La historia empieza en Der Riese, una falsa fábrica de armamento donde los nazis hacian experimentos con elemento 115, un elemento conseguido de un meteorito caído en Asia, el cual aseguraban revivía a los muertos. Varios experimentos consistían en reanimar cadáveres, los teletransportadores o las armas especiales (arma de rayos y Wunderwaffe). Al parecer, segun las radios ubicadas en este lugar, tenian una grave falta de presupuesto y de elemento 115. Necesitaban sujetos de pruebas, asi que fueron a un manicomio en Alemania (Verrückt) para experimentar con sus pacientes. En algun punto del experimento, algo falló y todo se descontroló. Mandaron a un grupo de marines, uno de los cuales podría ser Dempsey y otro era Peter. En el trailer de Verrückt solo se muestran 3 marines, por lo que posiblemente Dempsey se fuera y siguiera a Richtofen a Japón (Shi no numa) y el cuarto jugador que aparece on-line, esté ahí solo para rellenar. Debido a la falta de elemento 115 en Der Riese, y segun una de las radios, Maxis necesitaba encontrar un suministro regular de elemento 115... y lo encontraron, un meteorito ubicado en un pantano de Japón (Shi No Numa). Lo que no sabian es que el meteorito infectó de 115 toda el agua del pantano y devolvió a todos los caidos en la guerra a la vida. Entonces, es cuando uno de los miembros del proyecto que estaba en Shi No Numa en ese momento, manda el mensaje a Peter. Peter llega a Shi No Numa y se da cuenta de que todo está invadido por los cadáveres reanimados, en ese momento Peter, que habia perdido una mano en Verrückt, decidió hacer lo unico que podia hacer, ahorcarse fuera del alcance de los zombies. Mientras, en Der Riese, Maxis y su ayudante Edward Richtofen seguian con los experimentos. Maxis le regala una perrita embarazada a us hija, Samantha Maxis. Los experimentos con los teletransportes avanzan, pero los zombies siguen siendo incontrolables. Un dia, Maxis realiza una prueba con Fluffy, no se sabe si fué intencional o accidente, pero algo sale terriblemente mal. Fluffy se transforma en un ser monstruoso y sediento de sangre, llamado Hellhound (en alemán perro del infierno). En ese momento, llega Samantha buscando a su perrita. Tras ver lo sucedido, Richtofen encierra a Samantha y a Maxis con fluffy y activa el teletransportador. Samantha y Fluffy quedan atrapadas en una especie de "limbo", mientras que Maxis, consigue aparecer en algun lugar de Der Riese, aunque al final, acaba rodeado de zombies y ahorcandose. Después de eso, Richtofen va a Shi No Numa, donde se encuentra con los 3 personajes. De alguna manera, consiguen escapar de Shi No Numa hasta Der Riese, posiblemente con algun teletransportador y una vez allí, tras intentar teletransportarse, algo sucede y se teletransportan en el tiempo, hasta llegar a Kino Der Toten, en 1960. Curiosamente, ya que al llegar a Der riese hay un eclipse, se nota que hay una forma de oso en la Luna, donde seguramente proviene el elemento 115. Kino Der Toten era un cine teatro, donde los Maxis enseñaba a los soldados nazis las funciones del teletrasportador. Esta es la explicación de los "cubos" con zombies dentro en el escenario. En cuanto a los zombis de 4 patas, son experimentos fallidos segun Eduard Richtofen. Al parecer, intentaron combinar el gas Nova 6 con el elemento 115 para crear una nueva especie de zombies, pero no salió bién. Son mencionados en el primer cuarto del mapa (el vestíbulo), con una frase en la pared que dice "Beware of the 6"("Cuidado con los 6"). La investigación iba por buen camino, pero los sujetos se descontrolaban al oir sonidos fuertes o al ver luces intermitentes. Posiblemente todo se descontrolara después de que alguna alarma saltara y los zombies acabaron tomando el teatro. Después de salir de Kino Der Toten, los personajes llegaron de alguna manera a una base espacial soviética. En Ascension, estaban trabajando en diferentes proyectos: El proyecto Mercurio también llamado Dispositivo Gersch (Agujeros negros), creado por el científico ruso Gersch, Proyecto Trueno (Arma Thunder) y otro proyecto de nombre desconocido que consiste en lanzar monos a la atmosfera en cohete. Yuri menciona que esta aprendiendo muchas cosas sobre el elemento 115, lo cual puede significar que el en secreto podia estar experimentando con él y eso explicaria la plaga zombie allí. Los monos posiblemente se infectaran con el elemento 115 que hay en la Luna y en el espacio. Ascension se desarrolla simultaneamente con Five, esto se sabe gracias a que hay 3 telefonos rojos que en ciertos momentos suenan y al contestar, nos habla uno de los 4 personajes de Five. Se sigue investigando en este mapa. Mientras, en Five, los zombies estan tomando el Pentagono. Puede parecer que Five no tenga mucho que ver con la historia, pero no es del todo cierto. Segun una de las radios de Der Riese, los americanos tienen un suministro regular de 115 en el Area 51 (Hangar 18 especificamente), por lo que ellos también estarian experimentando con él en el laboratorio que hay en el Pentagono. El cientifico que aparece cada 5 rondas para robar las armas de los jugadores, es un cientifico que trabajó junto al doctor Maxis y a Richtofen en Der Riese y que consiguió escapar. El sistema de teletransportes de Five, es su versión mejorada de los teletransportes de Der Riese y Kino Der Toten. Esto da sentido a una frase escrita en la pizarra al lado de la electricidad donde pone: "Edward, I know it was you" (Edward, se que fuiste tu). Tras haber liberado a Gersch de el mecanismo Kassimir, de alguna manera se tele transportan a la actualidad, llegando a una pequeña isla de Siberia, mientras se rueda una película.