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INTRODUCCIÓN
INTRODUCCIÓN
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En más del 90% de los cánceres cervicales se ha podido detectar ADN de
papilomavirus humano ó virus del papiloma humano (PVH, VPH ó HPV – human
papilloma virus) [DLP02]. Hay datos que sugieren que no existe cáncer cervical sin
infección de VPH. Los virus papiloma humano son virus capaces de generar lesiones
verrugosas mediante la inducción de proliferación celular, durante el curso de una
infección. El cáncer de cerviz está entre la segunda y tercera causa más común de cáncer en
las mujeres de todo el mundo, después del cáncer de seno y compitiendo con el cáncer de
pulmón [DLP02]. En México, el índice de mortalidad debido al cáncer cervical se estimó
en 0.0218% entre mujeres mayores de 15 años en 1994 [He+97]. Se han identificado hasta
el presente alrededor de 80 genotipos virales de VPH, de los cuales más de 30 infectan la
región anogenital [GAG01] y al menos 10 de ellos están asociados con el cáncer cervical
[De+02]. De esto resulta que la asociación entre la infección por VPH y las lesiones
anogenitales en un fenómeno más complicado de lo esperado. Los genotipos VPH-16, -18,
-31, -33, -35, -39, -45, -51, -52, -56, -58, -59 y -68 son considerados de “alto riesgo”
porque fueron identificados en pacientes que desarrollaron neoplasias cervicales. Los
genotipos VPH-6, -11, -40, -42, -43, -44 y -55 son considerados de “bajo riesgo” y a los
VPH-6, -11 y -42 se los relaciona a las verrugas genitales (condilomas). Para mayores
detalles sobre variantes consultar el trabajo de Wheeler e Icenogle [WhI95].
La detección de secuencias genómicas de VPH para un diagnóstico adecuado
requiere grandes cantidades de muestras. Actualmente se recurre a la amplificación de
secuencias virales blanco mediante reacción en cadena a la polimerasa (PCR – Polymerase
Chain Reaction) ó hibridación.
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Dada la cantidad de tipos de VPH existentes y su diferente potencial oncogénico, se
han desarrollado estrategias de detección que se basan en la amplificación por PCR de
regiones de consenso entre los diferentes tipos de VPH para cubrir un amplio espectro de
ellos.
En todos los casos, además del diagnóstico, se vuelve de importancia fundamental
la identificación del genotipo viral. La determinación del tipo de VPH presente en la
infección se determina de diferentes maneras, comúnmente por un segundo PCR de los
casos positivos. Los tipos caracterizados del VPH han aumentado con el tiempo.
Paralelamente, se han ido modificando los procedimientos para su detección y tipificación.
Sin embargo, los nuevos métodos son poco eficientes en el uso de los recursos (iniciadores,
enzimas, tiempo, etc.) [Fer02].
En el Departamento de Química y Biología de la Universidad de las AméricasPuebla se ha trabajado en la clasificación de secuencias de ADN. Se pretende tipificar la
familia de los virus que causan el cáncer cérvico-uterino. El método comúnmente empleado
para genotipificar bajos volúmenes de muestras se conoce como RFLP (Restriction
Fragment Lenght Polymorphism). En éste método, una enzima llamada enzima de
restricción, proporciona al analista un patrón de restricción con cierta cantidad de
información. Al combinar la información proporcionada por diferentes patrones de
restricción, el analista es capaz de determinar con exactitud el genotipo viral. Se pretende
optimizar el número de enzimas necesarias.
Actualmente se conocen alrededor de 80 patrones de restricción complejos para
tipos y subtipos del VPH y más de 200 enzimas de restricción diferentes. Estos números
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irán aumentando con el tiempo, por lo que se requieren algoritmos de optimización con un
orden de complejidad razonablemente acotado.