Dr. Rojas Herrera Rafael Antonio - Universidad Autónoma de Yucatán

Dr. Rafael Antonio Rojas Herrera
DATOS LABORALES
Cargo: Profesor-Investigador Titular “B” de tiempo completo
Tel: (999) 9460981 y (999) 9460989
email: [email protected]
SNI: Nivel I.
Línea de investigación: Bioprocesos microbianos. Potencial de utilización de los recursos
microbianos mediante estudios de diversidad y ecología microbiana, utilizando métodos
moleculares independientes de cultivo (metagenómica), así como estudios encaminados a
entender el funcionamiento de consorcios microbianos nativos con actividades de interés
biotecnológico (degradación de hidrocarburos y compuestos aromáticos y producción de
exoplisacáridos). También me interesa estudiar la ecología de bacterias patógenas, en
particular vibrios, en ambientes naturales y su prevalencia y distribución en productos
pesquero para el consumo humano.
FORMACIÓN ACADEMICA
Doctor en Ciencias y Biotecnología de Plantas. 1 de Julio de 2002. Centro de
Investigación Científica de Yucatán. A. C. México
TESIS DE POSTGRADO DIRIGIDAS.
Posgrado Institucional en Ciencias Agropecuarias y Manejo de Recursos Naturales
Tropicales
1. Estudiante: Araceli González Burgos
Programa: Maestría en Ciencias en Manejo de Recursos Naturales Tropicales.
Universidad Autónoma de Yucatán.
Título de la tesis: Caracterización genómica y funcional de consorcios microbianos
procedentes de una laguna costera.
Fecha de examen: 24 de octubre de 2011
2. Estudiante: Joaquín Jesús Sánchez Zannatta
Programa: Maestría en Ciencias Agropecuarias. Universidad Autónoma de Yucatán.
Título de la tesis: Efecto de la inclusión de ramón (Brosimum alicastrum) en la dieta
del cerdo pelón mexicano sobre cambios de la microbiota intestinal.
Fecha de examen: 26 de agosto de 2011.
Posgrado en Ciencias Agropecuarias
3. Estudiante: José Ulises González de la Cruz
Programa: Doctorado en Ciencias Agropecuarias. Facultad de Medicina Veterinaria y
Zootecnia. Universidad Autónoma de Yucatán.
Título de la tesis: Caracterización de la comunidad bacteriana del tracto digestivo del
langostino de agua dulce Macrobrachium carcinus L.
Fecha de examen: 19 de agosto de 2011
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4. Estudiante: María Concepción de la Cruz Leyva.
Programa: Doctorado en Ciencias Agropecuarias. Facultad de Medicina Veterinaria y
Zootecnia. Universidad Autónoma de Yucatán.
Título de la tesis: Estudio de la comunidad bacteriana asociada al pulpo mediante
técnicas moleculares.
Fecha de examen: 11 de octubre de 2010
Otros programas
5. Estudiante: Karla Susana Escalante Herrera
Programa: Maestría en Ciencias Alimentarias. Facultad de Ingeniería Química.
Universidad Autónoma de Yucatán.
Título de la tesis: Diversidad genética de bacterias ácido lácticas en sedimentos y
efluentes de sistemas de explotación ganadera.
Fecha de examen: 9 de febrero de 2010
6. Estudiante: Geovanny Ramón Hernández Cisneros
Programa: Maestría en Ciencias en Producción Pecuaria Tropical. Instituto
Tecnológico de Conkal.
Título de la tesis: Polimorfismo del citocromo B mitocondrial en cerdos pelón de
Yucatán
Fecha de examen: 22 de julio de 2011
7. Estudiante: Salvador Elías Castell González
Programa: Maestría en Ciencias en Biotecnología Genómica.
Instituto
Politécnico Nacional.
Título de la tesis: Análisis de las comunidades microbianas asociadas a tapetes
hipersalinos de la Laguna Rosada de Uaymitun, Yucatán, México.
Fecha de examen: 13 de diciembre de 2010
8. Estudiante: Juan Enrique Mauricio Benavides.
Programa: Doctorado en Biotecnología. Facultad de Ciencias Químicas. Universidad
Autónoma de Coahuila.
Título de la tesis: Estudio de la diversidad procariota de algunas zonas de la reserva
ecológica de Cuatrociénegas, Coahuila y regiones aledañas, con perspectivas
biotecnológicas.
Fecha de examen: 22 de junio de 2010.
Artículos recientes:
1. Rafael Rojas-Herrera, Marcela Zamudio-Maya, Leticia Arena-Ortiz, Reynaldo C.
Pless y Aileen O’Connor-Sánchez. (2011). Microbial diversity, metagenomics and the
Yucatan’s aquifer. PHYTON INTERNATIONAL JOURNAL OF EXPERIMENTAL
BOTANY. 80:231-240. ISSN 0031-9457 (Print), 1851-5657 (Online).
2. Mónica Marcela Galicia-Jiménez, Rafael Rojas-Herrera, Carlos Sandoval-Castro &
Héctor Magaña-Sevilla. (2011). Possible chemotaxis in Ruminococcus albus:
comparative genomics. Journal of Applied Animal Research. 39(3): 189-191. ISSN
0971-2119 (Print), 0974-1844 (Online).
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3. Raúl Tapia-Tussell, Daisy Pérez-Brito, Rafael Rojas-Herrera, Alberto CortesVelazquez, Gerardo Rivera-Muñoz and Sara Solis-Pereira. (2011). New laccaseproducing fungi isolates with biotechnological potential in dye decolorization. African
Journal of Biotechnology 10(50): 10134-10142. ISSN 1684–5315.
4. Mónica Marcela Galicia-Jiménez, Carlos Sandoval-Castro, Rafael Rojas-Herrera,
Héctor Magaña-Sevilla. (2011). Quimiotaxis bacteriana y flavonoides: perspectivas
para el uso de probioticos. Tropical and Subtropical Agroecosystems, 14:891-900.
ISSN 1870-0462.
5. J. Ulises González-de la Cruz, H. Delfin-González, Ma. C. de la Cruz-Leyva; R. A.
Rojas-Herrera, M. Zamudio-Maya. (2011). Protocolo para la extracción de adn
metagenómico bacteriano del langostino Macrobrachium carcinus L. Tropical and
Subtropical Agroecosystems, 14: 875-883. ISSN 1870-0462.
6. M.C. de la Cruz-Leyva, M. Zamudio-Maya, A.I. Corona-Cruz, J.U. González-de la
Cruz, R. Rojas-Herrera. (2011). A method for isolating RNA from metabolically
active bacterial flora associated with octopus. Letters in Applied Microbiology 53: 813. ISSN 0266-8254 (Print) 1472-765X (Online).
7. Torres-Calzada, C., Tapia-Tussell, R., Quijano-Ramayo, A., Martín-Mex, R., RojasHerrera,R., Higuera-Ciapara, I., Pérez-Brito, D. (2011). A Species-Specific Polymerase
Chain Reaction Assay for Rapid and Sensitive Detection of Colletotrichum capsici.
Molecular Biotechnology 49: 48:55. ISSN: 1073-6085 (Print) 1559-0305 (Online).
8. Narváez-Zapata J. A., Rojas-Herrera R. A., López-Uc, Y., Sánchez-Estudillo, L. (2011).
Different physiological responses influenced by salinity in genetically related
Dunaliella salina isolates. Biotechnology Letters 33: 1021-1026. ISSN: 0141-5492
(Print) 1573-6776 (Online).
9. Narváez‐Zapata J. A., Rojas‐Herrera R. A., Rodríguez‐Luna I. C., Larralde‐Corona C. P. (2010). Culture‐Independent Analysis of Lactic Acid Bacteria Diversity Associated with Mezcal Fermentation. Current Microbiology 61(5):444‐450. ISSN: 0343‐8651 (Print) 1432‐0991 (Online). 10. Rodríguez‐Luna I. C., Larralde‐Corona C. P., Rojas‐Herrera R. A., Narváez‐Zapata J. A. (2009). Análisis metagenómico de la microflora bacteriana asociada a los mostos de mezcal. En: Avances en el Estudio de la Biotecnología. Narváez Zapata J. A., Villegas‐
Hernández M. C. & Mendoza Herrera A. Editores. Editorial Instituto Politécnico Nacional. México, D. F. ISBN 978‐607‐414‐060‐6. 11. López‐Uc Y. K., Sánchez‐Estudillo L., Rojas‐Herrera R., Narváez Zapata J.A. Physiological and Molecular Characterization of Dunaliella salina Mexican Strains under Saline Stress. (2009). En: Avances en el Estudio de la Biotecnología. Narváez Zapata J. A., Villegas‐Hernández M. C. & Mendoza Herrera A. Editores. Editorial Instituto Politécnico Nacional. México, D. F. ISBN 978‐607‐414‐060‐6. 12. Domínguez Benetton X., Rojas‐Herrera R., Alcocer Campos E., Martín López M. (2008). Respuesta en frecuencia y análisis de biodiversidad de la biocorrosión del acero al 2
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carbón en contenedores de gasolina de laboratorio con fracciones acuosas definidas. Proceedings of the 7th Corrosion‐Internacional Congress. Mexican‐Section. Cancún Quintana Roo. 17‐22 of August. Sponsoring CIMAV‐IMRC‐PEMEX. ISBN: 978‐607‐
95042‐1‐2. 13. S. Solís Pereira, M. Zamudio Maya y R. Rojas‐Herrera. (2008). Macrooportunidades del micromundo en la Península de Yucatán. Editorial. BioTecnología 12(2):1. ISSN 0188‐
4786. 14. R. Rojas‐Herrera, J. Narváez‐Zapata, M. Zamudio‐Maya, and M.E. Mena‐Martínez. (2008). A simple silica‐based method for metagenomic DNA extraction from soil and sediments. Molecular Biotechnology 40(1):13‐17. ISSN 1073‐6085. 15. M. Zamudio‐Maya, J. Narváez‐Zapata and R. Rojas‐Herrera. (2008). Isolation and identification of lactic acid bacteria from sediments of a coastal marsh using a differential selective medium. Letters in Applied Microbiology 46: 402‐407. ISSN 0266‐
8254.
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