EXTRACCIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS A ... CONGELADO Y PARAFINADO:

EXTRACCIÓN DE ÁCIDOS NUCLEICOS A PARTIR DE TEJIDO
CONGELADO Y PARAFINADO: COMPARACIÓN DE MÉTODOS
MANUALES Y AUTOMATIZADOS
Marín M.1, Gelabert L.1, Martín Á.1, Cuatrecasas M.1,2, Bermudo R.1
1 Banco de Tumores, Biobanc del Hospital Clínic-IDIBAPS, Barcelona
2 Anatomía Patológica, Hospital Clínic de Barcelona, Barcelona
Una de las aplicaciones más frecuentes de las muestras usadas en
investigación biomédica es la extracción y uso del ARN o el ADN en estudios
genéticos y de expresión génica. Con el fin de facilitar el uso de dichas
muestras, muchos biobancos han optado por proporcionar los ácidos nucleicos
ya purificados. Esto permite garantizar la estandarización del procesado de las
muestras con controles de calidad adecuados y además, optimizar el uso de
las muestras, lo que es especialmente importante en los casos en que la
disponibilidad de la muestra es escasa.
El Biobanco del Hospital Clínic-IDIBAPS ha adquirido recientemente un nuevo
equipo que permitirá automatizar las extracciones de ácidos nucleicos. El
objetivo de este estudio es la comparación de los métodos manuales, usados
hasta el momento, y los métodos automatizados para la extracción de ácidos
nucleicos a partir de muestras de tejido del Banco de Tumores de nuestro
Biobanco.
Para este estudio se han usado muestras de tejido de colon sano, tanto
congeladas en medio OCT como fijadas en formol e incluidas en parafina.
Estas muestras se han usado en diferentes protocolos de extracción
específicos para muestras de tejido, en concreto, para extracción de ARN, ADN
y extracción simultánea de ARN+ADN de la misma muestra. Para cada
protocolo se ha analizado el rendimiento de la técnica en cuanto a la cantidad
de ARN o ADN obtenido, y la calidad del ácido nucleico extraído, comparando
el método de extracción manual y el automatizado.
Los resultados de este estudio permitirán identificar cuál es el mejor método
para cada una de las aplicaciones planteadas, para así conseguir los mejores
resultados en cada situación, lo que contribuirá a la optimización en el uso de
las muestras de tejido disponibles.