VIROLOGÍA PROGRAMA DE LA ASIGNATURA CURSO 2009 / 2010 LICENCIATURA EN BIOTECNOLOGÍA 4 CURSO (Asignatura Cuatrimestral-6 créditos) º DEPARTAMENTO: BIOLOGÍA MOLECULAR E INGENIERÍA BIOQUÍMICA ÁREA ACADÉMICA: MICROBIOLOGÍA PROFESORES: Teoría: Prácticas: Inés Canosa Pérez-Fragero ([email protected]; extensión 49052) Aroa López Sánchez ([email protected]; extensión 49053) UNIVERSIDAD PABLO DE OLAVIDE Facultad de Ciencias Experimentales Licenciatura en Biotecnología MICROBIOLOGÍA. CURSO 2009-2010. ORGANIZACIÓN DEL CURSO El curso está basado fundamentalmente en la docencia de clases teóricas, la realización de prácticas y actividades complementarias. Las actividades complementarias consisten en la realización de seminarios, que formarán parte del temario de la asignatura CLASES TEÓRICAS La asignatura de Virología trata de resumir esquemáticamente los conocimientos aportados a la Biología por esta nueva disciplina que nació a finales del s. XIX. La asignatura consta de tres secciones. La primera corresponde a aspectos generales de la Virología como: taxonomía y clasificación, estructuras virales, genética o tipos de infecciones virales. La segunda sección incluye la descripción de algunas de las familias de virus animales más representativas. Debido a la grandísima diversidad que existe entre los virus, se intentará destacar los aspectos más relevantes de algunos integrantes de dichas familias. Se tratarán aspectos como la clasificación, el virión, el genoma, el ciclo infectivo, la relación con el huésped y la importancia clínica en aquellos patógenos de relevancia. Finalmente, en la tercera parte se analiza la interacción del virus con el huésped. Esta sección incluye capítulos de gran importancia científica como los mecanismos virales de evasión de la respuesta inmune, virus y cáncer, prevención de infecciones virales y terapia antiviral, entre otros. Se pretende abarcar con esta asignatura desde los aspectos más básicos de la biología de los virus, hasta los más aplicados y novedosos en terapia génica. CLASES PRÁCTICAS Las clases prácticas están pensadas como complemento a la docencia teórica. Las clases prácticas son obligatorias y al final de las mismas hay que presentar un resumen de los resultados obtenidos. Cada grupo de alumnos realiza las prácticas durante una semana, de lunes a jueves por la mañana en el laboratorio del área de Microbiología de la 2ª planta del edificio 28. La fecha de las prácticas será: Grupo 1: Grupo 2: Grupo 3: Dos semanas antes del comienzo de las sesiones prácticas, se pondrá a disposición de los alumnos las listas de los grupos, para que se apunten según les sea más conveniente. ACTIVIDADES COMPLEMENTARIAS Se podrá preparar en grupos de 4 alumnos parte del temario comprendido entre los temas 11 y 15. El trabajo se distribuirá y preparará entre todos los componentes y se expondrá en clase por una única persona. Se realizará además un resumen de 6 páginas en letra Times New Roman de 12 pt a 1,5 espacios, con el contenido expuesto en clase y se facilitará también la presentación en Power Point del tema. Los grupos que preparen temas relacionados deberán ponerse de acuerdo para no repetir la materia. La profesora llevará un control continuo del trabajo realizado para garantizar la calidad docente. Los trabajos desarrollarán parte del temario y por tanto el contenido será tratado como el resto de la asignatura. Además se podrá elaborar un trabajo monográfico individual sobre algún aspecto relacionado con la asignatura. Tanto la elección del tema como la bibliografía seleccionada por el alumno deberá estar supervisados por la profesora antes de realizar el trabajo. Las referencias empleadas deberán ser citadas al final del trabajo. La extensión máxima del trabajo será de 10 páginas con letra Times New Roman de 12 pt a 1,5 espacios. Los trabajos se entregarán a través de la aplicación Safe Assignment disponible en WebCT, y también en copia impresa. Cualquier intento de plagio total o parcial será sancionado duramente. Se evitará en la medida de lo posible, extraer información de páginas web y se manejarán libros de texto y publicaciones y revisiones en revistas de investigación de ámbito internacional, para que la información esté lo más actualizada posible. El plazo de entrega máximo del trabajo escrito será de una semana antes de la fecha del examen final de la asignatura. EVALUACIÓN Evaluación de los exámenes de teoría y prácticas. La evaluación de los conocimientos teóricos adquiridos por el alumno en cada cuatrimestre se llevará a cabo mediante un examen final, calificado de 0 a 9 puntos. Se considerarán aprobados los contenidos teóricos de un cuatrimestre cuando la calificación del examen parcial correspondiente sea ≥ 5. La calificación de los trabajos en grupo voluntarios será de hasta 1,5 puntos sobre la nota de teoría de la asignatura. La calificación de los trabajos monográficos individuales será de un máximo de 0,5 puntos sobre la nota de teoría de la asignatura. La asistencia a las clases prácticas es obligatoria, y las faltas de asistencia no justificadas se penalizarán en la calificación, pudiendo conllevar incluso el suspenso en la asignatura. La evaluación de los conocimientos prácticos adquiridos se llevará a cabo por medio de un cuestionario, calificado hasta 10 puntos. La calificación numérica de la asignatura (CN) será: CN = (CP+3CT)/4, siempre que CT ≥ 4,5 y CP ≥ 5. En caso contrario, la calificación global será Suspenso. Las calificaciones de Aprobado, Notable y Sobresaliente se asignarán de acuerdo con la normativa vigente. Se adjudicará la calificación de Matrículas de honor a aquellos alumnos que, habiendo obtenido Sobresaliente, presenten la mayor calificación numérica. En el caso de que no se cubriera el cupo de matrículas de Honor con estos alumnos, podrán optar a Matrícula de Honor aquellos alumnos que obtengan la calificación de Sobresaliente en la convocatoria de septiembre. Convocatorias de septiembre y diciembre. Aquellos alumnos que no hayan aprobado la teoría o las prácticas en la convocatoria de junio podrán presentarse en las convocatorias de septiembre y diciembre, con las limitaciones que recoge la normativa universitaria. Las calificaciones de teoría y de las actividades complementarias se mantendrán hasta la convocatoria de diciembre (inclusive). Una vez aprobadas, las calificaciones de las prácticas se mantendrán de forma indefinida. Aquellos alumnos que no hayan aprobado las prácticas en la convocatoria de diciembre tendrán que repetir las sesiones para poderse examinar de nuevo. PROGRAMA DE CLASES TEÓRICAS Bloque I. Introducción a la Virología Tema 1. Introducción a la virología. Historia de la virología. Naturaleza de los virus. Clasificación de los virus. Nomenclatura viral Tema 2. Estructura de partículas virales. Tipos de simetrías Tema 3. Genética y evolución de virus. Análisis genético en virología. Determinación de funciones génicas. Aislamiento y producción de virus. Tema 4. Interacción virus- célula. Etapas en la infección viral. Tipos de infección viral. Alteraciones celulares durante la infección viral. Tema 5. Bacteriófagos. Tipos de bacteriófagos. Replicación. Bacteriófagos de ADN como herramientas. Bloque II. Familias de virus animales Tema 6. Virus con dsDNA; 6.1 Virus con dsDNA circular: Papovavirus 6.2. Virus con dsDNA lineal: Adenovirus 6.3. Virus complejos de dsDNA: Herpesvirus y Poxvirus Tema 7. Virus con dsRNA: Reovirus Tema 8.Virus con (-) ssRNA: Ortomixovirus, Paramixovirus y Rhabdovirus Tema 9. Virus con (+) ssRNA: Picornavirus y Togavirus Tema 10. Virus con RT: Retrovirus y Hepadnavirus. Bloque III. Interacción virus- huésped. Tema 11. Patogenia viral y respuesta inmune. Inmunidad innata y específica. Tema 12. Mecanismos virales de evasión de la respuesta inmune. Virus y cáncer. Virus oncogénicos Tema 13. Prevención de infecciones virales. Los interferones. Vacunas. Tema 14. Terapia antiviral. Vectores virales en terapia génica. Aplicaciones de los vectores virales para la terapia génica. RNAs interferentes Tema 15. Agentes subvirales. Satélites, viroides y priones. BIBLIOGRAFÍA Y PÁGINAS WEB DE INTERÉS. BIBLIOGRAFÍA BÁSICA 1. Virus patógenos / coordinadores Luis Carrasco, José Mª Almendral del Río Publicación Madrid: Editorial Hélice: Fundación BBVA, cop. 2006 2. Principles of virology: molecular biology, pathogenesis, and control of animal viruses / S.J. Flint...[et al.] Publicación: Washington: ASM Press, 2004 Edición: 2ª ed. 3. Virology: principles and applications J. Carter, V. Saunders (eds) Chichester, England, John Wiley & Sons Ltd. 2007. ISBN 978-0-470-02387-7 BIBLIOGRAFÍA COMPLEMENTARIA 1- The biology of viruses / Bruce A. Voyles Publicación: Boston, McGraw-Hill, 2002. Edición: 2ª ed. 2- Principles of Molecular Virology (Standard Edition), 4th Edition by Alan J. Cann (Author) Editor Elsevier Academic Press, 2005 • ISBN(Std Ed): 0-12-088787-8 • ISBN(Instructors edition ): 0-12-088789-4 3- Introduction to Modern Virology, 6th edition (January 22, 2007) by Nigel Dimmock (Author), Andrew Easton (Author), Keith Leppard (Author): Wiley-Blackwell Ed. Publicación Oxford : Blackwell Science • ISBN-10: 1405136456 • ISBN-13: 978-1405136457 4- Molecular Genetics of bacteria 2nd ed. / Larry Snyder and Wendy Champness Publicación Washington : ASM Press, 2007 5- Bacterial and Bacteriophage Genetics. / E. A. Birge. ISBN: 0-387-23919-7. Springer 2006 6- Virology (Two Volumes) / B. N. Fields, M. Peter, M.D. Howley, E. Diane,Ph.D. Griffin, A. Robert, Ph.D. Lamb, A. Malcolm, M.D. Martin, B. Roizman, E. Stephen, M.D. Strauss, M. David, Ph.D. Knipe. 2001. Lippincott Williams & Wilkins. 4th Edition (August 2001) 7- DNA viruses: a practical approach / edited by Alan J. Cann. Oxford : Oxford : Oxford University Press, 1999 8- Human Virology. 2nd ed. Collier, L. &Oxford, J. Oxford Univ Press, 2003 9- Inmunología: biología y patología del sistema inmune. J. R. Regueiro González ... [et al.] ; Madrid : Editorial Médica Panamericana, 2004 DIRECCIONES DE INTERÉS EN INTERNET The Big Picture Book of Viruses http://www.virology.net/Big_Virology/BVHomePage.html All the Virology at the www http://www.virology.net/garryfavweb.html The Video Library http://www.virology.net/Video.html ICTVdB - A Universal Virus Database http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ICTVdb/Ictv/ICTVindex.htm Revistas internacionales de Virología: The Virology Journal: http://www.virologyj.com/ Journal of Virology (ASM) http://jvi.asm.org/ Virology http://www.sciencedirect.com/science/journal/00426822 Otras Enciclopedia Britannica-Salvat online http://institucional.ebrisa.com/portali/home.jsp RECURSOS EN EL SERVIDOR DE LA UPO Toda la información relativa a la asignatura se publicará en el servidor WebCT de la UPO, incluyendo las presentaciones de los temas teóricos, bibliografía adicional, los protocolos y calendarios de las prácticas, las convocatorias de examen y las calificaciones obtenidas. Se incentivará a los alumnos a que cuelguen en el servidor de la asignatura cualquier material relacionado con el temario como videos ilustrativos, esquemas o figuras aclaratorias, para que pueda ser compartido con el resto del alumnado. TUTORÍAS Las tutorías se llevarán a cabo a demanda, sin horario preestablecido y con previa cita. El profesorado de la asignatura entiende que las tutorías son una herramienta fundamental de aprendizaje y de comunicación y recomienda a los alumnos que no se cohíban a la hora de hacer uso de las mismas. No se darán cita para tutorías en las 24 horas anteriores a la realización de ningún examen de la asignatura. Los teléfonos y e-mails de contacto de los profesores son los siguientes: Inés Canosa Pérez- Fragero: teléfonos 95 4349052/ 49160. E-mail: [email protected] (Teoría) Aroa López Sánchez: teléfono 95 4349053. Email: [email protected] (Prácticas)