PROGRAMA DEL CURSO Bioinformática y biología computacional Cód. A01 DIRECTORES: Dr. D. Federico Morán Abad y Dr. D. Luis Vázquez Martínez. COORDINADOR: Dr. D. Antonio Sánchez Torralba. ESCUELA EN LA QUE SE INSCRIBE EL CURSO: Escuela de Ciencias de la Salud. HORARIO DEL CURSO: Mañanas de 9:00 a 14:00h., de lunes a viernes. NÚMERO DE ALUMNOS: 20. PERFIL DEL ALUMNO: El curso está abierto a doctores, licenciados o estudiantes de cualquier carrera de Ciencias o Ingeniería. Sin embargo es recomendable que los alumnos tengan conocimientos elementales de biología molecular, conocimientos básicos de manejo de computadores y conocimientos de inglés. OBJETIVOS: Adquirir conocimientos elementales del sistema operativo Linux, de programación mediante scripts y de diseño e implementación de bases de datos relacionales. Linux, como otros sistemas operativos emparentados con Unix, es la plataforma preferida para el desarrollo y el uso de aplicaciones Bioinformáticas, los leguajes de programación de tipo script se usan frecuentemente en el desarrollo de pequeñas aplicaciones bioinformáticas y las bases de datos relacionales son sistemas estándar de almacenamiento, análisis y consulta de datos. Familiarizarse con los tipos de datos que son objeto de análisis en la Bioinformática, y con las bases de datos en que dichos datos están almacenados y cómo se accede a ellas a través de la Internet. Conocer los tipos de herramientas y las estrategias generales de investigación usadas más frecuentemente en Bioinformática. Este objetivo es muy amplio y abarca técnicas y métodos enfocados a analizar y comparar secuencias de ácidos nucleicos, analizar y anotar genomas, predecir y comparar la estructura y la función de proteínas, diseñar fármacos optimizados para su interacción con centros activos de enzimas o receptores o con ácidos nucleicos, etc. PROGRAMA: Introducción a la Bioinformática. Nociones sobre el uso de computadores con sistema operativo tipo Linux y Cloud Computing. Nociones sobre bases de datos relacionales y servicios Web. Bases de Datos en Bioinformática (de la secuencia al genoma, de la proteína a la enfermedad). Herramientas y conceptos de análisis de secuencias de ácidos nucleicos. Herramientas y conceptos de análisis de secuencias de aminoácidos. Predicción de estructura secundaria y terciaria de proteínas. Filogenia. Arrays de DNA y análisis de datos masivos (Big Data). Proteómica y Bioinformática. ACTIVIDADES PRÁCTICAS: Este curso es fundamentalmente práctico. Todas las clases se impartirán en un aula de informática donde se realizaran ejercicios directamente por los alumnos. Las clases contemplan una breve introducción teórica o metodológica seguida de la actividad práctica por cada alumno. Se puede ofrecer, como actividad complementaria, la posibilidad de realizar prácticas adicionales, libres o apoyadas por un monitor, en horas extra, dependiendo de la disponibilidad del aula. PROFESORADO: D. Luis Vázquez Martínez, UCM. D. Daniel Mozos, UCM. D. Federico Gago, Universidad de Alcalá de Henares. Dª Mayte Villalba, UCM. D. Javier Lacadena, UCM. D. Antonio Puyet, UCM. D. José Manuel Bautista, UCM. D. David de Juan, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas. D. José Luis Vázquez-Poletti, UCM. D. Pedro Larrañaga, Universidad Politécnica de Madrid. Fundación General de la Universidad Complutense de Madrid. C/ Donoso Cortés, 63-65. 28015 Madrid