FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos” Directores: M.A. Pisarev (CNEA, UBA, CONICET) y R.S. Calandra (UNLP, CONICET) Coordinadores: M.O. Suescun (UNLP, CONICET) y G. Juvenal (CNEA, CONICET) Química Montpellier FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos 23 • Los conceptos que se expresan en esta publicación son exclusiva responsabilidad de su autor y no involucran necesariamente el pensamiento del editor. Química Montpellier SEPARATA MONTPELLIER Publicada por Química Montpellier S.A. Virrey Liniers 673 - Buenos Aires Director: Dr. Héctor Ascierto FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Introducción Con este primer fascículo se inicia la publicación de una serie que intenta abarcar los conceptos más actualizados acerca de la Fisiopatología Endocrinológica, en sus aspectos bioquímicos y diagnósticos. Esta Especialidad ha realizado avances notables, en función de los nuevos conocimientos que incluyen la Bioquímica, la Biología Celular y Molecular y los Métodos Diagnósticos no invasivos, entre otros. Esta Obra está basada en la Maestría del mismo nombre que se dicta a nivel de postgrado. El creciente y constante interés y apoyo de numerosos colegas nos ha impulsado a emprender esta tarea, que no sería posible sin la invalorable colaboración de los numerosos co-autores, que son al mismo tiempo docentes de la Maestría. La excelencia académica de los co-autores y docentes, ha sido reconocida por la CONEAU, otorgándole la Acreeditación y la Categorización Máxima, el Ministerio Nacional de Educación validando el Título a nivel nacional y los Colegios Médicos y Bioquímicos de la Provincia de Buenos Aires. Para la concreción de este esfuerzo ha sido de fundamental importancia el entusiasta apoyo que nos brindaron las autoridades de Química Montpellier S.A., sin cuya participación esta Obra no se habría concretado. A todos ellos nuestro más sincero y profundo agradecimiento. Química Montpellier Pero esta Obra, no tendría sentido si no contáramos con la cálida recepción de nuestros colegas de las diferentes profesiones y estudiantes avanzados vinculados a la Endocrinología. Es a ellos a quienes está dedicada la misma. Química Montpellier • 63 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Contenido de la Obra: • • • • • • • • • • • • • • • • • • • Química Montpellier • • • • 43 • • Principios del Metabolismo Celular. Principios de Bioquímica y Genética Molecular en Eucariotes. Modelos Transgénicos. Bases de la Genética en Endocrinología. Genoma. Bases de la Inmunología en Endocrinología. Interacciones Inmuno-Endócrinas. Introducción a la Endocrinología. Estructura y Función de las Hormonas. Secreción, Producción, Cinética y Transporte Hormonal. Cronobiología. en Endocrinología. Hormonas. Mecanismos de acción hormonal. Evaluación de un sistema hormonareceptor. Exploración de la Función endócrina. Tipos de Ensayos. Control de Calidad. Tests Funcionales. Radioisótopos. Valores normales y Pruebas Funcionales. Hormonas Digestivas. Fisiopatología y Diagnóstico. Bases Moleculares de la Tumorigénesis. Oncogenes. Factores de Crecimiento. Neuroendocrinología. Bases Fisiológicas. Fisiopatología y su Diagnóstico. Corteza Suprarrenal. Bases Fisiológicas. Fisiopatología y su Diagnóstico. Metabolismo Hidrosalino. Hormonas: Hipotálamicas, Adrenal y Cardiovasculares. Fisiopatología y su Diagnóstico. Médula suprarrenal. Bases Fisiológicas. Fisiopatología y su Diagnóstico. Tiroides. Bases Fisiológicas. Fisiopatología y su Diagnóstico Metabolismo del Calcio. Bases Fisiológicas. Fisiopatología y su Diagnóstico. Función Reproductiva Femenina. Bases Fisiológicas. Fisiopatología y su Diagnóstico Menopausia y Climaterio. Riesgos , Complicaciones y Laboratorio Función Reproductiva Masculina. Bases Fisiológicas. Fisiopatología y su Diagnóstico. Biología de la Reproducción. Fertilización e Implantación. Reproducción Asistida. Anticoncepción. Unidad Fetoplacentaria. Endocrinología Pediátrica. Desarrollo Normal. Fisiopatología y su Diagnóstico. Cànceres Hormonodependientes. Fisiopatología y su Diagnóstico. Páncreas Endocrino. Bases Fisiológicas. Fisiopatología y su Diagnóstico. Trastornos de la Alimentación. Tejido Adiposo. Fisiopatología. Obesidad, Anorexia y Bulimia. Imágenes en el Diagnóstico de la Patología Endocrina. Química Montpellier Fascículo I : *Principios del Metabolismo Celular Silvia I. Gonzalez-Calvar (IBYME, Fac de Medicina, UBA) *Principios de Bioquímica y Genética Molecular en Eucariotes Víctor Romanowski, Daniel H. Grasso, Mario O. Aguilar y Antonio Lagares (IBBM, Fac Ciencias Exactas, UNLP y CONICET) *Modelos Transgénicos Susana B. Rulli *Principios de Genética Médica. Nestor O. Bianchi (1,2) y Alejandro D. Bolzán (1,3,4) (IMBICE, CONICET, CICPBA, Fac Ciencias Naturales y Museo, UNLP) Química Montpellier Química Montpellier (IBYME, CONICET) • 65 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Principios del Metabolismo Celular Silvia Inés González Calvar Aspectos generales Química Montpellier Una característica esencial de los organismos multicelulares es la diferenciación celular y la distribución de funciones. Por lo tanto, diferentes tejidos tienen requerimientos energéticos y patrones metabólicos característicos. Las señales hormonales integran y coordinan las actividades metabólicas de los distintos órganos de manera que regulan la distribución de precursores y sustratos energéticos. 63 • El mantenimiento de la vida requiere el aporte constante de combustibles para los tejidos del organismo. Estos combustibles se usan para generar energía y preservar la estructura y funcionamiento de cada uno de los tejidos y órganos. Para que un individuo sobreviva, durante la fase de alimentación debe acumular el exceso calórico en forma de glucógeno y triglicéridos (TG) a fin de utilizar esas reservas durante el ayuno. Este aporte calórico se obtiene a partir de la ingesta de alimentos, los que son utilizados, directamente o bien a través de la transformación en otras sustancias, para obtener energía, reemplazar las membranas celulares, organelas y diversos componentes que sufren un recambio durante el proceso de la vida. La fase anabólica comienza con la ingestión de alimentos y se manifiesta durante varias horas. La fase catabólica usualmente comienza a observarse pocas horas después de la última ingesta y se prolonga hasta que el individuo se alimente nuevamente. Durante esta fase el organismo Química Montpellier cambia el uso de combustibles exógenos a endógenos; un cambio que se evidencia por la movilización de sustratos a partir de su almacenamiento en hígado o tejido adiposo. Estas moléculas combustibles se oxidan a dióxido de carbono y agua en presencia de oxígeno. La energía liberada en el proceso se conserva en enlaces de alta energía en las moléculas de adenosin-tri-fosfato (ATP), para ser usada en los procesos que la requieran. Así, permanentemente, las fases anabólicas y catabólicas alternan una con otra. Los mecanismos regulatorios dirigen los compuestos a través de las vías metabólicas involucradas en almacenar y utilizar estas moléculas combustibles. Estos mecanismos están controlados por las necesidades de energía del organismo, la concentración de los combustibles disponibles y ciertas hormonas (insulina, glucagon, catecolaminas, glucocorticoides). Los cambios en algunos de estos parámetros afectarán a los distintos caminos metabólicos mediante la regulación y control de la actividad de las enzimas claves de los mismos. La función de este complejo mecanismo es producir una respuesta graduada frente a un estímulo dado y además, proveer sensibilidad a diferentes tipos de estímulos, de manera tal que se forme un flujo, a través de esa vía, que cubra los requerimientos del organismo. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos La estrategia del metabolismo es formar ATP, poder reductor y unidades estructurales pequeñas para la síntesis de macromoléculas. La molécula de ATP posee un alto potencial transferencia de energía, lo que permite realizar diferentes trabajos celulares: contracción muscular, transporte activo, y biosíntesis. El ATP es generado, principalmente, por la oxidación de moléculas combustibles tales como glucosa, ácidos grasos (AG) y aminoácidos (AA). El intermediario común en la mayoría de estas oxidaciones es la acetil Coenzima A (AcCoA). La unidad acetilo es completamente oxidada a dióxido de carbono por el Ciclo de los Ácidos Tricarboxílicos Cítrico o Ciclo de Krebs (CTC) con la concomitante formación de NADH y FADH2. Estos cofactores reducidos transfieren sus electrones a la Cadena Respiratoria (CR) localizada en la membrana mitocondrial interna. El flujo subsecuente de electrones desde NADH y FADH2 a través de los distintos citocromos hasta el oxígeno establece un bombeo de protones hacia el espacio intermembrana mitocondrial, generando un gradiente de protones a ambos lados de dicha membrana. La energía contenida en esta gradiente es captada por ATPasa (también denominada ATP sintasa) la que sintetiza ATP en un proceso denominado Fosforilación Oxidativa (FO). La glicólisis es otro proceso generador de ATP, aunque en menor proporción por un mecanismo denominado fosforilación a nivel de sustrato, sin requerimiento de oxígeno. Un aumento en los niveles de ATP o NADH disminuye las actividades de las enzimas regulatorias del CTC: citrato sintetasa, isocitrato deshidrogenasa y alfa ceto glutarato deshidrogenasa. El CTC tiene tanto un rol catabólico como anabólico, ya que no sólo degrada AcCoA sino que también provee intermediarios para la biosíntesis, por ej. succinil CoA para la síntesis del hemo. Los caminos de biosíntesis y degradación son casi siempre distintos. Las moléculas son sintetizadas y degradadas por un conjunto diferente de enzimas. Esta separación de ambas vías metabólicas contribuye a un control meta-bólico más efectivo ya que son reguladas de manera diferencial y contrapuesta. Así, las velocidades de las vías metabólicas son reguladas por las actividades de las enzimas claves y no por la ley de acción de masas. REGULACIÓN ENZIMATICA La compleja red de reacciones en una célula esta muy finamente regulada y coordinada por diferentes mecanismos 1) Compartimentalización: glicólisis, ciclo de las pentosas y la síntesis de AG tienen lugar en el citosol, mientras que la oxidación de los AG, el CTC y la FO ocurren dentro de la mitocondria. Algunos procesos, como la gluconeogénesis y la síntesis de urea, ocurren entre ambos compartimientos. El destino de ciertas moléculas dependerá en qué compartimiento se encuentre. Por ejemplo, los AG son transportados hacia la matriz mitocondrial como esteres de carnitina, donde luego son rápidamente degradados. En contraste, en el citosol, los AG son esterificados o exportados. Es importante recordar que la membrana mitocondrial interna es altamente selectiva. 2.-Interacciones alostéricas: ciertas enzimas poseen, además del sitio catalítico, otro sitio, denominado alostérico, que puede unirse con diferentes compuestos (efectores). Esta unión causa un cambio conformacional en el sitio activo de modo tal que la enzima puede presentar mayor (efector positivo o activador) o menor (efector negativo o inhibidor) actividad. 3.- Modificaciones covalentes: Algunas enzimas claves de una vía metabólica, además de ser reguladas alostéricamente, están controladas por modificaciones covalentes (fosforilaciones, adenilaciones, etc). Por ejemplo, la actividad catalítica de glucógeno fosforilasa aumenta, mientras que la glucógeno sintetasa disminuye por fosforilación. Estas modificaciones covalentes están catalizadas por enzimas específicas, reguladas por hormonas. Las modificaciones covalentes de las enzimas son generalmente la etapa final de una cascada de amplificación. Consecuentemente, los caminos metabólicos pueden ser rápidamente regulados por señales disparadoras, como se ve en la acción estimulatoria de epinefrina sobre la glucogenolisis. Química Montpellier Química Montpellier Estrategia del metabolismo • 67 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos 4.- Niveles enzimáticos: las velocidades de síntesis de algunas enzimas regulatorias (inducción – represión) pueden variar en respuestas a estímulos hormonales. La activación e inhibición originadas por interacciones alostéricas causan cambios inmediatos en la actividad enzimática y consecuentemente, en el metabolismo. Las modificaciones covalentes lo afectan más lentamente. Los cambios en los niveles enzimáticos por inducción ó represión son procesos que demoran algunas horas. PRINCIPALES CAMINOS METABÓLICOS Y SITIOS DE CONTROL Química Montpellier Metabolismo de los hidratos de carbono .8 • Glucólisis: Esta secuencia de reacciones citosólicas tiene como propósito la degradación de glucosa para generar ATP por transferencia del grupo fosfato desde intermediarios de alta energía de este camino metabólico al ADP (fosforilación a nivel de sustrato). Además, en este proceso se forma NADH y esqueletos carbonados que serán utilizados en otras vías biosintéticas. La enzima regulatoria de la glucólisis es la fosfofructoquinasa I. Esta enzima es inhibida por altos niveles de ATP y citrato y es estimulada por AMP. Por lo tanto, la velocidad de esta vía depende de las necesidades energéticas de la célula (que se evidencia por la relación ATP/ AMP) y por la necesidad de unidades estructurales o esqueletos carbonados (que se evidencia por los niveles celulares de citrato). En condiciones de anaerobiosis el NADH formado en la glucólisis es reoxidado por conversión de piruvato en lactato por la enzima lactato deshidrogenasa. En aerobiosis, los equivalentes de reducción del NADH pueden ser transferidos a la CR y el piruvato puede ser oxidado completamente a CO2 en el CTC. Debido a que la membrana interna mitocondrial es impermeable al NADH, esta transferencia de equivalentes de reducción Química Montpellier desde el citosol a la mitocondria se realiza por sistemas denominados lanzaderas (lanzadera del malato – aspartato y lanzadera del glicerol3-fosfato). Para que el piruvato obtenido en la glucólisis sea oxidado a CO2 y agua debe ser previamente transformado irreversiblemente en AcCoA mediante una descarboxilación oxidativa catalizada por el complejo enzimático piruvato deshidrogenasa (PDH). Ciclo de las pentosas: esta serie de reacciones tiene como objetivo la generación de NADPH para las síntesis reductivas y la formación de ribosa 5-fosfato para la síntesis de nucleótidos. Este proceso está regulado a nivel de la enzima glucosa 6 fosfato deshidrogenasa. Gluconeogénesis: La glucosa puede ser sintetizada por el hígado y los riñones a partir de precursores tales como lactato, glicerol y AA. Estos metabolitos pueden ser convertidos a piruvato, el cual es carboxilado a oxalacetato en la mitocondria. El oxalacetato es luego decarboxilado y fosforilado en el citosol para formar fosfoenolpiruvato. Luego por una serie de reacciones similares a la glucólisis pero en sentido inverso, se sintetiza fructosa 1,6bifosfato, compuesto que es hidrolizado por una fosfatasa específica, a fructosa 6-fosfato, el cual es convertido en glucosa 6-fosfato. El hígado posee la enzima glucosa 6-fosfatasa que convierte la glucosa 6-fosfato en glucosa. Gluconeogénesis y glucólisis se regulan de manera recíproca, es decir AMP y NADH inhiben y citrato activa a la fructosa 1,6-bifosfatasa, enzima clave de la gluconeogénesis. La fructosa 2,6-bifosfato es un metabolito sintetizado por la fosfofructo quinasa II que activa la glucólisis mientras que inhibe la gluconeogénesis. Glucogenogénesis y glucogenólisis: El glucógeno es un polímero ramificado de unidades de glucosa, que sirve como reserva energética en hígado y músculo. El intermediario activado en su síntesis es la UDP-glucosa, la cual es formada a partir de uridin tri-fosfato (UTP) y glucosa 6-fosfato. La glucógeno sintetasa cataliza la transferencia de glucosa desde la UDP-glucosa hacia el hidroxilo terminal de la cadena en crecimiento. La enzima glucógeno fosforilasa cataliza la degradación de glucógeno para dar glucosa 1-fosfato. La síntesis y degradación de glucógeno están coordinada- mente reguladas por una cascada de reacciones disparadas hormonalmente (insulina, glucagon, catecolaminas), de modo tal que una de las vías está activada y la otra inhibida. Estas enzimas están reguladas por fosfo-defosforilación e interacciones alostéricas. Los niveles de glucosa plasmática son regulados fundamentalmente por el hígado, que responde a señales hormonales y a los niveles de glucemia per se. El hígado y, en menor proporción, el riñón pueden formar glucosa libre por ser los únicos órganos que poseen actividad de glucosa 6-fosfatasa. El músculo tiene un importante depósito de glucógeno como reserva energética. Este tejido, como el cerebro, no posee glucosa 6-fosfatasa, por lo que no tiene capacidad para exportar glucosa. Cuando el músculo se contrae, hay una activa glucólisis y si el aporte de oxígeno no es suficiente, el piruvato formado no entra al CTC y es reducido a lactato, el cual va hacia el hígado donde se reconvierte en piruvato, sustrato de gluconeogénesis. Este intercambio se conoce como Ciclo de Cori y transfiere parte de la carga metabólica del músculo al hígado. Además, en el músculo en actividad, se forma una gran proporción de alanina, por transaminación de piruvato. La alanina, igual que el lactato, puede ser convertida en glucosa en el hígado (Ciclo de la alanina). En el músculo en descanso, el metabolismo muscular es diferente: el principal combustible son los AA. En particular, en el músculo cardíaco los cuerpos cetónicos sirven como fuente de energía preferentemente a la glucosa. Metabolismo de los lípidos Síntesis y degradación de ácidos grasos: Los AG son sintetizados en el citosol por la adición de unidades de 2 carbonos a una cadena en crecimiento o a una proteína transportadora de acilos. El malonil CoA, intermediario activado, es formado por la carboxilación de AcCoA. Los grupos acetilos son transferidos desde la mitocondria al citosol por la lanzadera del citrato. Este transporte genera en el citosol parte del NADPH necesario para la síntesis, el resto proviene del ciclo de las pentosas. El citrato estimula a la acetil CoA carboxilasa, la enzima que cataliza el paso clave de esta biosíntesis. Cuando el ATP y la AcCoA son abundantes, el nivel de citrato aumenta, el cual acelera la velocidad de síntesis de AG. Los AG son degradados de manera diferente en un compartimiento distinto. Ellos son degradados a Ac CoA en la matriz mitocondrial por βoxidación, que entra, luego, al CTC si el aporte de oxalacetato es suficiente. Alternativamente, AcCoA puede dar origen a los cuerpos cetónicos. El FADH2 y el NADH formado en la β-oxidación transfieren sus electrones al O2 en la CR. La β-oxidación continúa sólo si NAD+ y FAD son regenerados. Por lo tanto, la velocidad de la degradación de los AG está también acoplada a las necesidades de ATP. El hígado juega un rol central en el metabolismo de los lípidos. Luego de una ingesta, los combustibles son abundantes, y el hígado, a partir de los hidratos de carbono, sintetiza AG en el citosol, éstos se esterifican a TG y son excretados a la sangre como lipoproteínas. Simultáneamente, la oxidación mitocondrial de los AG es impedida por el malonil CoA. Este metabolito inhibe a la carnitina acil transferasa I, involucrada en el transporte de AG hacia la mitocondria donde se localizan las enzimas de la β-oxidación. Durante el ayuno, en el hígado se observa una disminución de la síntesis de AG y por lo tanto de malonilCoA, facilitándose la entrada de AG a la mitocondria para ser oxidados. El tejido adiposo es la reserva más importante de triglicéridos. Es el órgano principal de síntesis de AG, los cuales son activados a AcCoA y transferidos al glicerol para la formación de triacil glicéridos. El glicerol 3-fosfato, un intermediario clave en esta biosíntesis, proviene de la reducción de la dihidroxi acetona fosfato, que se forma durante la glucólisis. El tejido adiposo es incapaz de fosforilar el glicerol endógeno porque carece de glicerol kinasa . Por lo tanto, los adipocitos necesitan glucosa para la síntesis de triglicéridos. La lipasa hormono sensible (LHS) activada por glucagon en el ayuno o catecolaminas en el estrés, degrada estos TG a AG. Estos AG son transportados por la albúmina al hígado, donde son oxidados (β-oxidación) para generar energía (ATP y coenzimas reducidas) necesaria para la gluconeogénesis. Química Montpellier Química Montpellier FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos • 9. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Metabolismo de lipoproteínas: Las lipoproteínas VLDL (lipoproteína de muy baja densidad) son producidas en el hígado principalmente a partir de los hidratos de carbono de la dieta. Se denomina lipogénesis al proceso por el cual la glucosa es convertida en piruvato, éste en AcCoA, sustrato para la síntesis de AG. Estos son luego esterificados con el glicerol fosfato para formar triglicéridos, los que salen del hígado como VLDL. En el intestino se forman los quilomicrones a partir de los lípidos de la dieta. Los TG de los quilomicrones y VLDL son digeridos por lipoproteinlipasa (LPL), una enzima que se encuentra en el endotelio de los capilares de los tejidos periféricos. Los AG son liberados, tomados por dichos tejidos y oxidados a CO2 y agua para producir energía. LPL convierte el quilomicrón en quilomicrón remanente, y a la VLDL en IDL (lipoproteína de densidad intermedia) y ésta en LDL (lipoproteína de baja densidad). Estos productos que tiene un bajo contenido en TG son tomados por el hígado por un proceso de endo-citosis y degradados por acción lisosomal. La endocitosis de LDL ocurre tanto en hígado como en tejidos periféricos. Otra lipoproteína, la HDL (lipoproteína de alta densidad) es la encargada de transportar el colesterol desde los tejidos periféricos hacia el hígado e intercam-biar lipoproteínas y lípidos con los quilomicro-nes y la VLDL. Inversamente la LDL lleva colesterol a los tejidos. Química Montpellier Metabolismo de los aminoácidos: 10 • El organismo mantiene en la sangre un pool importante de amino ácidos (AA), de modo tal que los tejidos disponen libremente de los mismos, aún en una situación de ayuno, para la obtención de energía, síntesis de proteínas y derivados esenciales tales como neurotransmisores y hormonas. Los AA representan una fuente importante de sustratos gluconeogénicos para el hígado. Este pool de AA deriva de la dieta y del recambio de proteínas del organismo y es metabolizado y degradado fundamentalmente en el hígado. En este proceso catabólico los AA se oxidan, y el esqueleto carbonado se convierte en glucosa, cuerpos cetónicos o dióxido de carbono. A partir del nitrógeno amínico se genera amoniaco (NH3), que es tóxico para las células y por lo tanto se convierte en urea (exclusivamente en el hígado) que se excreta por la orina. El nitrógeno derivado del catabolismo de AA en otros tejidos es convertido en alanina o glutamina y transportado al hígado. Los AA ramificados (valina, isoleucina, leucina) son oxidados principalmente en el músculo esquelético y otros tejidos, pero no en el hígado. La glutamina juega un rol central en el metabolismo intermedio. En el riñón, la glutamina libera NH4+, que se excreta en la orina, ayudando a mantener el pH del organismo. En las células en rápido crecimiento y recambio, como los enterocitos, linfocitos o macrófagos, la glutamina es usada como combustible, como dador de nitrógeno en reacciones de biosíntesis de bases púricas y como sustrato en la síntesis de proteínas. Durante las condiciones de sepsis, trauma o injuria el organismo atraviesa una fase catabólica caracterizada por un balance nitrogenado negativo, donde se observa una degradación del músculo esquelético que aumenta la disponibilidad de glutamina y otros AA para la división celular y síntesis de proteínas en las células involucradas en la respuesta inmune y la cicatrización. En estas condiciones, la proteólisis está aumentada como consecuencia del aumento de los niveles de glucocorticoides liberados desde la glándula adrenal. El progreso en el conocimiento de la Biología Celular ha sido un factor decisivo en el desarrollo concomitante de la Medicina y el Laboratorio Endocrino. La interpretación racional de los fenómenos fisiológicos y patológicos, en paralelo con la incorporación de nuevo equipamiento y metodologías serán aún más trascendentes en el futuro y permitirán una mejor calidad de vida de los individuos. Bibliografía • Biochemistry. L. Stryer. W.H.Freeman & Co. Eds., New York, USA, 1998. • Principios de Bioquímica. A.L.Lehninger, D.L.Nelson, M.M.Cox, Ediciones Omega S.A., Barcelona, España, 1995. • Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations. T.M.Devlin Editor, Willey-Liss., New York, USA, 1997 • Textbook of Endocrine Physiology. J.E.Griffin and S.R.Ojeda Eds, Oxford University Press, New York, USA, 2000. • Basic Medical Biochemistry. A Clinical Approach. D.B.Marks, A.D.Marks, C.M.Smith. Williams and Wilkins Ed., Baltimore, USA, 1996. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Principios de Genética Molecular de Eucariotas Víctor Romanowski, Daniel H. Grasso, Mario O. Aguilar y Antonio Lagares INFORMACIÓN GENÉTICA La caracterización estructural de los ácidos nucleicos se inicia recién en el siglo XIX con la descripción de la nucleína (ADN y proteínas). Y sin conocer aun la estructura de los mismos, a mediados del siglo XX se consigue mostrar que el ADN era el componente cromosómico ligado a la herencia en ensayos realizados con bacterias (Griffith, 1928; Avery, MacLeod y McCarthy, 1944; Hershey y Chase, 1952). Sin embargo, el comienzo de la Genética Molecular moderna es asociado con el descubrimiento de la estructura de doble hélice del ADN por Watson y Crick en el año 1953. Este descubrimiento sentó las bases estructurales iniciales que permitieron avanzar en el medio siglo siguiente hacia la descripción molecular del dogma central: ADN-ARN-proteína. Sin embargo, hoy sabemos que, si bien el ADN es el depositario de la información genética en eucariotes y en procariotes (bacterias), muchos de los virus que atacan estas células utilizan ARN como material genético, dando lugar a un flujo de información hacia la síntesis de proteínas que no es el descripto en el dogma central. Presentamos a continuación algunas de las características estructurales más relevantes del ADN y ARN que puede analizarse a diferentes niveles: estructura primaria, estructura secundaria, y estructuras de orden superior. Constituyentes nucleotídicos. Estructura primaria (secuencia). Los ácidos nucleicos son polinucleótidos. Los nucleótidos por su parte están constituidos por la unión de un azúcar a una base nitrogenada (que forman un nucleósido), y a un grupo fosfato. En el caso del ADN, el azúcar es la desoxiribosa, mientras en el ARN se utiliza ribosa. En cuanto a las bases, en el ADN encontramos adenina (A), guanina (G), citosina (C) y timina (T); con uracilo (U) en lugar de timina en el ARN. Los nucleótidos que forman parte del ADN y ARN se presentan en la Figura 1. En los ácidos nucleicos los nucleótidos de la figura se encuentran unidos por enlaces fosfodiester 5’- 3’ (esto hace referencia a los carbonos del azúcar) formando polímeros desde unas pocas unidades hasta varios millones dependiendo del ácido nucleico y del organismo. Cabe destacar finalmente que en ciertos tipos de ARN, como en los de transferencia (tARN), es muy frecuente encontrar nucleótidos con otras bases (ej. hipoxantina) o con bases modificadas. Como veremos más adelante la biosíntesis enzimática de ácidos nucleicos ocurre a partir de nucleósidos 5’ trifosfatos (NTPs) para el caso del ARN o de desoxinucleósidos-5’- trifosfatos (dNTPs) para el caso del ADN. Vinculado a ello, la inclusión de nucleósidos modificados Química Montpellier Estructura de ácidos nucleicos • 11 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Figura 1. Nucleótidos: se muestran los nucleósidos monofosfatos componentes del DNA (desoxirribonucleótidos) (A), y del RNA (ribonucleótidos) (B) Química Montpellier análogos a los utilizados in vivo es desde hace tiempo una estrategia muy utilizada para inhibir la replicación de células tumorales, y también la replicación viral. Los nucleósidos (profármacos) son transformados in vivo a sus nucleótidos trifosfatos que son los inhibidores directos del proceso de síntesis. En la Figura 2 se muestran algunos de los análogos utilizados 12 • en el tratamiento de infecciones por el virus de la inmunodeficiencia humana HIV-1/HIV-2. La importancia del conocimiento del ADN a nivel de estructura primaria (génica /extragénica) se sustenta en que la función codificada por una región genómica particular depende de su secuencia y, más propiamente, del modo en que la misma es reconocida FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Figura 2. Análogos de nucleósidos inhibidores de la transcripción inversa. Estructura secundaria del ADN: La doble hélice En el año 1953 Watson y Crick establecieron mediante interpretación de espectros de rayosX, la estructura de doble hélice para el ADN de doble cadena tipo B (puede consultarse el trabajo original en http://biocrs.biomed. brown.edu/Books/Chapters/ Ch%208/DHPaper.html). Este arreglo conformacional del ADN representa la forma natural en la que comúnmente se encuentra y aísla el ADN de doble cadena. La estructura está básicamente constituida por dos cadenas antiparalelas (cadenas orientadas en forma opuesta respecto de los hidroxilos 5’ y 3’ libres de las desoxiribosas terminales) generando una hélice con giro “a derecha” que presenta las características estructurales que se describen en la primera columna de la Tabla 1. La doble hélice se estabiliza esencialmente por puentes de hidrógeno e interacciones hidrofóbicas entre las bases nitrogenadas que se orientan hacia el interior. Los grupos fosfatos cargados negativamente se localizan en la superficie de la hélice, orientados hacia el entorno acuoso. Química Montpellier por otras moléculas con función regulatoria (esencialmente proteínas). Uno de los avances más relevantes de la última década ligado a la estructura primaria de ácidos nucleicos ha sido la determinación de las secuencias nucleotídicas completas de genomas de diferentes organismos procariotas y eucariotas, cubriendo varias decenas de bacterias con características bioquímicas diferentes, parásitos, plantas, y mamíferos incluyendo ratón y el humano (puede accederse a la base de datos del GenBank a través de NCBINational Center for Biotechnology Information en la siguiente dirección electrónica: http: //www.ncbi.nlm.nih.gov/Genomes/ index.html). Este avance directamente ligado al desarrollo de nuevas tecnologías de manejo de muestras y secuenciamiento automatizado ha sentado las bases para el crecimiento de una nueva disciplina, la Genómica, vinculada al estudio estructural y funcional (individual y comparado) de genomas completos. La disponibilidad de la estructura primaria completa de un genoma es una herramienta esencial para el rápido avance hacia la caracterización de defectos genéticos aún no caracterizados que estén ligados a la expresión de enfermedades específicas. • 13 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Puede consultarse: http://www.blc.arizona.edu/Molecular_ Graphics/DNA_Structure/DNA_ Tutorial.HTML, http://www.ncc.gmu.edu/ dna/, http://www.biology.arizona.edu/ biochemistry/activities/DNA/DNA_ intro.html Además de la forma B, existen naturalmente al menos otras dos formas de ADN doble cadena que corresponden a los denominados ADN A y ADN Z (este último formando una hélice con giro “a izquierda” (Tabla 1, columnas 2 y 3). El uso de bacterias recombinantes y de enzimas de modificación (metilación) que son capaces de discriminar el tipo de estructura B ó Z en el ADN sustrato, ha permitido demostrar la existencia in vivo de regiones con estructura Z en zonas específicas del ADN caracterizadas por secuencias del tipo (purina-pirimidina)n, en particular (CG)n. La estructura de ADN A, por su parte, puede encontrarse en formas esporuladas a las que confiere por ejemplo mayor resistencia a la radiación. Es interesante que mutantes carentes de proteínas denominadas SAPs son incapaces de inducir la formación de ADN A, hecho que sugiere la necesidad de las mismas para la formación in vivo de esta variante conformacional del ADN (la forma de ADN A puede ser inducida in vitro por deshidratación parcial del ADN tipoB). Hélices de tipo A se encuentran también naturalmente en ARNs con regiones con extensa autocomplementariedad (ver estructuras secundarias en forma de tallohorquilla en rARNs) y en moléculas de ARN de doble cadena como es el caso de los genomas y de las formas replicativas de algunos virus. Aunque las formas de doble hélice adoptadas por el ADN han sido las más caracterizadas desde el punto de vista estructural, existen virus en los que la forma genómica de su ADN es de simple hebra. Tabla 1. Química Montpellier Características estructurales más relevantes de los tres tipos básicos de ADN de doble cadena. 14 • FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Estructura terciaria del ADN. Superenrollamiento, cromatina El cálculo de la longitud de diferentes genomas a ADN asumiendo una estructura tipo B resulta en dimensiones inmensas con relación al tamaño de las células que los contienen (Tabla 2). Existen por tanto arreglos estructurales especiales que permiten el eficiente empaquetamiento y organización del material genético, de modo que sea al mismo tiempo accesible a los sistemas regulatorios que hacen uso de la información almacenada. Uno de los mecanismos que conducen al empaquetamiento del ADN es el superenrollamiento, es decir el giro sobre si mismo de una doble hélice de ADN circular o de extremos fijos. El superenrollamiento es inducido por las tensiones que se generan cuando existen más (o menos) de 10,5 pb/vuelta de ADN tipo B, que son los que corresponden a su estado relajado. Al superen-rollarse, dicha tensión es distribuida en toda la molécula alcanzando espontáneamente una conformación más compacta y de menor energía. Si bien el superenrollamiento existe tanto en organismos procariotes como eucariotes, en los primeros es mejor comprendido por una cuestión de sencillez. La inhibición de enzimas específicas ha mostrado la importancia funcional del estado topológico del ADN para el crecimiento bacteriano: antibióticos que inhiben la enzima girasa, una topoisomerasa de tipo II que modifica el estado de superenrollamiento del ADN, inhiben en crecimiento bacteriano. Tabla 2 Considerar el superenrollamiento del ADN en bacterias como un mero mecanismo para compactar ADN parece hoy un argumento incompleto dado el escaso conocimiento sobre el rol de las diferentes formas topológicas del ADN sobre la fisiología celular. Un hecho significativo que refleja la importancia del superenrollamiento en la estructura y función genómica en eucariotes es el elevado contenido de topoisomerasas presente entre las proteínas del esqueleto (scafold) de los cromosomas. Sobre dicho esqueleto proteico, el ADN se encuentra, además, cuidadosamente empaquetado formando una compleja estructura dinámica nucleoproteica, la cromatina (puede consultarse en http:// www.ndsu. nodak.edu /instruct/mcclean/plsc431/eukarychrom/ eukaryo3.htm), cuyo estado de condensación tiene gran variación a lo largo del ciclo celular. El estado de condensación de la cromatina en un momento particular del ciclo es el resultado del tipo de interacciones ADN-proteína existentes. Las histonas (H1, H2A, H2B, H3, y H4), que son los principales componentes proteico de la cromatina, son proteínas con casi un tercio de aminoácidos básicos (Lys, Arg) y representan una masa total equivalente a la del propio ADN. Las cinco histonas se encuentran entre las proteínas más conservadas entre organismos eucariotas distantes, hecho que refleja también la existencia de mecanismos muy conservados en lo que hace al depósito y uso dinámico de la información dentro de los cromosomas. Química Montpellier Comparación del tamaño celular de diferentes ADNs respecto de su tamaño (hipotético) bajo la forma tipo B • 15 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier Es interesante que en arquebacterias se han encontrado proteínas con similitud a las histonas. Además de las histonas existen en la cromatina otras proteínas minoritarias como protaminas, HMG (high mobility group), proteínas del esqueleto nuclear (scafold) y varias proteínas con actividad enzimática. Como resultado de la asociación del ADN con proteínas específicas pueden al menos considerarse cuatro niveles de organización (empaquetamiento): 1) nucleoso-mas de 10 nm, 2) fibras de 30 nm (solenoides de algo más de 6 nucleosomas/vuelta), 3) asas de eucromatina (50-100 kb de fibras de 30 nm) y bucles de heterocromatina de aprox. 1 µm, y 4) cromosomas metafásicos. Los nucleosomas y las fibras a que dan lugar han sido obtenidos y caracterizados mediante la combinación de métodos enzimáticos, microscópicos, y de difracción. Cada nucleosoma incluye un tramo de DNA de aproximadamente 200 pb, una molécula de histona H1 y dos moléculas de cada una de las otras histonas formando un octámero. Algunas de las proteínas HMG interactúan con el propio octámero mientras que otras lo hacen con el ADN espaciador. Como resultado final del proceso de empaquetamiento, en la fase M el grado de condensación del ADN es cercano a 50.000 (cociente entre el largo esperado para un ADN extendido con estructura B, y el mismo ADN empaquetado). En la interfase, por su parte, el grado de condensación local de la cromatina disminuye y es muy variable, hecho que permite diferenciar regiones de eucromatina (no muy condensada, transcripcionalmente activa) y de heterocromatina (altamente condensada aunque menor que la del cromosoma metafásico, intensamente teñida con May Grünwald 16 • Giemsa, minoritaria) (http://cellbio.utmb. edu/cellbio/ nucleus2.htm). En un proceso opuesto, toda la cromatina adopta una forma de tipo heterocromática al final de la fase G2. La espectacular dinámica de estos procesos está íntimamente ligada al delicado equilibrio entre la necesidad de almacenar la información y la necesidad de acceder a la misma en forma adecuada. Existe de todos modos heterocromatina constitutiva (i.e. satélites en regiones teloméricas) que se encuentra bajo dicha forma estructural en todo el ciclo celular, descondensándose sólo para la replicación en la fase S. Los métodos de extracción de ADN más utilizados hacen uso en general de agentes enzimáticos (proteasas) y químicos (fenol) que destruyen y desnaturalizan las proteínas asociadas con el ADN. Es posiblemente por esta razón que resulta frecuente referirse a la estructura de los ácidos nucleicos como moléculas desnudas. Como hemos visto, el ADN interactúa in vivo con un número muy grande de proteínas de distinto tipo. Muchas de ellas cumplen su función como componentes esencialmente estructurales (como histonas) mientras otras, más diversas y dependientes del estadío del ciclo celular y de la condición fisiológica, ejercen funciones regulatorias por interacción directa con secuencias específicas del genoma (ej. factores de transcripción, topoisomerasas). A pesar de esta aparente dualidad entre componentes estructurales y proteínas regulatorias, existen hoy evidencias cada vez más concluyentes respecto de cómo cambios finos en la estructura de la cromatina (acetilaciones, fosforilaciones) afectan los perfiles locales de expresión génica. Replicación y ciclo celular Una característica común a los organismos vivos es la transferencia de todo o parte (organismos sexuados) de su material genético a la descendencia. La multiplicación viral, la división binaria en procariotas y en eucariotas unicelulares, y los procesos de reducción cromosómica durante la gametogénesis en organismos multicelulares sexuados van siempre acompañados por una instancia de copia y a veces de reducción del material genético que pasará a ser parte de la progenie. La replicación es entonces el conjunto de procesos bioquímicos que resultan en la copia fiel del ADN genómico, o del ARN genómico para el caso de varios tipos de virus. No haremos aquí mención explícita a eventos de replicación viral dado que pueden seguir estrategias muy variadas. Para el caso de la replicación del ADN en bacterias y células eucarióticas se requieren al menos los siguientes componentes que hacen al funcionamiento de la maquinaria de replicación: un ADN molde, sitio/s de iniciación con secuencias específicas (orígenes de replicación: ori, que dependen del organismo), varias proteínas accesorias (helicasas y proteínas de unión a simple hebra que preparan la conformación del ADN en forma de hebras abiertas para su copia, topoisomerasas), enzimas polimerasas que inician y sostienen el proceso de síntesis a partir de dNTPs sustratos, y finalmente ligasas que aseguran la continuidad de los fragmentos sintetizados. En el propio origen de replicación se separan ambas cadenas por acción de proteínas específicas, se inicia luego la síntesis de ADN dando lugar a una horquilla de replicación que se desplaza (en una o en ambas direcciones) a medida que el nuevo ADN-copia es sintetizado. El proceso central de polimerización es llevado a cabo por las ADN polimerasas a partir de los dNTPs. Las ADN polimerasas, sin embargo, no son capaces de iniciar la síntesis de ADN a partir de una hebra sencilla producto de la apertura que ya hemos comentado de la doble hebra. Por tanto, una vez que el ADN es abierto actuará una ARN polimerasa (primasa en E. coli) que formará un pequeño ARN (cebador) que será posteriormente extendido por las ADN polimerasas que ahora sí pueden extender a partir del extremo 3’ el cebador recién sintetizado (el cebador será finalmente eliminado, ver más adelante). A pesar de que este proceso ocurre de forma análoga en ambas cadenas, la síntesis de cada una de las hebras hijas no tiene lugar del mismo modo debido a una de las características catalíticas de las polimererasas. Una propiedad ubicua de todas las polimerasas, tanto de ADN como de ARN, es que la polimerización (crecimiento de la cadena nueva) ocurre exclusivamente en dirección 5’ – 3’. Por tanto, a medida que la horquilla de replicación avanza, sólo una de las dos hebras antiparalelas de ADN molde se puede copiar en forma continua. La otra hebra debe esperar a que la horquilla avance y pueda realizarse la síntesis en dirección 5’ – 3’ en tramos discontinuos, dando lugar a los llamados fragmentos de Okazaki (http:// www.johnkyrk.com/DNAanatomy.html). En bacterias la polimerización de ambas cadenas depende de la actividad de la ADNpol-III que es la de mayor procesividad (número de nucleótidos incorporados a la hebra en crecimiento antes de que la enzima se disocie del molde) comparada con la polimerasas ADNpol-I y ADNpol-II. Más allá de esta diferencia que hace a la función central de la ADNpol-III en la polimerización de largos fragmentos de ADN, las tres polimerasas tienen actividad exonucleasa 3´ - 5’ que les permite corregir errores durante la síntesis (proofreading) y mejorar su fidelidad. Las ADN polimerasas tienen en promedio una tasa de error de aproximadamente 1 nucleótido cada 106 – 108 (comparar con el tamaño de un genoma bacteriano que es en el orden de 106 pb). La ADNpol-I tiene además una actividad exclusiva exonucleasa 5’ - 3’. Esta enzima es la responsable de remover los cebadores de ARN que encabezan cada uno de los extremos 5’ en que se ha iniciado la síntesis. La misma enzima completa la síntesis de ADN en dichos espacios. La ligasa unirá finalmente los extremos 3’ y 5’ contiguos resultantes, dando lugar a hebras continuas terminadas. Debemos mencionar además que en eucariotes existen sistemas complementarios destinados a mantener el Química Montpellier FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos • 17 Química Montpellier FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos 18 • largo de las regiones teloméricas (extremos de los cromosomas). Téngase en cuenta que en la doble hebra no es posible copiar desde el extremo mismo las terminaciones 3’ de las cadenas (recuérdese que la replicación sólo se inicia con cebadores de ARN que son finalmente removidos). Dicho problema se corrige mediante la actividad de enzimas de naturaleza ribonucleoproteica (telomerasas) con capacidad de extender los telómeros y contrarrestar asi el acortamiento que resulta de los sucesivos eventos de replicación a lo largo de la vida celular. La situación es diferente en bacterias ya que en la mayoría de las especies los cromosomas son circulares. En células eucariotes existen más de cinco ADN polimerasas diferentes: la ADNpolα que actúa a la vez de primasa e inicia la polimeriza-ción del ADN, las ADNpol-δ y ADNpol-ε responsables de la mayor parte de la elongación, la ADNpol-γ que replica el genoma mitocondrial, y la ADNpol-β que participa en los procesos de reparación. Las tres polimerasas que se encargan de la elongación tienen actividad de proofreading y tienen alta procesividad. Otra diferencia funcional con las enzimas bacterianas es que los ARN cebadores son removidos por nucleasas específicas y los espacios rellenados por las mismas ADNpol-_ y ADNpol-_. Si bien existen otras polimerasas recientemente descubiertas, las mismas están asociadas a procesos de reparación y recombinación. Un aspecto del proceso de replicación al que aún no hemos hecho referencia es el de su duración y coordinación con el resto del ciclo de división celular. ¿Cómo se realiza en el momento y tiempo adecuados la replicación de genomas que varían en tamaño desde unos pocos millones de pares bases en bacterias, hasta varias megabases en organismos eucariotas (>109)? La respuesta a esta cuestión debe encontrarse en la conjunción de diferentes factores que incluyen la velocidad de polimerización (500-1000 nucleótidos/ segundo en bacterias y 10-50 veces más lenta en diferentes organismos eucariotas), la procesi-vidad de las polimerasas, y el número de orígenes/genoma. En E. coli, existe un único origen de replicación para el cromosoma por lo que existe un único replicón (región de ADN que es replicada a partir de un mismo origen de replicación). En eucariotes existen, por el contrario, múltiples replicones en cada cromosoma que permiten duplicar todo el genoma dentro de la fase S del ciclo celular (ver más adelante). Cómo es la coordinación de la iniciación, elongación y terminación entre los diferentes replicones es una cuestión de resolución aun pendiente. Ciclo celular en células embrionarias tempranas y en células somáticas Una de las características distintivas entre los organismos procariotas y las células eucariotas es el modo muy diferente en que cada uno de ellos controla su respectivo ciclo celular. Mientras en organismos procariotas el inicio y control de la división está esencialmente ligado a la disponibilidad de nutrientes, las células eucariotas poseen un complejo ciclo celular cuya dinámica y regulación dependen del tipo de célula, del estadio de desarrollo (en organismos pluricelulares), y de una gran variedad de señales extracelulares solubles y resultantes también del contacto célula. La descripción de la pérdida de control y desregula-ción del ciclo celular permite ejemplificar hoy varios procesos de oncogénesis a nivel molecular. El ciclo celular de células somáticas en un organismo adulto transcurre a través de las siguientes fases: G1 (gap 1, luego de la división celular preparación para la replicación), S (síntesis de ADN), G2 (gap 2, preparación para la mitosis luego de la replicación), y M (mitosis) (puede verse http://vlib.org/Science/Cell_ Biology/cell_cycle.shtml, http://genomewww. stanford.edu/cellcycle/, http:// cellcycle-www.stanford.edu/cellcycle/). En este esquema, el período de interfase incluye las fases G1-S-G2. Algunos tipos celulares que no ingresan a la fase S, como neuronas adultas por ejemplo, salen de G1 e ingresan a un nuevo estadio denominado Go, de latencia en lo hace a la replicación y división. Otros tipos de células que ingresan en Go pueden retomar su ciclo celular activo por acción de estímulos externos específicos. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos a que hemos hecho referencia. En el estudio de los componentes regulatorios del ciclo celular se han utilizado (y se utilizan hoy) diferentes sistemas biológicos. El uso de oocitos de Xenopus leavis, por ejemplo, ha facilitado el descubrimiento del factor promotor de la mitosis (MPF, mitosispromoting factor), presente en máxima concentración en el citoplasma de células premitóticas. El trabajo con oocitos de Xenopus y con huevos fecundados de erizo de mar ha permitido manipular y microinyectar citoplasma de los mismos sobre distintos tipos de células para evaluar la presencia de componentes con actividad promotora de la mitosis y su variación a lo largo del ciclo (Figura 3). Estudios posteriores con otros organismos han permitido determinar que el MPF es un componente ubicuo desenca-denante de la mitosis, y que está compuesto por una quinasa (Cdk, cyclin dependent kinase), cuya actividad y especificidad es dependiente de su unión a una ciclina específica, la ciclina B. Hoy se conocen varios complejos quinasa-ciclina cuyas actividades regulan la transición entre las diferentes fases del ciclo celular. Mientras en levaduras y otros organismos existe una única quinasa que varía su especificidad por intercambio de ciclinas, en Figura 3. Variaciones en la concentración de MPF y ciclina B a lo largo del ciclo celular en huevos fecundados de erizo de mar. En la parte inferior de la figura se muestra la separación de proteínas de cada fase del ciclo en SDS-PAGE (modificado de Alberts et al., 1995). Química Montpellier Otra variante del ciclo celular es la que tiene lugar en células embrionarias tempranas, en las que sólo se observa una secuencia -M-S-MS- dado que la interfase se requiere sólo para la replicación del ADN. El citoplasma celular del huevo y embrión temprano ya contienen los componentes necesarios para una rápida serie de transiciones -S-M-S- sin necesidad de los períodos G1 y G2. Con una activa división nuclear en esta fase temprana del desarrollo casi no existe crecimiento citoplásmico. Sin embargo, ¿qué ocurriría si la misma estructura del ciclo celular del embrión temprano fuera conservada durante el desarrollo y posterior crecimiento, y mantenimiento de los tejidos? En células de estadios embrionarios más avanzados y del organismo adulto en general, el ciclo celular debe sin duda dedicar parte de su tiempo al propio crecimiento celular. En las células somáticas se requiere entonces un período de interfase que contemple la producción de la biomasa celular además de la replicación del material genético. En este esquema existe por cierto una única replicación/ciclo, y sólo en aquellas células que alcanzaron el tamaño y contenido adecuados. Estas observaciones denotan la existencia de controles muy precisos que regulan la transición entre cada una de las fases del ciclo • 19 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier mamíferos la situación es más compleja e incluye varias quinasas y ciclinas (Cdk4-ciclina D y Cdk6-ciclina D en fase G1 temprana, Cdk2-ciclina E en fase G1 tardía; Cdk2-ciclina A en fase S; y Cdk1-ciclina A y Cdk1-ciclina B en fase M). Como el término lo indica, las ciclinas son de aparición cíclica derivado de la síntesis y degradación secuencial de las mismas. Estas proteínas que se activan por acción de quinasas y fosfatasas específicas, se degradan en momentos muy precisos del ciclo celular. En el caso de la ciclina B constituyente del MPF, la degradación ocurre en proteasomas, complejos proteolíticos macromoleculares encargados de la degradación de proteínas citoplásmicas marcadas específicamente con cadenas de ubiquitina. Los complejos Cdk- 203 • ciclina mitótica que aumentan su concentración hasta alcanzar un pico en la fase pre-mitótica, son los encargados de inducir los cambios que llevan a la condensación cromosómica, la disolución de la membrana nuclear, y finalmente el inicio de la anafase por activación por fosforilación del complejo promotor de la anafase (APC, anaphase promoting complex). Es interesante que también por actividad quinasa del APC se desencadena la destrucción de su propio activador, el MPF (Figura 4). La inactivación del APC se extiende hacia la fase G1 reiniciando el ciclo celular, con nuevo aumento paulatino del MPF que alcanzará su máximo al inicio de la fase M. La genética de quinasas y ciclinas ha sido originalmente analizada en mucho detalle utilizando levaduras Figura 4: Representación esquemática de la participación del APC en la promoción de la anafase y la degradación de la ciclina B del MPF (modificado de Lodish et al., 2002) FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos cuando se egresa de la fase S, y del huso mitótico en fase M. Dependiendo del tipo de células los puntos de control dominantes (check points) suelen realizarse ya sea en la transición G1-S (como en mamíferos), o en el ingreso a G2 (como en levaduras) (Figura 5). Una de las proteínas más estudiadas en relación al punto de control G1 es el oncosupresor p53. Si existe daño en el ADN la proteína p53 es fosforilada aumentando su estabilidad y concentración celular, promoviendo entonces la activación transcripcional de inhibidores de complejos Cdk-ciclinas (como la proteína p21) y, por tanto, deteniendo el ciclo celular. Figura 5: Principales puntos de control en el ciclo celular de células de mamíferos (Modificado de Lodish et al., 2002). Las que siguen son algunas de las características más relevantes de la proteína p53: a) Es un factor de transcripción oncosupresor. En su forma no fosforilada es muy inestable y está normalmente presente en muy bajas concentraciones. b) Los daños del ADN por radiación u otras causas de estrés activan ciertas quinasas (como la ATM y quinasas dependientes de ADN) que fosforilan la p53 y la estabilizan, aumentando Química Montpellier de fisión y de gemación, sistemas en los que lamanipulación genética y construcción de organismos recombinantes es mucho más sencilla. Avances posteriores y la disponibilidad de la secuencia completa del genoma humano ha permitido identificar los genes de las diferentes Cdks y de las ciclinas antes mencionadas.Los procesos que hemos descripto están finamente regulados y coordinados, con puntos de control que tienden a evitar la transición entre fases del ciclo si no se han alcanzado, por ejemplo, estándares adecuados de tamaño celular, integridad del ADN, calidad del material genético replicado • 21 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier su concentración celular. En esas condiciones, la p53 induce la transcripción de genes responsables de su acción oncosupresora (ej. p21). c) Es esencial para el control del ciclo celular en la transición G1-S. d) Se observan mutaciones en la proteína p53 en más del 50% de los cánceres humanos. Según hemos mencionado, p21 es inhibidor general de complejos Cdk-ciclinas, tanto tempranos como tardíos en el ciclo celular (CIP, Cdk inhibitory proteins). Las proteínas p27 y p57 son también de este tipo. Otros inhibidores como p15 y p16 del grupo INK4 (Inhibitors of kinase 4) inhiben preferencialmente complejos tempranos Cdkciclinas como los que forman las Cdk 4 y Cdk6 que hemos mencionado precedentemente. Mutaciones simples o concertadas en proteínas y complejos involucrados en el control del ciclo celular son frecuentemente los iniciadores de procesos de oncogénesis (ej. mutaciones en el APC, diferentes tipos de mutaciones en p53, en p16, sobre-expresión de ciclina D, etc). Como veremos en capítulos siguientes, cambios en la expresión de las mismas proteínas salvajes se pondrán también en juego en condiciones normales toda vez que una acción hormonal modifique la actividad del ciclo celular. 22 • Flujo de la expresión génica La transcripción y la traducción La información genética que almacena el ADN adquiere significado biológico para la célula cuando se sintetizan las moléculas codificadas por los genes a través de un proceso de dos etapas conocidas como transcripción y traducción, que en su conjunto constituyen la expresión génica. Dado que en un organismo multicelular todas las células poseen la misma información genética, surge claramente que los diferentes fenotipos celulares de cada uno de los tejidos u órganos deben ser la resultante de diferencias en la expresión génica. Es por ello que la transcripción en células eucariotas es necesariamente un proceso complejo. No sólo presenta un alto poder de discriminación entre qué debe ser transcrito y qué no, sino que además la transcripción es precisamente programada durante el desarrollo y la diferenciación tisular. Es decir que esta maquinaria debe poder responder: “¿Qué? ¿Cuándo? ¿Dónde? y ¿Cómo?”. La transcripción genera una hebra de ARN cuya secuencia nucleotídica es complementaria a una de las hebras del ADN, que actúa como secuencia molde. Figura 6. Transcripción en eucariotas y procariotas. La parte izquierda de la figura muestra un esquema general de la transcripción de un gen eucariote, la maduración del transcripto primario y posterior exportación del núcleo. A la derecha se muestra el proceso de transcripción de un gen procariótico, intrínsecamente más simple que en eucariotes En general, la transcripción da lugar a ARNs pertenecientes a tres clases: ARN mensajero (ARNm), ARN de transferencia (ARNt) y ARN ribosómico (ARNr). También a través de este proceso se generan otros ARNs tales como los denominados ARNs pequeños nucleares (snARNs) y los ARNs citoplásmicos pequeños (scARN). Los transcriptos primarios producidos a partir de la mayoría de los genes codificantes de ARNr, ARNt y los pre-ARNm, experimentan un procesamiento extenso antes de constituirse en las formas maduras funcionales de estos ARNs (ver Figura 6). Mediante el proceso denominado traducción las moléculas de ARNm dictan el ordenamiento de los aminoácidos en el proceso de polimerización que conduce a la síntesis de las proteínas. El ARNr y ARNt son componentes claves del aparato de síntesis de proteínas. En células eucarióticas además de las ARN polimerasas de mitocondrias y cloroplastos, existen tres enzimas nucleares que transcriben diferentes porciones del genoma nuclear. Cada una de las ARN polimerasas es una enzima compleja con múltiples subunidades (aproximadamente 12). La ARN polimerasa I es la encargada de la síntesis de los ARNr; la ARN polimerasa II de los ARN y la ARN polimerasa III de los ARNt y snARNs. En todos los casos sin embargo, el proceso de transcripción puede ser dividido en las tres etapas de iniciación, elongación y terminación que caracterizan también la síntesis de otras biomacromoléculas poliméricas. En cada una de esas etapas se requieren además de la enzima polimerizante otros factores accesorios. Estos factores cumplen un rol importantísimo en el comienzo de la transcripción, determinando qué región del ADN se transcribirá y además con qué frecuencia. Para ello estos factores reconocen y se asocian a secuencias específicas de ADN que forman parte de los denominados promotores. Cada gen eucariota contiene además del promotor una secuencia que estimula la transcripción (enhancer) que frecuentemente se encuentra distante del inicio de la transcripción, y su modo de acción parece ser el de producir un bucle en el ADN –tal vez mediado por nucleosomas– ubicando las proteínas unidas a esta secuencia estimuladora en contacto con las proteínas unidas al promotor. Control del inicio de la expresión El control del inicio de la transcripción constituye el mecanismo predominante a través del cual las células procariotas y eucariotas regulan la expresión génica, y representa el punto de decisión para reorientar la fisiología celular. Las organismos unicelulares tanto procariotas (bacterias) como eucariotas (levaduras) poseen muchos genes que responden a condiciones nutricionales y variaciones ambientales sintetizando nuevos ARNm o incrementando el nivel de expresión. En el caso de los eucariotas multicelulares el control está dirigido a responder a requerimientos que aparecen en momentos precisos de la diferenciación y/o desarrollo (ver http://web.indstate.edu/thcme/mwking/ gene-regulation.html #initiation). Dado que los principios elementales que gobiernan la regulación de la transcripción fueron desarrollados a partir del conocimiento de sistemas procariotas sencillos, comenzaremos por hacer una breve reseña de ellos. La única ARN polimerasa que poseen las bacterias está constituída por cinco subunidades conocidas como subunidades grandes β’ (156 kDa) y β (151 kDa), dos subunidades pequeñas α (37 kDa), y una copia de la subunidad ó también llamada factor σ de tamaño variable, que determina el conjunto de genes a ser transcripto. El rol del factor σ consiste en reconocer a un promotor singular y por ende posicionar la polimerasa para que inicie la transcripción a una distancia definida a partir de la secuencia de reconocimiento. Se han descrito varios factores σ según el gen o grupo de genes (regulón) activados, los cuales se identifican con un superíndice que hace referencia al tamaño molecular de la proteína. Por ejemplo, los genes requeridos para responder a adversidades ambientales (stress) utilizan el factor σ32 mientras que los genes en respuesta al ayuno de nutrientes nitrogenados depende del factor σ54). La región promotora es decisiva para la unión específica de la ARN polimerasa mediada por el factor ó. La polimerasa se une a la región promotora formando el denominado complejo cerrado en el que las bases de la doble hebra permanecen apareadas. La ARN polimerasa inicia la transcripción de la mayoría de los Química Montpellier FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos • 23 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos genes bacterianos a partir de una base definida que está comprendida en la secuencia que se encuentra previa al extremo 5´ de la región codificante. Este sitio de iniciación (identificado con la posición +1 de la unidad de transcripción) define otra región 5´ adyacente, en la cual se encuentran los sitios de control y unión de la ARN polimerasa (región upstream o “rio arriba”). En la etapa siguiente, la polimerasa separa las hebras complementarias unidas por puentes de hidrógeno y forma un complejo abierto. Después de iniciada la transcripción y avanzado unos 10 pares de bases, la subunidad ó se libera, pudiendo formar parte de otro complejo promotor-ARN polimerasa y reiniciar la transcripción. Como se mencionó anteriormente, la frecuencia de inicio de la transcripción es un punto clave para regular el nivel de la expresión génica. Por ende, la constante de afinidad del complejo promotor - holoenzima es el factor determinante. Así, podemos imaginar que para un mismo factor ó, variaciones en la secuencia del promotor van a dar como resultado diferentes frecuencias de iniciación, es decir no todos los genes transcritos a partir de un mismo factor ó poseen el mismo nivel de expresión. A su vez, cambiando el factor ó de la ARN pol se transcribirá otro conjunto de genes. El inicio de la transcripción en eucariotas Los promotores reconocidos por la ARN polimerasa II y sus respectivos factores de transcripción (“Transcription Factors”, TF) se caracterizan por presentar un alto grado de variabilidad en su secuencia, adoptan un diseño modular y abarcan una región no menor a 200 pb en la región 5´ previa al inicio. En la Tabla 3 se muestran algunos elementos importantes de control para la ARN pol II y sus correspondientes factores de transcripción. Tabla 3. Química Montpellier Algunos elementos de control de la ARN pol II y sus correspondientes factores de transcripción (TF) 24 • FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos la transcripción está mediada por un receptor de naturaleza proteica que se une al esteroide en el citoplasma celular. Cuando se establece la unión hormona-receptor, el complejo constituye una forma transcrip-cionalmente activa, incrementando10 veces su afinidad por el ADN. El complejo hormona receptores direccionado al núcleo celular, donde reconoce una secuencia denominada GRE (Elemento de Respuesta a Glucocorticoide). El GRE se localiza generalmente en un elemento enhancer que puede encontrarse a varias kilobases en dirección 5´- o 3´- del promotor. La unión del complejo esteroide-receptor a la secuencia “enhancer”, provoca la activación del promotor cercano iniciando el proceso de transcripción. Este tipo de activación del “enhancer” constituye el mecanismo general por el cual se regula un grupo amplio de genes involucrados en la respuesta celular al esteroide. Siguiendo este modelo de activación de la transcripción, se ha encontrado que la transcripción del gen de la insulina, que se expresa específicamente en las células beta de los islotes de Langerhans, es regulada por el nivel sanguíneo de la glucosa. Se ha identificado un elemento regulatorio que actúa en cis, denominado RIPE3b, el cual a través de la unión con la proteína MafA resulta crítico para la regulación mediada por glucosa. Usando procedimientos basados en PCR cuantitativa del ARNm de mafA, se pudo demostrar que es regulado positivamente por glucosa y su detección significativa es específica de las células beta. Se puede concluir que MafA es un factor específico de células beta que activa al gen de la insulina de una manera dependiente de la glucosa. Química Montpellier Se han identificado tres tipos de secuencias promotoras. La caja TATA es común y predomina en los genes de transcripción rápida. La función del elemento de control TATA aparentemente es fijar el punto de inicio de la transcripción. Un segundo tipo de iniciador comprende a los llamados elementos iniciadores (Inr) que poseen un residuo citosina en la posición -1 y uno de adenina en el sitio de inicio de la transcripción. Otros genes se caracterizan por poseer segmentos ricos en bases GC que son reconocidos por el factor de iniciación SP1. La región 5´ upstream del inicio de la transcripción incluye además a otros elementos (enhancers) consistentes en secuencias cortas conservadas que son reconocidas apropiadamente por los factores transcripcionales amplificantes. En general, estos factores (TF), tanto los generales como los específicos, son de naturaleza proteica que concurrentemente actúan sobre el promotor del gen permitiendo la expresión del mismo. Un factor de transcripción reconoce secuencias concretas de bases de unos 8-10 nucleótidos, y se asocia a otros factores de manera secuencial formando un complejo activador en el lugar del comienzo de la transcripción. La unión cooperativa de múltiples activadores a sitios cercanos forma un complejo multiproteico denominado amplisoma (ver Figura 7) Los promotores eucariotas de la ARN pol II contienen elementos de control diversos y complejos. Debido a que la transcripción de estos genes debe ser tejido-específica y desarrollo-específica, requiere un ajuste muy fino de regulación. En algunos casos la transcripción debe responder también a moléculas señal tales como las hormonas. La activación por hormonas esteroideas a nivel de • 25 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier Figura 7. Modelo para la ARNpol II de la formación del complejo mínimo de preiniciación (PIC) con un promotor TATA. En su forma más simple, la unión de la Proteína de Unión a TATA (TBP) inicia la secuencia. Alternativamente se puede utilizar TFIID, el cual incluye TBP y factores asociados. La serie de líneas punteadas indican la fosforilación del dominio C-terminal de pol II. La fosforilación es necesaria para la liberación de la enzima del sitio de iniciación. (modificado de G. Roeder, Trends Biochem. Sci (1996) 21:327-3335) 26 • La regulación parece ser más compleja si se tiene en cuenta que otros factores específicos para células beta también interactúan con el promotor. Los factores IEF1 y IPF-1 se unen respectivamente a las cajas E y A del promotor del gen insulina. Alguno de los efectos provocados por la acción de la insulina son generados mediante la modificación de los niveles de expresión de genes insulinodependientes. Este proceso consiste en una cascada de fosforilación que culmina en la fosforilación de proteínas nucleares de unión a ADN incrementando su capacidad de actuar como factores de transcripción (Figura 8). El complejo juego de factores de trans-cripción y polimerasa no actúa sobre ADN desnudo. La estructura de la cromatina nos induce a preguntarnos ¿cómo se unen estas proteínas al ADN en presencia de los nucleosomas?, ¿ cómo sortean los nucleosomas la ARNpolimerasa?. En este sentido, las enzimas histona acetil transferasa y deacetilasa, juegan un rol importante afectando la arquitectura de la cromatina. Altos niveles de acetilación de las histonas se correlacionan con una elevada tasa de transcripción. Sorprendentemente, varias de las proteínas del complejo de iniciación poseen actividad acetilante de histonas. Recientemente, se han descubierto en levaduras y en eucariotes superiores factores de remodelado de cromatina aunque no se sabe aún cuál es su mecanismo de acción. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Figura 8. Activación de la expresión génica por insulina. La Figura ilustra el proceso de activación de la expresión de genes nucleares mediante una cascada de fosforilación que se inicia con la unión de la hormona insulina a su receptor de membrana (modificado de Nelson & Cox, 2000). como “splicing” (este término ha sido adoptado en el idioma castellano, aunque en algunas traducciones se lo menciona como empalme) (ver http://www.cas.muohio.edu / ~wilsonkg/Bot203/Gene_expression/Introns/ introns.htm). El procesamiento de este ARN primario tiene lugar en el núcleo celular en unas estructuras denominadas spliceosomas (o empalmosomas) que son complejos de snARNs y proteínas específicas, y es importante señalar que la capacidad catalítica para procesar el ARN primario reside en el componente ribonucleico del spliceosoma. Química Montpellier Maduración del ARNm El producto de la transcripción del gen es una molécula de ARN que se denomina transcripto primario. Este ARN, al igual que el ADN del cual ha sido copiado, contiene secuencias codificantes (exones) y también no codificantes (intrones) y por ende no es traducible directamente a proteína. Por ello, debe experimentar un proceso que elimina los intrones y de este modo obtener una molécula con la información completa en forma consecutiva para producir la proteína. El mecanismo de eliminar intrones y empalmar los exones, se lo conoce en inglés • 27 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Un caso muy interesante de maduración, es aquel que permite que un único gen de lugar a distintas proteínas a través de un splicing alternativo (ver Figura 9). Esta modificación consiste en que en uno de estos procesamientos alternativos algunos exones son eliminados junto con dos intrones flanqueantes. Entonces, a partir de un único gen se originará un único transcrito primario que por empalme alternativo originará varios ARNm, los que a su vez darán lugar a proteínas distintas. Un ejemplo de este tipo de maduración es el caso de las IgM y las IgD, inmunoglobulinas localizadas en la membrana de los linfocitos B, ambas codificadas por el mismo gen pero, según la maduración alternativa que tenga lugar se generará el mensajero de la IgM o de la IgD. Sin dudas, este caso representa otro ejemplo que se aparta del dogma adoptado inicialmente: un gen una proteína. Química Montpellier Figura 9. Splicing alternativo: El gen de calcitonina. Las señales alternativas para la poliadenililación que son usadas por los tejidos tiroides y neural para realizar esplicing alternativo están indicadas como pA1 y pA2, en el esquema del gen de la parte superior de la figura. El exon 1 y la parte 3'- del exon 5 (5b) codifica las secuencias 5'- y 3'- no traducidas. El exon 4 codifica el gen maduro de calcitonina en tiroides mientras que el gen relacionado CGRP (calcitonin gene-related peptide) sintetizado en el tejido neural es codificado por la parte 5'- del exon 5(5a). (adaptado de Strachan, T. & Read, A.P., 1999) 28 • Otras de las modificaciones postranscripcionales que sufre el ARNm, es el agregado en el extremo 5´ del capuchón cap y una cola de poliadenina en el extremo 3´ (poli-A) (figura 6). Cuando se han realizado todas estas modificaciones, entonces el ARN se considera maduro para avanzar en la etapa siguiente de la expresión génica: la traducción. Las moléculas maduras de ARNm deben ser movilizadas desde el núcleo al citosol a través de los poros nucleares. Durante el proceso de síntesis los ARNs se unen a proteínas nucleares que conducen a la formación de un complejo ribonucleoproteico (RNPm) asociado al CBC (cap binding complex) el cual es reconocido por las proteínas que forman el complejo de proteínas del poro nuclear. Se inicia así el pasaje a través de poro liderado por el CBC y acompañado por algunas de las proteínas asociadas al ARNm, mientras que otras proteínas se disocian y quedan retenidas en la matriz nuclear. Una vez en el citosol, el complejo ribonucleico experimenta la liberación de proteínas que son reimportadas al núcleo para su reciclado, y el ARNm queda disponible para interactuar con proteínas de RNPm citosólicas, entre las cuales se encuentra la proteína fijadora de poli-A (PABP). FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos La secuencia ARNm se lee en los ribosomas en grupos de tres nucleótidos denominados codones, que codifican un aminoácido o indican el fin de lectura. Existen 64 codones posibles formados por combinaciones de las cuatro bases A, C, U y G. Sin embargo, solo existen 20 aminoácidos codificados y cada uno puede tener más de un codón, por esta característica se dice que el código genético es degenerado. No todos los codones se traducen en aminoácidos; existen tres de ellos que codifican la señal que determina la terminación de la traducción (codones UAG, UGA y UAA). En la mayoría de los casos el codón de inicio es AUG (metionina). El ARN es un mensaje sin comas ni puntos, resultando importante la identificación correcta del inicio o el primer codón. En bacterias el reconocimiento del codon de iniciación se hace a través de la subunidad menor de los ribosomas, la cual interactúa con una secuencia de aproximadamente 8 nucleótidos del ARNm, ubicada muy próxima al inicio. Esta secuencia que se aparea con el extremo de la subunidad ribosomal 16S es conocida como la secuencia Shine-Dalgarno en honor a sus descubridores. El reconocimiento del codon de iniciación es diferente en eucariotes, en el cual la subunidad ribosómica 40S se une al casquete metilado 5´ (cap) y comienza a “deslizarse” sobre el ARNm hasta encontrar un triplete AUG aceptable. El concepto de aceptabilidad significa que el AUG se encuentra rodeado por determinadas secuencias preferenciales. Tanto en procariotas como eucariotas se requiere la participación de factores de iniciación formando complejos que previenen la asociación prematura de las subunidades ribosomales. Las moléculas que “traducen” la secuencia nucleotídica en secuencia de aminoácido son los ARNs de transferencia (ARNt). Este tipo de ARN transporta un aminoácido mediante una unión de tipo éster entre carboxilo del aminoácido y el OH 3’ del ARN, forma que se denomina aminoacil-ARNt Esta molécula, reconoce el codón correspondiente a ese aminoácido (en el ARNm) mediante una secuencia de tres nucleótidos complementaria a dicho codón que se denomina anticodón (en el ARNt). La polimerización progresa siguiendo la plantilla del ARN hasta encontrar un codón de terminación. De manera similar a la iniciación, las etapas de extensión y terminación requieren factores de naturaleza proteica. Generalmente, una molécula de ARNm es traducida simultáneamente por varios complejos ribosómicos (polisomas o polirribosomas), y una vez culminada la síntesis del polipéptido los ribosomas van siendo liberados y reciclados para reiniciar una nueva ronda de traducción. Los polipéptidos nacientes van adquiriendo el plegamiento que conducirá a su estructura nativa una vez liberado de los ribosomas, asistidos por proteínas acompañantes o chaperonas. A diferencia de lo observado en células procariotas, las células eucariotas utilizan frecuentemente el control de la traducción como mecanismo de regulación. En parte, este control ocurre a nivel de disponibilidad del ARNm (estabilización, degradación, accesibilidad). Algunos ARNms específicos pueden ser secuestrados mediante combinación de proteínas específicas de unión a ARN o con pequeñas moléculas de ARNs (ARNi, ARNs de interferencia). Por ejemplo, la síntesis de globina en los reticulocitos requiere de un adecuado aporte de grupos hemo. La célula posee una proteínquinasa denominada inhibidor hemo-controlado (HCI). En presencia de niveles adecuados de grupos hemo, la quinasa es inactiva, pero si el nivel es bajo, la HCI fosforila al factor de iniciación (de la traducción) (elF2). En el estado fosforilado eIF2 permanece establemente unido al factor eIF2B impidiendo que se recicle para una nueva iniciación y deteniendo, por ende, la síntesis proteica. Direccionamiento de las proteínas La célula eucariota es una estructura multicompartimentalizada. Cada organela requiere diferenes proteínas, de las cuales sólo unas pocas son sintetizadas en la organela misma. Algunas otras proteínas son exportadas de las célula tales como las proteínas de la matriz extracelular, enzimas proteolíticas y hormonas peptídicas ( por ejemplo insulina y glucagón). La diversidad de destinos nos indica que debe Química Montpellier Traducción: cambiando los códigos. • 29 Química Montpellier FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos 30 • existir un sofisticado mecanismo para «marcar» y ubicar en su correcto lugar a la proteína recién sintetizada. Las proteínas que se localizan en el citoplasma, mitocondrias, cloroplastos y núcleo se sintetizarán a partir de polisomas libres en el citoplasma. Los diferentes destinos de estas proteínas estarán indicados en su secuencia aminoacídica. Las proteínas que se localizarán en mitocondrias poseen una secuencia de aminoácidos en el extremo N-terminal que es reconocida por proteínas de la membrana externa e interna de la mitocondria que forman un poro a través del cual migrará el polipéptido. La secuencia señal N-terminal es hidrolizada en el interior de la mitocondria por proteasas específicas. La proteína naciente es asistida por chaperonas antes y después del pasaje al interior de la mitocondria. El proceso de direccionamiento de las proteínas nucleares se diferencia en varios aspectos a los de localización en otras organelas aunque comparte con estos el hecho de que la proteína posee una secuencia aminoacídica característica que indica su destino. En este caso la secuencia señal consiste en una secuencia de aminoácidos básicos. La naturaleza de esta secuencia señal adquiere sentido biológico si consideramos que la mayoría de las proteínas nucleares interactúan con los ácidos nucleicos, para lo cual emplean frecuentemente aminoácidos básicos. A diferencia del proceso de localización mitocondrial, la proteína se localizará en el núcleo después de haber sido sintetizada, es decir es un proceso posttraduccional y la secuencia señal no es eliminada de la proteína. Evidentemente, este mecanismo debe ser necesariamente así debido a que el núcleo es una organela que a lo largo del ciclo celular sufre un proceso de desensamblaje, con lo cual el contenido es liberado al citoplasma. Si la secuencia señal fuese removida, la proteína no podría ser recapturada por el núcleo una vez finalizada la mitosis. Las proteínas destinadas a las membranas celulares, lisosomas o la matriz extracelular utilizan un sistema de distribución especial. La estructura clave en este sistema es el retículo endoplasmático rugoso (RER) y el aparato de Golgi. La proteína destinada a alguno de estos compartimentos posee una secuencia señal Nterminal que al momento de ser sintetizada y emerger del ribosoma, es reconocida por una partícula de reconocimiento de señal (SRP) de naturaleza ribonucleoproteica. El complejo SRPpéptido naciente (unido al polisoma) se asocia con una proteína de membrana del RER; luego se libera la SRP y continúa la traducción pero el polipéptido naciente pasará hacia el lumen del RER ayudado por la proteína de membrana. Antes de finalizar la síntesis y translocación del péptido la secuencia señal es eliminada por una peptidasa específica. Las proteínas que van al lumen del RER, pueden ser transportadas en vesículas hacia el aparato de Golgi (donde sufren una serie de glicosila-ciones) y, a partir de allí, mediante exocitosis podrán ser exportadas al espacio extracelular. A partir de este panorama, claramente se puede inferir que de la misma forma en que una maleta mal etiquetada en un aeropuerto es un dolor de cabeza para su dueño, una falla en este mecanismo de direccionamiento produce graves consecuencias para el funcionamiento celular. Destrucción programada de proteínas Durante el ciclo de vida celular numerosas proteínas son sintetizadas; sin embargo, no todas son requeridas en forma permanente, de hecho algunas son necesarias en momentos precisos del ciclo celular y deben ser rápidamente eliminadas una vez que cumplieron su cometido (ver sección Ciclo celular en células embrionarias tempranas y en células somáticas). Del mismo modo aquellas proteínas que han sido dañadas deben ser eliminadas. Es decir, que la célula, así como posee mecanismos de regulación de la síntesis de las proteínas, también debe poseer mecanismos selectivos de degradación. Las células eucariotas poseen dos procedimientos diferentes para la degradación proteica. Los lisozomas contienen las enzimas proteo-líticas que degradarán cualquier proteína atrapada en el lisozoma. Conjuntamente con este proceso en el citoplasma se encuentra un sistema de degradación altamente selectivo. A continuación haremos una breve descripción de este importante sistema. Como mencionamos anteriormente, una característica fundamental del sistema de degradación citosólica es su capacidad FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Tecnología del ADN recombinante El estudio del funcionamiento de los genes depende en gran medida de la capacidad de aislar y estudiar secuencias nucleotídicas. Antes del advenimiento de la tecnología de ADN recombinante, las únicas oportunidades de contar con una población homogénea de moléculas de un ácido nucleico se reducía a los genomas de virus (esencialmente, paquetes discretos de genes), a los ADNs satélites (secuencias altamente repetidas de ADN), a los ARNs ribosómicos (más del 90% del ARN celular) y de transferencia. Estos se podían purificar en forma relativamente sencilla debido a la posibilidad de aislar los virus o a la gran abundancia relativa dentro de la célula. La tecnología de ADN recombinante extiende la posibilidad de estudiar cualquier secuencia de ADN o ARN en forma general e independiente de su abundancia relativa y complejidad. Mediante el uso de dos herramientas fundamentales de esta tecnología se logra el estudio y manipulación de secuencias que forman parte de una población compleja de moléculas de ADN: el clonado de ADN y la hibridación molecular. Clonado de ADN: El segmento de ADN de interés debe ser amplificado de manera que pueda ser purificado a homogeneidad. A continuación, su estructura y función pueden ser estudiadas mediante los métodos de secuenciación, expresión in vitro o en sistemas modelo, mutagénesis para cambiar su estructura, etc. Hibridación molecular: El fragmento de interés no es amplificado pero es detectado específicamente en una mezcla compleja de muchas secuencias. Química Montpellier de distinguir las proteínas que deben ser degradadas, es decir, estas proteínas deben estar marcadas para poder ser identificadas. Para ello, este sistema utiliza una proteína denominada ubiquitina. La ubiquitina es un polipéptido de 76 aminoácidos ampliamente distribuido en los sistemas eucariotas. Las proteínas que posean unidas varias moléculas de ubiquitina serán sustrato del sistema proteolítico. La unión del péptido de ubiquitina a las proteínas es un proceso en cuatro etapas: • La ubiquitina forma parte de una proteína fusión, la cual debe ser clivada para dar ubiquitina libre (primer paso) • La ubiquitina libre es activada mediante su unión por un enlace tiol a una enzima activante en un proceso dependiente de ATP (segundo paso) • La molécula de ubiquitina es luego transferida a una segunda enzima (tercer paso), la cual transferirá la ubiquitina a la proteína a ser degradada mediante unión en residuos de Lys. (cuarto paso). Dependiendo del modo y cantidad en que ha sido ubiquitinilada una proteína, esta marca le indicará a la célula o bien una localización celular o la digestión proteolítica en partículas denominadas proteasomas. La estructura del proteasoma (26 S) ha sido determinada a alta resolución y consiste en un barril de 28 subunidades, sorprendentemente similar en estructura a la chaperonina procariótica GroEL. Ambos sistemas aceptan polipéptidos desplegados (proteínas parcial o totalmente desnaturalizadas) en su interior, pero mientras que GroEL protege la cadena polipeptídica el proteasoma lo degrada. • 31 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier Clonado molecular El clonado de ADN es un método general para amplificar selectivamente secuencias nucleotídicas y generar poblaciones homogéneas de ADN Para estudiar genes es esencial contar con métodos que permitan su purificación. Dado que los genomas de mamíferos son complejos, cualquier gen específico o fragmento de ADN de interés representa solamente una ínfima fracción del ADN de una célula. Por ejemplo, el gen de la β-globina comprende solamente 0,00005% de los 3 mil millones de pares de bases (3000 megabases o 3000 Mb) del ADN genómico humano; aún el enorme gen de la distrofina de 2,5 Mb (el gen más largo que se conoce) da cuenta de tan sólo 0,08% del ADN humano. Precisamente, la tecnología del ADN recombinante se desarrolló con el fin de contar con métodos generales para estudiar una secuencia específica dentro de una población compleja de ADN En principio existen dos alternativas para contar con las cantidades necesarias de un gen o una secuencia nucleotídica pura: el clonado in vivo y la amplificación enzimática de secuencias específicas (PCR). El clonado molecular in vivo consiste en la inserción de una mezcla de fragmentos del ADN a estudiar en un vector. Este último es molécula de ADN capaz de replicarse en forma independiente cuando se la introduce en una célula huésped. Luego de introducir las moléculas recombinantes (vector + fragmento de ADN foráneo) en las células (proceso de transformación), éstas pueden cultivarse de tal manera que cada célula original se replicará para formar una población genéticamente homogénea (clon) conteniendo, además de su propio ADN genómico, el vector con un ADN insertado. Utilizando métodos habituales 32 • en microbiología se pueden aislar millones de colonias aisladas con diferentes ADNs insertados. De esta manera, cada colonia (clon) se convier-te en una fuente inagotable de producción de un determinado fragmento de ADN foráneo. El conjunto de estos clones se puede contener en una colección completa de fragmentos del ADN en estudio, insertados en un vector (genoteca, biblioteca de ADN, library). ¿Qué ácidos nucleicos pueden ser clonados? Tipos de colecciones de clones Cualquier secuencia nucleotídica puede ser insertada en un vector y propagada en bacterias u otros organismos. Sin embargo debe tenerse en cuenta que las manipulaciones de corte con enzimas de restricción y ligación para producir moléculas recombinantes sólo son practicables con ADN. Para estudiar los productos de ARN que funcionan en una célula (ARNm, ARNr, ARNt, snARNs, scARNs) éstas secuencias deben ser copiadas a ADN mediante el uso de una transcriptasa reversa (ADN polimerasa ARN dependiente aislada de retrovirus). De esta manera se obtiene lo que se conoce como ADN complementario o cADN, que puede ser manipulado de la misma manera que el ADN genómico. Así se pueden obtener dos tipos de colecciones de fragmentos de ADN : “bibliotecas” genómicas y de cADN (genomic & cADN libraries). Es interesante la comparación de la información proveniente de la secuencia de estas dos colecciones de fragmentos de ADN ya que, por ejemplo, permite definir la estructura de intrones y exones de los genes estudiados (presentes en las secuencias obtenidas de los clones de ADN genómico y ausentes en los de cADN). FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Figura 10: Clonado ordenado de secuencias genómicas en diferentes vectores. Fragmentos de ADN progresivamente más pequeños son subclonados hasta llegar a plásmidos que contienen inserciones cuya secuencia parcial puede ser determinada. Este tipo de información puede ser luego compilada para obtener en forma ordenada la secuencia nucleotídica del cromosoma entero. Clonado, paso a paso Cuando se pretende generar una colección de fragmento de mayor longitud, se debe recurrir a digestiones parciales. 2) Inserción del ADN foráneo en un vector: generación de moléculas recombinantes o quimeras Los vectores más ampliamente usados son plásmidos – ADNs circulares capaces de replicarse en bacterias o levaduras en forma independiente del cromosoma de la célula en la que se introducen. Los plásmidos que se usan como vectores se han modificado de tal manera Química Montpellier Un ejemplo: construcción de bibliotecas 1) Fragmentación del ADN Existen alternativas para fragmentar el ADN a estudiar: digestión con enzimas de restricción o ruptura mecánica. Aquí se debe recordar que la frecuencia de corte de una enzima de restricción depende del tamaño de la secuencia de reconocimiento: así una enzima que reconoce una secuencia de cuatro pares de bases, cortará en promedio una vez cada 256 (1 vez cada 44) pares de bases, mientras que una que reconoce un sitio de seis, cortará cada 4096 (1 vez cada 46) pares de bases. • 33 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier que contienen una serie de sitios de restricción únicos, generalmente como parte de una zona conocida como sitio de clonado múltiple (MCS o polylinker), un marcador de selección (un gen de resistencia a un antibiótico, por ejemplo) y un origen de replicación relajado (permite producir múltiples copias del plásmido por célula). Para generar los ADNs recombinantes, el plásmido se corta con una enzima de restricción (seleccionada del conjunto de sitios únicos) que genere extremos compatibles con los de los fragmentos a clonar (lo más simple es usar la misma enzima para cortar ambos ADNs). En la mezcla de millones de fragmentos de ADN con millones de moléculas del vector cortado se obtendrán mediante la ayuda de una ligasa un conjunto de moléculas recombinantes. En este conjunto tendremos distintos tipos de productos de ligación: un fragmento foráneo insertado en un vector, fragmentos que se unieron por sus extremos y vectores recircularizados sin ningún ADN extraño insertado. Actualmente existen métodos alternativos al uso de ligasas para unir el vector y ADN foráneo en una sola molécula recombinante. Estos métodos más recientes que consisten en el uso de recombinasas requieren, sin embargo, el uso de vectores especiales y fragmentos foráneos con secuencias de ADN específicas que puedan ser reconocidas por la recombinasa. Por esta razón no se utilizan recombinasas para la construcción de bibliotecas genómicas en las que los fragmentos de digestión tienen exactamente la secuencia presente en el genoma. Es frecuente el uso de recombinasas en la construcción de bibliotecas de cADN, o en el clonado de productos de PCR (ver más adelante) a los que puede modificarse fácilmente la secuencia terminal para que sea reconocido por la enzima (http: //www.orbigen.com/XiClone.html). 34 • 3) Transformación: introducción del ADN en bacterias Las moléculas de ADN del paso anterior se introducen en bacterias sensibles al antibiótico que se usará como método de selección. Para que estas macromoléculas puedan entrar a la célula (estado de competencia) se modifica la estructura de la membrana bacteriana mediante tratamientos químicos específicos (por ejemplo tratamiento con soluciones de cloruro de calcio), o sometiendo a las células bacterianas a un pulso de diferencia de potencial que abre poros en forma transitoria (electroporación). 4) Propagación selectiva de clones de bacterias con plásmidos recombinantes Las bacterias transformadas con moléculas de plásmido recombinante y recircularizado pueden crecer en un medio selectivo que contiene un antibiótico (ampicilina, si el marcador de selección del plásmido es el gen de la β-lactamasa), mientras que aquellas que no incorporaron ningún plásmido no sobrevivirán. Existen diversas estrategias para disminuir y hasta eliminar las chance de crecimiento de bacterias con plásmidos sin ADN foráneo (desfosforilación del vector, inserción del ADN foráneo en un gen tóxico, diferenciación de plásmidos recombinantes y vectores sin inserto, etc.). Inicialmente, las bacterias transformadas se deben distribuir sobre un medio de cultivo selectivo agarizado de tal manera que cada célula dé origen a una colonia (plaqueo). Así tendremos colonias con diferentes plásmidos recombinantes separadas sobre la superficie del medio semisólido. Ese conjunto de colonias es una colección de clones (DNA library, genoteca, biblioteca de ADN), que permitió tener separados diferentes fragmentos de ADN insertados en plásmidos. 5) Aislamiento del ADN recombinante Cada uno de los clones puede ser tomado de la placa anterior y cultivado en forma separada para aislar y estudiar su ADN plasmídico. ¿Cuánto ADN pueden ser insertado en un vector? Tipos de vectores Si bien los plásmidos son los vectores más utilizados por la facilidad de su manipulación, pueden resultar inapropiados para algunos tipos de estudio. Cuando el propósito es contar con secuencias clonadas del ADN de un organismo, se utilizan distintos vectores de clonado de acuerdo a la longitud promedio de los fragmentos (insertos) a clonar: Nótese que la diferente capacidad de cada vector para incorporar y mantener en forma estable ADN foráneo se corresponde con las FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos características funcionales de cada replicón en sus respectivas células/sistemas de origen (ver replicación). Aunque utilizando vectores apropiados los ADN insertados deberían ser idénticos a los existentes en el genoma del cual provienen, la estructura de largos insertos pueden sufrir en algunos casos rearreglos no deseados. Por tanto, la estructura del ADN en clones de interés debe ser siempre cotejada con la estructura genómica por análisis de Southern blot (ver más abajo). Utilizando apropiadamente estos vectores, se han obtenido colecciones de fragmentos de ADN que permitieron reconstruir genomas completos de organismos de diferente complejidad. Además del genoma humano, el estudio de los genomas completos de diferentes organismos modelo permite abordar estudios de gran importancia en el campo biomédico. (La expresión de genes clonados en sistemas heterólogos se tratará más adelante) Tabla 4 Vectores con capacidad para el clonado de fragmentos de ADN de diferentes tamaños La detección de secuencias nucleotídicas y sus alteraciones en forma específica es una herramienta fundamental en genética molecular. Todas las metodologías que se utilizan con este fin se basan en la hibridación de ácidos nucleicos, es decir en la capacidad de una hebra de ácido nucleico de interactuar y asociarse con una secuencia complementaria para formar una molécula de doble hebra. Las condiciones de hibridación dependen precisamente de la estabilidad de esta doble hebra (ver estructura de ADN y http: //www.ncbi. nlm.nih.gov). Tipos de sondas Los ácidos nucleicos que pueden servir como sondas incluyen los siguientes tipos de moléculas: ADNds (fragmento de ADN clonado en un plásmido, fragmento de restricción aislado de un plásmido recombinante, producto de PCR) ADNss (ADN clonado en M13, oligonucleótido sintético) ARNss (producto de trasncripción in vitro de un fragmento de ADN clonado en un plásmido a continuación de un promotor fuerte) Química Montpellier Sondas de ácidos nucleicos y PCR • 35 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Tipos de marcación: radiactiva y no radiactiva Para la detección de los híbridos formados entre la molécula blanco y la sonda, ésta puede ser marcada mediante la incorporación de precursores radiactivos o derivatizados con fluoróforos, biotina u otros grupos (digoxigenina) indicadores. En el primer caso la detección es mediante autorradiografía, mientras que en los siguientes el nucleótido modificado es reconocido directamente por fluorescencia, o indirectamente por avidina (o estreptavidina) o un anticuerpo conjugados con una enzima. En este caso el producto de la reacción enzimática puede ser fluorescente o coloreado. Las reacciones de marcación de sondas consisten en versiones in vitro de la replicación (extensión de primer, random priming, nick translation) o de la transcripción (secuencia clonada a continuación de un promotor fuerte como el reconocido por la ARN polimerasa del fago T7). Química Montpellier Formatos de hibridación 36 • Si bien la desnaturalización de ácidos nucleicos y su reasociación ocurren en solución, la mayor parte de las aplicaciones de la hibridación requiere que la molécula blanco se encuentra fijada a un soporte sólido, que se incuba con la sonda. El exceso de sonda es lavado y sólo queda donde se ha asociado con secuencias complementarias, permitiendo su detección y ubicación en diferentes situaciones: In situ (cortes de tejido, células en cultivo, cromosomas metafásicos, etc.) Southern blot (ADN digerido con enzimas de restricción, fragmentos resueltos por electroforesis y trasferidos a una membrana de hibridación: se usa para detectar qué fragmentos contienen las secuencias de un determinado gen y definir si existe alguna modificación de la secuencia que conduce a un polimorfismo de sitios de restricción y longitudes de fragmentos o RFLP; ver Fig. 11) Northern blot (ARN resuelto por electroforesis y trasferido a una membrana de hibridación: permite ver el tamaño de un ARNm y el nivel de expresión de un determinado gen) Microarrays (Una serie de oligonucleótidos con secuencias específicas de diferentes genes unidos en posiciones establecidas de un portaobjetos son hibridados con sondas de ADNc que representan la copia de todos los RNAs presentes en un tipo celular: Esta técnica permite el análisis simultáneo de los niveles de expresión de miles de genes en diferentes condiciones metabólicas, estímulos externos, infecciones, etc.). Amplificación de secuencias nucleotídicas PCR (polymerase chain reaction): Es la aplicación de la síntesis in vitro de ADN que revolucionó la biología molecular y amplió las posibilidades de la medicina, la antropología, las ciencias forenses y ambientales, entre otras, al permitir la caracterización de muestras que contienen al menos una molécula (¡una!) de ADN. Utilizando oligonucleótidos sintéticos (primers) complementarios a ambos lados de una secuencia blanco (por ejemplo, un fragmento de un gen), desoxinucleósidos trifosfato (dNTPs) y una ADN polimerasa resistente a temperaturas altas (Taq DNA pol) se repiten ciclos de desnaturalización, hibridación y extensión (síntesis de ADN a partir de los primers usando como molde el ADN blanco) que conducen a un aumento geométrico de la secuencia flanqueada por los primers (ver Figuras 12 y 13 y http://www.dnalc.org/ Shockwave/pcranwhole.html, http://www. biochem. arizona.edu/classes/bioc471/ pages/Lecture12/Lecture12.html). RT-PCR: Cuando las secuencias nucleotídicas que se pretende amplificar pertenecen a una molécula de ARN, también puede utilizarse la PCR luego de copiar el ARN a ADN en una reacción catalizada por una trascriptasa reversa. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Figura 11: Southern blot. Las muestras de ADN a analizar se digieren con enzimas de restricción seleccionadas y los fragmentos se resuelven por electroforesis. Estos fragmentos se transfieren a una membrana de nylon o de nitrocelulosa y se hibridan con una sonda radiactiva. Existen alternativas de marcación de sondas que incluyen nucleótidos modificados con fluoróforos o grupos detectables con anticuerpos conjugados con enzimas o con estreptavidina conjugada a enzimas. Los sustratos usados permiten detectar el producto por el color o por luminiscencia (adaptado de Strachan, T. & Read, A.P., 1999). (RT: Reverse Figura 12: Amplificación de ácidos nucleicos en el tubo de ensayo (PCR) En cada ciclo de PCR se requieren tres pasos a diferentes temperaturas para completar una ronda de síntesis de ADN synthesis. Inicialmente, el ADN de doble hebra debe ser desnaturalizado de manera que los oligonucleótidos sintéticos (primers) puedan encontrar sus secuencias complementarias en las hebras simples (hibridación a una temperatura dependiente de la secuencia del primer). Una vez unidos a esas secuencias los primers son extendidos por la ADN polimerasa, que incorpora dNTPs a 72o. El siguiente ciclo comienza nuevamente con la desnaturalización, sigue con la hibridación y, finalmente, con la extensión. La repetición de este proceso genera un millón de copias de cada molécula de ADN blanco (target). Este número puede variar dependiendo del rendimiento de cada etapa Química Montpellier Transcriptase) de retrovirus. • 37 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Figura 13: Amplificación exponencial de ADN mediante PCR A la derecha se esquematiza el proceso de PCR y a la izquierda se indica el número de copias que se obtiene en cada ciclo a partir de cada molécula blanco al comienzo de la reacción, suponiendo un rendimiento del 100% en cada etapa. En realidad, la cantidad de un producto de PCR puede ser calculada teniendo en cuenta el número de moléculas del ADN molde al comienzo de la reacción, la eficiencia de cada ciclo y el número de ciclos de acuerdo a la siguiente ecuación: producto de PCR = (masa de ADN blanco) x (1 + % eficiencia) x no de ciclos Usando esta ecuación, puede calcularse que se requieren 26 cycles para producir ~1 mg del producto de PCR a partir de 1 pg of de secuencia blanco (amplificación: 106) si la eficiencia de cada ciclo es 70% [1 mg prod. PCR = (1 pg molde) x (1 + 0.7) x 26]. Química Montpellier Expresión de genes clonados 38 • La tecnología del ADN recombinante permite introducir genes en organismos uni o multicelulares y expresarlos. Este aspecto de la tecnología tiene dos aplicaciones generales: (1) producción y aislamiento de grandes cantidades de un producto génico (proteína o ARN) en un sistema heterólogo para estudios básicos o fines terapéuticos (hormonas peptídicas, factores de crecimiento, etc.), (2) expresión del gen incorporado en un organismo con fines terapéuticos (terapia génica) y (3) alteración permanente del genoma de todas las células de un organismo (transgénico) para que se exprese allí un gen incorporado artificialmente. En todos los casos se utilizan distintos vectores de expresión. Sistemas procarióticos (proteínas silvestres, productos de fusión) Escherichia coli es una bacteria modelo muy fácil de cultivar en el laboratorio y que permitió muchos avances en biología molecular. Por esa misma razón fue posible desarrollar estrategias de expresión de genes clonados en plásmidos. Básicamente, los vectores de expresión usados son plásmidos en los que el sitio de clonado está precedido por un promotor inducible y una secuencia de unión a ribosomas y seguido por una secuencia de terminación de la transcripción. De esta manera, cualquier ADN insertado en ese sitio de clonado será transcripto en E. coli. Ese producto de transcripción (ARNm) será traducido siempre FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos tiene sus limitaciones, ya que las bacterias no poseen los mismos sistemas de procesamiento de proteínas que las células eucarióticas y además, a menudo, los polipéptidos sobreexpresados forman cuerpos de inclusión difíciles de solubilizar y renaturalizar. Sistemas eucarióticos (levaduras, líneas celulares de vertebrados, células de insectos y baculovirus) Las limitaciones de los sistemas de expresión en E. coli apuntadas más arriba, especialmente la falta de glicosilación de proteínas, hacen necesario el uso de células eucarióticas para poder contar con proteínas procesadas correctamente. Sin embargo, la mayoría de los sistemas eucarióticos no permiten la expresión de proteínas a niveles tan altos como los promotores fuertes usados en E. coli. En general los vectores de expresión eucarióticos contiene tipos de elementos similares a sus contrapartes procarióticas: • un marcador de selección eucariótico • un promotor eucariótico • señales de terminación de la transcripción y traducción • una señal de poliadenilación • origen de replicación eucariótico (no es necesario si se trata de un vector integrativo) Los sistemas más sencillos, son sin duda los de levaduras (los eucariotas más sencillos), para los cuales existe una tecnología de cultivo en gran escala desarrollada por la industria de la cerveza. También es posible contar con un repertorio de promotores inducibles y las manipulaciones genéticas de las levaduras son relativamente fáciles de realizar. La selección de las levaduras recombinantes se basa en el uso de células receptoras auxótrofas (incapaces de crecer en ausencia de un determinado aminoácido, por ejemplo) y de plásmidos de expresión que contienen como marcador de selección un gen que les restituye la capacidad de crecer en ausencia de determinado nutriente (enzima que permite restablecer la síntesis del aminoácido). Las estrategias de expresión en levaduras incluyen los vectores que permanecen como elementos extra cromosómicos (plásmidos) y aquellos que pueden recombinarse con el DNA cromosómico (integrativos). Química Montpellier que contenga un marco de lectura abierto (un ORF que comienza con codón de iniciación -ATG- y finaliza con uno de los codones de terminación –TAA, TGA, TAG). El producto resultante es un polipéptido definido por la secuencia del ORF. Sin embargo, muchas veces puede resultar conveniente generar un producto de fusión, que resulta del agregado de secuencias codificantes unidas en fase al ORF anterior. Estos productos de fusión contienen las secuencias aminoacídicas extra en el extremo N o C terminal. Estas porciones de la proteína de fusión pueden resultar útiles para estabilizarla en la bacteria y permitir su aislamiento por cromatografía de afinidad. Así los productos de fusión con glutatión S transferasa (GST) pueden ser aislados con glutatión unido al soprte de la columna; aquellos que contienen una secuencia biotinilable en E. coli poseen afinidad por estreptavidina, los que tienen 610 residuos de histidina pueden ser separados con una columna con un complejo de Ni2+, etc. El primer producto de la ingeniería genética que se distribuyó comercialmente fue la insulina humana producida en E. coli por Genentech. En ese caso, se utilizaron dos bacterias en las que se expresaron por separado los polipéptidos A y B de la insulina como productos de fusión con β-galactosidasa; luego de la purificación por afinidad con anticuerpos antiβ-galactosidasa, se liberaron los péptidos A y B por un tratamiento con CNBr y se asociaron para producir la insulina. Una de las aplicaciones más populares de los sistemas de expresión procarióticos (casi exclusivamente en E. coli) consiste en poder contar con grandes cantidades de un polipéptido para generar anticuerpos específicos para diferentes usos. Este hecho hace posible la producción de anticuerpos aún contra polipéptidos que se expresan a niveles ínfimos en el organismo original. Por otra parte, el clonado de ADNc en vectores de expresión permite generar libraries de expresión (de ADNc) en las que un determinado clon puede ser identificado por su reactividad con un anticuerpo. Cabe recordar que las bacterias no realizan splicing de preARNm y serían incapaces de eliminar intrones de un gen eucariótico. La versatilidad de los sistemas procarióticos • 39 Química Montpellier FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos 40 • Las células de insectos son excelentes huéspedes para la expresión de proteínas. Para ello, se usan vectores derivados de baculovirus. Estos virus son capaces de infectar invertebrados (en su mayoría insectos) y producir grandes cantidades de una proteína(poliedrina), que forma poliedros que encierran a los viriones en el núcleo de las células infectadas. La poliedrina se acumula hasta formar alrededor del 50% de la proteína total de la célula. Como esta pro-teína no es imprescindible para la viabilidad del virus en cultivos celulares, su gen puede ser reemplazado por aquél que se desea expresar en gran cantidad y en un entorno eucariótico más complejo que el de las levaduras. Debido al gran tamaño del genoma viral, resulta conveniente insertar el gen a expresar en un vector de transferencia (plásmido con un sitio de clonado entre las regiones flanquentes del ORF de poliedrina) y luego cotransfectar células con esta construcción y el ADN viral. Luego se seleccionan los baculovirus recombinantes que se generan por recombinación homóloga a nivel de las secuencias comunes del plásmido y del genoma viral. Los virus recombinantes se usan como inóculo de nuevos cultivos celulares, generando niveles del producto del gen clonado similares a los de la poliedrina. La tecnología de aislamiento de baculovirus recombinantes se ha simplificado notablemente y existen opciones de expresión de múltiples subunidades proteicas en una misma célula para producir estructuras complejas. En términos generales, cualquier virus puede convertirse en un vector de expresión aprovechando la posibilidad de inserción y sustitución de genes para generar recombinantes. Una ventaja adicional de los virus es que la evolución los ha transformado en los mejores vehículos de transferencia de genes: la infección es la manera más eficaz de introducir los genes en una célula. Así se han desarrollado vectores derivados de retrovirus, adenovirus, herpesvirus, etc. Diferentes versiones de vectores virales y plasmídicos pueden utilizarse para introducir y expresar genes clonados en una diversidad de células de vertebrados e invertebrados. Bibliografía general • Biología Celular y Molecular. Lodish, H, Baltimore, D., Berk, A., Zipursky, S.L., Matsudaira, P. & Darnel,J. (2002). 4a ed. Editorial Médica Panamericana SA, España. [Traducción de: Molecular Cell Biology. Lodish, H, Baltimore, D., Berk, A., Zipursky, S.L., Matsudaira, P. & Darnel, J. (1999). 4th ed. W.H. Freeman & Co. New York] • Leninger Principles of Biochemistry, Nelson, D.L. & Cox, M.M., (2000) Worth Publishers [www.worthpublishers.com.lehninger] • Principios de Bioquímica, Lehninger, A.L., Nelson, D.L. y Cox, M.M., (1995) 2da ed., Editorial Omega. • Genes VII Lewin, B. (2001). Marbán Libros SRL, España. [Traducción de: Genes VII, Lewin, B. (1999). Oxford University Press, UK] • Genética Moderna. Griffiths, A.J.F., Gelbart, W.M., Miller, J.H., Lewontin, R.C. (2000) McGraw-Hill - Interamericana de España, SAU. [traducción de: Modern Genetic Analysis. Griffiths, A.J.F., Gelbart, W.M., Miller, J.H., Lewontin, R.C. (1998) W.H. Freeman and Company]. • Biología Molecular de la Célula. Alberts, B., Bray, D., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K. & Watson, J.D. (1996). 3ra ed., Omega. (Molecular Biology of the Cell. Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K. & Walter, P. 4thed Garland Publishing, Inc. 2002) • The Cell (A molecular Approach). Cooper, G.M. (2000) ASM Press (Washington, D.C.), distribución fuera de Norteamérica a cargo de Oxford University Press. • Basic Medical: Biochemistry. A Clínical Approach. D.B.Marks, A.D.Marks, C.M.Srnith. Williarns and Wilkins Ed., Baltimore, USA, 1996. • Textbook of Biochemistry with Clinical Correlations. T.M.Devlin Editor, Willey-Liss., New York, USA, 1997 • Textbook of Endocrine Physiology. J.E.Griffin and S.R.Ojeda Eds, Oxford University Press, N. Y., USA, 2000. • Biochemistry. Stryer, L. (1998), 5th Ed., Freeman & Co. • Molecular Biology Weaver, R:F. (1999). WCB/McGraw-Hill • Human Molecular Genetics. Strachan, T. & Read, A.P. (1999) 2nd. ed. John Wiley & Sons, Inc. / BIOS Scientific Publishers Ltd. • Biochemistry, Voet, D. & Voet, J., (1995) 4th ed. John Wiley & Sons. • http://www.ncbi.nlm.nih.gov • http://vector.cshl.org/dnaftb/index.html • http://www.nhgri.nih.gov:80/DIR/VIP/Glossary/ • http://gslc.genetics.utah.edu/ • http://bioinformatics.weizmann.ac.il/cards/ • http://library.advanced.org/18617/ • http://www.tigr.org/ • http://www.ornl.gov/hgmis/ FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Modelos Transgénicos Susana B. Rulli pronuclear, el más comúnmente aplicado en la actualidad (1). Si bien el ratón es la especie más utilizada en tecnología transgénica, se ha extendido también a otras especies tales como rata, conejo, cerdo, cabra, vaca y primates. La técnica consiste en microinyectar secuencias de ADN directamente en el pronúcleo masculino de ovocitos fertilizados, los cuales se transfieren posteriormente a oviductos de hembras seudopreñadas que cumplirían el rol de madres sustitutas (Figura 1). Si el material genético es integrado en alguno de los cromosomas, el animal nacerá con una copia de esta nueva información en cada célula, que será posteriormente transmitida a su descendencia. El primer fenotipo evidente derivado de esta técnica, fue descripto en ratones transgénicos portadores del gen de la hormona de crecimiento (GH) de rata, donde la sobre-expresión de GH derivó en el desarrollo de ratones gigantes (2). A partir de ese momento, se han logrado importantes avances en diversas áreas de la biomedicina y la genética utilizando modelos transgénicos. La Tabla 1 muestra ejemplos de ratones transgénicos y sus fenotipos característicos (3-6). Química Montpellier La tecnología basada en la generación de animales modificados genéticamente ha dado una nueva dimensión al estudio de la función de los genes in vivo. Con anterioridad a la revolución de la genética molecular aplicada, el único método práctico para estudiar la regulación y función de los genes de mamíferos ha sido a través de la utilización de mutantes espontáneos. En la actualidad, es posible insertar nuevos genes funcionales, inactivar y modificar los ya existentes en un organismo vivo, o alterar espacial o temporalmente su expresión, a través de la manipulación genética. La tecnología transgénica permite crear modelos animales que posibilitan el estudio de patologías humanas, la identificación de las bases moleculares de la enfermedad y el desarrollo de nuevas estrategias terapéuticas. La metodología transgénica ha dado sus primeros pasos hace alrededor de tres décadas, a partir de la infección de embriones de ratón preimplantatorios con retrovirus, donde se ha podido demostrar que el ADN proviral es capaz de integrarse al genoma del ratón y ser transferido a las subsiguientes generaciones. Posteriormente, se desarrolló el método de transgénesis por microinyección • 41 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Tabla1: Química Montpellier Modelos representativos de ratones transgénicos con sobreexpresión: 42 • Gen Fenotipo Hormona liberadora de GH Acromegalia Hormona liberadora de corticotrofina Síndrome de Cushing P450 aromatasa Criptorquidismo, tumor testicular Prolactina Tumor mamario en hembras; hiperplasia de próstata Gonadotrofina coriónica humana Tumores ovárico, mamario e hipofisario Leptina Desaparición de tejido adiposo, hipofagia Hormona folículo estimulante Infertilidad en ambos sexos Figura 1: Producción de ratones transgénicos por microinyección pronuclear. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos A partir del reciente desarrollo de técnicas de recombinación homóloga entre ADN exógeno y la secuencia endógena del genoma, en combinación con la disponibilidad de cultivos de células embrionarias de ratón (células ES: embryonic stem cells), se ha ampliado enormemente el espectro de posibilidades en la manipulación del genoma murino, en particular las mutaciones dirigidas o ratones “knock-out” (Figura 2). Esta tecnología permite la eliminación o mutación de secuencias específicas de las células ES, introduciendo ADN al genoma vía recombinación homóloga (1). Dicho fragmento de ADN debe contener, además de la secuencia homóloga del gen de interés, el cual puede estar mutado o delecionado, elementos necesarios para la selección in vitro de clones de células ES modificados genéticamente. Las células ES derivan de la masa interna de blastocistos, son pluripotentes, y por lo tanto, tienen la capacidad de originar diferentes tipos de tejidos (estructuras epiteliales, musculares, nerviosas, etc). Estas células son transfectadas con el transgen por electroporación, y aquellas seleccionadas positivamente para la presencia de dicho transgen, son reinyectadas en blastocistos, donde se incorporan como parte del embrión en desarrollo, constituyendo una “quimera”. Estos embriones son posteriormente transferidos a úteros de hembras seudopreñadas. Las crías nacidas a partir de las quimeras son, generalmente, de diferente color de pelaje que las provenientes de los blastocistos donantes, con el fin de poder diferenciar fácilmente a la progenie transgénica. Cuando las técnicas de recombinación sitio-específica son utilizadas para reemplazar genes funcionales en un determinado locus, se habla de “knock-in”. Ejemplos de modelos de ratones “knock-out” con relevancia biomédica en Tabla 2 (3-6) (en Internet, ejemplos en http: //www.biomednet.com/db/mkmd). Tabla2: Gen Fenotipo Leptina Obesidad, hipogonadismo, infertilidad Subunidad α glicoproteica Hipogonadismo, hipotiroidismo Hormona liberadora de tirotrofina Hipotiroidismo α Inhibina Tumores de granulosa/Sertoli; infertilidad Receptor de prolactina Infertilidad en ambos sexos Receptor de homona luteinizante Organos sexuales atrofiados, infertilidad en ambos sexos Receptores de estrógenos α/β Múltiples alteraciones reproductivas Química Montpellier Modelos representativos ratones “knock-out”: • 43 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier Figura 2: Producción de ratones “knock-out” por recombinación homóloga. 44 • La estrategia basada en mutaciones dirigidas nos permite estudiar fenómenos relacionados con “pérdida de función”, opuestamente a aquellos enfocados a la ”ganancia de función”, logrados a través de técnicas de microinyección pronuclear. Actualmente, la utilización de ratones modificados genéticamente representa una de las herramientas de investigación más potentes y completas de las ciencias biológicas. El constante desarrollo de innovadoras metodologías transgénicas, permitirá avanzar en la generación de nuevos y más eficientes modelos animales de diferentes especies en el futuro. Bibliografía: • Hogan B, Beddington R, Constantini F, Lacy E. Manipulating the mouse embryo. A laboratory manual. Second edition. Spring Cold Harbor Laboratory Press, NY, 1994. • Palmiter RD, Brinster RL, Hammer RE, Trumbauer ME, Rosenfeld MG, Birnberg NC, Evans RM. Dramatic growth of mice that develop from eggs microinjected with metallothionein-growth hormone fusion genes. Nature 300:611-615, 1982. • Matzuk M, Brown CW, Kumar TR. Transgenics in Endocrinology. Humana Press, Inc, NJ, 2001. • Couse JF, Korach KS. Estrogen receptor null mice: what have we learned and where will they lead us? Endocr Rev 20:358-417, 1999. • Bartke A. Role of growth hormone and prolactin in the control of reproduction: what are we learning from transgenic and knock-out animals? Steroids 64:598-604, 1999. • Huhtaniemi I, Zhang FP, Kero J, Hamalainen T, Poutanen M. Transgenic and knockout mouse models for the study of luteinizing hormone and luteinizing hormone receptor function. Mol Cell Endocrinol 187:49-56, 2002. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Principios de Genética Médica Mendelismo- Los organismos eucariontes (organismos con membrana nuclear) poseen un sistema genético diploide, lo cual implica que el genoma de un individuo fue recibido por mitades de cada uno de sus dos progenitores. La aparición de la meiosis es el fenómeno evolutivo esencial para el establecimiento de un sistema diploide bisexual. El proceso meiótico tiene dos finalidades. En primer lugar generar un proceso de recombinación entre los dos cromosomas homólogos de cada par, y luego efectuar un mecanismo reduccional por el cual la gameta madura solo recibe un cromosoma de cada par, el cual es una mezcla de los dos elementos existentes en la célula diploide. En el proceso de fertilización la unión de las dos gametas haploides genera un embrión diploide. Los genes ubicados en un mismo cromosoma se denominan sinténicos. Durante la re-combinación meiótica se intercambian segmentos cromosómicos (crossing-over) entre los dos cromosomas homólogos (segregación). En consecuencia, las chances de intercambio de genes entre los dos miembros de un par cromosómico es una cuestión probabilística. Cuanto mas alejados estén dos genes sinténicos mayores serán las probabilides de que se separen por recombinación. Opuestamente, aquellos genes sinténicos que se encuentren cercanos segregarán en forma conjunta y se identificarán como genes ligados, o en desequilibrio de ligamiento. El nivel de ligamiento génico es inversamente proporcional a la distancia que separa dos genes; en general a 1 megabase de distancia intergénica (megabase o Mb = 1 x 106 pares de bases) las probabilidades de recombinación serán de 1% y estas chances aumentarán, hasta llegar a una segregación al azar o equilibrio de ligamiento cuando la distancia que separa dos genes sinténicos excede los 50-60 Mb. La recombinación al azar de los genes ubicados en distintos cromosomas o de los genes sinténicos en equilibrio de ligamiento constituye la ley de segregación independiente o segunda ley de Mendel. Los cromosomas son unidades discretas formadas por ADN y proteínas. El ADN es constante mientras que la asociación de éste con las proteínas varía y depende del estadio del ciclo celular y del estado de funcionamiento del gen. En el ser humano existen 23 pares cromosómicos y, con excepción del par XY que será descrito en detalle más adelante, todos los demás pares son homólogos (similitud entre los dos elementos de un par). Dentro de un par cromosómico homólogo existen lugares o loci (locus en singular) donde se ubican los genes homólogos o alelos (genes que codifican una determinada proteína o controlan una determinada función). En ocasiones, los genes homólogos pueden tener múltiples alelos, por variación en su composición de nucleótidos, pero solamente dos de ellos, uno por cada locus cromosómico homólogo, estarán presentes en un individuo. Cuando los dos alelos homólogos de un individuo son iguales, el locus se definirá Química Montpellier Néstor O. Bianchi y Alejandro D. Bolzán • 45 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier como homocigota. En el caso de que cada locus esté ocupado por un alelo diferente, el individuo será heterocigota para dicho locus. El gen CYP2D6 correspondiente a la familia de genes del complejo citocromo P450 es un ejemplo de polialelismo (los acrónimos que identifican los genes se escriben con todas las letras en mayúscula en los seres humanos y con la primera letra mayúscula y las demás en minúscula en las otras especies). En el ser humano CYP2D6 posee 14 alelos que difieren en su composición de bases y en sus acciones fenotípicas. La función de CYP2D6 es metabolizar más de un 30% de los compuestos químicos exógenos que se incorporan al organismo. En consecuencia, de acuerdo al par de alelos que posea un individuo será un metabolizador rápido, intermedio o lento para distintos agentes químicos y mostrará sensibilidad y/o resistencia variables a distintos compuestos medicamentosos. En un locus heterocigota puede suceder que un único alelo de los dos alelos homólogos sea suficiente para cumplir su función y expresarse en el fenotipo. A dicho alelo se lo llama dominante. En otros casos, para que aparezca un efecto en el fenotipo, se requiere la acción sumatoria de dos alelos iguales (homocigosis) y en estas condiciones los alelos se definen como recesivos. Finalmente, puede acontecer que en un individuo heterocigota cada uno de los dos alelos diferentes tenga efectos en el fenotipo. En esta eventualidad los dos genes homólogos se definen como co-dominantes. Dominancia y recesividad corresponden a la primera ley de Mendel. 46 • Cuando todos los portadores de un gen dominante en condición heterocigota o de un gen recesivo en condición homocigota muestran la manifestación fenotípica del gen se dice que la penetrancia génica es completa. Alternativamente, cuando parte de los individuos portadores de un gen dominante o de un par de alelos recesivos muestran acción fenotípica de estos genes la penetrancia del gen es incompleta y el grado de penetrancia se expresa como porcentaje de individuos que muestran manifestaciones fenotípicas del gen en relación al total de individuos que son portadores del gen en cuestión. La acción fenotípica de un gen dominante o de un par de alelos recesivos puede ser similar en todos los portadores; en tal caso se habla de expresividad génica constante. Cuando el fenotipo de los portadores difiere (pleiotropismo) la expresividad del gen es variable. En el caso de enfermedades con componente genético, la expresividad variable corresponde a las distintas formas clínicas de la afección. La penetrancia y expresión de un gen pueden ser moduladas por la acción de otros genes (mecanismo epigenético), por metilación génica o factores ambientales. La hiperplasia endocrina múltiple tipo 2 (MEN2 por multiple endocrine neoplasia) es un síndrome hereditario dominante originado por mutaciones del proto-oncogene RET ubicado en 10cen-10q11.2 (ver más adelante el sistema de nomenclatura cromosómica). La afección se caracteriza por la asociación de carcinoma medular de tiroides, hiperplasia o adenoma de paratiroides con hiperparatiroidismo y feocromocitoma. La penetrancia del gen es FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Mutaciones- Se denomina mutación a cualquier cambio en el ADN que se transmita a las células hijas o a generaciones subsiguientes y que no sea debido a la recombinación meiotica. El tipo de mutación más frecuente es el cambio de una base por otra. Cuando este reemplazo ocurre entre bases complementarias (A↔T o C↔G) la mutación se denomina transición; si ocurre entre bases no complementarias (A↔ G o G↔T) es una transversión. La relación de frecuencia de transiciones a transversiones es de 20 a 1. En conjunto los cambios de base en el ADN son identificados por el acrónimo SNPs derivado de “single nucleotide polymorphisms”. En total se han descripto aproximadamente dos millones de SNPs, lo cual implica, en promedio, un cambio de base por cada 1500 nucleótidos del genoma. Además, se estima que unos 20.000 SNPs ocurren en los genes produciendo cambio de codones y la producción de proteínas anormales por incorporación de aminoácidos no canónicos en la cadena polipeptídica. En otros casos el cambio de base ocurre en una posición del codón (generalmente la 3ª, y menos frecuentemente la 2ª posición) que no altera el tipo de aminoácido codificado. En estas circunstancias el polipéptido producido por el gen no cambia y la mutación se denomina silenciosa. En ocasiones los cambios de base pueden ocurrir en una región del intron involucrada en el procesamiento, lo cual puede generar procesamiento alternativo con producción de proteínas anormales. Otros tipos de mutaciones son las inserciones o pérdidas (deleciones) de uno o unos pocos nucleótidos. Cuando esta alteración ocurre en un exon genera un corrimiento en la lectura de los codones a partir del punto de la inserción/deleción y una expresión anormal del gen. Química Montpellier completa para el carcinoma de tiroides, por lo tanto en niños con antecedentes familiares de MEN2 se aconseja efectuar la búsqueda de mutaciones en RET y si estas se encuentran, efectuar una tiroidectomía y paratiroidectomía preventivas. En relación al feocromocitoma, la penetrancia es incompleta. Recientemente se ha encontrado que el desarrollo de feocromocitoma en varios de los casos con MEN2 depende de la coexistencia de mutaciones en RET con mutaciones en un segundo gen supresor de tumores denominado VHL, el cual mapea en 3p25-26. En consecuencia, la aparición de feocromocitoma en algunos casos con síndrome MEN2 depende de un mecanismo epigenético por interacción de dos genes. La diabetes tipo MODY (maturity-onset diabetes of the young) tiene transmisión hereditaria dominante y penetrancia incompleta. La forma más frecuente de MODY se debe a la mutación del gen HNF-1 alpha (hepatocyte nuclear factor) ubicado en 12q. Sin embargo, existen otras formas de MODY originadas por mutaciones de HNF-1 beta, HNF-4 alpha, IPF-1 (insulin promoter factor-1) o ND1-beta 2 (neuro D1). Las formas clínicas de MODY varían según la mutación causante. En estos casos no se trata de expresividad variable, sino de seudo-expresividad variable por mutaciones en genes diversos con expresión fenotípica similar. • 47 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier La mutación más frecuente en la fibrosis quística es una deleción de tres pares de bases, denominada ΔF508 la cual ocurre en el exon 10 del gen CFTR. Asimismo, deleciones en la región codificante del gen SRY dan lugar anomalías en la diferenciación de la gónada embrionaria y la aparición de mujeres XY con disgenesia gonadal. En el dominio de un gen (se denomina dominio al segmento de ADN que comprende a los exones, intrones y estructuras reguladoras de un gen) pueden existir tripletes que se repiten en tandem de 5 a 50 veces. Cuando estos repetidos ocurren en un exon dan lugar a polipéptidos con secuencias de aminoácidos idénticos. Por causas no bien establecidas, en la línea germinal de algunos individuos acontece un aumento en el número de tripletes repetidos lo cual produce gametas con cientos de repeticiones o expansión de tripletes. Los individuos resultantes del proceso de fertilización con estas gametas tienen deficiencia o falta de expresión del gen que contiene la expansión de tripletes en su 48 • dominio.El síndrome de X frágil (FRAXA), el cual es la causa más frecuente de discapacidad mental en niños después del síndrome de Down, se debe a una expansión del triplete CGG del gen FMR-1 del cromosoma X, con un aumento en el número de repetidos de 5-50 en individuos normales a más de 200 en casos con FRAXA. En la distrofia miotónica el triplete GCT, ubicado en el dominio del gen miotoninaproteína- kinasa (MPK) se expande de unas 10-30 copias a más de 200 copias. La corea de Huntington acontece por una expansión de cientos de veces del triplete CAG en el dominio de un gen ubicado en 4p16.3. La ataxia de Friedreich, la atrofia muscular espino-bulbar y la enfermedad de Machado-Joseph son otras de las enfermedades causadas por expansión de triplete. En general, en estas afecciones, la expansión de triplete se acentúa en la línea germinal del paciente, lo cual genera en su descendencia el fenómeno de anticipación, caracterizado por la aparición de la enfermedad en edades más tempranas y con síntomas mas graves que los observados en el progenitor. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos extensión. Cada nucleosoma más un segmento internucleosómico totalizan 206 bp y esta hilera de cuentas o fibrilla primaria de cromatina tiene un diámetro de 11 nm (nm = 1 x 10 -9 mt). En el siguiente estado de empaquetamiento la fibrilla primaria se enrolla formado una serie de solenoides con aspecto de un resorte en espiral; cada vuelta del solenoide comprende 6-8 nucleosomas y la estabilidad del solenoide se mantiene mediante la unión de moléculas de histona H1 a la parte externa de la estructura en espiral formando la fibrilla de cromatina secundaria de 30 nm de diámetro (Figura 2). La fibrilla de cromatina de 700 nm de diámetro, característica de las regiones hetero-cromáticas del núcleo en interfase, se origina mediante un enrollamiento adicional de la fibrilla secundaria. Finalmente, el máximo nivel de condensación y empaquetamiento se observa en el cromosoma en estadio de metafase; una unidad de longitud de la fibrilla de 1400 nm del cromosoma metafásico equivale aproximadamente a 50.000 unidades de longitud de la cadena de ADN. Figura 1. Nucleosoma. En el centro se ve el octámero formado por 2 moléculas de H2A (verde), H2B (amarillo), H3 (rojo), H4 (marrón). En el exterior del octámero se enrolla la cadena de DNA. Química Montpellier Fibrilla de cromatina, cromosomas- La cantidad promedio de ADN de un cromosoma humano de tamaño mediano equivale aproximadamente a 1.3 x 108 pares de bases. La distancia entre dos nucleótidos consecutivos en una cadena de ácido nucleico es de 3.4 Ångstrom (Å = 1 x 10 -10 mt); por lo tanto la extensión de la molécula de ADN en un cromosoma promedio es aproximadamente 5.5 cm. Una célula diploide humana tiene 46 cromosomas y el ADN del complemento diploide debe ser acomodado en el núcleo, el cual es una esfera de unos 5-8 μm de diámetro. Para resolver este problema topológico la célula emplea niveles crecientes de enrollamiento del ADN. En un primer estadio se forma una fibrilla tipo hilera de cuentas, donde cada cuenta es un octámero formado por cuatro pares de moléculas de histonas de las variedades H2A, H2B, H3 y H4. La cadena de ADN da 13/4 vueltas alrededor del octámero formando el nucleosoma (Figura 1), el cual se conecta a los dos nucleosomas vecinos en la cadena mediante un segmento de ADN de 60 bp de • 49 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Figura 2- Fibrilla de cromatina de 30 nm. Las estructuras roja y azul representan proteínas de asociación con la membrana nuclear (rojo) o con otras fibrillas de cromatina (azul). Modificado de : www.average.org~pruss.nucleosomes/html Química Montpellier Además de la fibrilla de cromatina, los cromosomas tienen otras dos estructuras esenciales: los telómeros y el centrómero. Los extremos de los cromosomas de los vertebrados comprenden los telómeros, los cuales están formados por miles de repeticiones en tandem del hexámero 5’-TTAGGG-3’. En las células humanas, la longitud de los telómeros varía entre 5 a 20 Kb La función principal de estas estructuras es facilitar la replicación del ADN en las regiones terminales de los cromosomas. Durante cada ciclo de replicación del ADN se pierden algunos de los hexámeros del telómero, los cuales son repuestos por la acción de la enzima telomerasa. 50 • La caída en los niveles de telomerasa y la subsiguiente disminución en el número de hexámeros en los telómeros es parte del proceso de envejecimiento celular. Opuestamente, en la transformación celular cancerosa existe una marcada actividad de telomerasa la cual asegura la reposición de hexámeros en los telómeros de las células en división La segunda estructura constante de los cromosomas es el centrómero. El ADN en la zona del centrómero de los primates y del ser humano está formado por repeticiones de una secuencia de unos 171 bp constituyendo el ADN alfoide, el cual es específico para cada par cromosómico (debido a esta especificidad el DNA alfoide se utiliza para la identificación cromosómica mediante técnicas de FISH, ver más abajo). Durante la profase y metafase mitóticas, el cromosoma ya dividido consiste de dos cromátidas que se mantienen asociadas por el centrómero. Asimismo, un conjunto de varias proteínas se asocia con la fibrilla de cromatina en la región del centrómero formando el kinetocoro, al cual se conectan las fibras del huso mitótico promoviendo la separación de las dos cromátidas durante la anafase. El estudio de los cromosomas y de sus anomalías se denomina citogenética. Las anomalías cromosómicas son responsables de una gran proporción de enfermedades genéticas, observándose en alrededor de 1/150 nacidos vivos, y constituyen la causa principal de retraso mental y de aborto espontáneo. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Los estudios citogenéticos se realizan en extendidos de cromosomas en etapa de metafase. La concentración de células en este estadio se obtiene mediante tratamiento de 1-3 hs. de las células vivas con colchicina, la cual inhibe la formación del huso mitótico e impide la progresión de la mitosis más allá de la etapa de metafase. Luego las células se distienden con solución hipotónica, se fijan y se realizan extendidos, los cuales se tiñen con Giemsa o algún otro colorante apropiado. En los cromosomas metafásicos el centrómero permite dividir al cromosoma en un brazo largo (q) y un brazo corto (p), y clasificar los cromosomas en metacéntricos, submetacéntricos, subterminales y acrocéntricos de acuerdo a que el centrómero esté en posición mediana o progresivamente desplazado hacia uno de los extremos. Se denomina cariotipo a la presentación de los cromosomas ordenados por tamaño y forma (en función de la posición del centrómero). El cariotipo normal de una mujer se designa 46XX y el de un varón normal, 46XY. En el cariotipo humano los pares cromosómicos 1-3 (grupo A) son metacéntricos largos (centrómero en posición más o menos mediana), los pares 4-5 (grupo B) subterminales largos (centrómero cercano a un telómero), los pares 6-12 y X (grupo C) submetacéntricos medianos (centrómero desplazado de la posición mediana), los pares 13-15 (grupo D) acrocéntricos medianos (centró-mero muy cercano a un telómero), los pares 16-18 (grupo E) submetacéntricos pequeños, los pares 1920 (grupo F) metacéntricos pequeños, y los pares 21-22 más el cromosoma Y (grupo G), acrocéntricos pequeños. En el período inicial de la Citogenética sólo era posible determinar con seguridad el número cromosómico e identificar algunos pares cromosómicos por su tamaño y ubicación del centrómero. Sin embargo, para otros pares cromosómicos la identificación era tentativa, ya que el tamaño total y de cada brazo no eran propiedades suficientes para una caracterización exacta del cromosoma. Debido a estas limitaciones, el análisis preciso de las anomalías cromosómicas era en ocasiones dificultoso. Recién a partir de la década 1970-1980 fue posible identificar con exactitud cada uno de los pares cromosómicos, gracias al desarrollo de las llamadas técnicas de bandeo. Mediante una ligera digestión con tripsina de los extendidos cromosómicos y la subsiguiente tinción con Giemsa se induce la aparición de una secuencia de bandas cromosómicas oscuras y claras, denominadas bandas G por Giemsa; estas bandas son constantes y específicas de cada par cromosómico permitiendo la identificación de los mismos. Las bandas G oscuras son ricas en bases AT y contienen la mayor parte de los genes específicos de tejidos (genes activos en un, o unos tejidos y silenciosos en los demás). Las bandas claras son ricas en AG y en ellas se encuentran los genes constitutivos (genes activos en todos los tejidos). El número total de bandas G en el complemento cromosómico humano depende del grado de elongación del cromosoma, el cual a su vez es inversamente proporcional al tiempo de tratamiento con colchicina. Los cromosomas con condensación mediana muestran aproximadamente unas 400 bandas. A mayor elongación se observa que algunas bandas están formadas por dos o más bandas oscuras y las correspondientes interbandas claras, con un total de unas 550 bandas por cariotipo. Finalmente el número de bandas en un complemento con cromosomas de elongación máxima es aproximadamente 850. Cabe señalar que el bandeo G es el más utilizado en la clínica médica. Química Montpellier Si bien a mediados del siglo XIX fue posible visualizar los cromosomas al microscopio, recién a partir de la década de 1950 se desarrollaron las técnicas que permitieron una mejor visualización e identificación de los cromosomas humanos. En efecto, la ciencia de la citogenética humana moderna data de 1956, cuando Tjio y Levan, empleando técnicas efectivas para el análisis cromosómico establecieron que el número normal de cromosomas humanos es 46. Desde entonces, el análisis cromosómico se ha convertido en un procedimiento diagnóstico importante en la medicina clínica. • 51 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Las bandas G han generado un sistema de nomenclatura cromosómica que se usa de referencia pare indicar la posición de los genes en el cromosoma. Para un número total de 400 bandas el cromosoma se identifica por su numeración; a continuación se identifica el brazo (p o q); las bandas o regiones se numeran consecutivamente desde el centrómero hacia los extremos de los brazos; convencionalmente el centrómero es la región 10 y la primera región y banda hacia q o p es la 11 y así sucesivamente. Un ejemplo ilustrará el sistema: 1p31 indica el cromosoma 1, brazo corto, región 3, banda 1. Para números totales de 550 y 850 bandas se agregan sub-bandas numeradas consecutivamente a partir del centrómero; los números de las sub-bandas se indican después de un punto. Así, por ejemplo, para 550 y 850 bandas 1p31 se transforma en 1p31.1, 1p31.2 y 1p31.3 por la sub-división de la banda 1 en tres sub-bandas (1-3). Química Montpellier En el sitio de INTERNET www.pathology.washington.edu/ cytopages pueden obtenerse los esquemas de los bandeos cromosómicos G para 400, 550 y 850 bandas y el detalle completo de nomenclatura para cromosomas normales. 52 • Química Montpellier Las bandas Q y H son similares a las bandas G y son inducidas por tinción con los colorantes fluorescentes quinacrina o Hoescht los cuales se unen preferentemente a las regiones ricas en AT. Tienen la desventaja de que para su visualización se requiere de un microscopio de fluorescencia y que este bandeo desaparece más o menos rápidamente, a diferencia de las bandas G que son permanentes. Las bandas C son inducidas por tratamientos suaves con álcali y coloración con Giemsa. Revelan las zonas heterocromáticas ricas en secuencias repetidas, y por lo tanto en el ser humano aparecen preferentemente en las regiones pericentroméricas. Existen además otros tipos de bandeo cromosómico, tales como el bandeo por enzimas de restricción y el bandeo NOR (nucleolar organizing regions) el cual identifica regiones nucleolares con genes ribosómicos activos; estas técnicas de bandeo son poco empleadas en citogenética clínica y tienen mayor uso en investigación. Hacia mediados de la década de 1980 se dio un gran avance en el campo de la citogenética, con la aparición de la técnica de hibridación in situ fluorescente (FISH, fluorescence in situ hybridization), producto de la combinación de la citogenética con la genética molecular. El empleo de FISH permite la identificación precisa de cromosomas enteros o regiones cromosómicas, y por ende, facilita la detección de anomalías tanto numéricas como estructurales. La técnica de FISH consiste en hibridar una sonda fluorescente con cromosomas ya fijados y procesados. La sonda es un segmento de ADN complementario de regiones cromosómicas ricas en secuencias repetidas. Empleando sondas afines a los ADN alfoides puede identificarse cada par cromosómico tanto en metafase, como en cualquier otro estadio del ciclo celular, incluyendo el núcleo en interfase. Asimismo, usando sondas marcadas con compuestos que emiten fluorescencia con longitud de onda diferente pueden reconocerse con facilidad los distintos cromosomas por diferencias de color, sin tener que recurrir al empleo de bandas G, las cuales requieren cierto nivel de entrenamiento del observador. Para individualizar la región cromosómica en la cual híbrida la/s sonda/s se utiliza un microscopio FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Entre otras cosas, el FISH es de gran utilidad para el diagnóstico prenatal de Síndrome de Down (ver más abajo) pues permite rápidamente identificar el centrómero de los tres cromosomas 21 en las células en interfase del líquido amniótico, sin tener que esperar los 10 a 15 días que se requieren para cultivar estas células y analizar los cromosomas en metafase. Existe actualmente una gran variedad de sondas para FISH, lo que facilita la identificación y análisis de las anomalías cromosómicas, tanto numéricas como estructurales. De este modo, las llamadas sondas de pintura cromosómica (sondas para cromosomas enteros o whole chromosome painting, como las que se muestran en la Figura 3, marcadas con un fluorocromo rojo -Texas Red- y uno verde –FITC) permiten identifican pares de cromoso-mas específicos y por lo tanto, facilitan la detección de translocaciones recíprocas y no recíprocas o inserciones. Este tipo de sondas, puede utilizarse también para determinar el número de copias de un cromosoma específico (por ejemplo, el 21 en el Síndrome de Down) lo que permite analizar la pérdida o ganancia de cromosomas (anomalías numéricas) en células en interfase. La sonda pancentromérica (constituida por una selección de secuencias alfoides que hibridan simultáneamente con todos los centrómeros) permite la identificación y análisis de cromosomas dicéntricos o multicéntricos y en anillo. Figura 3: FISH (pintura cromosómica) sobre metafase humana normal con sondas específicas para los cromosomas 1 (rojo, Texas Red) y 2 (verde, FITC). El resto de los cromosomas se observa de color azul debido a la tinción con el fluorocromo DAPI. (Foto: Dr. Bolzán). Química Montpellier de fluorescencia, equipado con los filtros adecuados al fluorocromo empleado para marcar cada sonda. • 53 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Química Montpellier Las sondas centrómero-específicas están constituidas por secuencias alfoides específicas para cada par cromosómico, y permiten detectar la presencia y número de copias de un determinado cromosoma, ya sea en metafase o en interfase (Figura 4). Las sondas teloméricas o subteloméricas son específicas para cada par y para cada brazo cromosómico, y permiten identificar translocaciones a nivel subtelomérico, frecuentes en enfermedades relacionadas con trastornos neurológicos. Las sondas brazo-específicas, permiten la identificación de inversiones pericéntricas (es decir, que incluyen al centrómero), mientras que existen sondas que identifican 54 • determinadas bandas cromosómi-cas, y que permiten identificar la presencia de inversiones paracéntricas (es decir, que no incluyen al centrómero). Cabe señalar que existen kits comerciales de pintura cromosómica que permiten detectar en forma simultánea varios pares de cromosomas humanos, ampliando así el espectro de análisis en cuanto a número de cromosomas se refiere, a lo que se agrega el desarrollo más reciente de kits que permiten, mediante el uso de un equipamiento adecuado, la detección simultánea de todos los pares de cromosomas humanos en una misma metafase (FISH de 24 colores, M-FISH, Rx-FISH y SKY-FISH). Figura 4: FISH sobre metafase e interfase humanas normales con sondas de DNA alfoide (centrómeroespecíficas) para los cromosoms 8 (FITC, verde) y 17 (Rodamina, rojo). Contratinción con DAPI. Foto: Qbiogene (USA).. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos de los otros cromosomas, por lo tanto será el último integrante del complemento en iniciar y terminar la duplicación del ADN. En el momento de la inactivación, la elección del X a heterocromatinizar (X de origen paterno o materno) es al azar para cada célula. Sin embargo, una vez elegido el X a inactivar la progenie de la célula mantendrá silencioso al mismo cromosoma X. Por lo tanto, los mamíferos hembras son un mosaico con dos líneas celulares: una con el X paterno y otra con el X materno inactivo. En los casos en que existen cromosomas X en exceso, solamente un cromosoma X se mantiene activo, con lo cual se cumple el proceso de compensación de dosis, lo que se expresa con la ecuación: Xht = nX -1, donde ht indica heterocromático y n indica número). La translocación de XIST a un autosoma puede generar la inactivación del autosoma; un cromosoma X reordenado siempre se inactiva, salvo que se pierda el XIST y no pueda producirse la inactivación.. Si una mutación recesiva esta ligada al X (X*) el varón X*Y padecerá la enfermedad. Las mujeres X*X serán un mosaico con X* activo/X inactivo y viceversa; en consecuencia no padecerán, o tendrán formas atenuadas de la afección. Los varones X*Y tendrán descendencia masculina normal (esperma Y con ovocito X) y descendencia femenina portadora (esperma X* con ovocito X). La hemofilia, la ceguera al color y el síndrome de X frágil (FRAXA) son ejemplos de enfermedades ligadas al sexo. La distrofia muscular de Duchenne y el testículo feminizante también son enfermedades ligadas al sexo; sin embargo, por letalidad en la primera y por infertilidad en la segunda no puede observarse la forma de transmisión de la afección por vía masculina. Química Montpellier Cromosomas Sexuales, Compensación de Dosis y Enfermedades Ligadas al SexoEn los mamíferos el sexo heterogamético (XY) es el masculino y el homogamético (XX) el femenino. En casi todos los mamíferos el cromosoma X mide el 5% del conjunto cromosómico haploide mientras que el cromosoma Y es siempre más pequeño. En el ser humano el cromosoma Y mide 1,2 a 1,6% del conjunto haploide, y por lo tanto el genoma de las mujeres es 3,2 a 3,8% mayor que el genoma de los varones. Para compensar esta diferencia de tamaño o dosis del genoma, en la mujer se inactiva un cromosoma X de tal manera que en ambos sexos solamente existirá un único cromosoma X activo o hemicigótico (expresión de un solo gen, por lo cual no existe ni dominancia ni recesividad). En el ser humano, la inactivación de un cromosoma X ocurre aproximadamente en el día 16 post-fertilización, cuando el embrión femenino tiene unas 500-1000 células y se halla en la etapa de gástrula. La inactivación del X depende del gen XIST (X inactivation specific transcript). En el momento de la inactivación del X, uno de los alelos XIST se inactiva por causas no bien conocidas (probablemente por la acción epigenética de otro gen) y el cromosoma X con el gen XIST inactivo mantiene todos sus otros genes activos. Opuestamente, en el otro cromosoma X, la expresión de XIST produce un mRNA no codificante que tiene la función de silenciar los demás genes del cromosoma. El cromosoma X inactivo se mantiene condensado (heterocromático) durante la interfase produciendo la cromatina sexual o corpúsculo de Barr. Durante la replicación, el X inactivo debe decondensarse a partir de una conden-sación mayor que la • 55 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Síndromes por aberraciones cromosómicas- A partir del descubrimiento por Lejeune y cols. (1959) de que el Síndrome de Down estaba asociado a la presencia de un cromosoma del grupo G en exceso (el cromosoma 21), nació la llamada Citogenética clínica, que trata de la relación entre Síndromes clínicos y anomalías cromosómicas. Como ya se mencionó, las anomalías cromosómicas pueden ser numéricas o estructurales, y afectan a los autosomas o a los cromosomas sexuales. Algunas generalidades vinculadas a los síndromes por aberraciones cromosómicas son las siguientes: A- Los síntomas de los síndromes por anomalías cromosómicas son debidos a desequilibrio de dosis génica (más de dos genes en los casos de aumento en el número de cromosomas o regiones cromosómicas; un único gen [haploinsuficiencia] en los casos de ausencia de un cromosoma o región cromosómica). B- Las alteraciones de número de los cromosomas sexuales son siempre menos deletéreas que las alteraciones de número de los autosomas. C- Las aberraciones cromosómicas con efectos fenotípicos más acentuados terminan en la pérdida del embrión. Solamente son viables las aberraciones menos deletéreas. Química Montpellier D- Algunos síntomas son comunes a gran parte de los síndromes por aberraciones cromosómicas; p.ej.: retardo de crecimiento, microcefalia, retardo mental, implantación baja de orejas. 56 • E- En los casos de trisomías (un cromosoma en exceso), monosomías (un único cromo-soma de un par cromosómico) o en los síndromes por pérdida de un brazo o segmento cromosómico la mayor parte de los síntomas se deben al desequilibrio de dosis de una región crítica y no al desequilibrio de dosis de todo el cromosoma o región en exceso o deficiente. Así, por ejemplo, en el síndrome de Down, gran parte de los síntomas se debe al aumento de dosis de los genes en la banda 21q22.3 y no a la presencia de un cromosoma 21 en exceso. F- Gran parte de los procesos cancerosos muestran alteraciones de número y estructurales de los cromosomas, las cuales son con frecuencia específicas de la afección. Principales Síndromes por aberraciones cromosómicas- La cantidad de afecciones por anomalías cromosómicas es muy extensa por lo cual sería imposible detallarlas en este fascículo. No obstante, vamos a señalar brevemente los principales Síndromes por aberraciones cromosómicas, recomendando al lector dirigirse al sitio de OMIM (Online Mendelian Inheritance in Man) en INTERNET, donde entrando por nombre de enfermedad, sitio cromosómico o acrónimo de gen puede obtener la descripción clínica y la causa cromosómica o génica de todas las enfermedades con componente genético. Además, el sistema de nomenclatura completo para aberraciones cromosó-micas humanas puede consultarse en: An Internacional System for Human Genetic Nomenclature, Editor F. Mitelman, Editorial Karger, 1995. A-Síndromes por anomalías autosómicas: 1-Numéricas (Están asociadas generalmente a edad materna avanzada y se originan en su mayoría por no disyunción en meiosis I materna). Síndrome de Down o trisomía 21: Es la patología de origen cromosómico más frecuente en relación al retardo mental, siendo su incidencia de 1/700 recién nacidos. Síndrome de Edwards o trisomía 18: Tiene una frecuencia de 1/6000 a 8000 recién nacidos. De éstos, sólo un 10 % sobrevive al año de vida. FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Síndrome de Patau o trisomía 13: Su frecuencia es de 1/13000 recién nacidos. Sólo el 5 % vive más de tres años. 2-Estructurales (En la mayor parte de los casos, aparecen “de novo”). Síndrome de Wolf: Se identifica citogenéticamente por una deleción del brazo corto del cromosoma 4. Síndrome de Cri du Chat: Se identifica citogenéticamente por una deleción del brazo corto del cromosoma 5. enumeración y descripción de estos síndromes excede el marco de este fascículo. Un detalle de los síndromes por aberraciones cromosómicas puede encontrase en: Schinzel, A. Catalogue of unbalanced chromosome aberrations in man. 1ª Edición pp. 963, 2001 y en el capítulo 14 del libro Genética Humana, de A. J. Solari, Edit. Panamericana, 1999, 2ª. Edición. Cuándo debe solicitarse un estudio cromosómico- A continuación se enumeran los casos en los cuales es aconsejable indicar un estudio cromosómico: Diagnóstico prenatal 1-Numéricas Síndrome de Turner: Su incidencia es de 1/2500 recién nacidos (mujeres). Es una monosomía del cromosoma X. El 99 % de las concepciones 45,X terminan en aborto espontáneo. No existe relación con edad materna avanzada. El 50 % de los casos posee cariotipo 45,X, mientras que el 50 % restante posee mosaicismo. En un 75 % de los casos, el cromosoma X ausente es el de origen paterno. Síndrome XXX: Su incidencia es de 1/1000 recién nacidos. Su aparición se relaciona con edad materna avanzada. Síndrome de Klinefelter: Su incidencia es de 1/1000 recién nacidos. Su aparición puede ser debida a edad materna avanzada, o a no disyunción en la meiosis paterna. El 80 % de los casos presente un cariotipo 47,XXY. Síndrome XYY: Su incidencia es de 1/1000 recién nacidos. 2-Estructurales: Existen diversas patologías asociadas a alteraciones estructurales de los autosomas y cromosomas sexuales. Sin embargo la A- Embarazo de mujeres añosas (más de 35 años de edad). B- Embarazadas con antecedentes familiares de síndromes por aberraciones cromosómicas. C- Embarazadas con antecedentes familiares de enfermedades hereditarias de etiología desconocida, con el fin de descartar cromosomopatías. En pediatría A- Malformaciones congénitas. B- Dismorfismo facial. C- Retraso de desarrollo psicomotor D- Estatura baja y/o retardo de crecimiento. E- Pubertad retardada. En obstetricia y ginecología A- Abortos recurrentes. B- Infertilidad masculina con o sin atrofia testicular. C- Esterilidad femenina. Química Montpellier B-Síndromes por anomalías en los cromosomas sexuales: • 57 FISIOPATOLOGIA ENDOCRINA: Bioquímica y Métodos Diagnósticos Próximos Fascículos Fascículo II : Fascículo III : Bases de la Inmunología en Endocrinología. Interacciones Inmuno-Endocrinas Exploración de la Función Endócrina. Parte I. Carlos A. Fossati, Fernando G. Chirdo, Guillermo H Docena y, Martín Rumbo . Parte II. Amada Segal-Eiras y María V. Crocce. Introducción a la Endocrinología. Estructura y Función de las Hormonas. Secreción, Producción, Cinética y Transporte Hormonal. Ricardo S. Calandra Cronobiología en Endocrinología Conceptos elementales del uso de radioisótopos. Mario A. Pisarev Tipos de Ensayos. María O. Suescun y Silvia I. GonzalezCalvar Control de Calidad. Zulema Farinati , Silvia Quiroga y Martha Torres Pruebas Funcionales y Valores normales. Sergio Damilano, Laura E. Boero,Cecilia A. Fenili, Mirta S. Gurfinkiel y Alberto G. Del Río Daniel P. Cardinali Hormonas. Mecanismos de acción hormonal. Hormonas Peptídicas Guillermo J. Juvenal Evaluación de un sistema hormona-receptor Juan C. Calvo Química Montpellier Hormonas Esteroideas Isabel A. Luthy • 59