forman la doble hélice de DNA cuyo descubrimiento les sirvió a Watson y Crik para obtener el premio Nobel en 1953. Cuando la célula está en reposo (no se divide), el DNA se encuentra en forma de una masa de filamentos enmarañados, en el interior del núcleo, que junto con proteínas recibe el nombre de cromatina. Cuando la célula se divide, ese material hereditario, el DNA y las proteínas (la cromatina) se organiza en unos cuerpos discretos, cuyo número y forma es característico de cada especie. Estos cuerpos reciben el nombre de cromosomas. En la especie humana tenemos 46 cromosomas. Este número recibe el nombre de número diploide o dotación cromosómica de la especie y se representa por 2n. Es decir, en la especie humana 2n=46, de los cuales 23 son de origen paterno (nos los ha dado nuestro papá) y otros 23 son de origen materno (nos los ha dado nuestra mamá). Se llama número haploide o guarnición cromosómica y se representa por n al número de cromosomas de un gameto (espermatozoide u óvulo). En la especie humana n=23 El RNA se forma en el núcleo sobre moléculas de DNA. La síntesis de RNA se hace de forma complementaria a una de las dos cadenas de DNA y recibe el nombre de transcripción. Después el RNA emigra al citoplasma donde será traducido a proteínas. Desde el punto de vista químico el RNA contiene ribosa, sus bases son A, U, C y G y sus cadenas son sencillas (no dobles). Existen tres tipos de RNA: - RNAm (mensajero). Es una molécula, copia de un fragmento de DNA, que se va a traducir a proteínas. Cada tres nucleótidos de RNA significan un aminoácido en una proteína. Según la secuencia de nucleótidos que tenga el RNAm se formará una u otra proteína. - RNAr (ribosomal). Se forma en el nucleolo del núcleo y luego emigra al citoplasma donde formará los ribosomas junto con proteínas. Los ribosomas son los orgánulos donde se sintetizan las proteínas. - RNAt (transferente). Las moléculas de RNAt son pequeñas y su función es unirse a los aminoácidos para transportarlos hasta los ribosomas, donde se unirán para formar proteínas. Como acabamos de ver, los ácidos nucleicos llevan la información para la síntesis de proteínas. Esta información está contenida en el DNA y protegida en el núcleo. Existe un código genético que es universal: tres bases nitrogenadas (o tres nucleótidos) del DNA determinan un aminoácido en una proteína. Según la secuencia de bases que posea el DNA de una determinada especie o de un individuo se formarán unas proteínas u otras, que caracterizarán a esa especie o a ese individuo. Estas proteínas, actuando como enzimas, determinarán los caracteres de cada especie o de cada individuo. Como el DNA no sale del núcleo, es una copia de él, el RNAm el que llevará el mensaje genético a los ribosomas del citoplasma, que como ya sabemos son los orgánulos en los que se sintetizan las proteínas. Los a.a. son llevados a los ribosomas por las moléculas de RNAt. Por último estos aminoácidos se unen para formar proteínas. Se estima que en el genoma haploide humano (en los gametos) existen unos 25000 ó 30000 genes, se desconoce el número de proteínas que se pueden formar, pero probablemente sea un número mayor. El proyecto Genoma Humano, en el que colaboran varios países, trata de identificar los genes (fragmentos de DNA que codifican proteínas) y las proteínas que resultan de la expresión de esos genes. 12