CÁTEDRA DE GENÉTICA GENERAL Y APLICADA Genética de Poblaciones 2016 El presente apunte corresponde a las clases teórico-prácticas: T-P 12............................................................................................................... pág. 4-21 T-P 13............................................................................................................... pág. 22-38 T-P 14............................................................................................................... pág. 39-57 Genética de poblaciones 2 Tabla de Contenidos GENÉTICA DE POBLACIONES ................................................................................................................4 Introducción: ....................................................................................................................................4 1- DESCRIPCIÓN DE LAS POBLACIONES: FRECUENCIAS FENOTÍPICAS, GENOTÍPICAS Y GÉNICAS ...5 1.1 Frecuencias fenotípicas y genotípicas ....................................................................................5 1.2 Pozo génico – Frecuencias génicas o alélicas .........................................................................6 1.3 Derivación de las frecuencias génicas a partir de las genotípicas .........................................7 1.4 Composición y estructura ......................................................................................................8 1.5 Estática y dinámica de las poblaciones: equilibrios y cambios ..............................................8 1.5.1 Los principios de Mendel en el nivel poblacional. .........................................................9 1.5.2 Derivación de la descendencia a partir del pozo génico ..............................................11 1.5.3 El equilibrio estático .....................................................................................................11 1.5.4 El Teorema de Hardy-Weinberg. El equilibrio estático ................................................12 1.5.5 Representaciones gráficas ...........................................................................................13 1.5.6 Los alelos recesivos raros y los portadores ..................................................................14 1.5.7 Alelos raros dominantes ..............................................................................................14 1.6 Equilibrio de Hardy-Weinberg y más de dos pares de alelos...............................................16 1.6.1 El Equilibrio ..................................................................................................................16 1.6.2 Aproximación al equilibrio ...........................................................................................16 2- MEDICIÓN DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA EN LAS POBLACIONES ...........................................19 2.1 Índice de polimorfismo ........................................................................................................19 2.2 Índice de heterocigosidad ....................................................................................................20 2.3 Similitud y distancia genética ...............................................................................................21 2.3.1 Similitud .......................................................................................................................21 2.3.2 Distancia genética ........................................................................................................21 3- APAREAMIENTOS. SISTEMAS DE APAREAMIENTOS ..................................................................22 3.1 Apareamientos aleatorios: Panmixia ...................................................................................22 3.2 Fenogamia: Apareamiento fenotípicamente selectivos o clasificados ................................23 3.2.1 Apareamiento clasificado (selectivo) positivo u homofenogamia (homo, semejante; gamia; unión) ........................................................................................................................23 3.2.2 Apareamiento clasificado (selectivo) negativo o heterofenogamia (hetero, diferente; gamia; unión) ........................................................................................................................23 3.3 Apareamientos según el parentesco: ..................................................................................24 3.3.1 Endogamia....................................................................................................................24 3.3.2 Exogamia ......................................................................................................................24 4- ESTIMACIÓN DE LA CONSANGUINIDAD .....................................................................................25 4.1 En genealogías......................................................................................................................25 Genética de poblaciones 3 4.1.1 Consanguinidad en genealogías irregulares ................................................................25 4.1.1.1 Coeficiente de parentesco o coascendencia.............................................................30 4.2 Consanguinidad en las poblaciones .....................................................................................32 4.2.1 Coeficiente de consanguinidad (F) ...............................................................................32 4.2.2 El coeficiente de consanguinidad referido a la población base ...................................33 4.2.3 Frecuencias genotípicas en la población total .............................................................33 4.2.4 Relaciones entre el número efectivo y el número real ................................................34 4.2.4.1 Número diferente de machos y hembras .................................................................34 4.2.4.2 Tamaño diferente en generaciones sucesivas ..........................................................35 4.2.4.3 Distribución desigual del tamaño de la familia .........................................................35 4.2.5 Equilibrio en poblaciones Alógamas y Autógamas ......................................................36 DINÁMICA DE LAS POBLACIONES ......................................................................................................39 5- SELECCIÓN..................................................................................................................................39 5.1 Aptitud y selección ...............................................................................................................39 5.2 Modelos de Selección ..........................................................................................................40 5.2.1 Dominancia ..................................................................................................................40 5.2.2 La selección contra el recesivo. Estimación de las generaciones ................................42 5.2.3 Modelo de selección Codominante .............................................................................42 5.2.4 Modelo de selección de sobredominancia. Selección favoreciendo al heterocigota ..44 5.2.5 Selección contra el Heterocigota. Equilibrios inestables .............................................47 5.2.6 Coeficientes de Selección Variable ..............................................................................47 6- MIGRACIÓN ................................................................................................................................49 6.1 Una generación de migración ..............................................................................................49 6.2 Migración Recurrente ..........................................................................................................50 6.3 Equilibrio ..............................................................................................................................50 6.4 Equilibrio entre migración y selección .................................................................................51 7- MUTACIÓN .................................................................................................................................52 7.1 Mutación recurrente ............................................................................................................52 7.2 La mutación y la evolución ...................................................................................................53 7.3 Mutación y agronomía .........................................................................................................53 7.4 Selección y Mutación. Equilibrio ..........................................................................................53 8- DERIVA GENÉTICA ......................................................................................................................54 8.1 Fijación o pérdida .................................................................................................................55 8.2 Equilibrio entre factores determinísticos y probabilísticos .................................................57 Genética de poblaciones 4 GENÉTICA DE POBLACIONES Introducción: La materia viva, si bien tiene una relación de continuidad a través del tiempo ya que todo ser vivo proviene de otro ser vivo, en un momento determinado se distribuye espacialmente en forma discontinua, organizada en unidades metabólicamente independientes, los individuos. Individuos con similares requerimientos ecológicos tienden a agruparse formando poblaciones. El término de población en biología puede incluir distintos grados de asociaciones según el área de dispersión de sus miembros y el punto de vista con que se los estudia. Es por eso que al referirse a ellas es necesario: -mencionar los organismos que la componen (pueden ser poblaciones mono o poliespecíficas) -delimitar el tiempo y el espacio que ocupan -definir el criterio con que se las agrupa (geográficos, ecológico, genético) En genética la relación final que comparten los individuos de una misma población es la de "intercambiar material genético". El término de población genética o población mendeliana, tiene un significado restringido, ya que se limita al "Conjunto de individuos de una misma especie, de reproducción sexual, que coexisten en tiempo y en espacio y que intercambian genes durante la reproducción". La limitación impuesta al apareamiento sólo dentro del grupo, hace que los individuos que la forman sean reproductivamente dependientes, y en consecuencia, pueda considerarse a la población mendeliana como una unidad reproductiva. Al ser la unidad reproductiva, es la que está sujeta a cambios adaptativos y por lo tanto puede considerarse como la unidad evolutiva. Las relaciones con otros grados de agrupación pueden representarse: Especie biológica: conjunto de individuos potencialmente capaces de cruzarse y dejar descendencia fértil. Representa el conjunto universo. Cuando el área de dispersión de la especie es muy amplia puede estar formada por diferentes subconjuntos, llamados razas. Razas biológicas: subconjuntos de la especie. Sus individuos están relacionados por su adaptación a macroambientes (razas geográficas) o a microambientes (razas ecológicas o ecotipos). Cuando las diferencias adaptativas se manifiestan o están acompañadas con diferencias morfológicas, los taxónomos las suelen clasificar como subespecie. Según su dispersión están formadas por una o muchas unidades reproductivas o poblaciones mendelianas. Poblaciones mendelianas: subconjunto de las razas donde los individuos intercambian genes. Algunos autores incluyen la jerarquía de “poblaciones panmícticas” (población mendeliana local, unidad panmíctica) para referirse al subconjunto de la población donde el apareamiento es al azar (panmixia). En la naturaleza, estas distintas categorías están integradas en sistemas más o menos complejos, Genética de poblaciones 5 donde los límites se confunden por la presencia de individuos o gametos migrantes. El criterio general que se sigue para establecer los límites está dado por la graduación en que se diferencian las composiciones genotípicas. Para describir y comparar las estructuras de las poblaciones mendelianas, los parámetros utilizados son sus frecuencias génicas, genotípicas y fenotípicas. La teoría matemática de la genética de poblaciones tiene como objetivo general describir en términos matemáticos el origen y la dinámica (o estabilidad) de la variación genética en las poblaciones mendelianas. El método consiste en establecer modelos, en este caso basados en las leyes de la herencia mendeliana, que interpreten la estabilidad o los cambios de las frecuencias génicas a través de las distintas generaciones. Como en todo modelo, las condiciones se idealizan y en consecuencia su validez debe ser siempre contrastada con las observaciones. Es necesario, por lo tanto prestar tanta atención a las condiciones impuestas al modelo, como a las conclusiones derivadas. Los modelos pueden ser de dos tipos, determinísticos o probabilísticos según incluyan o no las perturbaciones producidas por el azar. Los determinísticos consideran sólo los procesos sistemáticos (migración, selección y mutación) y predicen un solo estado final de la población a partir de un estado inicial, en un tiempo determinado (en generaciones). E INICIAL E FINAL Factores determinísticos Los probabilísticos al incluir los procesos dispersivos (tamaño de la población) producidos por el azar, no prevén un solo estado final, sino una distribución de estados probables. EINICIAL ~ E POSIBLES Factores probabilísticos 1- DESCRIPCIÓN DE LAS POBLACIONES: FRECUENCIAS FENOTÍPICAS, GENOTÍPICAS Y GÉNICAS En la genética de los organismos, los diferentes individuos se describen genéticamente mediante los conceptos de fenotipo, genotipo y gametas. Las poblaciones, al ser un conjunto de individuos, se caracterizan por las correspondientes frecuencias: fenotípicas, genotípicas y génicas (o alélicas). 1.1 Frecuencias fenotípicas y genotípicas Si se considera un par de alelos, A1 y A2, de un locus autosómico, se pueden simbolizar las frecuencias genotípicas, es decir la proporción de cada genotipo en la población, relativas a la unidad como en la siguiente tabla. Tabla 1. Frecuencias genotípicas GENOTIPOS FRECUENCIAS A1 A1 P De manera que se cumple: P + H + Q = 1 A1 A2 H A2A2 Q Genética de poblaciones 6 Las frecuencias fenotípicas dependerán de la relación de dominancia entre A1 y A2. Tabla 2. Frecuencias fenotípicas Relación de dominancia Fenotipo 1 Dominancia completa (P + H) Q - P H Q Codominancia Fenotipo 2 Fenotipo 3 Ejercicio resuelto 1 En una población se cuentan 720 plantas de flores rojas, 960 de flores rosadas y 320 de flores blancas. Si el color de la flor está determinado por un par de alelos con dominancia parcial, calcular las frecuencias genotípicas. FENOTIPO GENOTIPO FR. ABSOLUTAS FR. RELATIVAS ROJO A1A1 N1 = 720 P = 0,36 ROSADA A1 A2 N2 = 960 H = 0,48 BLANCA A2A2 N3 = 320 Q = 0,16 NT = 2000 Total = 1 1.2 Pozo génico – Frecuencias génicas o alélicas De la misma manera que puede considerarse la población de genotipos (2n), puede hacerse con las gametas (n). Suponiendo que cada individuo aporta sus gametas a un pozo y que éstas se unen de a dos para formar los individuos de la generación siguiente: Población Pozo génico Genotipos 2n A1A1 A1A2 Gametas N (A1) Población Genotipos A1A1 Pozo génico Gametas N Genotipos 2n 0 (A1) A1A1 A2A2 (A2) 1 1 A1A2 Generación 0 (A2) A1A2 Población 2n A2A2 A2A2 2 Genética de poblaciones 7 Surge así el concepto de "pozo génico" como la población de gametas. Concepto muy usado para el estudio y descripción de las poblaciones mendelianas. Simbolizando: Tabla 3. Frecuencias génicas Alelos A1 A2 Frecuencias en el pozo p q Se tiene que p + q = 1 Puede referirse a la población mendeliana como: “El conjunto de individuos que comparten un mismo pozo génico” 1.3 Derivación de las frecuencias génicas a partir de las genotípicas Para una determinada generación, las frecuencias del pozo pueden deducirse de las frecuencias genotípicas Población Genotipos 2n Pozo génico A1A1 2A1 A1A2 1A1+1A2 Genes n (A1) (A2) A2A2 2A2 Generación 0 Si por cada individuo con genotipo A1A1 se aportan al pozo 2 alelos A1, por P se aportarán 2xP. Por cada individuo con genotipo A1A2 se aporta al pozo 1 alelo A1, por H se aportará 1xH. La frecuencia p del alelo A1 en el pozo está dada por: p0 = (2P0 + H0) /2 = P0+ 1/2 H0 (es necesario dividir por 2 para expresarlas en frecuencias relativas a la unidad, ya que por cada N individuos diploides hay 2N gametas haploides). De igual modo para la frecuencia q del alelo A2, se tiene: q0= (2Q0 + H0) /2 = Q0 + 1/2 H0 En general para una determinada generación: pt = Pt + 1/2 Ht pt + qt = 1 ; y pt =1- qt ; qt = 1-pt qt = Qt + 1/2 Ht Genética de poblaciones 8 Ejercicio resuelto 2 Con los datos del Ejercicio resuelto Nº 1, calcule las frecuencias génicas, en esa generación. Como P0 = 0,36 H0 = 0,48 Q 0 = 0,16 p0 = 0,36 + 0,48/2 = 0,60 q0 = 0,16 + 0,48/2 = 0,40 1.4 Composición y estructura Al referirnos a poblaciones hay que distinguir los conceptos de composición y estructura. La composición genética de una población hace referencia a los tipos de alelos que forman su pozo génico y sus correspondientes frecuencias (frecuencias génicas o alélicas). La estructura genética de una población está relacionada con los genotipos y sus frecuencias (frecuencias genotípicas). Dos poblaciones pueden tener igual composición, pero diferente estructura. Tabla 4. Comparación de distintas poblaciones por su composición y estructura Genotipos Alelos A1A1 A1A2 A2 A2 A1 A2 Frecuencia P H Q p q Población 1 0,36 0,48 0,16 0,6 0,4 Población 2 0,50 0,10 0,40 0,6 0,4 Población 3 0,09 0,42 0,49 0,3 0,7 Las poblaciones 1 y 2 tienen igual composición, pero difieren en la estructura. En cambio la población 3 difiere de la 1 y la 2 tanto en composición como en estructura. 1.5 Estática y dinámica de las poblaciones: equilibrios y cambios Si se comparan las frecuencias génicas del pozo de una población en una generación (t) con las frecuencias del pozo de la generación siguiente (t+1), se puede establecer si la composición se ha mantenido constante o si ha habido un cambio en la misma. Como p + q = 1, es suficiente describir el cambio de un solo alelo y generalmente se lo representa mediante Δq Δq = qt+1 - qt Si Δq = 0, la población está en equilibrio. Si Δq 0, hay un cambio en la composición, ya sea un aumento de A1 (Δq negativo) o de A2 (Δq positivo). La existencia de cambio en la composición genética, está determinada por la presencia de factores evolutivos: mutación, selección, migración y deriva. El sistema de apareamiento relaciona la composición genética de la población progenitora con la estructura de la población progenie. Es decir que las frecuencias genotípicas de la descendencia estarán determinadas por las frecuencias génicas de los progenitores y su sistema de apareamiento. Genética de poblaciones 9 1.5.1 Los principios de Mendel en el nivel poblacional. La genética de los organismos analiza los descendientes de cruzamientos entre genotipos determinados. Para un solo locus con dos alelos A1 y A2 se pueden establecer 6 tipos de apareamientos diferentes, si no se diferencia un sentido del apareamiento con su recíproco (por ejemplo, hembra AA y macho aa, del recíproco hembra aa por macho AA). Tipos de apareamientos y descendencia esperada. 1- AA x AA 2- AA x Aa ó Aa x AA 3- AA x aa ó aa x AA 4- Aa x Aa 5- Aa x aa ó aa x Aa 6- aa x aa 1 AA 0,5 AA + 0,5 Aa 1 Aa 0,25 AA + 0,5 Aa + 0,25 aa 0,5 Aa + 0,5 aa 1 aa A nivel de población se analizan en forma conjunta todos los tipos posibles de apareamiento y sus correspondientes descendencias. Para ello es necesario determinar las frecuencias de cada tipo de apareamiento. Si los apareamientos se producen al azar, la frecuencia esperada de cada tipo de apareamiento está dada por el producto de las frecuencias de los genotipos intervinientes (por ejemplo, para el cruzamiento entre hembras AA por machos Aa, la frecuencia será P.H). En una tabla de 3 x 3 se puede calcular las frecuencias para cada uno. Tabla 5. Frecuencias de los apareamientos al azar a nivel poblacional Genotipos ♀ A1 A1 Genotipos ♂ A1 A1 A1 A2 A2 A2 Frecuencias P P H Q 2 PH PQ 2 P A1 A2 H PH H HQ A2 A2 Q PQ PH Q2 El producto entre la frecuencia de apareamiento y la proporción esperada de la descendencia en cada tipo de cruzamiento permiten calcular las frecuencias genotípicas esperadas en la descendencia. Ordenando y agrupando los apareamientos recíprocos se puede calcular las frecuencias esperadas de la descendencia según las leyes de Mendel. Genética de poblaciones 10 Tabla 6. Tipos de apareamientos y descendencia esperada Progenitores Apareamiento Descendencia Frecuencia A1 A1 A1 A2 A2 A2 A1A1 x A1A1 P2 P2 - - A1A1 x A1A2 2PH PH PH - A1A1 x A2A2 2PQ - 2PQ - A1A2 x A1A2 H2 1/4H2 1/2H2 1/4H2 A1A2 x A2A2 2HQ - HQ HQ A2A2 x A2A2 Q2 Suma 1 Q2 P2 + PH + 1/4H2 = PH + 2PQ + 2/4H2 + HQ = 1/4H2 + HQ + Q2 = (P + ½ H)2 = 2(P + ½ H) (Q + ½ H) = (Q + ½H)2 = p2 2 pq q2 Las frecuencias genotípicas de las descendencias están determinadas por las sumas correspondientes de genotipos iguales de los diferentes tipos de cruzamientos. Indicando como P1, H1 y Q1 las frecuencias de la descendencia, se tiene: Frecuencia de A1A1 Frecuencia de A1A2 Frecuencia de A2A2 P1 = P02 +P0 H0 +1/4 H02 = (P0+1/2 H0)2 = p02 H1= P0H0 + 2P0Q0 + 2/4H02 + H0Q0 = 2(P0+1/2 H0) (Q0+1/2 H0) = 2p0q0 Q1= 1/4H02 + H0Q0 + Q02 = (Q0 + 1/2 H0)2 = q02 Deducción que permite establecer la función que relaciona las frecuencias genotípicas de la población descendiente con las frecuencias génicas de la población progenitora, si los apareamientos son aleatorios. Generalizando: Las frecuencias genotípicas de la descendencia (generación t+1) dependen de las frecuencias génicas de la generación parental (t), si el apareamiento es aleatorio, según la relación: Tabla 7. Frecuencias genotípicas expresadas en función de las frecuencias génicas en panmixia. Genotipos AA Aa Aa Frecuencia Pt +1 = pt2 Ht+1 =2 pt qt Qt+1 =qt2 Observe que la función corresponde al desarrollo del binomio (p+q)2. Genética de poblaciones 11 1.5.2 Derivación de la descendencia a partir del pozo génico A las mismas conclusiones se puede llegar usando el concepto de pozo génico y considerando que el apareamiento al azar de los genotipos equivale al apareamiento al azar de las gametas en el pozo génico. Tabla 8 Alelos ♂ A1 A2 Frecuencias pt qt A1 pt pt2 pt qt A2 qt pt qt qt2 Alelos ♀ 1.5.3 El equilibrio estático Se ha deducido a partir de la condición de apareamiento aleatorio y la aplicación de las leyes de Mendel a nivel de población que: Pt+1 = pt2 Ht +1 = 2 pt qt Qt+1 = qt2 Donde se indica con los subíndices t y t+1, la población original y la descendencia respectivamente. A partir de ellas se puede calcular las frecuencias génicas (pt+1 y qt+1) en la generación (t+1). pt+1 = Pt+1 + 1/2 Ht+1 = pt2 + 1/2 x 2 pt qt = pt (pt + qt) = pt qt+1 = Qt+1 + 1/2 Ht+1 = qt2 + 1/2 x 2 pt qt = qt (pt + qt) = qt Con lo que se demuestra que las frecuencias génicas permanecen constantes y como P, H y Q están determinadas por p y q de la generación anterior, P, H y Q tampoco cambiarán de una generación a otra. Generalizando: las frecuencias genotípicas y génicas permanecen constantes de generación en generación. Para que esta conclusión sea válida es necesario resaltar las condiciones a partir de las cuales se logró: -Tamaño de la población tendiendo a infinito: Si el tamaño de la población es bajo, “la muestra de gametas” a partir de la cual se forma la siguiente generación no será representativa y en consecuencia se producirá un error por muestreo. A ese error por muestreo se lo denomina deriva genética. -Ausencia de selección: En la deducción se aceptó implícitamente que los genotipos paternos tenían igual fertilidad y viabilidad. Si los diferentes genotipos poseen tasas de supervivencia o fertilidad distintas, las proporciones de la descendencia no se corresponderán con las deducidas, ya que la proporción de gametas se desviará de la esperada según las leyes de Mendel. Cuando se produce ese efecto, se dice que está actuando la selección, ya sea en forma natural o artificial y en consecuencia los alelos tienen diferente aptitud. Por el contrario cuando dos alelos tienen la misma o muy similar aptitud se los denomina alelos neutros. La conclusión de constancia fue derivada Genética de poblaciones 12 considerando que los alelos eran neutros. -Ausencia de migración: La población es cerrada cuando no se producen inmigraciones de individuos de otras poblaciones. El ingreso de individuos migrantes de poblaciones vecinas de diferente constitución genética puede modificar las frecuencias esperadas a partir de las leyes mendelianas. -Ausencia de mutación: El cambio por mutación de un alelo por otro también modifica las frecuencias esperadas, alterando el equilibrio. -Panmixia: La relación entre las frecuencias génicas de la generación paterna y los genotipos de la generación descendiente fueron deducidas a partir del supuesto de apareamiento al azar entre los genotipos o gametas. Cuando se cumple esta condición se dice que hay panmixia (pan= todo; mixia: mezcla) y por lo tanto la población que la cumple es una población panmíctica. 1.5.4 El Teorema de Hardy-Weinberg. El equilibrio estático Las conclusiones anteriores, fueron derivadas en forma simultánea e independiente por Hardy (Inglaterra) y Weinberg (Alemania) en 1908, y se la conoce como la Ley de Hardy - Weinberg, aunque correspondería llamarlo teorema, ya que es deducible a partir de las leyes de Mendel. En resumen dice: En una población suficientemente grande, de apareamiento aleatorio (panmixia), en ausencia de migración, mutación y selección: a) Las frecuencias génicas y genotípicas permanecen constantes de generación en generación. b) Se cumple la relación p2:2pq:q2, para cada uno de los genotipos. Cuando una población cumple con estos requisitos se dice que está en equilibrio de HardyWeinberg. El equilibrio de Hardy-Weinberg es un equilibrio estático, determinado por la ausencia de los factores evolutivos: la mutación, la migración, la selección y la deriva génica. Ejercicio resuelto 3: Con los datos de los Ejercicio resueltos Nº 1 y 2, deducir las frecuencias genotípicas y génicas de la generación siguiente y las condiciones necesarias para que se cumplan. a) Apareamiento al azar de genotipos Apareamiento Frecuencia A1 A1 Descendencia A1 A2 A1 A1 x A1 A1 0,362 0,362 - - A1 A1 x A1 A2 2x 0,36 x 0,48 0,36 x 0,48 0,36 x 0,48 - A1 A1 x A2 A2 2x 0,36 x 0,16 - 2x 0,36 x 0,16 - 2 2 2 1/4 x 0,482 A1 A2 x A1 A2 0,48 1/4 x 0,48 A1 A2 x A2 A2 2x 0,48 x 0,16 - 0,48 x 0,16 0,48 x 0,16 2 2/4 x 0,48 A2 A2 A2 A2 x A2 A2 0,16 - - 0,162 Totales 1 0,36 0,48 0,16 Genética de poblaciones 13 b- Pozo génico Genes ♂ A1 A2 ♀ Frecuencias génicas 0,6 0,4 A1 0,6 0,36 0,24 A2 0,4 0,24 0,16 c-Condiciones necesarias: - apareamiento al azar o panmixia - población con N - ausencia de mutación, migración y selección. 1.5.5 Representaciones gráficas -Graficando las frecuencias genotípicas de equilibrio de H y W: p2, 2pq y q2, desde p=1 (q=0) hasta p=0 (q=1), se pueden representar los estados posibles de las poblaciones en equilibrio. Ejercicio resuelto 4 Observe el gráfico y responda: a) ¿Cuál es el valor máximo de heterocigotas que puede haber en una población en equilibrio de H y W y a qué valor de frecuencias génicas corresponden? Del gráfico se deduce fácilmente que el máximo de H corresponde a 0,50 y se establece cuando p = q= 0,5. b) Si en una población encuentra el 60% de heterocigotas, ¿qué conclusión inmediata extraería? Se excede la frecuencia máxima posible de heterocigotas, por lo tanto no se cumple alguno de los supuestos y la población no está en equilibrio de H y W. El estado de una determinada población en equilibrio de H y W puede representarse mediante un cuadrado, partiendo sus lados verticales y horizontales en segmentos proporcionales a p y q, de manera que las superficies de las celdas internas que se forman sean proporcionales a los genotipos, Genética de poblaciones 14 como puede verse en la figura siguiente: p q p p2 pq q pq q2 1.5.6 Los alelos recesivos raros y los portadores Ejercicio resuelto 5: a-Represente gráficamente los valores genotípicos de una población en equilibrio de H y W, para las frecuencias génicas de un alelo recesivo raro, de q = 0,05. b-Del total de alelos recesivos ¿qué porcentaje está en A1A2 y cuál en A2A2? c-Del total de individuos con fenotipo dominante ¿qué proporción será portador del alelo recesivo (heterocigota)? Respuestas: a- Si q = 0,05 => p = 0,95 A1A1 A1A2 A1A2 A2A2 b-Cada individuo A1A2 porta un alelo A2, luego se tendrán 1 x2 (2pq) alelos A2 en A1A2. Cada individuo A2A2 porta 2 alelos A2, luego se tendrán 2x q alelos A2 en A2A2. La relación (A1A2) / (A1A2 +A2A2) es igual a 2 p q / (2 q2 +2 p q) = pq / (q (q+p)) = p 2 La relación (A2A2) / (A1A2 +A2A2) es igual a 2 q2 / (2 q2 +2 r p q) = q / q = q r (A1A2) / (A1A2 +A2A2) = p = 0,95 y (A2A2) / (A1A2 +AR2A2) = q = 0,05 El 95% de los alelos raros está en el heterocigota y sólo un R 5 % en el recesivo. R Conclusión: R Cuando un alelo es muy raro está en su mayor proporción en el heterocigota. c-Portadores = H/(P+H) = 2pq/(1-q2) = 2 x 0,95 x 0,05 /(1 - 0,052) = 0,0952 1.5.7 Alelos raros dominantes Ejercicio resuelto 6: La mutación Br produce la braquidactilia en humanos (dedos cortos) y es dominante sobre dedos Genética de poblaciones 15 normales (br) ¿Cómo puede explicar la baja incidencia de ese fenotipo si es dominante? ¿Cómo representaría ésta situación mediante el cuadrado? . Con fondo claro se representa el fenotipo normal y con oscuro los mutantes. La aparición del fenotipo dominante es rara porque la frecuencia del alelo dominante Br es muy baja y en consecuencia Q >> (P+H) Conclusión: Un fenotipo puede ser raro a pesar de ser dominante, si la frecuencia génica es muy baja. No se debe confundir con la frecuencia de 3/4 del fenotipo dominante de las F2, ya que ésta es una situación especial donde p=q=0,5 Ejercicio resuelto 7: La incapacidad de gustar la feniltiocarbamida (P.T.C.) se debe a la presencia de un alelo recesivo en el hombre. Si en una población la frecuencia de “no gustadores” es de 0,3 y suponiendo que la población está en equilibrio de H y W a- ¿Qué proporción de heterocigotas debe esperarse? Fenotipo Genotipo Frecuencia No gustadores gg Q = 0,30 Gustadores G- (P+H) = 0,70 No se puede derivar q directamente (q = Q + ½ H) porque se desconoce qué proporción del fenotipo dominante corresponde a P y cuál a H. Pero como se da el supuesto de equilibrio de H y W se pueden aplicar las siguientes fórmulas: Q0 = q02 q0 = √Q0 = √0,30 = 0,55 y p0 = 1- q0 = 1 - 0,55 = 0,45 H0 = 2 p0 q0 = 2 x 0,45 x 0,55 = 0,495 b - ¿Qué probabilidad hay de que al elegir un matrimonio al azar, éste esté formado por padre gustador y madre no gustadora? P = 0,452 = 0,2045 H = 0,4955 Q = 0,30 Prob. (gg x G-) = Q x (P+H) = 0,30 x (0,70) = 0,21 c - Si se elige un hijo al azar dentro de los matrimonios formados por padres gustadores. ¿Qué probabilidad existe de que el hijo sea no gustador? Prob (G- x G-) = (0,2+0,5) x (0,2+0,5) = 0,49 Genética de poblaciones 16 Prob (G- x G-) y un hijo gg = H x H x 1/4 = 0,5 x 0,5 x 1/4= 0,0625 Prob 1 hijo gg condicionada al apareamiento G-x G- = 0,0625/0,49 = 0,127 1.6 Equilibrio de Hardy-Weinberg y más de dos pares de alelos 1.6.1 El Equilibrio Considerando simultáneamente dos pares de alelos (A - a) y (B - b) y simbolizando: Tabla 9. Frecuencias génicas Alelos A a B b Frecuencias p1 q1 p2 q2 Si la población está en equilibrio de Hardy y Weinberg se cumple: 1-Que las frecuencias gaméticas son iguales al producto de las génicas, de manera que: Tabla 10. Frecuencias gaméticas Gametas AB Ab aB ab Frecuencias p1 p2 p1 q 2 q1 p2 q1 q2 2- Que el producto de las gametas en acoplamiento es igual al producto de las gametas en repulsión: (AB) x (ab) = (Ab) x (aB) ; lo que expresado en frecuencias es: (p1p2) x (q1q2) = (p1q2) x (q1p2) La frecuencia de los genotipos estará dada por el producto de las frecuencias de las gametas, lo que puede obtenerse en una tabla de apareamiento (en este caso de 4 x 4) o desarrollando el polinomio: ((p1p2) + (p1q2) + (q1p2) + (q1q2))2 De manera que la frecuencia del genotipo compuesto (considerando los dos genes) va a ser igual al producto de la frecuencia de los genotipos simples. Así por ejemplo la frecuencia de AA Bb será igual a: p12. 2p2q2 Ejercicio resuelto 8 En una población con p1= 0,8 y p2 = 0,3 y en equilibrio de H y W ¿Cuál será la frecuencia del genotipo Aabb? H(Aa) = 2 p1 q1 = 2 x 0,8 x 0,2 = 0,32; Q(bb) = q22 = 0,72 = 0,49 Aa bb = H(Aa) x Q(bb) = 0,32 x 0,49 = 0,1568 1.6.2 Aproximación al equilibrio Ejercicio resuelto 9 Suponga que en una población se funda con la mitad de individuos AAbb y la otra mitad aaBB, donde los loci son independientes. Se designa como C0 a la población original, con C1 a la primera multiplicación al azar y con C2 segunda multiplicación al azar: a -¿Cuáles son las frecuencias génicas y genotípicas en C0? Genética de poblaciones 17 -Considerando en forma separada cada locus: Frecuencia génica en 1ºlocus Frecuencia génica en 2º locus p(A) = 0,5 + ½ 0 = 0,5 p(B) = 0,5 + ½ 0 = 0,5 q(a) = 0,5+½ .0 = 0,5 q(b) = 0,5+½ .0 = 0,5 Alelos 1º locus Frecuencias 1º locus 2º locus Frecuencias 2º locus Genotipos A a AA Aa aa 0,50 0,50 0,50 0,00 0,50 B b BB Bb bb 0,50 0,50 0,50 0,00 0,50 La falta de apareamiento aleatorio en el origen de C0 (mezcla de AAbb + aaBB) determina que no se cumpla para un locus la relación esperada p2 : 2 pq : q2 -Considerando en forma conjunta los dos loci las frecuencias de los genotipos compuesto son: Genotipo AABB AaBB aaBB AABb AaBb aaBb AAbb Aabb aabb Frecuencia 0 0 0,5 0 0 0 0,5 0 0 Como la mitad de los individuos son AAbb (sólo producen gametas Ab), y la otra mitad aaBB (sólo gametas aB) las frecuencias gaméticas son: AB 0,00 Gametas Frecuencias Ab 0,50 aB 0,50 Ab 0,00 La diferencia (D0) entre las gametas para acoplamiento y repulsión: D0 = (AB).(ab) - (Ab).(aB) = 0 - 0,25 = - 0,25 b -¿Cuál es la frecuencia gamética y genotípica en C1? Como esta generación está originada por el apareamiento aleatorio de Co, su estructura se logra considerando el apareamiento al azar de las gametas en el pozo: ♂ ♀ Ab 0,5 aB 0,5 Ab 0,5 0,25 0,25 aB 0,5 0,25 0,25 La estructura de esta población puede analizarse: 1)-Considerando los genotipos simples de cada locus: Genotipos Frecuencias AA 0,25 Aa 0,50 aa 0,25 BB 0,25 Bb 0,50 bb 0,25 Genética de poblaciones 18 Donde se comprueba que cada par independientemente cumple con las expectativas de equilibrio, luego de una sola generación de panmixia. 2) - Considerando los pares en conjunto Genotipos AABB AaBB aaBB AABb AaBb aaBb AAbb Aabb aabb Frecuencias 0 0 0,25 0 0,50 0 0,25 0 0 No se alcanza el equilibrio, ya que sólo se producen los genotipos AAbb (0,25), AaBb (0,50) y aaBB (0,25). Las frecuencias gaméticas en esta generación, teniendo en cuenta que los locus son independientes (no ligados) serán: Gametas AB Genotipos Frecuencia AAbb 0,25 AaBb 0,50 aaBB 0,25 Total 1 Gametas Ab Gametas aB Gametas ab ¼ 0,50 ¼ 0,50 0,25 ¼ 0,50 ¼ 0,50 0,25 0,125 0,375 0,375 0,125 Y una diferencia entre acoplamiento y repulsión de: D1 = (AB).(ab) - (Ab).(aB) = (0,125 . 0,125) - (0,375 . 0,375) = -0,125 Comparando D0 con D1 se tiene que D1 = 0,5 D0 Generalizando: Si una población derivada de apareamientos no aleatorios, se reproduce posteriormente por apareamiento aleatorio se tiene: -Considerando cada locus autosómico en forma independiente: se alcanzan las frecuencias de equilibrio en una sola generación de panmixia y se cumple la relación gametas progenitoras/genotipos progenie (p2:2pq:q2). -Considerando dos locus en conjunto: no se alcanza el equilibrio en una sola generación de panmixia y en consecuencia las frecuencias de los genotipos compuestos no son iguales a los productos de las frecuencias de los genotipos parciales. - Las diferencias entre el producto de las gametas en acoplamiento y repulsión (D), disminuye a la mitad por cada generación de apareamiento aleatorio Dt = 0,5 Dt-1. - Luego de sucesivas generaciones D se hace nula y la población alcanza el equilibrio para el genotipo integrado. - Si los loci considerados están ligados, la aproximación al equilibrio es más lenta. La D es función de la distancia. De manera que cuando hay ligamiento: Genética de poblaciones 19 D1 = (1 - c). D0 En forma general: c = proporción de recombinantes Dt= (1 - c) . Dt-1 Representando gráficamente el número de generaciones necesario para alcanzar el equilibrio, para valores de c= 0,5; 0,3; 0,2 y 0,1 a partir de un valor de D0 = 1. Figura. Evolución del desequilibrio gamético (D) para distintos valores de ligamiento. Extraído de Antonio FontdevilaAndrés Moya, 1999 en “Introducción a la Genética de poblaciones”. Ejercicio resuelto 10 Si se encuentra asociación genética entre dos caracteres en una población ¿qué causas podrían explicarla? Las causas genéticas que pueden originar asociaciones son el ligamiento y el efecto pleiotrópico. Sólo puede ser causada por ligamiento si la población aún no ha alcanzado el equilibrio. En poblaciones con muchas generaciones de apareamiento al azar y por consiguiente en equilibrio, la causa más probable de asociaciones es el efecto pleiotrópico. Conclusión: En poblaciones en equilibrio no se puede detectar el ligamiento (*), ya que todos los genes se comportan como independientes. * Recuerde que esta deducción es válida en ausencia de selección (alelos neutros), ya que ventajas selectivas de dos genes ligados pueden determinar desequilibrios gaméticos (D 0) 2- MEDICIÓN DE LA VARIABILIDAD GENÉTICA EN LAS POBLACIONES 2.1 Índice de polimorfismo Se estableció que una población es monomórfica (mono uno; mórfica: forma) para un locus determinado, cuando la frecuencia del alelo más abundante es igual o mayor de un límite arbitrario, generalmente 0,95. En consecuencia, será polimórfica (poli varias; mórfica: forma) cuando ningún alelo supere o iguale esa frecuencia. Genética de poblaciones 20 Si se miden varios loci de la población se puede calcular el índice de polimorfismo de esa población Suma de loci polimórficos P -----------------------------------Total de loci analizados Si bien este índice da una idea rápida de la variabilidad de la población, presenta algunos inconvenientes. -el límite entre un locus considerado mono o polimórfico es arbitrario. Algunos autores prefieren el valor de 0,99 y no el mencionado 0,95. - un locus con muchos alelos contribuye al índice con el mismo peso que otro con pocos alelos. Por ejemplo un locus con 5 alelos con frecuencias de 0,20 cada uno, se lo considera de igual peso a uno de dos alelos con frecuencias de 0,90 y 0,10; a pesar de que obviamente el primero contribuye más a la variabilidad de la población. 2.2 Índice de heterocigosidad El índice de heterocigosidad (H) está dado por el promedio de las frecuencias de heterocigotas estimados en todos los loci analizados en la población. Donde j indica el locus, de j=1 hasta j=n y Hj la frecuencia de los heterocigotas en ese locus. Este índice expresa más fielmente la variabilidad, ya que indica la posibilidad de que se reúnan dos alelos diferentes en un mismo genotipo. El inconveniente que presenta, es la imposibilidad de su aplicación en poblaciones con endogamia, donde la frecuencia de heterocigotas está disminuida o vale cero (esto se verá más adelante). Esta dificultad se supera, calculando el valor de heterocigosidad esperado para las frecuencias génicas estimadas, considerando que la población se reproduce con apareamiento aleatorio (panmixia). Ejercicio resuelto 11 Si en una población se evalúan tres loci y se encuentran las siguientes frecuencias génicas: A1=0,7 A2=0,3 B1=0,2 B2=0,8 C1=0,6 C2=0,4 Calcule el índice de heterocigosidad. La esperada para el apareamiento al azar será: A1A2=2x0,7x0,3 = 0,42 ; B1B2=2x0,2x0,8= 0,32 ; C1C1=2x0,6x0,4= 0,48 Y el índice de heterocigosidad será: H = (0,42+0,32+0,48)/3 = 0,41 Genética de poblaciones 21 2.3 Similitud y distancia genética Cuando se comparan poblaciones se usan diferentes índices para relacionarlas, ya sean por sus semejanzas o diferencias. 2.3.1 Similitud Conocidas las frecuencias génicas para un locus determinado en dos poblaciones, puede estimarse la similitud de esas dos poblaciones en el locus considerado. Sean los alelos A1 y A2 del locus j pA y qA sus frecuencias en la población A y pB y qB sus frecuencias en la población B. La similitud genética entre las poblaciones A y B para ese locus (j) será: Ejercicio resuelto 12 Dadas dos poblaciones: A B pA=0,2 pB=0,4 qA=0,8 qB=0,6 Estime el índice de similitud para ese locus Sj = (0,2x0,4+0,8x0,6) / [(0,04+0,64) x (0,16+0,36)]1/2 = 0,56/0,351/2 = 0,94 Este valor da la probabilidad de que al tomar al azar un alelo de cada población en ese locus, éstos sean iguales. Esta probabilidad puede variar entre 0 y 1. Si se toman varios loci, desde j=1 hasta n, puede usarse como similitud genética de las poblaciones los promedios, de manera que: 2.3.2 Distancia genética La distancia genética (DG), puede calcularse: DG = - ln Sg Esta distancia indica las sustituciones o reemplazos de unos alelos por otros durante la evolución independiente de las dos poblaciones y puede variar de 0 hasta infinito. Genética de poblaciones 22 3- APAREAMIENTOS. SISTEMAS DE APAREAMIENTOS Para deducir las frecuencias genotípicas de la descendencia a partir de las frecuencias génicas de los progenitores, se debe partir del supuesto de que los apareamientos entre los individuos son aleatorios (panmixia), a menos que se especifique algo diferente. Al considerar las consecuencias de otros sistemas de apareamiento, se los relacionará con los desvíos que se producen con respecto a las expectativas esperadas para esa la condición. Sistemas de apareamiento: -Panmixia: apareamiento al azar. -Fenogamia: apareamiento según el fenotipo. -Endogamia y exogamia: apareamiento según la relación de parentesco. 3.1 Apareamientos aleatorios: Panmixia (pan=todo; mixia: mezcla, combinación): En panmixia, y si se cumplen otras condiciones (ausencia de selección, mutación y migración), la frecuencia esperada de heterocigotas es: Hesp = 2ptqt; Hesp= frecuencia esperada de heterocigotas Si llamamos Hob a la frecuencia de heterocigotas observada (medida) en la población, se puede definir el Índice de panmixia como: Ip = frecuencia de heterocigotas observados / frecuencia de heterocigotas esperados Ip = Hob/ Hesp Ip=1; máxima panmixia Ip<1ó Ip>1; se aleja de la panmixia. Ejercicio resuelto 13 Si las frecuencias génicas en población son p = q = 0,5 y la frecuencia de heterocigotas medida es de 0,45. Calcular el índice de panmixia Ip = 0,45 / (2 x 0,5 x 0,5) = 0,90 En poblaciones naturales mediante el Ip se puede determinar si toda la población de una región se comporta como una unidad de apareamiento aleatorio o está formada por subpoblaciones locales panmícticas. Genética de poblaciones 23 Ejercicio resuelto 14 Suponga que los datos de la tabla siguiente corresponden frecuencias genotípicas de dos localidades de una misma región, siendo A y a alelos neutros (ausencia de selección). Localidad AA Aa Aa q 1 0,01 0,18 0,81 0,9 2 0,25 0,5 0,25 0,5 Media 0,13 0,34 0,53 Dentro de las subpoblaciones Índice de heterocigotas en Loc. Nº1 Ih1 = 0,18 / (2 x 0,1 x 0,9) = 1 Índice de heterocigotas en Loc. Nº2 Ih2 = 0,5 / (2 x 0,5 x 0,5) = 1 Índice de heterocigota para la región: = Ihr Heterocigotas observados para la región= Hor = media de las localidades = 0,34 Heterocigotas esperados de la región = Her qr = Qr + ½ Hr = 0,53 + ½ 0,34 = 0,7 Her = 2 x 0,7 x (1-0,7) = 0,42 Índice en la región: Ihr = Hor / Her = 0,34 / 0,42 = 0,80 La población de la región no se ajusta a las expectativas de panmixia, aunque si lo hacen las subpoblaciones locales (poblaciones panmícticas o gamodemos). 3.2 Fenogamia: Apareamiento fenotípicamente selectivos o clasificados Los apareamientos están influenciados por los fenotipos. Las frecuencias de los apareamientos se desvían de los esperados para panmixia, ya sea por: 3.2.1 Apareamiento clasificado (selectivo) positivo u homofenogamia (homo, semejante; gamia; unión) Los fenotipos similares tienden a aparearse. Ejemplos de este tipo de apareamiento se han observado en animales con respecto a tamaño y color del cuerpo. La consecuencia es un aumento de los homocigotas en detrimento de los heterocigotos, en los genes relacionados con el fenotipo que determina el apareamiento. 3.2.2 Apareamiento clasificado (selectivo) negativo o heterofenogamia (hetero, diferente; gamia; unión) Los fenotipos diferentes tienden a aparearse. La consecuencia es una disminución de los homocigotas y aumento en los heterocigotos, en los genes relacionados con el fenotipo que determina el apareamiento. Ej: tipo de plumaje en aves del género Zonotrichia, heterostilia en Primula sp. Hay diferentes índices para estimar estos sistemas de apareamiento, uno simple es: Indice de heterogamia Ihe = cruzamientos heterogámicos / cruzamientos homogámicos Genética de poblaciones 24 A B B A Heterostilia en Prímula: A) Flor longistila (PIN), B) Flor brevistila (THRUM) Ejercicio resuelto 15 En una jaula de observación de moscas se colocaron 20 machos y 20 hembras normales junto con 20 machos y 20 de hembras mutantes. A medida que copulaban se eliminaban las parejas y se computaban los apareamientos. Fenotipos y frecuencias Machos normales 0,5 Machos blancos 0,5 Hembras normales 0,5 Observadas 8 12 Esperadas 10 10 Hembras blancas 0,5 Observadas 14 6 Esperadas 10 10 Apareamientos homogámicos = 8 + 6 = 14 Apareamientos heterogámico = 12 + 14 = 26 Índice heterogamia observado = 26/14 = 1,875 Índice heterogamia esperado = 20/20 = 1 En la descendencia se esperaría una mayor proporción de heterocigotas que en panmixia, para los genes que determinan el fenotipo comprometido en el apareamiento 3.3 Apareamientos según el parentesco: 3.3.1 Endogamia (endo= dentro; gamia: unión) La frecuencia de apareamientos entre individuos emparentados es mayor que la esperada para una población con panmixia. La consecuencia es un aumento de los homocigotas en detrimento de los heterocigotas. A diferencia de la homogamia, el incremento de la homocigosis es en todos sus genes. 3.3.2 Exogamia (exo = fuera; gamia unión) Es lo opuesto a la endogamia. La frecuencia de apareamientos entre individuos emparentados es menor que la esperada para una población con panmixia. La consecuencia es un aumento de los heterocigotas en detrimento de los homocigotas para todos los genes. La endogamia puede ser un sistema de apareamiento natural normal de la especie (plantas autógamas) o ser la consecuencia de una disminución brusca del tamaño de la población en alógamas. También en la naturaleza han evolucionado mecanismos especiales para escapar a la endogamia, como son los sistemas de autoincompatibilidad en vegetales o conductas especiales en animales. En el manejo de las poblaciones artificiales, el hombre modifica los sistemas de apareamiento, haciendo endogamia o exogamia según sus intereses. Genética de poblaciones 25 4- ESTIMACIÓN DE LA CONSANGUINIDAD El término de consanguinidad hace referencia al apareamiento de individuos relacionados entre sí por sus antecesores. La consecuencia esencial de que dos individuos tengan un ancestro común es que ambos pueden llevar la copia de uno de los genes del mismo ancestro. Si, además, esos individuos se aparean y tienen descendientes, ambas copias del mismo gen pueden reunirse en un individuo de su descendencia. En este caso se llama a esos genes idénticos por descendencia, en contraposición a los genes idénticos por estado o naturaleza, que son iguales entre sí, sin considerar su origen. La identidad de dos genes por descendencia da la base para medir el proceso dispersivo de la población a través del grado de relación de los individuos que se aparean. Esa medida se denomina coeficiente de consanguinidad, que es la probabilidad de que dos genes de un locus determinado en un individuo sean idénticos por descendencia, es decir, provengan de copias de un mismo gen de un ancestro. 4.1 En genealogías 4.1.1 Consanguinidad en genealogías irregulares Observe la siguiente figura: R A1A2 Q A3A4 A1 ó A2 A3 ó A4 A3 o A4 M P X A1A3, A1A4, A2A3, A2A4 A1A1, A2A2, A3A3, A4A4 Los abuelos R y Q, no tenían ningún parentesco entre sí, por lo que sus genes no son idénticos por descendencia. Sus hijos, se aparean entre sí y tienen a X. Q de cada locus trasmite un alelo a M y otro, igual o diferente, a P. Lo mismo sucede con R y sus alelos, por lo que M y P pueden ser A1A3, A1A4, A2A3 o A2A4. Vamos a calcular el coeficiente de endogamia F de X, que, como definimos, es la probabilidad de que un individuo reciba dos alelos idénticos por descendencia. La probabilidad de que Q pase el alelo A1 a M es ½, y que M lo pase a X es ½, como ½ x ½ es ¼, ¼ es la probabilidad que X reciba Genética de poblaciones 26 A1 de Q a través de M. Q tiene también una probabilidad de ½ de trasmitir A1 a P, y P una probabilidad de ½ de trasmitirlo a X. Por lo tanto, la probabilidad combinada de que X reciba A1, tanto de su padre como de su madre es ¼ x ¼ = 1/16. Lo mismo sucede para los otros alelos, la probabilidad de que sea A2A2 es 1/16, lo mismo que para que sea A3A3 o A4A4. Por lo tanto, la probabilidad que haya heredado dos alelos idénticos por descendencia es 1/16 + 1/16 + 1/16 + 1/16 = ¼, que es la probabilidad que X sea A1A1, A2A2, A3A3 o A4A4. Por lo tanto el coeficiente de endogamia de un hijo de hermanos es F = ¼. Otro ejemplo: A B D C P Q X Dada la genealogía representada en el esquema anterior, consideremos primero a los ancestros B y C. La probabilidad de que los dos reciban el mismo alelo de A es ½, puesto que es la suma de las probabilidades de que los dos recibieran el alelo A1 o el alelo A2; es decir: Prob. A1 y A1 + Prob. A2 y A2 = ½ x ½ + ½ x ½ = ½ Por tanto, la probabilidad de que B y C reciban de A alelos diferentes será también ½. En efecto, Prob. A1 y A2 + Prob. A2 y A1 = ½ x ½ + ½ x ½ = ½ Pero si a su vez el antecesor común A presenta consanguinidad, entonces la probabilidad de que A1 y A2 sean idénticos entre sí es igual al coeficiente de consanguinidad de A que es FA. Por consiguiente la probabilidad que B y C reciban genes idénticos es: ½ + ½ FA = ½ (1+FA) En otras palabras, ésta es la probabilidad que dos gametos de A tomados al azar lleven alelos idénticos por descendencia. En cada paso posterior BDPX y CQX la probabilidad de que se trasmita el mismo gen es ½. Por tanto, la probabilidad final de que X reciba alelos idénticos por descendencia será, en este caso, ½.(½)3.(½)2.(1+FA) Y en el caso general sería: Fx= (½)n1+n2+1 (1+FA) Donde n1 y n2 representan el número de etapas o generaciones que separan a los parentales P y Q del individuo problema X del ancestro común A. En el ejemplo utilizado, n1 = 3 (PDBA) y n2 = 2 (QCA). Si los dos parentales del individuo problema tienen más de un ancestro común, entonces hay que Genética de poblaciones 27 sumar las probabilidades correspondientes a cada ancestro común, es decir, Fx= ∑[(½)n1+n2+1 (1+FA)] Aunque teóricamente, por las razones aducidas anteriormente, en una población cualquier individuo tendría algo de consanguinidad, se considera que en la población base (la más antigua en la genealogía que se estudia), la consanguinidad es cero (FA = 0), a no ser que haya datos previos que indiquen lo contrario. Aplicando este modelo general, fácilmente se pueden calcular los valores de los coeficientes de consanguinidad en los siguientes casos: hijos de hermanos, Fx= ¼; hijos de medio hermanos, Fx= 1/8; hijos de primos hermanos, Fx= 1/16; hijos de tíos/as – sobrinas/os, Fx= 1/8; hijos de dobles primos hermanos, Fx= 1/8. Esquemas: Hijos de hermanos A B Hijos de medios hermanos A B C Hijos de primos hermanos A B F C D D X E X C D G E H X Es obvio que el riesgo genético que entrañan los matrimonios consanguíneos radica en la mayor probabilidad de que en la descendencia se manifieste en homocigosis un gen deletéreo portado por uno de sus antepasados. Así, por ejemplo, si uno de los abuelos comunes de un individuo X hijo de primos hermanos es portador de un gen recesivo deletéreo d, la probabilidad de que el individuo X muestre la enfermedad por ser homocigoto dd será 1/4 F = 1/64. Análogamente, si el padre y el abuelo común a los padres del hijo del matrimonio entre tío(a) y sobrina(o) llevará en heterocigosis el gen deletéreo d, la probabilidad que el individuo X fuera homocigoto dd sería 1/4F =1/32. En el caso del hijo de medios hermanos, la probabilidad de que el individuo X reciba en homocigosis el gen d del padre común de sus padres sería ½ Fx=1/16. Al calcular el procedimiento indicado los coeficientes de consanguinidad en cualquier genealogía hay que tener en cuenta las siguientes normas generales: 1. Considerar todos los ancestros comunes a los padres del individuo problema, y 2. Considerar todos los caminos que unen a los padres a través del ancestro común siempre que sea en línea ascendente-descendente; es decir, en cada camino no se puede pasar dos veces por el mismo punto. Como puede existir más de un antecesor común, puede haber más de un sendero y las probabilidades deben sumarse. A1A2 Z A3A4 T M P X Genética de poblaciones 28 FX = P {A1A1}+P {A2A2}+P {A1A2 ó A2A1} * FZ + P {A3A3}+P {A4A4}+P {A3A4 ó A4A3} * FT FX = s (½)n+1 . (1+ FAC) Donde s es el nº de senderos independientes que unen un padre con el otro, a través del antecesor común; Aplicación Tenga presente siempre el concepto de FX y no aplique la fórmula en forma mecánica. Tabla 14. Cálculo de FX Antecesor Común (AC) (½)n+1 n FAC (1+ FAC) (½)n+1 . (1+ FAC) Construya la siguiente tabla: Localice los padres del individuo en estudio y luego al o a los antecesores comunes a estos padres. Compute a los antecesores comunes en la tabla en la columna correspondiente Precauciones 1 2 3 4 X Observe que sólo el individuo Nº 2 se considera antecesor común, ya que no existe ninguna posibilidad de que réplicas del individuo Nº 1 lleguen independientemente a X. 1 2 3 5 4 6 x Genética de poblaciones 29 Observe que el mismo individuo puede actuar más de una vez como AC, si existe más de un sendero independiente que permite unir a los padres a través del AC. En el ejemplo: El individuo 1 tiene tres senderos independientes Sendero: 6 4 1 3 5 6 4 1 2 5 6 3 1 2 5 En consecuencia, en el cuadro el individuo 1 debe figurar tres veces para sumar las tres probabilidades de que réplicas de 1, lleguen simultáneamente a X. 1 2 3 4 5 6 X Observe que la probabilidad de recibir réplicas del individuo 1, está contemplada en (½)n+1. F4 y en consecuencia no debe considerarse a 1 como AC. Como regla práctica recuerde que un mismo sendero no debe pasar simultáneamente (vía ascendente y descendente) por un mismo individuo. 1 2 3 4 5 6 7 X El único sendero correcto es: 7 4 1 3 6 y no el sendero 7 5 2 4 1 ya que resulta imposible que réplicas de 1 pasen a 2, a través de 4. 3 6 Genética de poblaciones 30 Al elegir el sendero, tome un padre y de ahí en línea siempre ascendente hasta el AC y de éste en línea descendente hasta el otro padre, sin cambiar el sentido. 1 2 3 4 5 6 X Para calcular FX considere: FX = (½)n+1 . (1+ F4) y para el cálculo de F4 considere el esquema a partir de 4, de modo que F4 = (½)n+1 . (1+ F1) En caso de retrocruza considere que el padre recurrente (Nº1) es también AC y padre. FX = (½)n+1 . (1+ F1) y como n toma el valor de uno. FX = (½)2 . (1+ F1) 1 2 X En caso de autofecundación 1 X FX = (½)0+1 . (1+ F1) 4.1.1.1 Coeficiente de parentesco o coascendencia Dado los individuos Z e Y, el coeficiente de parentesco (rZY) se define como la probabilidad de que al tomar al azar un alelo del individuo Z y uno del individuo Y, para un locus cualquiera, éstos provengan de la réplica de una misma cromátida de un antecesor común. Por definición puede establecerse la equivalencia: Genética de poblaciones 31 , si Z Y X El coeficiente de parentesco entre dos individuos (grupos o líneas) es equivalente al coeficiente de consanguinidad del descendiente posible. Aunque parece ser una complicación innecesaria, resulta útil desarrollar la metodología del cálculo, ya que resulta más conveniente cuando los árboles genealógicos son complejos y para el cálculo de la consanguinidad en sistemas regulares. Cálculo: Si: A B C Z (ab) D Y (cd) X Y simbolizando los genotipos de Z e Y, como ab y cd, para distinguir los alelos de origen paterno y materno, las posibles combinaciones alélicas en X serán: Combinaciones ac ad bc bd Frecuencia ¼ ¼ ¼ ¼ y si se designa con el signo = a l posibilidad de que sean réplicas de una misma cromátida, rZY= ¼ [P(a=c) + P(a=d) + P(b=c) + P(b=d)] y como por definición P(a=c) = rAC P(a=d) = rAD P(b=c) = rBC P(b=d) = rBD Sustituyendo: rZY= ¼ [rAC + rAD + rBC +I rBD] se obtiene la expresión general que indica que el coeficiente de parentesco entre dos individuos es igual al promedio del coeficiente de parentesco de sus respectivos padres. Observe que para calcular rZY, no es necesario ir más allá de la primera generación de ascendientes y permite de esa manera calcular fácilmente rZY o F(x), en cada generación de cruzamientos consanguíneos, sin necesidad de recorrer el árbol genealógico. Genética de poblaciones 32 4.2 Consanguinidad en las poblaciones Si se tiene en cuenta que en organismos bisexuales, un individuo tiene 2 padres, 4 abuelos y en general en la generación t, 2t antecesores, resulta evidente que en cualquier población finita los individuos deben tener uno o más antecesores comunes y también que mientras más pequeño sea el tamaño de la población, mayor será el grado de parentesco entre los miembros. Como se dijo anteriormente, al cruzamiento entre individuos emparentados se lo denomina endogamia, y la consecuencia resultante es que la descendencia es consanguínea. Para medir el grado de consanguinidad se utiliza el coeficiente de consanguinidad, que se simboliza con la letra F 4.2.1 Coeficiente de consanguinidad (F) Se define como la probabilidad de que los dos alelos de un locus cualquiera de un individuo de la población, provengan de la réplica de una misma cromátida de un antecesor común a sus padres. Si se considera cualquier población desde sus orígenes, todos los loci cumplirán con el requisito establecido, por eso para que F tenga sentido es necesario referirlo a una determinada generación (población base), donde se fija, arbitrariamente, que ningún alelo es réplica de la misma cromátida y en consecuencia sus coeficientes de consanguinidad son iguales a cero. Consanguinidad en la población base (generación 0) F0 = 0 AiAj AiAl En la población se denomina Nr al número de individuos que la forman (tamaño real de la población), y Ne (tamaño efectivo o número efectivo) al número de individuos que efectivamente aportan gametas al pozo. La estimación de la consanguinidad en la generación t (Ft valor medio de consanguinidad), es función de Ne El coeficiente de consanguinidad en una determinada generación (t), está dado por dos partes: la primera, es la tasa o incremento que mide el aumento en la última generación (de t-1 a t), la segunda parte que es la arrastrada de generaciones anteriores. Ejercicio resuelto 16 La mayoría de las razas puras de ganado fueron obtenidas a a partir de muy pocos animales en el siglo pasado. En la actualidad se crían millones de cabezas (N ) situación que se ha mantenido en los últimos años. De acuerdo al cálculo establecido anteriormente, ¿se podría afirmar que animales razas puras son consanguíneos? Son consanguíneas. Si bien 1/ 2Ne actualmente puede ser bajo (alto Ne), el segundo término o consanguinidad arrastrada no se pierde si la población no se ha cruzado con individuos de otros orígenes. Genética de poblaciones 33 Ejercicio resuelto 17 Calcular la consanguinidad luego reproducir una población por dos generaciones, la primera con 6 individuos (F0 a F1) y la segunda con 8 individuos (F1 a F2). F0 =0 F1 = 1/(2 x 6) = 1/12 + 0 = 0,0083 F2 = 1/ (2x8) + (1 - 1/ (2x8)) 0,0083 = 0,0625 + 0,9375 x 0,083 = 0,153 Al tomar al azar dos alelos del pozo génico hay una probabilidad cercana al 15% que provengan de réplicas de la misma cromátida de un individuo. La probabilidad que provenga de individuos diferentes es el complemento, es decir 85%. 4.2.2 El coeficiente de consanguinidad referido a la población base Si el valor de N se mantiene constante en todas las generaciones se pude estimar a partir de la población base (F = 0), de la siguiente manera: Ejercicio resuelto 18 Calcular el valor de F luego de 10 generaciones de multiplicar una población de 20 individuos por generación. ΔF = 1/(2 x 20) = 1/40 F10 = 1-(1-1/40)10 = 0,2236 4.2.3 Frecuencias genotípicas en la población total Se puede demostrar que el cambio en la frecuencia de los genotipos cuando hay endogamia en una población en equilibrio: Genotipos Panmixia Endogamia Independientes Dependientes Cambio F=0 parcial de endogamia de endogamia F >0>1 A1 A1 p02 p02 + p0 q0F p02 (1-F) p0F + p0 q0F A1 A2 2 p0 q0 2 p0 q0 -2pqF 2 p0 q0 (1-F) 0 -2 p0 q0F A2 A2 q02 q02 + p0 q0F q02 (1-F) q0 F + p0 q0F Donde se visualiza como aumentan los homocigotas y disminuyen los heterocigotas, a medida que aumenta el F. Cuando F= 1 las Frecuencia son: A1A1 = p02 + 1. p0q0 = p0 (p0 + q0) = p0 A2A2 = q02 + 1. p0q0 = q0 (p0 + q0) = q0 A1A2= 2 p0q0 (1-1) = 0 Cuando la endogamia es igual a 1, todos los individuos son homocigotas y dependiente de la endogamia Genética de poblaciones 34 Ejercicio resuelto 19 Estime las frecuencias genotípicas esperadas luego de seis generaciones de reproducción con 6 individuos, si p=q=0,5; indicando los dependientes e independientes de la endogamia F 6 = 1-(1-1/(2X6))6 = 0,406 Genotipos F0=0 F6=0,406 Dependientes de endogamia 0,203 Cambio 0,3515 Independientes de endogamia 0,1485 A1 A1 0,25 A1 A2 0,50 0,297 0,297 0 -0,203 A2 A2 0,25 0,3515 0,1485 0,203 +0,1015 +0,1015 La disminución de heterocigotas y consecuentemente el aumento de homocigotas es función de F y de las frecuencias génicas. 4.2.4 Relaciones entre el número efectivo y el número real A los fines de una mejor aproximación, resulta útil definir el tamaño efectivo de la población (Ne) y relacionarlo con el tamaño real de individuos de la población (N), para acercarse a las condiciones naturales, ya que no todos los individuos de una población corresponden a los realmente reproductivos. 4.2.4.1 Número diferente de machos y hembras Si N♀ = N♂, N será igual a N♀ + N♂ Pero si N♀ N♂, se usa la media armónica: Ejercicio resuelto 20 Calcule el coeficiente de consanguinidad de una población de vacas que se multiplica cuatro generaciones con 10 ♂ y 100♀ 1/ Ne = 1/(4 x 10) + 1/(4 x 100) = 0,0275 Ne = 36,36 36 F4 = 1 - (1 - 1/2Ne)t = 1 - (1 – 1/(2x36))4 = 0,054 Ejercicio resuelto 21 Ídem si se multiplica 10♂ y 1000♀. 1/Ne = 1/(4x10) + 1/(4 x 1000) =0,0252 Ne = 39,68 39 F4 = 1 - (1 - 1/(2x39))4 = 0,050 Observe que a pesar de que se multiplicó por 10 el número de hembras en el segundo caso, la consanguinidad disminuyó muy poco. El número del sexo escaso es el que más incide en el coeficiente de consanguinidad. Genética de poblaciones 35 La inseminación artificial permite el uso en gran escala del semen de pocos toros selectos, pero su aplicación indiscriminada puede traer aparejado un incremento no deseado de la consanguinidad. 4.2.4.2 Tamaño diferente en generaciones sucesivas Si el número de individuos es diferente en las distintas generaciones se puede calcular Donde N1, N2, ....., Nt = tamaño de la población en la generación 1, 2, ...., t. t = número de generaciones. Esta aproximación es válida si N > t, en caso contrario se debe calcular F en cada generación. Ejercicio resuelto 22 Calcule F si se multiplica según se indica en la tabla siguiente: Generación N 1 10 2 20 3 40 4 40 5 60 6 80 7 100 1/Ne = 1/7 (1/10 + 1/20 +1/40 +1/40 +1/60 + 1/80 +1/100 ) = 0,03417 Ne = 29,26 30 F7 = 1 - (1 - 1/2Ne)t = 1 - (1 - 1/(2x30))7 = 0,111 4.2.4.3 Distribución desigual del tamaño de la familia Es de esperar que en condiciones naturales algunos individuos aporten mayor número de descendientes que otros (diferentes tamaños de familias), lo que trae aparejado una disminución del número efectivo de individuos reproductivos. Asumiendo que la población no aumenta de tamaño y por lo tanto el número medio de hijos por pareja es 2, se tiene: Donde σk es la variancia del tamaño de la familia Artificialmente se puede hacer la variancia igual a cero, eligiendo el mismo número de semillas de cada cruzamiento o el mismo número de hijos de cada pareja de animales, Genética de poblaciones 36 El número efectivo es el doble del número real. Esto indica que con la práctica de hacer la varianza del tamaño de la familia igual a 0, tomando el mismo número de descendiente por familia, el valor de Ne sería el equivalente al doble del tamaño real (N) correspondiente, si los reproductores se eligieran al azar. Como regla general si se quiere minimizar la consanguinidad se debe hacer máximo el número de individuos y mínima la variancia del tamaño de la familia, lo que se puede recordar como: "Cosechar pocas e igual número de semillas de muchas plantas y no muchas y variable cantidad de semillas de pocas plantas" Ejercicio resuelto 23 Se reproduce una variedad sintética de maíz sembrando 50 semillas por generación ¿Cuál será la tasa de consanguinidad usando las siguientes maneras de reproducirlos?: 1- Se cosecha masalmente (en bulto) y se extrae las 50 semillas al azar (Se considera la varianza del tamaño de la familia Vk =2) Ne = N = 50 ΔF = 1/2x50 = 0,01 2- Se cosecha masalmente (en bulto) la semilla y se extrae 50 semillas al azar. Se considera en este caso que Vk = 4 Ne = 4x 50 / ( 4 + 2 ) = 0,66x 50 =33 ΔF= 1/ 2x33 = 0,015 3-Se cosechan 50 granos de una sola espiga Excluyendo la autofecundación se tendrá N° machos = 49 y N° de hembras = 1 1/Ne = 1/(4x49) + 1/4 x 1 = 0,2551 Ne 4 ΔF = 1/ 2x4 = 0,125 4-Cosechando separadamente cada espiga y tomando un grano por espiga. En ese caso Vk= 0 y Ne = 2 N = 2 x 50 = 100 ΔF = 1/ 2x100 = 0,005 A pesar de que se toma el mismo número de semillas en los cuatro casos (N=50), el número efectivo es muy diferente, llegando al extremo de que en tercer caso, es 25 veces menor que el cuarto (Ne =4 y Ne= 100, respectivamente). 4.2.5 Equilibrio en poblaciones Alógamas y Autógamas Si las frecuencias genotípicas en función de F están dadas por: Genética de poblaciones 37 AA = p2 + F pq Aa = 2pq - 2 F pq = 2pq (1-F) aa = q2 + F pq Y cuando se alcanza el equilibrio en poblaciones alógamas se tiene que F = 0 y en autógamas F =1 La estructura esperada para plantas alógamas en equilibrio para loci neutros será AA = p2 Aa = 2pq aa = q2 En autógamas AA = p2 + F p q = p2 + 1 p q Aa = 2pq - 2 F pq = 2pq - 2pq aa = q2 + F pq = q2 + 1 pq = p (p + q ) = p =0 =q ( q+p) = q En muchos casos el sistema reproductivo es intermedio y en consecuencia las plantas son parcialmente autógamas o parcialmente alógamas, según se aproximen a uno u otro extremo. Se denomina tasa de alogamia a la proporción de cruzamientos, es decir la proporción de cruzamientos panmícticos, expresada en frecuencias relativas a la unidad o en porcentaje. Tasa de alogamia: El coeficiente F se relaciona con α, cuando la población alcanza el equilibrio mediante: Resumiendo Genotipos 100 % Alógamas Parcialmente auto o alógamas 100% Autógamas A1 A1 A1 A2 A2 A2 F=0 p02 2 p0 q0 q02 F = (1-)/ (1+) p02 + F p0 q0 2 p0 q0 (1-F) q02 + F p0 q0 F=1 p0 0 q0 Ejercicio resuelto 24 Si p=q= 0,5; ¿qué proporción de plantas normales (dominantes) y mutantes se tendrá y cuál será su relación cuando se alcance el equilibrio si la especie es: a - totalmente alógama p=q= 0,5 y F = 0 Dominantes = 0,25 + 2 x 0,5 x 0,5 = 0,75 Recesivos = 0,25 Relación dominates / recesivos 3 : 1 Genética de poblaciones 38 b - totalmente autógama p = q = 0,5 y F = 1 Dominantes = 0,50 y Recesivos = 0,50 Relación dominates / recesivos 1 : 1 c - parcialmente autógama (α =0,2). p=q=0,5 y F= (1-0,2)/(1+0,2) = 0,66 Recesivos = 0,25 + 0,66 x 0,5 x 0,5 = 0,415 Dominantes = 1- 0,415 = 0,585 Relación dominates / recesivos 1,4 : 1 d - parcialmente alógama (α = 0,9). p = q = 0,5 y F = (1-0,9) / (1 + 0,9) = 0,05 Recesivos = 0,25 + 0,05 x 0,5 x 0,5 = 0,28 Dominantes = 1 - 0,28 = 0,72 Relación dominates / recesivos 2,57 : 1 Genética de poblaciones 39 DINÁMICA DE LAS POBLACIONES 5- SELECCIÓN En los modelos anteriores, la selección estaba excluida al considerar que la contribución de gametas de los diferentes genotipos a la siguiente generación dependía sólo de sus frecuencias. La selección puede operar en las diferentes etapas del crecimiento y desarrollo, afectando la viabilidad, la fertilidad o la capacidad de apareamiento, lo que condiciona que algunos genotipos aporten una mayor proporción de gametas al pozo y otros una menor. 5.1 Aptitud y selección Condiciones impuestas: La población es suficientemente grande El apareamiento es al azar Ausencia de mutación y migración Bajo estas condiciones y admitiendo que actúa la selección, se puede definir: w = aptitud (valor adaptativo o eficiencia biológica) como la capacidad de un determinado genotipo de contribuir con sus gametas a la siguiente generación. Para un locus simple autosómico se puede simbolizar: Genotipo AA Aa aa Aptitud w0 w1 w2 Por razones de simplicidad se prefiere trabajar con valores de w relativos, dando el valor 1 al genotipo más favorecido y refiriendo los otros a este último. Si la contribución a la siguiente generación es de: AA = 90% Aa = 80% aa = 70% AA 90/90= 1 Aa 80/90=0,8 se tendrá: Genotipo Aptitud aa 70/90=0,7 Por complemento puede definirse: s = coeficiente de selección relativo w=1-s Ejercicio resuelto 25 Al cosechar la semilla de una especie alógama se contaron como promedio 250 semillas por planta en el genotipo AA, 200 en Aa y 150 en aa. Calcular la aptitud relativa de cada genotipo por la fertilidad: Aptitudes: AA = 250/250 = 1 Aa = 200/250 = 0,8 aa= 150/250 = 0,6 Genética de poblaciones 40 5.2 Modelos de Selección Según el grado de dominancia de la aptitud se pueden diferenciar: Dominancia Selección contra recesivo Selección contra dominante Codominancia Sobredominancia AA w0 Aa w1 aa w2 1 1-s 1 1-s 1-s 1 1 1- 1/2s 1-s 1 - s1 1 1 - s2 5.2.1 Dominancia AA Aa aa Aptitud media “Wm” Lastre “L” p2 2 pq q2 1 0 1-sq2 sq2 Frecuencias antes de la selección Aptitud “w” 1 2 1 2 p / (1-sq ) Frecuencias después de la selección 1-s 2 2 2pq / (1-sq ) q (1-s) / (1-sq2) Se define como lastre o carga genética a la proporción de genotipos eliminados, en este caso: L = s q2 y aptitud media Wm = 1-L = 1-sq2 Las frecuencias genotípicas luego de la selección se logran multiplicando las frecuencias antes de la selección por la aptitud y dividiendo por la aptitud media, para referir las proporciones a la unidad (hacer la suma de las frecuencias luego de la selección igual a uno). Ejercicio resuelto 26 En una bolsa de semilla de maíz se cuenta un 84% de granos amarillos y 16% de granos blancos. Al sembrar se elimina el 70% de los blancos. Si la población inicial estaba en equilibrio ¿Qué proporción de granos blanco debe esperarse en la siguiente generación? Amarillo domina a blanco. Q = 0,16; q = (0,16)1/2 = 0,4 ; p = (1-0,4)=0,6 2 P = p = 0,36; H = 2 p q = 2 x 0,6 x 0,4 = 0,48 La selección es contra el recesivo y con s= 0,7 y w = 1-0,7 = 0,3 AA Aa aa w media L Frecuencias antes de la selección Aptitud “w” P0 = 0,36 H0 = 0,48 Q0 = 0,16 1 0 1 0,3 Contribución a la próxima generación 0,36 x 1= 0,36 0,48 x 1= 0,48 0,16 x 0,3= 0,048 0,36+0,48+0,048 = 0.888 0,7 x0,16 = 0,112 Frecuencias después de la selección P’=0,36/0,888= 0,405 H’= 0,48/0,888 = 0,541 Q’= 0,048/0,888 = 0,054 1 Genética de poblaciones 41 La frecuencia del alelo a en la población luego de la selección: q1 = Q1 + 1/2 H1 = 0,054 + 1/2 x 0,541 = 0,3245 El avance de la selección Δq = q1 - q0 = 0,3245 – 0,400 = - 0,0755 REPRESENTACIÓN GRÁFICA Ejercicio resuelto 27 De acuerdo al gráfico anterior: ¿Dentro de qué valores de p y q se obtiene el máximo avance? La máxima ganancia en la selección para esta situación se encuentra entre q= 0,6 y 0,8. En términos generales se puede recordar que la ganancia o avance máximo se logra con frecuencias intermedias y el mínimo cuando el alelo es muy raro o muy común. En el gráfico siguiente se ha representado el cambio de un alelo recesivo por efecto de la selección a lo largo de las generaciones. Genética de poblaciones 42 La función muestra las diferentes fases de la selección. Al principio cuando el alelo es muy común (0,99) la disminución por generación es más lenta, luego con frecuencias intermedias es muy rápida, para tender posteriormente asintóticamente a 0. El modelo de selección contra el recesivo muestra como los loci sujetos a este tipo de selección tienden a ser monomórficos (frecuencias de uno de los alelos >0,95). La presencia de polimorfismo en este modelo sólo se explica durante el proceso de sustitución de un alelo por otro, de ahí que sea un polimorfismo transitorio. El "costo" de sustituir un alelo por otro más adaptado por generación está dado por el lastre o carga genética. 5.2.2 La selección contra el recesivo. Estimación de las generaciones Si se eliminan todos los recesivos, es decir se hace s = 1, se puede demostrar que: donde t es el número de generaciones necesarias para pasar de q0 a qt. Para valores s diferentes de 1 y valores bajos de q0, se puede usar la aproximación: Ejercicio resuelto 28 Una de cada 500 semillas de cebolla son marrones en una variedad en equilibrio. Si se eliminan todas las marrones al sembrar. a-¿En cuántas generaciones se reducirá a la mitad su frecuencia? Semilla negra es dominante sobre marrón. q0= 1 = 0,044 ; 500 qt= 1 = 0,03 1000 1 1 t 9,53 10 0,03 0,044 b-¿Cuántas generaciones son necesaria si se eliminan sólo la mitad de las marrones? t 1 1 1 20 0,5 0,03 0,044 5.2.3 Modelo de selección Codominante En este caso la aptitud del heterocigota es intermedia entre las aptitudes de los dos homocigotas. Genética de poblaciones 43 Ejercicio resuelto 29 Sea una población de insectos tratada con un plaguicida, donde el genotipo RR es resistente, rr sensible y Rr intermedio. Se utiliza una dosis que elimina el total de rr y la mitad de Rr. Si la población está en equilibrio de Hardy-Weinberg y las sensibles están en una proporción del 25%. S es igual a 1 y la aptitud para rr es (1-s) = (1-1) =0 y para Rr es (1-0,5s) = 0,5 RR Rr rr Frecuencias antes de la selección 25 50 25 Aptitud 1 1-0,5 0 Contribución a la próxima generación 0,25x1=0,25 0,5x0,5=0,25 0 Frecuencias después de la selección 0,25/0,5=0,5 0,25/0,5=0,5 0/0,5=0 Aptitud media (Wm) Lastre (L) 1-(0,5x0,5)-(0,25x1)=0,5 [(0,25+0,25+0)=0,5] 0,5 q1= 0 + 1/2 x 0,5 = 0,25 Δq = 0,25 – 0,5 = - 0,25 REPRESENTACIÓN GRÁFICA SELECCIÓN EN CODOMINANCIA S=0,4Q 0,1 0,2 0,3 0,4 0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1 0 -0,01 -0,02 Δq -0,03 -0,04 -0,05 -0,06 -0,07 q El avance de la selección en función de la frecuencia muestra como el máximo se logra con frecuencias intermedias. Los modos de selección contra el recesivo y codominate sólo pueden generar polimorfismos de transición. La observación de mariposas con colores oscuros reemplazando los pardos, ejemplifica el cambio producido por la era industrial. Al modificarse las condiciones de los bosques por el hollín de las fábricas, se produjo un cambio en las frecuencias de los genes que favorecen el mimetismo. La selección prolongada en ese sentido tiende a que un alelo se sustituya por otro, generando poblaciones monomórficas del alelo favorable. Genética de poblaciones 44 SELECCIÓN EN CODOMINANCIA. S=0,4 1 0,9 0,8 0,7 0,6 q 0,5 0,4 0,3 0,2 0,1 0 0 4 8 12 16 20 24 28 32 36 generaciones 5.2.4 Modelo de selección de sobredominancia. Selección favoreciendo al heterocigota Ejercicio resuelto 30 En una población el alelo R confiere resistencia a una raza de patógeno y el alelo r a otra, de manera que el heterocigota tiene la máxima aptitud. Si la aptitud de RR es 0,7 y de rr 0,4 y la población original está formada por una frecuencia de r = 0,1, ¿qué avance de la selección se debe esperar? Luego s1 de RR es 1-0,7 = 0,3 y s2 de rr = 1-0,4 = 0,6 Frecuencias antes de la selección Aptitud (w) Contribución proporcional de los genotipos a la población Frecuencias después de la selección RR Rr rr W medio 0,81 0,18 0,01 1 0,7 0,567 1 0,18 0,4 0,04 1-0,81x0,3+0,01x0,6=0,751 0,755 0,240 0,05 L 0,249 q1 = 0,05 + ½ 0,240 = 0,17 y Δq = 0,17 – 0,1 = 0,07 La selección favoreciendo al heterocigota tiende a aumentar la frecuencia del alelo r, para esas frecuencias iniciales. Ejercicio resuelto 31 ¿Cómo sería el avance de la población del Ejercicio resuelto anterior si la frecuencia génica original de r fuera 0,8? Genética de poblaciones 45 Frecuencias antes de la selección Aptitud Contribución proporcional de los genotipos a la población Frecuencias después de la selección RR 0,04 Rr 0,32 Rr 0,64 w medio 1 L 0,7 0,028 1 0,32 0,4 0,256 1-0,04x0,3-0,64x0,6=0,604 0,396 0,046 0,530 0,424 q1 = 0,424 + ½ 0,530 =0,689 y Δq = 0,689 – 0,8 = - 0,111 En este caso la frecuencia de r tiende a disminuir Ejercicio resuelto 32 ¿Cuál es el avance de la selección si la frecuencia inicial de r es 0,33? RR Rr rr W medio Frecuencias antes de la selección 0,449 0,442 0,109 1 Aptitud 0,7 1 0,4 Contribución proporcional de los genotipos a la población 0,314 0,442 0,044 Frecuencias después de la selección 0,3925 0,5525 0,055 0,8 L 0,2 q1 = 0,055 + ½ 0,5525 = 0,331 y Δq = 0,331- 0,33 = 0,01 0 En este caso el avance de la selección es casi nulo. De la comparación de los tres Ejercicios resueltos de la selección por sobredominancia, puede extraerse que la frecuencia del alelo r aumenta cuando es menor que 0,33 y disminuye si la frecuencia original es mayor que ese valor. Cuando alcanza esa frecuencia el avance es nulo y la población logra un equilibrio dinámico. Generalizando: Cuando la selección favorece al heterocigota, hay un valor de frecuencias de equilibrio. Ese valor depende de s1 y s2 de acuerdo a la relación donde e indica la frecuencia de equilibrio Ese equilibrio lleva a una población con frecuencias intermedias, es decir a una población polimórfica. Este polimorfismo, a diferencia del transitorio de la selección contra el recesivo o semidominante, es un polimorfismo estable. El lastre o carga genética que genera se llama lastre segregacional y está dado por Ls = s1 p2 + s2 q2 Genética de poblaciones 46 Ejercicio resuelto 33 Estime las frecuencias génicas y el lastre en el equilibrio, en los Ejercicio resueltos anteriores qe = 0,3/ (0,3+0,6) = 0,33 pe = 0,6/(0,3+0,6) = 0,67 Le = 0,672 x 0,3 + 0,332 x 0,6 = 0,2 REPRESENTACIÓN GRÁFICA El gráfico muestra como varía Δq en función de q. Por arriba de q de equilibrio, en este caso 0,4; los valores son negativos y por debajo positivos. El equilibrio con frecuencias intermedias que resulta es estable. La selección por sobredominancia es un argumento muy citado para explicar la existencia de polimorfismo en las poblaciones. El gráfico muestra cómo las frecuencias génicas convergen a la de equilibrio, partiendo de frecuencias iniciales de q= 0,99 y 0,01. La frecuencia de equilibrio es independiente de las iniciales y sólo función de los coeficientes de selección, como puede apreciarse en la función qe = s1 / (s1 +s2) Genética de poblaciones 47 Ejemplos: La mayor incidencia del alelo de la anemia falciforme en zonas donde la malaria es endémica está explicada por la mayor aptitud del heterocigota frente a dicha enfermedad. En ratas, una mutación recesiva disminuye la viabilidad por deficiencias en vitamina K, pero en el heterocigota presenta ventajas con respecto al homocigota normal porque es más resistente a venenos anticoagulantes como la warfarina. En vegetales el heterocigota puede presentar resistencia para dos razas de un patógeno. (Cada alelo confiere resistencia para una raza) 5.2.5 Selección contra el Heterocigota. Equilibrios inestables Si se deduce un modelo donde el heterocigota es el genotipo de menor aptitud y se representa la función del avance de la selección, se puede observar un valor de equilibrio inestable para q= 0,5. Es inestable porque cualquier pequeña modificación de esa condición, por ejemplo por azar, lleva a la pérdida o fijación del alelo. SELECCIÓN CONTRA EL HETEROCIGOTA. s=0,4 0,05 0 0,04 0 0,03 0 0,02 0 0,01 Δq 0 0,00 0 -0 0,010 0,020 0,030 0,040 0,050 0, 1 0, 2 0, 3 0, 4 0, 5 0, 6 0, 7 0, 8 0, 9 1 q 5.2.6 Coeficientes de Selección Variable En los modelos anteriores se ha deducido el destino de los alelos sometidos a una selección constante. Pero también se pueden formular modelos de selección variables, que conducen a polimorfismos estables. -Selección dependiente de la frecuencia: La selección puede incrementar un alelo cuando es raro y disminuirlo cuando es común. Ejemplos de mimetismo siguen estos patrones. -Selección dependiente del estado del desarrollo: La selección puede incrementar un alelo en un estado y disminuirlo en otro. Por ejemplo, un alelo puede incrementar la viabilidad, pero tener un efecto pleiotrópico negativo en la fertilidad. El “óptimo intermedio” que se observa en muchos caracteres de poblaciones naturales, puede estar basado en este tipo de selección. Por ejemplo alelos que aumentan el número de huevos por nidada en los pájaros, son favorables para el componente adaptativo relacionado con la fertilidad, pero perjudiciales para el correspondiente a la supervivencia de los pichones. -Selección dependiente del sexo: La selección puede incrementar un alelo en un sexo y disminuirlo en el otro. Un plumaje vistoso puede favorecer el apareamiento de los machos, pero el mismo alelo puede hacer menos precoces a las hembras. -Selección dependiente de la densidad (selecciones r y k): Alelos que incrementan la reproducción (genotipos r) son favorecidos en bajas densidades y aquellos alelos que aportan un mayor desarrollo vegetativo (genotipos k) en altas. Genética de poblaciones 48 -Selección dependiente de la variabilidad microambiental: un alelo puede ser favorecido en determinados nichos ecológicos por las condiciones de suelo, humedad o exposición de la luz y no en otras condiciones cercanas, lo que puede llevar a la formación de ecotipos. Las relaciones específicas entre los genotipos de los patógenos y los genotipos de los huéspedes en sistemas naturales, se asimilan a este tipo de selección. Todas estas alternativas conducen a equilibrios estables y se engloban bajo el término de selecciones equilibradoras o balancistas. Conclusiones: Los modelos de selección contra el recesivo o codominacia: -conducen a poblaciones monomórficas para esos genes. Durante la sustitución de un alelo por otro originan polimorfismos transitorios. -El avance de la selección es máxima cuando las frecuencias son intermedias y mínimo cuando el alelo es muy común o muy raro. El modelo de selección por sobredominancia: -Conduce a equilibrios estables, resultando las poblaciones polimórficas para los genes involucrados. -El equilibrio depende de los coeficientes de selección contra los homocigotas. El modelo de selección en contra del heterocigota: -Conduce a la fijación de uno de los alelos (y pérdida del otro alelo), y por lo tanto a la condición de monomorfismo -Hay una condición de equilibrio (p=q=0,5), pero es inestable Los modelos de selección variable en función de la frecuencia, del sexo, del estado del desarrollo, edad, densidad y de diferentes nichos ecológicos dentro de un hábitat, conducen a equilibrios estables, resultando las poblaciones polimórficas para los genes involucrados. Selección y Evolución - La selección natural es el factor evolutivo que conduce a la adaptación. Los modelos muestran que pueden actuar no sólo "gastando la variabilidad" mediante selecciones normalizadoras o clásicas tendientes a favorecer la adaptación inmediata, sino también "conservando variabilidad” (selecciones balancistas) en función de la adaptación mediata. Selección y Agronomía - Los modelos visualizan los peligros de aplicar en forma sostenida un mismo plaguicida, al aumentar la frecuencia del alelo resistente. - Muestran también como, para caracteres cualitativos dominantes o codominantes, el máximo avance se logra cuando las frecuencias son intermedias y por lo tanto la escasa ventaja de tratar de eliminarlos cuando son muy raros. - La sobredominancia puede ser la causa de la falta de respuesta a la selección artificial de algunos caracteres. - La selección r y k indican la necesidad de relacionar las densidades comerciales con las utilizadas en la recolección, en la producción de semilla y en la selección de nuevos cultivares. - Las selecciones balancistas indican cómo la selección artificial de algún carácter con ventaja económica en una etapa, puede impactar negativamente en otra. - En general todos los modelos de selección, alertan sobre las consecuencias de establecer sistemas artificiales homogéneos. Genética de poblaciones 49 6- MIGRACIÓN En los modelos anteriores se estableció como condición la ausencia de migración. Una población carente de migración es una población cerrada. En el modelo para poblaciones no cerradas o abiertas (*), las condiciones impuestas son: Población suficientemente grande Apareamiento aleatorio Ausencia de mutación y selección Considerando población nativa a la población en estudio y población migrante a la población a la que pertenecen los individuos que ingresan. Se puede simbolizar: qm: frecuencia en población migrante qo: frecuencia en población nativa antes de la migración q1: frecuencia en población nativa luego de una generación de migración m: tasa de migración m = nº de individuos migrantes /(nº de migrantes + nativos) *El concepto de metapoblación, se usa para indicar un grupo de poblaciones locales que están conectadas entre sí por procesos de migración 6.1 Una generación de migración Luego de una generación de migración, la frecuencia génica q1 será la media ponderada de la correspondiente a los nativos y migrantes q1 = m x qm + (1 - m) qo = qo + m (qm - qo) Δq = q1 - qo = m (qm - qo) Lo que indica que el cambio producido luego de una generación de migración es directamente proporcional a la tasa de migración y a la diferencia entre las frecuencias génicas de la población nativa y la migrante. Ejercicio resuelto 34 Al sembrar maíz se mezclan 10.000 granos de la bolsa A con 1.000 granos de la bolsa B. En la bolsa A la proporción de granos blancos es del 64 % y en la B del 16 % ¿Qué proporción de semilla debe esperarse en la descendencia, si se supone que las dos poblaciones estaban en equilibrio de H y W? NOTA: grano amarillo es dominante sobre blanco. Q0 = 0,64 blancos q0 = (0,64)1/2 = 0,8 Qm = 0,16 blancos qm = (0,16)1/2 = 0,4 m = 1000/(1000 + 10000) = 0,09 q1 = 0,8 + 0,09 x (0,4 - 0,8) = 0,76 p1 = 1 - q1 = 1 - 0,76 = 0,24 Δq = 0,09 x (0,4 - 0,8) = -0,04 Si el apareamiento es al azar la descendencia será: Granos amarillos: p12 + 2 p1 q1 = 0,242 + 2 x 0,24 x 0,76 = 0,42 Granos blancos: q12 = 0,762 = 0,58 Genética de poblaciones 50 6.2 Migración Recurrente La ecuación recurrente puede obtenerse: En donde: t = número de generaciones m = tasa constante de migración qt y q0 las frecuencias génicas en la generación t y la original qm la frecuencia de los migrantes Ejercicio resuelto 35 Si se admite que la población de EEUU blanca ha sido lo suficientemente grande como para que los cambios en su material genético introducidos de la población negra hayan sido insignificantes, que las poblaciones nativas negras en África han estado aisladas y que las frecuencias génicas de las poblaciones negras actuales del este de África (zona de origen de los primeros esclavos), son similares a las de hace 300 años cuando se inició la introducción de esclavos. Se puede considerar: q0: frecuencia en la población negra original. qm: frecuencia población blanca caucásica, donde son oriundo los americanos qt: población negra de los EEUU actual, luego de aproximadamente 300 años de las primeras introducciones de esclavos. qt: frecuencia estimada en la población negra actual en EEUU = 0,446 qm: frecuencia en la población caucásica = 0,028 qo: frecuencia en la población negra africana = 0,630 Calcule: a) La proporción de genes de origen blanco en las poblaciones negras actuales. -Considerando el total de la migración 0,446 = 0,63 + m (0,028 - 0,63) m = 0,3056. Lo que indica que el 30,56% de los genes de la población negra actual son de origen blanco. Los datos son coincidentes con otras estimaciones que usan otros sistemas sanguíneos. 6.3 Equilibrio Si la migración es recurrente se alcanzará un equilibrio entre la población migrante y la nativa. En el equilibrio: Δq = m (qm - q0) = 0 El equilibrio se logrará para cualquier valor de m cuando q m = qo , es decir cuando las dos poblaciones tengan la misma constitución. Generalización: La migración tiende a disminuir las diferencias de las poblaciones vecinas. -Migración y evolución: Al ser la migración un factor de homogenización de las poblaciones, disminuye el efecto de la formación de razas en el proceso de diferenciación. De ahí que sea condición necesaria (pero no suficiente) para la especiación la aparición de mecanismos que disminuyan o impidan la migración. Una migración esporádica puede actuar en la población como una fuente de variabilidad. -Migración y producción agrícola. La migración es un factor muy importante especialmente en la producción de semilla. En esta Genética de poblaciones 51 actividad es necesario establecer barreras que impidan el flujo de polen extraño. Estas barreras pueden ser geográficas, temporales o mecánicas. Las reglamentaciones de la ley de semilla establecen las distancias mínimas para la producción de semilla de las diferentes especies y en las categorías. La producción comercial también puede afectarse por el efecto de xenia (por ejemplo en la producción maíz dulce la contaminación con polen normal). 6.4 Equilibrio entre migración y selección Si se analiza la acción conjunta de la migración con la selección y se considera que la migración tiende a incrementar un alelo (Δq+) y la selección a eliminarlo (Δq-), el balance tiende a que se alcance un equilibrio cuando se igualan (en valores absolutos) los avances. Igualando el cambio por migración y por selección contra recesivo, se tiene En el equilibrio la resultante es nula y no se produce ningún cambio. Ese equilibrio dinámico y estable puede generar poblaciones polimórficas. En las prácticas relacionadas con la conservación de biodiversidad, se habla de la necesidad de contar con corredores ecológicos para favorecer las migraciones entre poblaciones. Ejercicio resuelto 36 En cultivos maíz de variedades bt (transgénicos resistentes a isoca), se aconseja intercalar franjas de variedades normales sensibles ¿Qué fundamento avalan esta recomendación? El uso exclusivo de cultivares resistente puede ejercer una alta presión de selección para la resistencia. Dejando refugios con cultivares sensibles la migración retarda esa selección. Para ser eficaz esta estrategia se requiere que la resistencia en el insecto sea recesiva y que el insecto tenga una etapa migratoria. En el siguiente gráfico se simula una selección (s=0,9) contra un recesivo, en una población cerrada (m = 0) y una abierta (m=0,25). Se representa el avance del alelo resistente a partir de una frecuencia original de 0,01. Puede apreciarse como la selección sola tiende al monomorfismo y combinada con la migración al polimorfismo. Genética de poblaciones 52 7- MUTACIÓN Condiciones impuestas: La población es suficientemente grande Apareamiento aleatorio Ausencia de migración Ausencia de selección Presencia de mutación 7.1 Mutación recurrente -Si el alelo A muta al alelo a, con una tasa μ se puede representar: µ Si A ------> a po qo Donde µ = tasa de mutación po, qo = frecuencias génicas originales Luego de una generación de mutación se tendrá: p1 = po - µ.po = po (1 - µ) Considerando a μ constante, en la segunda generación será: p2 = p1 (1-µ) = po (1-µ)2 y en la generación t pt = po (1-µ)t Ejercicio resuelto 37 a) Calcule el número de generaciones necesarias para producir un cambio de 0,2 a 0,1, con una tasa igual a 10-5. 0,1 = 0,2 x (1- 10-5)t De donde 0,1/0,2 = 0,99999 t Aplicando logaritmo log 0,5 = t log 0,99999 t = log 0,5 / log 0,99999 = 69314,37 b) De acuerdo al resultado obtenido, ¿qué conclusión puede obtenerse con respecto al papel de la mutación en los cambios evolutivos observados en la naturaleza? (válida si se cumplen las condiciones del modelo: mutación selectivamente neutra y población suficientemente grande). Las mutaciones neutras en poblaciones grandes, de acuerdo a las tasas observadas del orden de 10 -5 a 10-6, no afectarían la dinámica de las poblaciones en el orden de los cientos de generaciones. De acuerdo a estas conclusiones el papel de la mutación en los cambios radica en ser la fuente original de variación sobre la cual actúan los otros factores (selección y deriva por ejemplo). Los cambios producidos por su única acción requerirían tiempos excesivamente prolongados, del orden de las 100 a 200 mil generaciones, como puede apreciarse en el gráfico siguiente: f r e c u e n c i a s g é n i c a s Genética de poblaciones 53 C am bio por m utación recurrente ,para una tasa de 0,00001 1 0 ,9 0 ,8 0 ,7 0 ,6 0 ,5 0 ,4 0 ,3 0 ,2 0 ,1 0 p q 0 75000 150000 225000 g e n e ra c io n e s 7.2 La mutación y la evolución Al tratar en este punto el efecto de la mutación en la dinámica de las poblaciones se hace referencia a su efecto como fuerza o factor del cambio y no su papel como materia prima o fuente inicial de variabilidad. Los modelos indican que cuando las poblaciones son suficientemente grandes pero no infinitas, el papel de la mutación neutral en la dinámica es muy poco representativo, ya que su destino es perderse (mutación única), o es necesario postular un tiempo excesivamente grande para producir cambios considerables, de acuerdo al orden de las tasas de mutación conocidas. Diferente es el caso de que se trate de poblaciones pequeñas, como se verá al tratar la deriva. 7.3 Mutación y agronomía En la dinámica de las poblaciones artificiales, la mutación, con mayor razón, no es un factor de cambio por el tiempo de manejo de las mismas, si las tasas se mantienen en los niveles normales (la multiplicación in vitro puede incrementarlas). En los casos de conservación del germoplasma a largo plazo, el efecto acumulativo de las mismas puede tener mayor importancia. 7.4 Selección y Mutación. Equilibrio Si la mutación tiende a incrementar la frecuencia de un alelo recesivo y la selección tiende a disminuirlo, habrá un valor de qe donde Δq será igual a 0 Y el lastre o carga en ese equilibrio será igual a la tasa de mutación Le = s qe2 = μ Ejercicio resuelto 38 Genética de poblaciones 54 En poblaciones en equilibrio entre la mutación y la selección. a- Calcule las frecuencias génicas y genotípicas esperadas para una tasa de mutación µ = 10-5 y los valores de s = 0,01; 0,1 y 1. b- Compare los valores obtenidos y extraiga conclusiones. a- μ= 105 Coeficiente de selección (s) 0,01 0,1 1 0,03 0,01 0,003 qe 0,001 0,0001 0,00001 qe2 La acción conjunta de la selección y la mutación, explican las frecuencias bajas de los alelos recesivos deletéreos en las poblaciones naturales (monomorfismos). 8- DERIVA GENÉTICA Modelo básico: Apareamiento al azar. Ausencia de mutación, migración y selección. Tamaño de población finito. Generación 0 1 Tamaño de la población N N Frecuencias génicas q0 Pozo génico q1 2 - N - q2 - t N qt Con el recuadro claro se representa el pozo genético en cada generación y con el recuadro oscuro el subconjunto de gametas que aportan a la generación siguiente. Con N el tamaño de la población, asumiendo que no hay superposición de generaciones y que dicho tamaño permanece constante a lo largo de las mismas. Como el número de progenitores que forman la siguiente generación representa sólo una pequeña muestra (recuadro oscuro) del total de gametas posibles (recuadro claro), las frecuencias génicas están sujetas a un cambio, por el error de muestreo. A ese cambio se lo denomina deriva genética. La deriva genética se produce porque no se cumplen con las probabilidades mendelianas, por ser la muestra un valor finito. A diferencia de los cambios producidos por mutación, migración y selección, donde el modelo contempla la magnitud y dirección del cambio (procesos determinísticos), en la deriva es sólo predecible la magnitud (en términos de variancia), pero no el sentido (+ ó -), ya que éste fluctúa por efecto del azar. La teoría del muestreo indica que para una muestra de N individuos (2N gametas), la distribución en la siguiente generación será la correspondiente a una distribución binomial: Genética de poblaciones 55 p0 q0 2 N Con media q q0 y variancia Vq 1 = p0 q0 2N o expresado en función del cambio: con media q =0 y variancia V q = p0 q0 2N Ejercicio resuelto 39 Si las frecuencias originales son p0=q0= 0,5 y el número de individuos reproductores (Ne) es igual a 20 ¿Qué valores de q son los esperados? Si el número de individuos N=20, el número de alelos será 2N= 40. Cuando 2 Np ó 2 N q > 15, la distribución binomial se aproxima a la normal, lo que permite calcular las probabilidad usando las correspondientes a la normal. En este caso: 0,5 x 40 > 15. Luego aceptamos que la distribución de Δq se aproxima a la normal con media = 0 y variancia = 0,5. 0,5/40= 0,00625. La desviación estándar será igual a = (0,00625)1/2 = 0,079 Luego por la distribución normal se tendrá: Δq 0± 0,079 0± 2* 0,079 0± 3* 0,079 intervalo Δq -0,0079 a 0,0079 -0,0158 a 0,0158 -0,0237 a 0,0237 q±S 0,5±0,0079 0,5±0,0158 0,5±0,0237 Probabilidad 0,66 0,95 0,99 8.1 Fijación o pérdida Durante el proceso de muestreo los valores fluctúan al azar, hasta que finalmente el alelo se fija (q = 1) o se pierde (q = 0). Una vez alcanzado ese límite, se mantiene en forma permanente (recuerde que se han excluido la mutación y migración). Los valores que se representan en el gráfico se han obtenido simulando una población que se ha multiplicado con 10 individuos (20 alelos) por generación a partir de una población inicial con frecuencia p = q = 0,5 (en ausencia de selección, mutación y migración y con apareamiento al azar). Genética de poblaciones 56 FIJACIÓN Y PÈRDIDA POR DERIVA Las frecuencias génicas varían por efecto del azar, si el proceso continúa indefectiblemente un alelo se fija y en consecuencia el otro se pierde. Como las frecuencias originales eran en este caso p=q = 0,5; los dos alelos tenían igual probabilidad de fijarse o de perderse (si q inicial es de 0,1 la probabilidad de fijarse es de 0,1 y en consecuencia, la perderse 0,9). Por efecto del azar del muestreo dos o más subpoblaciones originadas de una misma población pueden ser diferentes. Si la población original es polimórfica para alelos neutros, en las primeras generaciones las subpoblaciones también serán polimórficas pero con diferentes frecuencias y luego de muchas generaciones, las diferencias aumentan al ser monomórficas por la fijación de alelos diferentes. Ejercicio resuelto 41 Una población se encuentra subdividida en dos poblaciones con las siguientes frecuencias: Subpoblación 1 Subpoblación 2 P 0,49 0,01 H 0,42 0,18 Q 0,09 0,81 p 0,70 0,10 q 0,30 0,90 a) Si los alelos son neutros y hay ausencia de migración ¿qué factor evolutivo puede explicar las diferencias entre subpoblaciones si las dos tienen igual origen? -Si el número efectivo de cada subpoblación (Ne) es actualmente grande, el efecto de la deriva dentro de cada subpoblación puede ser mínimo y las diferencias pueden deberse a la deriva en el origen o fundación de cada subpoblación (efecto fundador). b) Si el Ne de cada subpoblación es bajo, ¿Qué predicción se puede establecer si las subpoblaciones no intercambian genes? Que un alelo se fije y el otro se pierda. Hay una probabilidad de que eso ocurra en un menor número de generaciones en la segunda subpoblación por su menor variación. La probabilidad de fijación luego de muchas generaciones es proporcional a su frecuencia (q) y en consecuencia la de pérdida al complemento (1-q). Conclusiones -La deriva es un cambio producido por el número finito de la población. -El cambio es aleatorio (el alelo puede aumentar o disminuir su frecuencia) Genética de poblaciones 57 -La magnitud del cambio depende de Ne (tamaño efectivo), a menor tamaño mayor magnitud del cambio - El efecto consecutivo de la deriva lleva a que uno de los alelos neutros se fije y el otro en consecuencia se pierda, por azar. -Por efecto de la deriva las subpoblaciones o líneas provenientes de la misma población original, al estar aisladas se van diferenciando -Se denomina efecto fundador al efecto de la deriva al formarse una nueva población a partir de pocos individuos de la población original. Por más que el tamaño de la nueva población aumente, el efecto de la deriva en las primeras generaciones por el efecto fundador (cuello de botella) no se pierde. -Se puede reconocer si una población se comporta como una unidad panmíctica o está subdividida, calculando el índice panmíctico. 8.2 Equilibrio entre factores determinísticos y estocásticos Sea x el parámetro del factor determinista: tasa de mutación, tasa de migración o coeficiente de selección. Si 4.x.Ne es << 1 predomina el efecto del azar de la deriva. Si 4.x.Ne es >> 1 predomina el efecto del factor determinístico. Nota: <<: mucho menor; >>: mucho mayor Con valores intermedios hay acción conjunta de deriva y de factores determinísticos. Ejercicio resuelto 40 Si μ = 10-5 y Ne = 100 ¿Qué tipo de efecto predomina? 4 x 10-5.100 = 4 x 10-3 << 1 efecto de deriva Si μ = 10-5 y Ne = 106 ¿Qué tipo de efecto predomina? 4 x 10-5.106 = 4 x 10 >> 1 efecto determinístico. Ejercicio resuelto 41 Si se reproducen pocos individuos selectos por generación ¿se puede asegurar que se fijarán todos los alelos favorables? No necesariamente, porque el azar de la deriva puede hacer que se fijen alelos no deseados, si se seleccionan pocos individuos por generación.