Marcadores Moleculares
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Marcadores Moleculares ¿Que son los marcadores moleculares? • • • • • • Evolución Ecología Bio-Medicina Ciencias Forenses Estudios de diversidad Localización y Aislamiento de Genes • Directos (ADN) • Indirectos (proteínas) • Capacidad de detectar polimorfismos en loci únicos o múltiples • Dominantes o Codominantes Tipos de Genoma • ADN nuclear • ADN de cloroplastos • ADN mitocondrial Isoenzimas/Aloenzimas • • • • • • • Selectivamente neutras Codominantes Técnica laboriosa frecuencias alelicas y genotípicas Heterocigosis Diversidad genética Diferenciación genética Isoenzimas/Aloenzimas • Otras medidas de variación genética intra e interpoblacional • Biología evolutiva • Relaciones fenotipo-ambiente • Filogenias • Interacción Planta-Animal Isoenzimas/Aloenzimas PCR RAPDs • • • • • • Dominante Oligonucleotidos 10 pb Polimorfismo debido a sitios de acoplamiento HW (estimación de frecuencias) Tamaños efectivos Estructura poblacional RAPDs • Regiones codificantes y No codificantes (niveles de variación más altos que RFLPs e Isoenzimas) • Sin conocimiento previo de genoma • Sin reproducibilidad • Homología de bandas RAPDs Microsatélites • SSRs STR • 1-4 pb (TT) (AT) (AAGG) • Varían en tamaño por el numero de veces que se repite el motivo • Se encuentran en regiones codificantes y regiones no codificantes • Geles de Poliacrilamida (nitrato de plata, radioactividad) • Codominantes Microsatélites • Fuente:http://www.monografias.com/trabajos37/marcadoresmoleculares/Image8136.gif Microsatélites • • • • • • Secuencias flanqueantes conservadas Mas polimorficos que AFLPs, RAPDs y RFLPs Lectura de bandas clara y fácil interpretación Selectivamente neutros Variación genética intra e interespecífica Análisis de linajes y Sistemas reproductivos • • • • • SSRc SSRm (demográficos y mutaciones) Monitoreo de flujo genético Análisis de Paternidad Inferencias de parámetros demográficos Patrones evolutivos (origen de especies, formas o razas) • Estudios comparativos entre especies o géneros de un mismo grupo • Mutación homogénea (mayoría mutaciones de un paso) • Reconstrucciones de árboles de genes (Teoría de coalescencia) • Se necesita conocer secuencia de región a analizar (cebadores) Microsatélites • Fuente Orona-Castro et al 2006 Molecular characterization of commercial and elite genotypes of potato (Solanum tuberosum L.) in Mexico SNP´s • http://cmbi.bjmu.edu.cn/cmbidata/snp/images/SNP.gif • 1% de la población • Los SNP constituyen hasta el 90% de todas las variaciones genómicas humanas • Codificantes y No codificantes • estudios de poblaciones • Pruebas genéticas • Investigación médica • Desarrollo de fármacos • Varias formas de identificación (RFLPs, secuencias) ANALISIS DE SECUENCIAS DE ADN ITS (ADN ribosomal nuclear) Fuente: Collins 1990 ADN Mitocondrial • Fuente:http://3.bp.blogspo t.com/_ud1zAGJBkYE/TLJvi s2aY3I/AAAAAAAAABQ/yJi D8PIdCrw/s1600/Genoma Mitocondrial.jpg Microarreglos (Microarrays) • Tecnica de microarrays para detectar niveles de expresion de genes, Fuente: pagina web del Instituto de Neurobiologia, UNAM) Microarreglos (Microarrays) ¿preguntas? ¡Gracias!
